EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-18244 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:140865300-140870650 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:140869276-140869294CACTCCTTCATTTCTTCC-6.35
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:140869280-140869298CCTTCATTTCTTCCTTCA-6.47
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr4:140868854-140868869TGACCTGTTGACCTC-7.49
POU2F2MA0507.1chr4:140866839-140866852CACATTTGCATAT+6.64
RARAMA0729.1chr4:140868851-140868869AACTGACCTGTTGACCTC-7.36
RFX1MA0509.2chr4:140868040-140868056TGTAACTATGGTAACG+6.39
RFX1MA0509.2chr4:140868040-140868056TGTAACTATGGTAACG-6.4
RFX2MA0600.2chr4:140868040-140868056TGTAACTATGGTAACG-6.32
RFX2MA0600.2chr4:140868040-140868056TGTAACTATGGTAACG+6.4
RFX3MA0798.1chr4:140868040-140868056TGTAACTATGGTAACG-6.19
RFX3MA0798.1chr4:140868040-140868056TGTAACTATGGTAACG+6.38
RFX4MA0799.1chr4:140868040-140868056TGTAACTATGGTAACG-6.1
RFX4MA0799.1chr4:140868040-140868056TGTAACTATGGTAACG+6.75
RREB1MA0073.1chr4:140865692-140865712CCCTCCAACACCCCCCCCCA+6.69
RREB1MA0073.1chr4:140867298-140867318CCGTTGCGGGTGTGTTGGGG-7.09
RarbMA0857.1chr4:140868854-140868870TGACCTGTTGACCTCA-6.92
SREBF1MA0595.1chr4:140866226-140866236ATCACCCCAC+6.02
USF2MA0526.2chr4:140866209-140866225TGACCACGTGACTTCC-6.15
ZNF263MA0528.1chr4:140866221-140866242TTCCCATCACCCCACTCCTCC-6.15
ZNF263MA0528.1chr4:140869509-140869530GAGGGAGGGAGAGGGGGAGCA+6.94
ZNF263MA0528.1chr4:140869505-140869526GAGGGAGGGAGGGAGAGGGGG+7.2
ZfxMA0146.2chr4:140869064-140869078GTGGCCCAGGCCTG+6.15
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02945chr4:140847320-140916861TACs
mSE_07566chr4:140867389-140869340Intestine
mSE_08585chr4:140863457-140870913Liver
mSE_09063chr4:140865280-140867243Lung
mSE_10040chr4:140865008-140866990Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
GTCTTGGGGG GTAGTTGTGA TAATCACATG ACCTCATGCT CGTAAAGTGC TTACGTCAGC 60
GCCTGACACT TAAATACCGG TGAGCTTGGC TGTTATTTTT TGATTCATCC TGTGAATAGT 120
TGCTGCCCTG GCTGGGGCTA GGAAGTCTAT TCCCAGGAGC TGTTTCTGAT TCTCTTGCTG 180
