EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-17903 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:130420220-130423160 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr4:130421857-130421873GGTTACCATGGCGACA+6.64
RFX1MA0509.2chr4:130421857-130421873GGTTACCATGGCGACA-6.64
RFX2MA0600.2chr4:130421857-130421873GGTTACCATGGCGACA-6.7
RFX2MA0600.2chr4:130421857-130421873GGTTACCATGGCGACA+6.88
RFX3MA0798.1chr4:130421857-130421873GGTTACCATGGCGACA+6.92
RFX3MA0798.1chr4:130421857-130421873GGTTACCATGGCGACA-6.99
RFX4MA0799.1chr4:130421857-130421873GGTTACCATGGCGACA+6.43
RFX4MA0799.1chr4:130421857-130421873GGTTACCATGGCGACA-6.82
RFX5MA0510.2chr4:130421857-130421873GGTTACCATGGCGACA+6.7
RFX5MA0510.2chr4:130421857-130421873GGTTACCATGGCGACA-6.7
ZNF263MA0528.1chr4:130422368-130422389TCGCTCTCCTCCTCCTCCTTT-6.17
ZNF740MA0753.2chr4:130421773-130421786CCCCCCCCCCCCC+6.03
Enhancer Sequence
AGCACACCAA ACGTGTCCTG CAGAGCACAG CATGGTTCTT GGTCTCCGGG TGACATCAGT 60
AGTGACCAAT TCTTGCTTGC CAAGCACCGG ATCCACTCTG CCCATCTGCT TTGGGTGGCT 120
TCTTGTGTTC AGACCCCTGG GCATCATGAT GTCACTTACA CTGCCTCCAT TTTCTGGCTG 180
ATGACTGGAA TCCCATGAAC TGCCCAGGGC TGCCTGAGGG AGGTTCCTCT GAGCTTGGGA 240
TGAGCAAGGA GATGGTGTCT GCTTCAGGCT TTGGGCTCTG TCTTCTGTGG ACCTAAGAGA 300
GCTCCAGGTA GGGAGAAGCT ATGGGGACAG AACGATGTCA TGAGGCGTTC TCTGGGTCAC 360
GAAGCTCAGT GACCAGGGAC AGATGTGCTG TTATCGTCCT CTGTCACGTC TCTTTGGTAT 420
TTGTGACAGA ATGTGTAAAA ACATTTGTAT AAGTATGTTT AGAATGTCAC ATAGCAACAC 480
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC GGGGTGGGGG TTGGCCCCAC 540
TGCCTAAAAG ACCCATGGGA GTCCATCCTC TTGTACGATG CTTGAATTTC CATGTCCAGC 600
TGGAAAGTCA GTGCTTTGCT GAACGCCAGT CCCTGCTTGG AGCAGGAACC TTCTCTCCTT 660
TCAAAGGCTG TGCTTTGAAA AGCCTGGACT ATGCCAGGCT GGGAGTCCTG GCAGAATTAA 720
GGCTAGAGGC CAGGAAGTGA AGAGCCAGGC CCCAGGAGAG AAAAGCAATG TAGACTACAA 780
ACCAGAACCA TGCCTGACTT TCCCATGTAA CCCAGGCTGA CTTCAAACCC AAGGATGACC 840
TTGGATTTCT GATCCTCCTG TCCCCACCTT CCTAGTTCTG AGATTACGGG TGCATGCCAG 900
TGTGCCCAGT TTATGAGTTG CCGGGGATTG AACTCAGAGC TTTATGCATG CTAGGCAGGC 960
ATTCTACCAA CGGAGCCACA TCCACAGCCC CCTGTTTCAT CCTCACTGTG TCCCCGACAT 1020
CTCACTGACA TCATCCCATT TCTCAGAAGA AGAAACTCAG TTTTGGAGAG GCCTGCACTC 1080
