EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-17253 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:90104090-90105620 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr4:90104828-90104838TCTAATTAAA+6.02
GFI1MA0038.2chr4:90105063-90105075CAAATCACTGCA+7.22
LMX1BMA0703.2chr4:90104298-90104309TTAATTAAATC-6.02
Lhx3MA0135.1chr4:90105135-90105148GGCTAATTAATTT-6.41
POU4F1MA0790.1chr4:90105158-90105172AATTATTTATTCAT-6.19
POU4F1MA0790.1chr4:90105155-90105169ATGAATTATTTATT+6.32
POU4F3MA0791.1chr4:90105155-90105171ATGAATTATTTATTCA+6.04
RFX1MA0509.2chr4:90104729-90104745AGTTTCTATGGCAACC-6.08
RFX1MA0509.2chr4:90104729-90104745AGTTTCTATGGCAACC+6.09
RFX2MA0600.2chr4:90104729-90104745AGTTTCTATGGCAACC+6.53
RFX2MA0600.2chr4:90104729-90104745AGTTTCTATGGCAACC-6.6
RFX3MA0798.1chr4:90104729-90104745AGTTTCTATGGCAACC-6.38
RFX3MA0798.1chr4:90104729-90104745AGTTTCTATGGCAACC+6.52
RFX4MA0799.1chr4:90104729-90104745AGTTTCTATGGCAACC+6.61
RFX5MA0510.2chr4:90104729-90104745AGTTTCTATGGCAACC-6.58
RFX5MA0510.2chr4:90104729-90104745AGTTTCTATGGCAACC+6.62
RUNX1MA0002.2chr4:90104510-90104521CTCTGTGGTTT+6.14
Enhancer Sequence
GCAGAGCCTC TCCTATTTCT TGAGAAAGCA TTTCAGGTAT TTGCTCCTTG GCTTGTGATA 60
TTTGAAATAT AAATTCCAAA TTCGTGGCTT ATCAATAAAA ACACATTGAC TTTCACAGAG 120
GTTGTCTGGT GAATTCTAGT ACAGGAGGAG TAGCAACATT GACTTACATT GTGCTCACAG 180
CTGATAAACT GCAGTTGCTA ACAGTTTGTT AATTAAATCT TATTTAAGCT TTGTCCTTCC 240
TGCTTAGAAA TAGGAACTCT TAACATTTGA GGCTGCAATT TGCATGCATC AGCCAACACA 300
AATGCTGAAC AAAGTGCTTG TTTAGGTAAT AAGATAAGGA GGTGCCCTCT CCACTTCTGA 360
GCTGTAACCG CCTCAAAGGC AACATTTCCC ATGATTCCCT GCTGCTGCTT GTTCAGGCAG 420
CTCTGTGGTT TGCGCTGCAT ATTAATTTCT GTCCGACACG GGAATTCAAT TTGTACTGTA 480
CATTTCATTT CTTCACAGAT TTAGATTTAT TTCATGTTCT CTGCTTTTAA TTAACTCTCT 540
GGCACAGCTG CTGGACAGGA TAGAAAAACT CATTGCTCTC CCTGTGTTAT GAGTACACTA 600
CCAATCATTT GCCACTTAGA TGGTGGTGCA GGAGCTATCA GTTTCTATGG CAACCAGAGC 660
CGTGGTGATT GATTCTTTGC CAGTATGGCA TCACCACAGG GAGTGCAGCT TGTGATTTTT 720
GTATGCTCGC AACATCCATC TAATTAAAAC AGGATTATGG AATCATCCCA GTGCATGTTC 780
AACAACTACA CTGCAATCCA TTCATGTAAA TGTCAACACA ATTAAATACA ATGGTCAGAA 840
TGTTTATGAA GAAATAGTAG TTTAAGTCTT TGGGAAGAAA GTGCTCAAAC ACCCGGTTTG 900
GGTTATATTC TCTTAAATTG TAACCCTCAA CATGCATAAT CATTTCATAT ATGAAAATCA 960
TAAGAAGACC GGCCAAATCA CTGCACTTCA ATTGATACAA TACTGGCCGA GTCTAGAATG 1020
TTATACTAAG CTTTTCTGGG AATTTGGCTA ATTAATTTAC TTTCTATGAA TTATTTATTC 1080
ATCAAGAGCT CTTAATTCAT GTGATTGATT TCTCTTTCAG TGGCGTTGCT CTTCTTTCTC 1140
CTAGAGGATT CCTCAAGTCT TTACCAGTTG TGTAGGAATT AGGAAAGTTT TCCTATCAGT 1200
TGAGATGAAC GGTCACAGTA ATGTGTGGAC GCTCCCAATG ACGAGACTGC CTATGGGAGT 1260
CATGAAGAGA TAAATTGGAA TGCAAGCCCT TAAGCTACTT GTGAGCAGTA TATGCAAAGT 1320
GAAACGGAAG ACCAGAGGGT GGCAGATCAT TTACCAATGT TGGTTAATAC AAAACAGGTT 1380
TTTCTGGACA AGGCTGACAA GAATTGTGTT AACATGAAAA ATAACAGCTG CGCTGCATAA 1440
TAGTTCCATG TCCATCTGTG CTTCACTCTG CAATGTGTTT TTGTGTTATA GAAGATGTGA 1500
TTAAGATGTA TATACGTATG TGTTCAGTAG 1530