TGTGGCCTCA AACACATTGC TCAACTTCTC TGGGCTTCAG CTCATCATTT AATGCAGTTT 240
ATTTGCGTGC TGATTCAGAC CCAGGGTATG CTCGAATCAC CTGGAGTGGA ATGGAGGAGC 300
TGTGAAGTGG GGCACAGTTA GCTCTCAGTA GAGCCACAGA CCCAGAGATC CTCTCTTGGG 360
GTTTATTGAT GACATAGGGA GACTGCAGAG CCCCCTCCAA CACCCCCCCC CATTTGGGTG 420
ACTCTCTGGG AACAGGTCTG GGCATTGGGC ATTAGCAAGC TCACACATGG GAAGCTGCGG 480
GGACAGCCAA GGCCTGGGAC AGCGGAAATG TACAATGGGT TTGTAGTGGA TGACTCTGGA 540
AGCGACTGGG ACAGAGCGCG TGAGGAATGC CGCCGCCGCT GACCTTTGAA AGGCACTGGG 600
AGCTGCTTTT GCAGCAGATA AGCTCGGTAT TGAGAAATTG GGGGCCAGGG CCTTCCATGC 660
CTGGCCGGCT GGATGACCCT AGGCTGAGGA GTCCCCTCCT CATCTCTGGC TTCAGCTTTC 720
CTATGAGCAA AATGGGATTA AAAAAAAATC TCCTCCACCT GCAGATCTGG TTTTCCATGA 780
AGGAGGCTGG AAGACCCTGA AGCCTTTCTA ATGGGTGGTC TGTGTGCTTC CCAAGGCCGC 840
GCTGTTCTTA GAACCTTGCT TAACACGGAA CTTAAGCCCC CTGGATGAGG GGTTTCCTCC 900
AAGCTTTTCT GACCACGTGA CTTCCCATCA CCCCACTCCT CCCAGCGACC TTCTGCTGAG 960
TGAGCCCCCT TCCCTAGGTG GCCCCCTGCT TAGGTGACCT CAGTTGCACA CTCTCAGCTT 1020
CAGACAATGA CCATGGAAAG GGGGGGTGCA TGTGTGGGGG ACAGGACAAC GAGTGGGCCT 1080
AGGAGCTCCT CCTCCATGAC ATCCTAACAC AAGAATGCAG GGGTGGAGGA GGGGCGGTTG 1140
AAAACTTTCC ACCCCGGTGA TTCAGACCCT GCAGAGATAA GTGGGGGCTA AAGGAGGGAG 1200
GGCTCTTCAT GTAGCAGGCT AGCTCCCTTT TCTTGTGGGG ATTCAGGGTT CTTGGCAAGC 1260
TTTGTTTATA AAGAGCTTAT AAAAAGCCAG CCCCCCCCCC CAGGAATCAG CCCCAGCTCT 1320
GCCTGGGGAC TAATCTCCAG GAGGGACACT CAACTTAGCT GGCACCACTC TCTTGAGTAC 1380
TAGCCACCCA CTGCTCTGAC TCTGTCTCCC GGTCCTCCTC CCAGCAGGTA AAGGGTCTTG 1440
CCCTGCAAGA CTGGCAACCT TGCAAACTAA GGCGAGTTCA GTTCTCAGAG CACAGAAACA 1500
GGTAGACGAA AGAACCAGCA GCTTCACCGT ATTGACTTGC ACATTTGCAT ATGGTGCATG 1560
GCATGCACGG ATGTGTGAGT ACCCGAGAGA GTGCCTGGGC ACGCAGTCGT CGTGATAAAT 1620
AGAGTTAATT TCAAAAATTC TTGCTTCTAC GCCTGGGACG GTGTGGTACT GGGGTCGGGG 1680
GTGGTTAGCA GTGGTGTATT CTGAAGTTTG TCTGGTCTTC TCTGTGAGTC TGGGACTCTT 1740
GGTAGACCCG CTGACTAGAT GAAGAAACTG AGGCTCCGTT TGCCTGGAAT CGCACAACTA 1800
TGTCAGGGTT TAACTCACGG TACACAGCAG TGCCCAGGCT GCCATGGGTC AGGAAGTGGG 1860
ACAGGAAATG ACCAGATCCT GTGGAATCCC TGACTCAGCT CTTGGCACTG AGATGGGCTC 1920
