EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-17669 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:123268350-123273120 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr4:123271903-123271915CCAAAGTAAACA-6.74
Foxd3MA0041.1chr4:123272993-123273005GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:123272997-123273009GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:123268530-123268542AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr4:123272708-123272720AAACAAACAAAC-6.32
Foxo1MA0480.1chr4:123272175-123272186TGTAAACAGCA-6.14
Nr2f6MA0677.1chr4:123270902-123270916AGGGTCAAAGGACA+6.05
PAX6MA0069.1chr4:123269647-123269661TTCATGCATCACTT+6.08
PHOX2AMA0713.1chr4:123269186-123269197TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr4:123269186-123269197TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr4:123269186-123269197TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr4:123269186-123269197TAATTTAATTA+6.62
RXRBMA0855.1chr4:123270902-123270916AGGGTCAAAGGACA+6.21
RxraMA0512.2chr4:123270902-123270916AGGGTCAAAGGACA+6.05
TCF3MA0522.2chr4:123268514-123268524AACACCTGCT+6.02
TEAD1MA0090.2chr4:123271106-123271116ATGGAATGTG-6.02
TEAD4MA0809.1chr4:123271106-123271116ATGGAATGTG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02563chr4:123232649-123354875HFSCs
Enhancer Sequence
TTTGCAAATA CTTTCACATT ATATGAAGTG TTTTTCACTT TTAAAACAAT TTCAGCTGGG 60
TAGTGGTGGC ATACACACTT CCAGAACTCA GGAGACAGAA GCTGGCGGAT CTCCAAGTTT 120
GAGGCCACCC TGTGAGCTTT GGGACAGCTA GGGATACACA GAAAAACACC TGCTTTGGGG 180
AAACAAACAA ACAAAAATTG TCTTAGTTAG GGTTTTATTG CTATTATGAA ACACCACGAC 240
CAAAAAGCAA GACAGGGAGG AAAGGGTTTA TTGGGTTCCC ACTTCCACAT TGCAGTGCAT 300
CACTGAGGAA GCCAGGACAG GAACTCACAC AGGGCAGGAC CTGGAGGCCA GGAGCTGTTG 360
CCCTACCCAG CCTGTTTTCA TATAGAAACC AAGACCACCA GCCCACGGAT GGCCTCACTC 420
ACAACGGGCT GGGCACCACC ACCACCCCCA TCACTAATTG AGAAAATGCC CTACAGCTAG 480
ATCTCATGGA GGTATTTCCT CAGCTGAGAC TCCTTCTCTG ATGACTCTAG CTTGTGTCAA 540
GTTAACACAA AACCAACCAC TACAAACCCA TTTGTGTATA TTCATTGTAC TGTTACATTG 600
AGACATTTTC TTTTAAGTTA TGTTTTCTCA TTTTCTAGAT ACTACCACAT ACCACGAGCA 660
TATTCAACTT CTTTCTATCT CTATCTATCT ATCAACCTAC CTACCTACCT ACCTACCTAC 720
CTACCTGAGA CCAGATCTCC GCTAGAATCC AGACTACCCT GGAACTTACT ATGTAACTCA 780
GGCTGGCCAA TACGGTTTGT TAAAAAGATC ATTTGCTCTC CCTCTGGCTT GATCATTAAT 840