TTGCTCAGGA TCACACGGCT GGAAAAGAGC AGGGCAGGGA GTGAGGGTGC CAAGAGAGGA 1140
AGTGCCTTGG GGTTACCAGT GTGCAGAGCT GGGATTTGAA CTCACATCTC TGCTCCTGGG 1200
GTCTGTGCTT CTTGTGTTAG ACCCTTCTTC CCAAGTTCCG TGGTGACTAG ACACACCCTC 1260
GGTGTGTGAC AAGACAGACA TGGGTGGTCA GGGAAGGAAA GGGCTGATTC TGCCTGTAGG 1320
GTCAGAATAC AAGGCATGAA TGACAGCTGG GGATGCTCAG GGGGAAGGGG TGGGACAGGT 1380
CGGAGAAGAG AAGAGAAAGG CGTACAGGCG TGAAATGGGG TGCCACATTC TGGTGCTTTA 1440
TGACTGGCCC ACTGAGCGGG AAGATGACCT CCATTTCTCC CTGCCCCCAT CCAGCCTGGT 1500
TCAGAAAGCT TTACTGTCCT CACCGCCCTC CCGTCCCCCC CCTCCCCACG CTTCCCCCCC 1560
CCCCCCAGGC TCCTGAGATA TGGACAAGAA AGGAACTTGT CTTTCCTGGC TCTGCTGGAG 1620
TCCTGCCGCT GAGGTTTGGT TACCATGGCG ACAGGCTCCA TGGAAACCCT CAGCTGGCCT 1680
TTTCCAGGAT GGGCCTGGAC CCAAGCCCAC CTGCTGGTGC TTTGCCTCTG CCCGGCTTTG 1740
GCATCTGGGG AGATGTGTGG GTGGTCATTC TGGGGGTCTG CTTGCCTCTA CACGCTTACC 1800
TTGGCAGGAG CAGAGAGTCC TGAGGTGGCA ATCCCAGTAT GAAGGGTACC AGTGGGTGGC 1860
CCCAGGATTC CACATCAAAC CCAGGCACAG AAGCCCAAAT TCTCACATGG AGACAAACTA 1920
GGGGAATGTC TGTCTTTGGC TACTGACTGG TGCTTTGCCG TGGTGTGCCC ACGTCTGAGT 1980
CTGTTTCTCC CCGCCCTGCT TCTCTGTGAG CTCTGCTCAG TCAGCTCATC ATCTCTCCCA 2040
CACCCGGTGC TCATTTTGTC TCCAGGGCAG CTAAGAGACT GCTTTAGTAG TGAGGTGTGG 2100
GGACCTTGAA CATGCCACCC ACCCTTCCTG AGCCACAGGC TCGCTCATTC GCTCTCCTCC 2160
TCCTCCTTTG CCTCTAAGAC AAGATCTTTT CATGGAGCCC AGGCTGGCTT CAAATTGGAG 2220
ATCCTCCTGG CTTAGTCTTC CGAGTGCTGG GATTACAGGC GTGTGCCACC ATGCTAGGTC 2280
CTGTATATCT GAAGCATCTC TTGCAGGGCT GCTGCTTATC CAGTGTACGT GAGCTAGGCA 2340
ACCACTGCCT TTAGTGAGCA CTTATTGATG TCCTTGCATC TGGTGCATTC TTTGTGCTAT 2400
ACGCTGCTCT TACACCATCT TATGCTCATT ATGCTGCTAT GAGACAGAGT TCTCACTCAT 2460
GCTGGGCATG TGCCCTACCA CCAGCTACAC ATGTTTACGC CCATGCCACA ACCCACAACC 2520
CACAACTGTC AGAGGACAGT TGGCAGGAGG TGACTCTCCT TCCACCAGGT GGGACCTTGG 2580
GATCAAACTC AGGTTGTCAG GCCTGGCTGC GGGTGCCTTT ACCTGCCGAT GAGCCATCTG 2640
GAGCCCGAGA CAATTTTCAC CCTGTGAGGA AGGAGGTTGG TTCTGTCACA AAGCCACCAG 2700
GGAAGCAAAA GAAGGACATT GCCAGCCTGA TGGCTGAGAG TCACTCTTAA ACACTTCATT 2760
TCGTGGTCTG TCAGCTTTTA TTGAGCACCA ACTATGCCCT GACCTCCTAG CTTCTGCCTT 2820
GCTGGAGCTG CCTCTTGGGG GAATGGAGCT GCTGCAGGGC ATGAGACAGG ACGGTGGATG 2880
CAGGCAATGC TTGTTTCAGT TTAATTCCCT TTTTGGTTGA TACACACTAA TCATTGCAGG 2940