TCTGGGCAGT TCTGGGATGG CAGGTCTTGG CATCGGAACT GGGGCTTCAT CAGAGGGAGG 1980
GGTGGGGTGA CTGGGGGGCC GTTGCGGGTG TGTTGGGGGA CAACTTGCTC AGCTCTCTCT 2040
AGCCTGAGCC TCAGGTGCTT CTGTTACAGC TTTTACTGAT GATAGGGGGT GTGGCACCCT 2100
GAGGTCATCC TGTACCAAGT CAGGGTCATT TCCAGAGTCA TCAGTTTGGG GGATCTGTTT 2160
TTCCTGGGGG TTCTCTTCCT AGGGAAGAAG GCTGGTCAGG AAACAGTTAA GTGGTCAGCA 2220
GAAAGGAGGT GCCTTCCAGG TGGACAGGTG GGCATGCTGC CCTGCCATGC TACCCAGAGC 2280
GAGCTATGTC AGGAATGAGC CGGCCTCCCT CCAGCCCACC CCCAGCATCG TCCAGGGAAC 2340
TGTGGAGCCA CTCAGGCTGG CTGCCCTCTC CCTGGGGGCT GCTTTGTCTC TGCTTCCTGC 2400
CTGCCTTGGC TTCTGCAGGC CCCTCCACCC CTGACTGGCA CCTCACCTCC GCCCAGGGAG 2460
ATGGAGGCCA GGTGAGCAGG TGGCCGACGG CCTAGGCCAG AGGCTCAGCC CAGCAGCTGG 2520
AAGGCCAGCC TCTGGAGGAT GTCTATGCTG GCTCCAGTTT CATGACAGCC TTTCATATGC 2580
AGGGACACTT CATTCTAGGT ACCAGAGCAA ACACTTCACA GGCAAGATCT GTCTATAGTC 2640
TGTAAAGCAC TCAGAGAGGG TGAGGACTCT CCCATTTTAC AAATGAGATC AAGGCCCAGA 2700
GAGGAGATGG CTGTAGACCA TCCCCTCCTG TGTGGATCAG TGTAACTATG GTAACGCCCC 2760
TTTGGGCTTT ATCCTTGCTA TGTGTGCATG GCTCTGAGGG ACATGGCCAC CTTATGATCA 2820
GATCCAAAAA GCTGTCACTT TCTCGATCAG CTCAGTGTGA GCTTTTACAT GTGGTTTACA 2880
TGTGATCTAC TACATGTGAT TTACATTCAA TGTTACATGT GATAGATGGT GAGAAGGGAC 2940
TCCCTGCCCA GGGCCCACAG CCGTGATATT GCACCATGGT GGGACTGGGG GACTCTAAGT 3000
GCTGTTGATA GTGGCTCACA GGGGTATGCC TCCCCCGGTA TAGTCATACC GGATCTTATT 3060
TCTGTGGATT TCAAGGGTAA AGGTCATGGT GGCAATCCCC AAGCCTCACC CTTGTGCTCT 3120
GATCTCTGTG CCCTAATAGC CACACCAAGC AGGCTCAGCC TCTCCCTAGT TACCGGAGGT 3180
AAGTGGGTCC CCCGAGCGGA AGGAAGGAGG CCCGCAGAGA AAGCAAACAA GATAAAGAGT 3240
GGAGGTGAGG GAGTCGGGTG GGTGGAGGGG AGCGCTTAGC TTATCTGCTA GGTGGCGGAT 3300
ATGCCCACAG ATAGCGCCCG GGGCACATGG GAGAGGAGAT GGGGCCTGAG AACTGGGAAT 3360
GTGGCTCCCC TTTTCTGTAG GCACCACAGA GCCTGTTGGG GGCCACTTTC TACACCCTGG 3420
GTCAGTAACG CACAGTTGCT GTTCACTGTC AGGATACAAA GTTCAGGCTC CACGTGCATG 3480
GCCCAGCTAG CGAGGTGGTG TTCTGGTTGC CAGCTGCTCC TGGCTTGGTT GGGGAGGCCC 3540
ATTGCCTCCA GAACTGACCT GTTGACCTCA CAACCTTACT ACCCAAAGCC TGGGAGGTGG 3600
CTGGGCCTGG GGAGGGGCTG GCTCCATAGG AGCTGGATTA GCGCCACACA GAGGGCGTCT 3660