TTAATTATAC ATCCCAGCCC TACATCCTTA GAGATGATAC TGACCACAGT GGGCTGTATC 900
CTCCTGCATC AATTTTTAAA ATGTGTCACA AACAGGGGTG CAGTCCAATC TTGATCAAGG 960
CATTTCTTCA ATTGAGATTT TCCACTTCTC AGACTACCCT AGGCTTGTGT CAAGTTAACA 1020
CCTAAAGTTT ACAGCAACAT TTTTTAACAA GTTTCCCAAA CAGCCCAGCA CCACAGGTCT 1080
AAGACTTGAG ACATTGAGAC TCAGCCAGGC CAGGCAGTGC AAGAGCTGAG AGGAAGGCAA 1140
GCAGCCTGCA GCACGCCAGC CCTGCGGGAC TTGGCTCACT TTGTCTCAAT AAAGAACAGC 1200
CTACCTGTGC CCTGCTTCTC TACCGAACGT CCTCAGGGAT TATAACCTTT AAATTTTATG 1260
TTTTAGTTTA CAAAGTAGCA CGTTTCTTTA TGGATGTTTC ATGCATCACT TAGTTTTGTC 1320
TGAGCCCACC CCCCAGTCCC TTCCCCGAAG TATATATTTT TGTAGATAAT GTCTACAAAT 1380
CCTTCCGAAG AGAAGTCAAC CTTTGCGTGA GTACTAGAGT ACGGTGACAA GTGTCAAATA 1440
GGCTTGTGTG TGGCGATATG CTCGGGACAT CACAGTGACG CTACATACTG CATTCATACA 1500
GCACACTGCT TTCTTCACTT TGTGTATCTG GAGCAGCTTC AGGGAGGTGC TGGAGATAAC 1560
GAAGCTAAAA GCCCCAAGAC CCTTGGGTGT GCTACAACTA CCTGACTCTA ACAAAGACCA 1620
AGAAAAGCAC AATTTCAAAG TATGGCATAT AAAGTGTACT ACTAACACCG TGAGAGGAGA 1680
CAAAAAAACT AACCATAGTC AATCTAAATC ATTCTGAATT GTCAATCACA GCAAAGCTAA 1740
CAGACTTAAC TAAGTGCTTA ATATATGTGC CAGGCAATGT CCTTTAATAT ATAACTTAAA 1800
TCATTTCTAT TTCTATTCAT AAAGGCAAGA GTCTTCATCC CCACCTTATA GAAGCAGAAA 1860
CCCAAGACTT AGAGAGATGG AGTAGCCTGC CCAGGATCAA ACAGTTCCTC AGGAGTACAA 1920
CTGAATGCAA ACCCAGCTTC CTTCAGCTCC CACTTTGGTG CTTCTCCTAC CAATTCCATA 1980
GCTTTCCAAT GTGCCAACCC TATCTATCCT TCACCCTAAG GCCTTCCAGA AACCACACAC 2040
AAAGGCAACT GAGTGGCACC CAAACTGCTG TGGGCATAAG TGGTTCTCAG AATAATCAGA 2100
GCAGCATGGA GGAGGCAGGA GAACAGGAGG AATACGAGGA AAGACGACGG TGGACAGCAG 2160
GAAAGACGGC TGTGTGCAAG CTCGCCTTGC TGCTAAACAT GAAAAAGAAT GAGGGCAGGC 2220
AGTCCATGGT CAGCAAAGAC TTGTCAGTCA AAACAGTACA TCTGTCCCCT GGAGGTTTCC 2280
AATTGTCCCC CATAAAGAAG CTAAATTATT CCTTAAGCAC TGTTTAATCG TTCTCTATAA 2340
GTTCAGTGTG GTTTAACTCC TTATATTCCA TCTCCAACAG ATGCCTAGGA GACCCTAGAG 2400
AGGAAATAGA GAGTCAAGGG GTAGCTAGTG CTGGGGATAG TGGTGCACAC TTAAATGTCA 2460
GCACTGCGGA GGCAGAGGCA GGAGCTCAAG GTCCACAGAG AATTCCAGGC CAGACAGGGC 2520
TGCATAGTAA GACCCTATTT CAAAAGGGGA GGAGGGTCAA AGGACAGGGC CGTTGATGGA 2580
AACTTCTGGT AAGTATGGAT TACAAAAGCA CCTTTCCAGT CGGAAGTTTT ATGCTAAAGT 2640
CACAGGCCAC CTGTTCCTCC AGCTTCTCAA CCAGACACCT AATTCATGCC CTGGCCTTGC 2700
TGCAAGAAGA GATTCCAAAA GAACATTTCA CTCCTGAGGG TCAGGCCTTA AGACTGATGG 2760
AATGTGCCTG GTAAAGATGA GGGAAGTCTG GGCAGCTGGA AGCCTCCACA GGGGAATTCA 2820
