EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-18380 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:149227740-149232500 
TF binding sites/motifs
Number: 29             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATF3MA0605.2chr4:149228509-149228521CATGACGTCACC-6.04
ATF7MA0834.1chr4:149228508-149228522CCATGACGTCACCA+6.01
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Arid3bMA0601.1chr4:149229935-149229946TTAATTAATAT-6.62
Creb5MA0840.1chr4:149228509-149228521CATGACGTCACC+6.27
FOXB1MA0845.1chr4:149228312-149228323AATGTAAATAT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:149229765-149229777AAACAAACAAAC-6.32
GCM2MA0767.1chr4:149228766-149228776TACCCGCATA-6.02
JDP2(var.2)MA0656.1chr4:149228509-149228521CATGACGTCACC+6.62
KLF16MA0741.1chr4:149228449-149228460GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr4:149228450-149228460GGGGCGGGGC-6.02
NFAT5MA0606.1chr4:149231000-149231010AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr4:149231000-149231010AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr4:149231000-149231010AATGGAAAAT-6.02
Nr5a2MA0505.1chr4:149228001-149228016ACTGGCCTTGAACTC-7.4
POU4F2MA0683.1chr4:149229161-149229177CTGATTAGTTATGCAT-6.42
RFX1MA0509.2chr4:149232013-149232029GGTAACCATAGTAACG+6.46
RFX1MA0509.2chr4:149232013-149232029GGTAACCATAGTAACG-6.46
RFX2MA0600.2chr4:149232013-149232029GGTAACCATAGTAACG+6.57
RFX2MA0600.2chr4:149232013-149232029GGTAACCATAGTAACG-6.5
RFX3MA0798.1chr4:149232013-149232029GGTAACCATAGTAACG-6.37
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RFX4MA0799.1chr4:149232013-149232029GGTAACCATAGTAACG-6.77
RFX5MA0510.2chr4:149232013-149232029GGTAACCATAGTAACG-6.13
SP1MA0079.4chr4:149228448-149228463TGGGGGCGGGGCTAC-6.46
SP2MA0516.2chr4:149228447-149228464ATGGGGGCGGGGCTACC-6.13
SP4MA0685.1chr4:149228446-149228463CATGGGGGCGGGGCTAC-6.67
TBR1MA0802.1chr4:149228569-149228579AGGTGTGAAA+6.02
Enhancer Sequence
AGCACCATGT CTGTCTGTGT GCTGCCAAGC TCTCTGTCAT GATGACAATG GACTAAACCT 60
CTAAAACCCA CAGTTGAATG GGTTCTTGGT TAAGAGTTGC CTTGGTCATG GTGTCTCCTC 120
ACAGTGACAG AATAGTAACT AAGCCAGTGC CCTGATCCAT GTCCTCTGCA TGTGTGGCAA 180
GTGCTCTTAA CCACTGAGCC ATCTCTCCAA CGCCCACCAT CACTTTGCTG TTTTAAAGAG 240
AGAGCTTCTT GGCTAGACCA GACTGGCCTT GAACTCACAG AGATCAGACT GCCTCTGTTT 300
CCTGAGGGCT GGGATTAGAA GCACGTACCA CCACACCCCT CATATAGATT TTGGGATTCT 360
TACCTTAGGC CTGTAAGTTG CTGAACTCAT TCTTACACTC CATAGGAAAC AAAGCTCTAT 420
GGAAGTTCAG CAGAAAGCGC TCTAGAACAG TGGTTGTCAA CCTTCCTAAT GCTGTGACCC 480
TTTAATACAC TTCTTCATGT TGTGGTGGCC CCAACCATAA ATTATTTTCA TTACTGTTTC 540
