EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-18070 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:135779200-135781330 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr4:135780507-135780522AGAGGTCAGAGGTCA+8.73
Nr2f6MA0677.1chr4:135780508-135780522GAGGTCAGAGGTCA+7.42
RFX1MA0509.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC+7.99
RFX1MA0509.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC-7.99
RFX2MA0600.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC-8.31
RFX2MA0600.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC+8.35
RFX3MA0798.1chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC+8.45
RFX3MA0798.1chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC-8.4
RFX4MA0799.1chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC-8.01
RFX4MA0799.1chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC+8.04
RFX5MA0510.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC-8.42
RFX5MA0510.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC+8.51
RXRBMA0855.1chr4:135780508-135780522GAGGTCAGAGGTCA+6.84
RXRGMA0856.1chr4:135780508-135780522GAGGTCAGAGGTCA+6.91
RxraMA0512.2chr4:135780508-135780522GAGGTCAGAGGTCA+6.88
Enhancer Sequence
CCTGGCTGGC CCAGAGTTTG CCAGGTAGAG CAGGGTGTTC TCAAATTCAA AGATCTGCGC 60
TGCTACCTGC CGGGGTTACA GGTGTGCACC ACTCATGGCT GGTTTGGTTT GGTTTGTTTT 120
CTCCTTACTT TTAAATTTAC ATCCATTTGT TTTGTGGCGT GCACATGTGC AGATGTGTGC 180
ACACTAGCGC ATGTCCTAGG ATACATATGG AAGTCAGAGG ACAAGGTGAC AGAATCTGTC 240
CTCTCCTCCC ACCATACAGG TCCCTGGCTT TGAATTCAGC GCCTTGTCTT GGTAGCAAAC 300
CCGTTTACAC ACTGAGCCAT CGCCCTATGT GGGTTCTGGT TCAGATCTTT CCGTTAGTCT 360
GTTAAGGGGG CGGGGGCGGG GGTGGGGGAA ATGCTCTGGA TTTTGATTTT TCAGTCTTAG 420
TGTTACAGGT ACTGGGCTCA GTCTATATCC AGTGGCTTGG GCTCTCCAGA GGCACCCTCA 480
CGGTGGTCCA GAGCAAAGCA GTAAGTGGTC AGTCCACCTC CTGCTTCAGC TGTAGGCTAC 540
AGCAAGAGTT TACAGGCAGC GGGTACCTGA GAGCTCTCAG CAGAATGACA AACCCAGAGC 600
CAGTGGGAAA ACCGCGGTTG CTGATTGGTG ATAGCCGTAA TGGTCACTGG AGATTCAAAA 660
ATGGTGTCTG GGCCTGGTAT TATACTGGTC CAAAGGAGTG AAATTTAATC TACAGCTCCC 720
AGGGCTTTCT GTCCCTTTGC TCGGTTGCCA TGGTAACCAC AGCTGGCACC GCAGAGCCAC 780
AGGGATGAAG AATGGGTGCT ATTGATGCAT CCTGACCCAA GGAGAGGTGC AGGCAGAAGA 840
CCTTTCTAGG CAGGGCATCT GGGCATGGTC TGGTGCTGCC ATCTGTGGTC TTTTGCACAG 900
GCAGAAAGCA CAGGCTGAGA GCCAGAGTGG TGGAGAGTTT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 960
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTCT CGGGTGGGGG AGGGGCACAA AGGACAATAC 1020
CAGTAGTTGG AATTCAGCCC TTTTCTTGGG CTGGACAGGC CAGGCTGCCT GAAGGACTCC 1080
ATTGGGCTTC CAAGTTCAAA CATCTCTTTT GTGCTGTGTT TCACGCATCT TGGTCCCGTG 1140
CCTATGGAGG TTTCTGCATA GAGGCACTGG CTCTTAGTGT TGAGAGAAAT CTAGGTGGCC 1200
ACCAGTCCTT CCATCTCACG CATTTATTTA TTTGTCTGTC TGTCTGTTTC AGTGTACCCG 1260
TGAGTGTGTG TGCATCTTTT CGAGTGTACA TATCAAAGCA GGAGTGTAGA GGTCAGAGGT 1320
CAGCTGCAGG GCGTCAGTTT TCCCCCCTCT CACCTTGTAG AATCCAGGGG TCTGACTCAG 1380
CTCATCAGGC CCTGTGCACG AGCATTCTTA CCTGCTGAGC CATTTTTCCA GCCTTCGCCT 1440
CCCTGTTCTG ACGTAGAATC CAGGGCCTCA GTCTCTGCAG CACTGGAGTC CCTATGTCAA 1500
GTGGCAGAGA GCTCACGCCC TAGAGAGGAA ACTTGGGAAC GTCCTGTTTG GGCTGAAGTC 1560
TGTGTCTCGC TGACTTCCAC CTCTCTGGGA TCATCCAGTC CACTTCTAAT TCTCCCTTGT 1620
GCAGAACAGG CTCGAGGGTG TCAGGCATTG GGAACCGAGG ACTGCTATCA ACTTCCCTTT 1680
CTTGAGACAA GTTCCCTCTT TCCTTCCCGG TTCCTCGCCT ACTTTCTAGG AGACAGTGAG 1740
AGAATTTGTA CAGATGTTGG AGTTGAGGAT TTTGGGCTAC GAATCAAAGC CGTGCTCAAT 1800
ACTCTGGGTC TGCTTGCTGT GGGCAGAATG TGGACCCTGG ATATAGCCTC CTATCCTGGG 1860
TTAAGTTCTG ACTCTGACCC TGTTTATGAC TGAATAATCT GGACATTTTC CTTGTAACGT 1920
AGTCACTGCG ATGTCCTCCT TCCTGTGTGT GTGGCCGGGA GCGCTGAGTC CTCTGGGCAC 1980
AGAGCATGCG CAGCGTGACA GACGCTGGAG CCCAGAACCT ATGAGCATGC GCAGCGTGAT 2040
GCTGGAGCCC AGAACCTATG CTCCTGGTTC GCCGTTGTCC TTACAGTGTC CTGGAAACTC 2100
CTCTGCCTTT CCCCAGACAC CTTCTCTTCC 2130