EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-17642 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:120552780-120555670 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFE2L1MA0089.2chr4:120553819-120553834TCTGCTGAGTCACAC-6.52
Nfe2l2MA0150.2chr4:120553821-120553836TGCTGAGTCACACCT-6.34
RESTMA0138.2chr4:120553498-120553519TCCAGTACCAAGGACAGAGCC+8.45
RFX1MA0509.2chr4:120555016-120555032GGTTGCCATGGAAACC+7.07
RFX1MA0509.2chr4:120555016-120555032GGTTGCCATGGAAACC-7.09
RFX2MA0600.2chr4:120555016-120555032GGTTGCCATGGAAACC-7.58
RFX2MA0600.2chr4:120555016-120555032GGTTGCCATGGAAACC+7.65
RFX3MA0798.1chr4:120555016-120555032GGTTGCCATGGAAACC-7.74
RFX3MA0798.1chr4:120555016-120555032GGTTGCCATGGAAACC+7.96
RFX4MA0799.1chr4:120555016-120555032GGTTGCCATGGAAACC+7.13
RFX4MA0799.1chr4:120555016-120555032GGTTGCCATGGAAACC-7.45
RFX5MA0510.2chr4:120555016-120555032GGTTGCCATGGAAACC-7.49
RFX5MA0510.2chr4:120555016-120555032GGTTGCCATGGAAACC+7.5
Enhancer Sequence
CATGCACATG CACGAATGCA TGTACAAACT CTGAGTATGC CAGTGCCTCA GCCTGCAGCA 60
TCCTCCTGGA TGGGAGAATC AGACAAGTAT GTGGTCACCT CGCCATGGAC ATTGCCCCAG 120
GGATTGCTGC TCTGAGAAAA GATCCCAGAA GGGGACCCCT GTTGCCCTAA GTAGAATGGC 180
TTGATTGCCT GTAGAACTTG GCTATGAGGA GGGATTCTTT TCCTCAGCCT AGCCTTTGGG 240
GCTCTGGATC GTCTCTTGCA AGAACCCCAC CCTCCCAGTT CATGAGTAGC CTATGCTGGC 300
TGTAGCCCTG CCTGATCCTA TTTGTTCCTG AGCCCAGCTC ATGTAATGTA ATGTCTAGTC 360
TGTCACACCA GTCCCTCTGG TCCCCTGCCT GTCTGCCCTC TTGTAGTTTA TCACTATGCT 420
TCCCTAATGC AGATCTCTAA AATCCCACTC TGTGCTTTAG AGGGCTAGTT CTGGCTCCAT 480
AGCTTTCTGT GGAATTGTCA GAAAGTCACT TTCCAGTCAG GGCTGTTTCC TCTTCAGCAA 540
AATGGAGCTA ACAATGCCCT CTCCCAACTT CTTCTGAGAT CTGTCAGTTC ACCGAATTGT 600
GGGAACAATG AAGGGTGAGG AGTTTGGGGA TCCTAGGACC TATGTAAAAT CTGACCAGAC 660
ATTAATCAGG CAGATCCACA GAGGGTCATG CTGGGCTGAA GCAACCCCCT TCTAAATGTC 720
CAGTACCAAG GACAGAGCCC TTCCTTCCTG TGCTGGCTGA GTCAGGGGCT TGAGACTTGT 780
GGAAGATGGC AGAGTGTAGC TGCAGGCCAT GGCTGCCCAT CTTTTGTATG TGATGGCACA 840
GAGAGAATGG CTCCTGGAAG CTTTCTCCAG GGAACACTGA ATTATTGCAA CCATTTGGTC 900
TGGTTTTCTA GAGGGAGCAC CATAGTTATT CCCTGGTTCA GCAGGGGCCT AGGCTAAATG 960
GGAACGAAGC CAGTGGGAGG ATTTCGCTCT GAGTTTGCAA GACCTTTCCC CCTCGAACTG 1020
AAGAAGCCCG AGTTTAATCT CTGCTGAGTC ACACCTCCAA GAGAGGAAGT AATGGGAAAG 1080