ACAACTGTAA TTTTACTACT GTTAGGAATA GTAATGTAAA TATCTGATAT TCAGGATATC 600
TGATATGTGA CCCTGATGAA AGGGGTCGTG ATCCTCCCAG GGAGAACCAC AAAACACTCT 660
TGCCCCTGTG GGCTTTTGAA TATTGGCCAG AGTCAGCCAA TCCAGTCATG GGGGCGGGGC 720
TACCACGTTT CCCATCTCTA CGGCAACGAC TCTGCTCTTT GAGCTTCCCC ATGACGTCAC 780
CAGCACACGC TGTCTGCGTG AGAAGCCCAG ATGTAGAAGC TGTACTAGCA GGTGTGAAAG 840
GAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAGAGCAT GGCCTGGGAC ACTGCGCATG TGCCACCTCA 900
GGTCGGCGCT CACTTCGGCT TCAGTTCGCA GTCTAGGGTT TGCTGGAACT TGGCTCCTGT 960
AATCTTAGCC GCAGATATGA GATGCTGCAG CGTTTCTCTG GCTTGCTTTG AGCCGCCGGC 1020
GGGCGATACC CGCATAGTGC TCTGTTCATC TTGTCGTTAA TATCCATTGG CGTGCCTCCA 1080
CCATGCCTAG CCTCTCTGAC TGCTACATGA ACTCACAAAT CGCTGTTGCT AGCAAGCTGG 1140
CCATCTTCCT AACGTGCTCC TGAGCTCTGT GGGCCAAGGA GAGCCTCAGC CACGCGTTCT 1200
AGAGTCACAG GTAACACAGA ACAGGCCACT GTGGACTTGA GAATTTTGAC TATGTAACAG 1260
ACCTGGCAGG AATGAAGATA TTCTAAAGAG ATACTGGGCG CCAGACCCGG GAAAGGGGGG 1320
AGACTGTCTT CTAGAGAGAT CTACACAGTC CTAACACCTT GCAGATGGCC CTGCAAAACA 1380
GACTGGAGCG GATCACGGGT GGGACCACAC CTTTCTGGAG ACTGATTAGT TATGCATAGC 1440
TCCTGTCTTC TCTTTAAACA GAAACCTCAT GTTAGAACCC TGAAGACGGG TTTATAGGGT 1500
ACAGGACCTC TTTGTCCCTT TTCCTTACGT GGCCATGTCG CATGAATCTT CTTTTCTGCT 1560
TTTTACTGTT ATTTGTTTCT GTAACTGACT CACTGGGGAC AGGATGCTGA GTCTAGATTG 1620
TCAGGGCTGC TAGGACCTAG GCTCTGACCC CGGCAATGCC AGTAACGATA GAGCAGCCAT 1680
TCTGCACTAT GCATTGTGCA GATATTCCCA GTGGGTTGGG TTTCCTATGC GGATCGCACT 1740
ATCTTTGCCA CAAATGATAG CGCGGCTCGC TGATAAAGTT GAGCACCAGC TGTGCTAGGC 1800
AGTTGTTACT ACTCATTAAG ACAATAATCT AGGGCCCAGC AGGGAGCTAA GAACCAACTT 1860
GAAATTGAAT CCTAGCCCCA CTTTTTTTTA GATCTTTTTA TACAATATAT GCTAACCTTA 1920
CTTTCCTCTT CCCCAACTTC TTCCAGATTC TACCCACCCA AATCCATACC CTTTCTTTCT 1980
CTCATTAGAA AAAAAAAAAA GGCACGTAAA AAGAAAATAG AATTCAAACA AACAAACAGG 2040
AAGAAGAGAG AGAGAGAGCC AGAAGTGCAA AAGAAACACG TACTGATGCA GAGACACACA 2100
CCCACACGCA GAAATCCTGT AAAAACACAG AATCAGAAAC CATACTGTAT AAGCAAAGAG 2160
CCTCTTACCT CTTAATTAAT ATGTGATCTT ACCTCTTAAT TAATATGTGA TCTTAGGTGA 2220
GCTAAGACCC TCTCTGTAGG TCAATTTAAT GATTCTTAAA CATATTCACA AGTCCACCTC 2280
CTGAGGTTTT GAGAGCTTTT CTATTTTCTT TTGTCTTCCC ATCGATAAAA TGGAAAAGTG 2340
TTGTGCATTT AAGGCCAGCC TGCTCTGTAT AGCAAGTTGC AGGACAGGCA GAGCTACATA 2400
AGACCCTGTG TCAAAGGAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAGGA AGTGTGTGGG GGCCTCAGCA 2460
AACCCAGTCC TTATAGGGAG GCCAGCTTTG CTAATGGGAA ATCAGTCCCC TGTTCAGCAC 2520
ATGGCTTCAG TGGTCACCCA CAGATTCCCA AATTATCATA AAAGCAGCTT TATCCAGACA 2580
CTGCATTTTG TGAGTCTGCA CTCGGAGGCC AAGTTATATT TAAGCAGAGC TTCCCCTCCA 2640
