EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-18390 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:149363760-149366310 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr4:149366057-149366067AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr4:149366057-149366067AGCAGCTGCT-6.02
Lhx3MA0135.1chr4:149364148-149364161TAATTAATTAACA+6.12
Lhx3MA0135.1chr4:149364136-149364149TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr4:149364140-149364153TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr4:149364144-149364157TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr4:149364133-149364146AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:149364137-149364150AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:149364141-149364154AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:149364145-149364158AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:149364132-149364145AAATTAATTAATT+6.92
Nr5a2MA0505.1chr4:149365837-149365852GAGTTCAAGGCCAAC+7.29
POU6F1MA0628.1chr4:149364134-149364144ATTAATTAAT+6.02
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POU6F1MA0628.1chr4:149364146-149364156ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:149364134-149364144ATTAATTAAT-6.02
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ZNF263MA0528.1chr4:149364309-149364330CTCTCTCTCTCTCCCTCCCTC-6.89
ZNF263MA0528.1chr4:149364313-149364334CTCTCTCTCCCTCCCTCCTCT-7.28
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02270chr4:149353854-149387248Macrophage
mSE_08104chr4:149364169-149367167Kidney
mSE_08435chr4:149363736-149368847Liver
mSE_09594chr4:149363766-149365268MEF
Enhancer Sequence
TGTGATATAA ATAGAACTGA ACAAAAATAT AGATCTGTTA AAAATATATT ATGCAGATTG 60
TCAATACATG GAGATATGGA TGGGAGGTTT AAGAAAGCAG GAAGAGTATT GTAGACCAGT 120
TACAGACCAC ACGCTAAGCC AGCATTGGTT GGAACAGGCA TTTTAAGATC ATCCTTTGTG 180
AACTTGGAGG GAATCTCTAT TTGTTGAGTA CAACCACGGT CATTATCTAA TTTAACACAG 240
AAAATCACCC AGAGAGTGCC TAGGGCGGCT TTCACTCTTT ACAAGTTGAA CCAAGAGTCA 300
CTTCTCTCCA ACTGAGCCAG TAACCGTCTC CCATGTTTCT GTGCTGTGGG AGACCTGGGT 360
TCCCAGACCC AAAAATTAAT TAATTAATTA ATTAATTAAC AAAACAAAGA GGAGAAAACA 420
ACCAAAAGTT AGCTGCAGTT CCTACCAATG TCTTCTGGGA TCACTAAAAA TAAGGAAGGT 480
GAGAACCGAG GGGAGACACT GACTGCTGGC TGGCTGGCGC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC 540
TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCCCTCCCTC CTCTCTCTCC CTGGCTCTGG GTATGGAGCT 600
AGCTGCAGCT ACCCCAGCTC ACCCTGCAGA CAGCACAGCA GATGGCTTGG AAGGGACGCT 660
GCTCTGCTGA GCAAGTGCCC AGCACCTTAT GTCACATGGG CAGAAGGAAG CCAGGACAGC 720
TGGTGTCACC TGGGAGGAGC CTGGTTGTTT GGGTCCCTTG GTGAGAGGCA GTGGGCAGCC 780
ATCCTAACCC CCAGGGGTGA ACATGCCTTT CCCCAATGCC TGGATAGCAC ACTCCTCACC 840
AGGGGCAGTC TCGGGGAGTG CCCCTCCCCC GCTTCCCTAC TCCCATTTTC CAATCAACTC 900
TTTGTGCAGA GGGAACTGAA TTGGTAGGGA GTGTCCAGAG TACAGGGTAG TGAGGGAGGC 960
CAACTCTGGA GAGCCTGGGC ACGGAGAGGC TGAGGAACAC ATGGATAAAA GCTTGGGTTC 1020
AAACCCCAGA ACATAGACTG CTGAACCTCT GTCATTACAG ACCCGATTTC TCTGTCTGCA 1080
CAGTCTTCTG GACTCATTGC TTCAATGCAG CAAGTGACCA AGGTCACTTC CTTAGCCCAT 1140
GCTGCTGCGT CTGAAGACCC CACCGAGGGA CCTCGGGTCT CCTGTGGGGA GAACCCAGGT 1200
CAGACACTGC CAGGGGGGGT TGCTGCTGGC CTGAAGGATG GCTTCTTCCT TCCTCCTCCA 1260
GTGTGCCCCC AGCCTCTGCA GCAGCCTCTG CAGCAAGCTC CACTGAGCCA AAGGCTGCGG 1320
CAGAAGCAGA AGCCGTGGAG GGGAGGGAGC TGGAGAGACT GCGGCCACCC AGGTGGATGG 1380
GGGTGGGAGA GAAAGAGCCA AACGACCTTG CAGTTCAAAA GTCCCTTTCC CAGGGCTGCC 1440
ACAGAGCAGG GGCGGGGGCA GGAAATGACA GGCTCAGAGA GCACCCCTGC CTCTCCAGAA 1500
TGCAGGGTAC AGTTTAGAGC CCCAGCATCT ACCCCTAGGT AGAAGCAGAA CACGAGCAGG 1560
TAGGGGTGGG GGAAGAGGGA GGGGAAATGG CTTGTGACCT TGGTCTTCTC CCTTGCAATT 1620
CAGACTGCAG GGCTCAGAAT TCAGCCTTGG AAACACTCAG CCCAGGCTGA GGCCCACAGG 1680
AGTGGCCCTC ATCCATTGTC ACCCAGGTGC TGGCACGGGC AGAGCTACAG CTCCTGTCAG 1740
GTAGATGGGA GAGGACTGGG CCTGCAGCCT CTGCAGCGCA CTCCTCAGGA TGCCAACCAG 1800
ACTCGCCTGC CCAGCAGTCA TGTTTGCTCA ATCTAGTGCC AACATGGCCT GCAACAGAGG 1860
CCCTCCTACT GGGACTGAGG GTCTGGTAGC ACAGTTTCCC ATTATTGGCT GCTCTGGACC 1920
AGTGCCTAGA CTAGAGAGAC CCAAACCACA GCAGAGCAGT TGTCCTGCTG GGCAGCTGGG 1980
TCAAAAACAA ACATTAGAAA AGGGGAATCA TAAGTGGTAG TTTGTGTTTG TGACCCCAGC 2040
ACTTGGGAGT CTGGGATCAG GGCGGGAGTA TTTCTGTGAG TTCAAGGCCA ACCTGAGCTA 2100
TATTGGAAGA TGGAGGCCAG CCTAGGCTAC ACTTTGGGAC AGACACACAC ACACACACAC 2160
ACACACACAT GGCCTGGCTG CCTGTCCTCC CACTACATGG GACAGCACCA TCCTGGAGGT 2220
ATAGGAATAG TCAAACTACT TGCTACAGGA GCCTTGTAGC CAGCCCCTGG TCTGTCTCTG 2280
GGCACAGCCA CCCTGGTAGC AGCTGCTGTT CAGACCCATG CTCTCACTGC TACAGGCTGG 2340
CCTCACTAAG TCCACCTGTC TGTCTATCTG TCTGCCAGCT TCCACTCTGT AACTTCCAAA 2400
GGCACCTTTG TAGTGCTATA GTCTGCCTGG TCACAGTCTC CACAGAATCC TCAAAAAGAA 2460
TCCATAGAGG GTGTGCAATA CGTGAAGGAC CACAGACAAC TGCACACTGG ATTCTTCCAT 2520
GCCCCATGGC GAGCACAGGG AAGAACCCCA 2550