GTGAGGCCAG CTGCTTTCCC TCAATCAGGA GGAGAATTTA AAAATAAACC TCAGTGGCCC 2880
TCATGTATTA AGAATTTTTT TGGGCAAAGA ATGTTGCCAA ATGCAGCAAC TATTTGCTCC 2940
CGAGGGGTGA AGAACAGAAC AGGAAAAAGA AGAAAATGCT GAGTACCCAT TCAAGGAGTA 3000
TGCCAGACAA AAAGGCAAGG AGAAACCCAA GTGACTTTGC CAGGAGCACA ATATAACACA 3060
TATCTGTTTC TTATTCTTCA GATTTTAGGA GGAATTTAAT GCAGGAATTC TCTAAAGTGT 3120
TAAGATTGTG TTCTCTGTGT TAGAATGTCT CTTAAAAGAA CACTAACAAT GGAACTGTCA 3180
AATAGTTCAC TGGTCAGCTC TATGCTCTTC CAAAACCTTC CTCCACAGGG ATTTGTAAAT 3240
AAAAGCCTGT AGGAAATAAC TGTTCCCCTG ACAGCCTCCA TTCTATGGAA AACCCCGCCT 3300
CCACATCCCC CCACCATTCC CCATTTCTCA GCCTGACTGA AATAACTACT ACACAGCTTC 3360
TGGAAATTAC CATTTACTTA TTCAGTGGGG AGCTTTATTG CCATGGCAGT GCAGCTTTTC 3420
TCTGGAGCCA GCTGACTACA GCTTTAGCAT TATGTTCATT CAAATGCTTC CTGAAGCTTG 3480
AGGGTCACTG AGAGCTGCCT ACAGGTACTT TAAAGGGCAC TGGCTCTCCC ATTTACTAGA 3540
GCTGCTGGTC ATACCAAAGT AAACAGTGCG GAGTAACCGA GACACTTCTC CAAAGTTATC 3600
TGTTGGAGCT GACTGTCACC AACAGCAAGT GACAGTGTGG GTGAGTCAGT AGTAGAATCC 3660
CCACAGCACG TAAAGGCCTG GGGCCCGGGG CCCAGCAAGA GGGAGCAATG AGTGTTATAG 3720
TCCTGAATTC CCCAAGAACA CAGATACCTC TGCCTCCACC ACTACTTCTG CGATAGAATG 3780
TGAACCATTG GGAGCCACAG GTGATGGCTC CTAGTGATTG CTCTCTGTAA ACAGCAGCAG 3840
CCAGGAACTA AGGCAGTCCT CTGCACACAA TCATCCAAGT GGAACGCTCC CAGAGACACA 3900
GGAGCTAACT GATGACAGAA GACTCTAAGG CCACCTAGAA AACTGACAGG ACATAGCCTT 3960
TCCTTCAGAG CATGCTACTT GCTTGCCATC AAAGCCTTAC CTAGAGGCAA CCCTTTGTAA 4020
GACCTTTTCT GCAACTGAAC AGAGGGCCTG GAAGGTGGAA ATGGCTGTTC CGACTAAAAG 4080
CGTAAACTGG AAAAGACTAT ACAGGTCCCA AGACTCCTTT AAAGATTGCT GAACACAGGG 4140
CAGAGGTGGT GTACACATTT AATCCCAGCA CTAGGGAAGT AGAGGCAGGT GAATCTCTCA 4200
GTTTGAGGCC AGCCAGAGTC ACACAGAGAA ACTCTGTCTT GAAACCCAAG GGGGAAAAGA 4260
AAAAAAGCCT TAGGACCTGA GCTCTGTCCC CAACACCCAA AAGGGAGAAG AATGACTTAC 4320
TACAAAGCAG CCAGGGCTAC ACAGAGAAAT CCTTTCTCAA ACAAACAAAC AAAAATCAGG 4380
AAAGATACAG TAGAATCATA AGACACATAT TTTGCAAGTC TGGCAAGAAG AAAGAGTAAG 4440
TGGTGCTGAG GTGTCTACCA CCCAATTCCA CCAAGGTGAA GCTATGCTGC CAGGGCACTG 4500
TGAACCATCT TCAAACTTCA GCTCCCGTGG GACTTTTACA GTGTAAGATT AATGTTGAAA 4560
TATAACATGT CCCTTACTTT ATATGATGTT TCAGTTCTGT TCTGACATAT AGACAAAGCC 4620
ATGGTTGGTT GGTTGGTTTT TTTGTTTGTT TGTTTGTTTT GTTTTGTTTT GTTTTGAGAC 4680
AGGGTTTCTC TGTGTAGCCC TGGCTGTCCT GGAACTCACT CTGAAGACCA GGCTGGCCTC 4740
GAACTCAGAA ATCTGCCTGC CTCTGCCTCC 4770