ATCCAGACAG CGGCTTGAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA ACCACCTATG TCCAGAAGCA 2700
AAAGAATGCC TTTCCTTCGC TTGCACGGTG ACTTGCAGCT GACTATGGCT GGGAGTTGGA 2760
GGGTGGCCTA GAGCCGGGGC TGGATCCTGC CTGGGATCTT GTCTGAGGAG CCGCCATGTG 2820
CTGTCAGGTC TCAGAGCCAG TGTCTGACTT CCTTGTTACC ACAAGGCCTG TGGTTTCCAA 2880
CTCTGTCTGC ATCTGAGTCC CACTTAACCA ACAGCGGGAG AGAAAACAGA CGCGAACGCC 2940
GGCAGCCACA CACAGCCACC CAGACGCGCG CAGTCTTCAG AGGAAGTGGA GCACCAGGTG 3000
TTCTGGGTTT CCTGTTCGAT GCTTCCACAG CTGGTTGAGT CTGTGGCTGT GGTTTGTCTG 3060
TCTAGGGCTC ATGTGAAAGA CAAACGCCTG GCTGACGGGA AACCTTCCCC CATCTCTGAC 3120
TGATCAGTTA TACAGAAATC TGGCAGATCA GAGATTTCCT GAAACACTCA GACCCGGATT 3180
CTCCCAGAAA GACGCCCAAG TCCCCCTCTC CCCAAGGAGC GGCCATAAGC TGTTGGGTGG 3240
CCTTCTTAGG ACCTGGGGAC AATGGAAAAT ACTTCAAATG TGCCATGATT TTGACCTGGT 3300
GAGCAAAAGG AGGCTGAGGC CAGGCTGCTT CAGACCCCAG TCCTGAGCCT GGCATAGAGT 3360
AGGCACTCAG AAAACACCTA ACAAGGGCAG GCATGGTGGT AAATGCCTGT GGTCCCAGTG 3420
CTCAGAAGGC TGAGGCAGGA GGATGGATAG AGCCCAAGAA TTGGAGTCCA GGTTTCAAAC 3480
AGCAAGATCT TGTTTCAAGA TAAAATAGGG GCTGAGAAAG GGCTCAGTGA GAGAAATGCT 3540
TGCAGCACAC ACATGGGAGA CCTAAGTTTT TGTCCACAGA ATTCACATAA AGGCCGGGCG 3600
TGGTGGTGTG TCCCTCTAAC TCCAGCACTG GGATGGCAGG GTGTGTATGG AGGGAAGACC 3660
CTGGTAGCTT GGGCCACCAA TCTGGCTGAA ACAGCAAGTT TCAGATTCAG AAATAAGATG 3720
GAGAGGCAAT TGAGGAGCGA CCTACCAACC TATCAATGTA AACCTCTATA TGCATCCACT 3780
TGGGCAAATA TACACACACA TTCACATGTG CATATATACC TTACACACAT GCATACAGTC 3840
TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 3900
ACACACAAGT AATACAACAC AGCCACTCAT GCAACATCTG GAGGAATAGC TGAAGGGTCC 3960
ACTATGTCTC TGGGAGTTGG GTCTAAAAGC CCCGGCTTAG CATCATGTTT CATATGCAGC 4020
TTCGGATTTT AGCAGACAAG GCTTTGAGGC AGTGCTATGT TGCTGATTTC CTGATTGCAA 4080
GTCCTTTAAA GCCACAGGCC TGCTTTTCTT ATCTGCGCAA GAGATACTGC TTCCTAGGGG 4140
TGCATGGATT TGCTTGGCAG AGTCATGCCC ATAGCAACCC CTCAGTAAGG CTGGCTCCCT 4200
CTCTCTCCTT GCAATGATGC AGTTTATCTA GGGAGAGGTT ACTAAGCAAA CAGGGTGGAA 4260
CAGATAACAG CCAGGTAACC ATAGTAACGA TGGTCCTGGG ACACCTGCTT GTGGAGCATG 4320
GTGTACAGCA GGGTACTAAT GTTTGCGGGG ATGTGTGTGT CATCAGGCCA TCCTGGGCCT 4380
CTAGGCTCTC TAAGGAGGCT CCTATTGTTC TCCTCTGGCT GTGCAGTGGG GTTAGGGGTT 4440
AGGGGTGAGT ATGGCTTAGT CTCCTTAGTG ACCACCAGCG GTTATTTTAA TCCTTGATTG 4500
CTACTGTTAC TATTCAGTAT GCACTGGAGT CCCTTAACAA GGGTCCCTTG ATGCAGCAGG 4560
CCTCACAGGT CTGTCCTTCA CCTGTATCTC TGCCTATGAA ATGCAACATC CGCAACTGAC 4620
CGTGGACATC AGTTTTGTCT CTGGAATGGA CCCATGAGGT TCAAGTGTCA TCTCTGATAT 4680
TTATCTGTGC AGTGTTGGGC AAGTTCATGT CATCTCTCTG TGCCTCTGTA AAGACGGCAC 4740
ATGTGCCTTT AGGTAAAATG 4760