GTCCCTGAGT CAACCTGCAC TGCCACCTGA GGGGCGGGCA TCGGGAACTG GAAAAACCAG 3720
GGTACAGCCC TAGCTGCAGC GCCTGTGCCC CAGTTCTGCT TGGAGTGGCC CAGGCCTGCC 3780
AGGCAATTGG GGCCAGAAGA TACACTCCAC AGGTGCCCCA AGTGTGCCCG AGCCAGGCTC 3840
TCCTGCCAGC CAGGTGGGTG CCCAAGTGAT GATGTCCCTG GGGAGGCCCT TCTGCAGCCC 3900
TTGGCATGCT TCTTTGTGCA CTGCGAGTTT GCCATTCACT CTCTCCTTCA TCTCTTCATT 3960
CATTCATCCA TTCATTCACT CCTTCATTTC TTCCTTCACT CTCTCCATCT CTTCATTCAT 4020
TCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATTCATTCAT TCACTCCTTC ATCTCTTCAT 4080
TCACATTTCC ATATTTATTC AAGACTGATG CGTTGAGACC TCCTTCACAT GAGGTCCTGT 4140
GCGGAGCCAC ACATGGGGCA GATAAACCAG ACTCTTCCTG CTCTCTCTAA GCTGCCAGTC 4200
TCAGAGAGGG AGGGAGGGAG AGGGGGAGCA GAGCCGATCC TCGTATGTGC ACAGATAATT 4260
TCAAATGAGG CATAAAAGCT AGGCTGTGAA TTCCCCTGGA GCTGAAAAGA TGCTAATCTC 4320
TCAGTCACAC CACCACATCC CAGTTCTCAG CGCTGTGCCA GACACGTAGG TTGGGCTTGT 4380
TTCTGTTTGG TAAACTTGAA CCTGGGTAAT AGACGCCCCA TTGGCTCACC AGGAGCCCTG 4440
CAACCGAGCA GGTAGTGAAG GTTATAGAGC AGCTTAGCAA GGTGGGCACT TGGTGTGGTG 4500
GGTACGTTGT GTGAGACCAT GGCTGCTTGC TTGCCCTAGA TGCTGGGGAA ATTTAGGCGA 4560
CTCTTAGGGT CCTCGGTGGT CCTCCTGGCG TGTTCTGGGA CTTCTCAGAC ACTTGCAGAC 4620
TCTGGCAGGC AGGGCCTGTG GGTGCTCCAG AGCTATGTGG TTGGAGGAGG AGGAGGGGGC 4680
AGCACGTTTT CAGCAGGCAA GAGCATGCCC TGTGGACGCC GCCTCCCCTG CATTATCTGG 4740
CATATCCGCA GCGGAAATCT CTCCAAATTC CCTTTTTCCT GCCGTCAGGC AGGCCACCCC 4800
CAGGCTCTGG GGCCAAAGAA TAGAACCCAT CTCTTCCCCC ACTTCCTCTC CTGGCGTGAG 4860
ATGGTGGGGA GCAGGGGAGG GTTGGCAGGT GGCTCGGGCC TTTGTGACCC CCATTCTGCA 4920
CTCTGAGCAC TGGGGCTCAG ATGAAGTGCT TGTGACTTGG GGGCTCTATC TCCCAGTTCC 4980
CTGACCTTGG TCCCCAGTGA ACCAACACTT ACTCCAAGTG CCGCTGGATT TAGAGAGAAC 5040
ACTAGGGGAA GGGGAAAGCC AGGGCCTGGC ATTCTGGCGT CTGAGTTTTG TGTGAAAGTT 5100
AGACGAAGAA GAGAGATATT TTCGTTTTGT AACAGCTCTG TAACGAGAGT GAGGCCAGAG 5160
ACACACAGCA GGATGCTAGA AAGGCTCATG GAGCTGGGGG AGGTGTATGT AGCTAACTCC 5220
ATAGCCCCCT GGGTGGGCCT GGTGACCTGG GAGCTCCTCT CCAGGCTGTT TTAGCTACAG 5280
TCTGGACTTC CTGGTTGGTG AGGTAGGTCT GCAGGATTCA TGTTGCACCA ATATTGAACG 5340
CTGTTCCAAA 5350