EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-17680 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:123667190-123669210 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr4:123668875-123668886ATATTTACATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr4:123667748-123667761TAATTAATTATTC+7.12
NFAT5MA0606.1chr4:123669052-123669062ATTTTCCATT+6.02
NFATC1MA0624.1chr4:123669052-123669062ATTTTCCATT+6.02
NFATC3MA0625.1chr4:123669052-123669062ATTTTCCATT+6.02
POU4F1MA0790.1chr4:123667944-123667958TTTAATAATTAATG+6.25
POU4F1MA0790.1chr4:123667749-123667763AATTAATTATTCAG-6.91
POU4F2MA0683.1chr4:123667944-123667960TTTAATAATTAATGAG+6.74
POU4F2MA0683.1chr4:123667747-123667763TTAATTAATTATTCAG-7.37
POU4F3MA0791.1chr4:123667747-123667763TTAATTAATTATTCAG-7.14
POU4F3MA0791.1chr4:123667944-123667960TTTAATAATTAATGAG+7.18
Spz1MA0111.1chr4:123669003-123669014AGGGTTACAGC+6.14
Enhancer Sequence
CACACCCTCT TGACTCTGCC TCCTACTGCT GGGATTGCAG GTGTGCACCA CCACACCTAG 60
TGTATATGAT GTTGGGGAGA GTTGAAGCTT TGATCGTTCT GTGTAAGGAC TCTACCCCTA 120
GTACTTGAGG GAGTTTCTGT AATTCTAGTT TTGGGCATAA GCAGAGATAC TGGGCCAGAG 180
AGGGAAAGTG GTATATACTA GGGTGCCCAG GAGCTCAGAA GCTGAGTAGG TGACTAACCG 240
GGCTAATTCA CCCATCTTCC CATCCCCACT TGCAGAGGGC AATTGGTGCA GCATCCATGA 300
GGCCCTGGTC TGCTCAGCCT GGAAGGCGAT GCTCTTATTT TCACAGGTGA GAGATCTTCT 360
TTAAGGGATC AGAGCCGTGT CCTCTTGTGG GGTGGGAGAG GAAAGAGGGG AGAAGCTGGG 420
CTTTAAAGAC CCCTGAGCCC CCTCTCCAAA TTTTGTCCTG AAAACGCTCT CTGAGTGTCC 480
CCCTCCCCCA CTCTAACCCA TAGCAAATAC CCACTCAGGT TACAGCTCCT GTTTGCAAAG 540
CCAGCTACAG AGATGCCTTA ATTAATTATT CAGGCTGACA TCTCTAGCTC CCAAATCACA 600
AGGTTGAGAA GAGATCATAG GAATATAATC AATGTGAACT TGAGTGATAA TCACTGGTCC 660
CCGGGTGGAG CAAAGAGAAG AAAACCCTCC AAATTGGTCT TTTTCTTCTA CTCTGGCCTC 720
GATTCTGCCA GCGGACAAGA TAAAACCGCC CTCCTTTAAT AATTAATGAG TAGGCACCGG 780
CGCCCCTGGC CTGGGCCCCG GGAGGCCTCT CGCGGTGGCT GCGCCTCCTG GAAGGCAGGG 840
CGCGTGTGCA CAGCCACGTG CGCCAGCCCG GTCTGGGGCG CAGCACTGAG TCACAGCGGC 900
TGACCCAGCA AAGTGCTGCG AGTGTGACCG GAATGAAGGG TTGCTCCGTC TGTCTCCGAG 960
GTGGCGTGGC AGATCAAATC ACAGCGGATC AGGCGCCGAG ATGTTGCCTT GCTCTGAGTG 1020
ACAGAAGTTA ATAATTAGTG ACAATGATTG ACAGATACAC TCCATCTGCT GCTCCGACGC 1080
CTAGGAGCAG TTATTCCACA ACTGTCTGCG GGCACAATGA ACTCCCCCGG GAGCGCGGGC 1140
TGGCCTGTGA TTGACAGCTG CCTCCAAGAG AGACAGGCCA CTGATGGAAA GTCGCTGTCA 1200
GCAGAAGCGC TCCGGTCCCC CCCACACTCC CCGTGTTCCC GCCGAGGCTC ACTCGCTGTA 1260
TACATTTATT CTGTTTCATT TATCATGTCA GCCGCGGTTT TAAATAGATT ACTAGCTAGC 1320
CTGTTTTTTA ACTGGAGAGT TTTCTACCCG TAAATTAGAA ATATCCACGT ACATGGCAGG 1380
CTACTTCCTA GGACTCCAGA CTTCCTCTTG TTCTCTGCAT GGATCCAGGA GAGGTGGCAG 1440
GAGCTTCGGG GGTTGGGGGT GTTCAGATGT GCCGAGTCTT TCCATTCTAA TCAAAATGGA 1500
ATGTTTAACC AGAAGCCCTG CAAAATGGTG CTGAGCACCG TGGGGCAAGC TTGAGCTCAG 1560
ACTACAAACT AAACTCCGAA AGCACCCCCT CCCCCAACCG CCACCATCAC CAACCCCGGG 1620
AGAAATAAGT GTGTCTCTGA GACTGGCTTT CAGTGACATA ACTTGTAACA ATCACTCCTT 1680
AAGTGATATT TACATTTTCA GATAGTGGGA ATTCTGGGAG GATACTAAAT CCAATGTTCC 1740
CAGGGCAATC TGTTTACTAC CTTGTGGATT TATGGTCAAA ATCTGGTGTT AGCTAGGTAG 1800
ATAATTTCAA GTGAGGGTTA CAGCCCCATC CAGACCAAAG ACCCTGTCCC TGCTCCTTCC 1860
GGATTTTCCA TTCTAAGTTC AAGGTTAGAG TCAAGTAGCT CATGTGGAAC TGGGGAGAGA 1920
GACACCTTCC AGCCCCATTA TAAATTGGAA AGCAGGAGCA CAGGGGTTTT CAGTAGACGG 1980
ATGGTTCCTG CGTCTAATTT GTTTGGTTTT CTGGAAAAGT 2020