GAGGGGGGTG GCATGTCAGC AGACAGGCAG TCTGAGGGCC TCCTGGCTAG CTCCAGCTCT 1140
TTAGCATCAG AACCCAGACT CCTCCTCACT GAAGTGATGG AGGGGCCTAG AGAAGTACAT 1200
ATCTCCGACC CTCCAGGAGT CCCCCACTCA TGGGTACTCA CACTGGGTTG GGCAAGTCTT 1260
ATCTAAGAAG GTGATTTCAC TTTCAAATGG GTCAGAGCTT TCCCAGGCTC CAAAAGAATG 1320
TGTGTTGAGG GGGTGAGGAT GTGAGGGGGA GGCAGGGTGA CTTTCAGCCC CCATGGCCAT 1380
CTGTCTTCTG AGTTAGAGGG GAGTCGGCAG TTAGGAGTCA GGGACAGAGT CCCATGGCAG 1440
GTCACACGAC ATGGGTGGGT GGACATCATG TGTAGTGAGT AGATGGGCTC AATTCTAGAT 1500
GTTAAAGATC ATATATATAC AACCTGTTTG ACAGTGCACA CTCTATCCAT GCAAGACCTG 1560
GAGGGCCTGT GTGACTGTGT ATATACAGAC ACATGATATC ATACATGAAG TTATTCACAT 1620
ATATGATAGT CAGCACTCCT GTGTGTCTGT CTTATGCGTG TGTAAGAAAA ATCTGTCCAA 1680
GCTAAAATGA CTCTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGAGA ATGGTTCCTG 1740
GATGTGCTGG CTATTCTAGC TATCTAGACT AGATAGGCCA CATTGAGTTT AGAAGCCATA 1800
TTCCTTGGCA CACTGTCCTG TTCTCTTTGC CTCCCCTCCA CCACCCTATC TGCTAGAGTT 1860
TGCCCCCTTG GCCTTCTCTC ATTCAGTGGG GACTTCCTGA AGGGTAAGTG GGGCAAAACC 1920
TCCCTTTCCT AGGCTGGGGA CTTGACTGTT CCCTCCATAG CCCATTGGCT GCCTTCCGGG 1980
ATGCGTGTGC TGCTACTCTG CCCTAGGCAT GCTTGTTGGC CACTCCACTA ACAGTTTTCT 2040
TGGGCCTGTA ACTGGTGGCA GCAAATGGCC CATTTGGTAC AGTCCCTATC TGAGTGCCAC 2100
TTCCCTCCCC ATCAAGTTGC TCAGCCATCA AGCTTTAGCA GGGGAGTCCC TGCAAAAACC 2160
CCAGCCTGTC TTCCCCCAGC CCCACCCCCG CCCAGGAGGA GAGCTGTCTA GAGGGACCAC 2220
ACTGCAATGC TAAGAAGGTT GCCATGGAAA CCCAGGCAGG CTGGTGTGCT ACTCAGAGAG 2280
GGAAAGTGCC CTGTGTTTCC TGCCAGGCTG AGGGGGGTGC GGGGCTGGGG CCCCTGAGCA 2340
GAAGCTACAG AGACAGGGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TCGGGGGGGC TGGGGAGGTT 2400
CTTCTGTGGA CCTTCTCAAA TCCAACATCA GTCCTGGTGA AGCTAGTTAC CCGACTCTGA 2460
CCTTACATTC ATGATGCTCT CCAGCAGGCT TACTTGAGAA AACAAGTTTC AAATGGCCAG 2520
ACTTGTAGTG GCGCAGCAGA GGGCTTTGGA GTCTGGTCAG ATATCTAGAA GAGAAAGTAA 2580
ACCCGGAAAT CCTAGAACAA ACTTTCCAGA AGTGAGAGGA AGAAGCAAGT CTTAAGTTTT 2640
GGGGTTCAAG ATGAAACAGA ATGGGAAGGT AGAGAGGGGG AGCCTAGTGA ATGGTGAGGG 2700
CCCCAAGACT ACAGGGCTGT TTACTTCCAG TTGAACTTCT ATGTCCCTGG GCAGCTTTGG 2760
GGTCAGCTCA GTGGTGTCCC AGCCTTGGCA GATCCCCACC TGCCTCTGTT CAGAGAATCT 2820
CTTTGGTAGC ACTCTTCAAG AAGCCTAGGC CATGTTTTGA CCTTTTCCCC CCTCTCTCTC 2880
CTTGGGATGG 2890