EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-18372 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:148935900-148938310 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CremMA0609.1chr4:148936544-148936554TATGACGTAA+6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:148936373-148936391GCAAGTGAGGAAGGAAGA+6.09
Gata4MA0482.1chr4:148937867-148937878TCTTATCTCCT+6.14
HOXA13MA0650.2chr4:148937526-148937537GTTTTATGGGG-6.02
KLF14MA0740.1chr4:148937333-148937347AAATGGGCGTGGCC-7.04
Klf12MA0742.1chr4:148937332-148937347GAAATGGGCGTGGCC-7.36
RARAMA0729.1chr4:148938067-148938085CCATGAACTTCTGACCCC-6.89
RarbMA0857.1chr4:148938070-148938086TGAACTTCTGACCCCT-6.13
SP1MA0079.4chr4:148937334-148937349AATGGGCGTGGCCAG-6.55
SP3MA0746.2chr4:148937334-148937347AATGGGCGTGGCC-6.07
SP4MA0685.1chr4:148937332-148937349GAAATGGGCGTGGCCAG-7.24
Six3MA0631.1chr4:148937286-148937303AAATGGGTATCATATAT+6.37
Enhancer Sequence
ACTCAGCAGG GCAGGAACCT GGAGGCAGAG CTGATGCAGA GGCCACGGAG GATGCTGCTT 60
ACTGGCTTGC TCCTCATGCC TTGCTCAGCC TGCTTTCTTA TAGAACCCAG GACCACAGGC 120
CAGGAGTGGC CCCACCCATA ATGGACTAAA CCCTCCCACA TCGATCACTA ATTAATGAAA 180
GACCCTACAG GCTTGCCTGC AGCCCAGTCT TATGTAAGAG AGCATTTTCT CAGTTGAGGT 240
TTCCTCCTTT CAGATACCCT CAGCTTATGT CAGGTTGACA TAAAAAAACA GCCAGCACAC 300
TTGCTGTCTT CAGAGTACAG GACATGGACC CATGAGCAGT TTGCAGAGCC CAGTGATGGG 360
GATTTGAGCT TCTCTAAGGA GCCAGTGGCC CATTTCCTCC TGGGGACCCA GTGCTATTTT 420
TGCACATGCA GCTCTCTGCA GAGGCCCAAG GTCCCTGCGA GAAAACCCAC GAGGCAAGTG 480
AGGAAGGAAG AGAGTGGGTT GTCTCCGTTC ATTGCCCCAG AAGCATCTTC TGCTGACGCC 540
TCCCCAGCAC GGTCTTGCTT CGACCCCCTC ATGCCTAGCG AGCTGGAGGC AGCCCTCAGA 600
GAAACCAGCA TCTGTTAGAC ACCCAGCTCA GCCACCACAC AGGGTATGAC GTAATCCTGG 660
CGACAGTCCT GCTTGCAGTG ATAGTGCATG GTCCCAGGAC TGGAGTGAGA ACAGAGAAAG 720
GATCTGAGGG CTTCTCAAGC AAGAAGCCAG ATGTCTGCGC TCCTTTCTGG AGGCTTGTCT 780
GTCTTTCCAA GAACACCGAT GAGGCAGAAA CAGGCTGGGT GGATGATAGA TTACGTTCCC 840
TTAGCACCAC TGTGCTGATG TGAAGGCAGG ATTTCCGAAT GTCACGTGTT CGTCTGGGCC 900
ACCCTTCCGC AGCACTGCCT GGGGTGCCCC CTGGCTCCTC CAGGCAGCAA GGTGCGTGCA 960
CGGGATGGTG TGGACAAGGA TGAGCAACAC TGTGCGACTC TGGTCCAAGT GCCGGAGGCT 1020
CTGGTGCACC CCACCCCCAC CTAACCCAAC CCAGTCCTTG GAGGCCTTTG CTTTCCCTGC 1080
TGTTCCCATC TGCGTCTTCC AGGGAGATAG CTTCCCATAG CGCAGCAGGG AGGTATGCCA 1140
GAGGCACAGG CAGCCTCACT GCTACCGCTT AGGGCAAGAT GCAGGACCAC CACGCTTTAG 1200
AAAAGGCGGA CAGGGAGCAG GAGGTACCGA CAGCTTGGGT AGGCTAGCAT TTCCTGCTCC 1260
TTCCCTCCTC CCCTTGCCTC TTCTGGCAAT GTGTCAGAGC CTGTCTTAGG GAGAACAAGA 1320
CAAAGGGAGC GATTTCATGA GTGGCTGGAC TAGAATCTCA AATTCAGGAT TAAGAAAAAC 1380
CATAAGAAAT GGGTATCATA TATTTCTGTC AAGCCTGGCA GGCAGCAGGC TGGAAATGGG 1440
CGTGGCCAGG CTCCTTGGAA CAAAGGCTGG GTTTGAGCAA AGGGAGGCTG TGGCAGAGGT 1500
GAATAGTGTT TGCATTCATA GTGAGAGGGC TGGCAAGAGG GCTCAGTGTG TACAGGAGCT 1560
TGCCACCAAG CTTGACCACC CGAATTCGAT CCCCAAAGCC CATGCAAAGG TGGGAGGAAA 1620
GAACCAGTTT TATGGGGTTG TCATCAGACC TTTACACACA TGCAGGAGTG TGTCGCCCCA 1680
CCATACAACA ATGAGAAGTA AGCAGTTTTC AATTATTTGA TTTGATTTTC AGTCACAAAT 1740
GACTATGGGT ATTAGACATA ATGGCACATA GCTTTAATCC CAGAGGGTTG TGAGCCAGTG 1800
TGTAGGTGCT GGGAATCGAT CCTGGGTCCT CTGTAAGAAC CGTCTCTCCA CTACCAAAAT 1860
CTACACTTGA GAAGAGAGAG GCTCCCAAGA AAACGTTACC TCCCATCCTA ATGTGATGCC 1920
CTTGGAGCAA GGGACATGGG CTGAGCAGAG TCCTGCCCCA GGACCTGTCT TATCTCCTAG 1980
CTATGAGGCT TTGAACCAGG CTCTGAAGCT TTGCAGCAGG GTGGGGTCAC TCATGTCCCC 2040
AGATTGGCTG TAGGAAGTCT AAGGAGAGGT GGACTTAGTT AGAAACACTT CTGTCTCCTT 2100
CCCGGTAGTT TTTATTAGGT TGCCATGTGC CCCCGGCTGG CCCTGAACTC ACTGTAGCCA 2160
AGGATGACCA TGAACTTCTG ACCCCTTTGC CATATCAGCA GTTCATGTGC TGCTAGGGGG 2220
CCAACCCGGG GGCTTTTGCA TGCAAGACAA GTACTCTATC AGCTGAATTA CATCCCGGAC 2280
CTTTGAAGCA CTCCAAGCTC AGCACAGTTT GGCAAGGGTG GGAAGATAAG GAGGGCTGCT 2340
CCCAGTGAGC ACAGCCTTTC TGCCTTGTCC TGATTCCAGA AGCCATTAGC AGTTCTTGTC 2400
CCCTGGTCTG 2410