EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-17231 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:87029980-87032750 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:87030960-87030978GGCAGGCAGGCAGGCAGG+6.1
GATA2MA0036.3chr4:87032546-87032557AGAGATAAGAA-6.32
Gata1MA0035.3chr4:87032546-87032557AGAGATAAGAA-6.32
IRF1MA0050.2chr4:87032187-87032208ACTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.09
IRF1MA0050.2chr4:87031059-87031080TCCAGCTTTCTCTTTCTCTCT+6.16
IRF1MA0050.2chr4:87031784-87031805AAAGAAAAAAAGAAAGAAAGA-6.34
Lhx3MA0135.1chr4:87030915-87030928TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr4:87030912-87030925AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:87030916-87030929AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:87030911-87030924AAATTAATTAATT+6.92
POU6F1MA0628.1chr4:87030913-87030923ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:87030917-87030927ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:87030913-87030923ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr4:87030917-87030927ATTAATTAAT-6.02
Stat6MA0520.1chr4:87031172-87031187AATTCTCAGGAAGAG-6.65
Enhancer Sequence
TGCTAGTGGT GACAATAGGG CTCCTCCATC CTCCTCCATT ATTGTAGGAA TAGACTGATT 60
TTAATCTATT CACCCTCCAG GGCCTTGCGT ACTGAAAAAA GCCCATCTTT CTTGAGAGAG 120
ACTGCCAAGT TCCTATACCG TACCACCTTT GACTTTGGAA ATAGCACACG ATTATAGGAG 180
CCATCTATGT TCTAGAAATG TCCTCAGGTC ATTTGAGTAT CGACCAGATT CAAAGTAAAG 240
CAGCTAGAAT TTGGGGCATT CCTGTTTTAT GGTCAATGGT GAAACCAGGT AGAGTTGCTC 300
CCTACCTGCC TCCCACTGTC AGCCTCTACT CAGTGGTTCA TGATTGGCTA AGAGCAAGGG 360
CATTTATGCC ATTTCTAACC CCACCTCCAG CTCTGTTGTT AAGGAAAATG CTCAGTGGTT 420
TAAGTGGAGT CCTAATTACT AAGTCTGATC CCTGCCTTAC ACTGGCTCAT TTTAACCTGG 480
TAAACTCATT AAACCCCAGC TCTTTATTCA GCCATGGGTG ACCAGAGTTT CATAATTTCA 540
ACTACGAGCA CTCAGTGATT GAAGGGGCCT TGAGTTCCCC TCATTCCTAT AGTTGCCCAT 600
CTGAAGAGTT CAATTACTAA AGTCAGAAGT TTATTCAGCT CGAAGAGAGA GCTCTCTGAT 660
CTGGCCTGAA TTCAACTAAA GGCTTTAAAG ATGAATGAAA GCAAACCGCT GGCTCCACAA 720
TTTCAAATGA CCCAGTTTGC TTTCACCATA AATCACCCAA GAGGTCTCAA AGGCAGACAG 780
TTTGCAGACA GGCCAGGTCA TCTCCAGAGT TAATGAGATG ACACGTGCTT TAAAAACAGC 840
GCTCACCTTC ACCAGCAGAT GCAGTGCCTC CTCCTCCTTA CGCTGAGAAA GGATCTGGGT 900
TTGAGCTCCT CACATTCTGA AATTTAAAAA AAAATTAATT AATTAATTAA AAGCAAGAAG 960
AACAATACCA CAGACAGACA GGCAGGCAGG CAGGCAGGCA TGCACAAACA CACACACACA 1020
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CAGTTGCATG CACACACATA CAAGATTGCT 1080
CCAGCTTTCT CTTTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTTTCTCT CTCTCTCTCT 1140
CTCTCTCTCT GCTTTCATTC CAAATTTCTG CCCAGTTAAT CACATCAAAG GGAATTCTCA 1200
GGAAGAGCTG TCTTTCCAGT GTTCTTACTG CTATTTTGTT CGTGTGAATG TGTAGATATC 1260
TAATAAATGG CTTCCCTCTT CCTATATAAA AGAATTTTCC AAATGTAAAA CTGGCCAGGA 1320
CTATCTGGTT TCAAATTTCA ATGGGTTCTC ATAAAACCTC TGTCAATAGT GAGTTCCCAG 1380
TCAGTGTTTT ACAACACTGA CAGCTTTGCA AATACTGTAA CATATGTAAC TTGGGCTGGG 1440
TCAATACATG GCGGGGAAAT CGGGCTGTGA GATGGTCGAG CTGTTCATTT TGGCTGTCTT 1500
TACAATCAAT CAGTCAGACT AACCGAGCCT GCAGAGACAC TCACTGATTA TTGAGAAAGC 1560
TAAAGCAAAT GCATTCGCCT CGCTGTCTGC CAAGGCTCAC TCAATAGCTA AACCTCTGTC 1620
AAGATGCAGA TGGGCACCAC CTTTGAAAAC TAAGGTTATT AGAAAAAATA TTCAGGTCCA 1680
TCTGAAAGCG AGCCTGTGCT TTGGCTGCCA AAGAGAAAAC AGAACAAAAT AAAACCAAAA 1740
ACCGAAAACC AAATTACACA AACAAATAAC AATAACCCGG AAAGAGAGAG AGAAAGTCAG 1800
AAAGAAAGAA AAAAAGAAAG AAAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGGAAGAAAG AAAGAAAGAG 1860
AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAAAGGGAA GGAGAGGAAG 1920
GACTTGGACA GTGTGTTCCA ATAAACTTTG TTGGGTACAT TTGCAGACTG ACCATCTTCA 1980
GAAACAAACG TTTATAGGCT TTGGTGACAA GCCATAAGCA AGGACTATTT CTGTGTTGTC 2040
CCATCTTGGG TTCCTTTGTT GTTTTCTTTG TGTGGTTTTC TTTTTTAAAC TTTTTAAAGC 2100
TTGTGCTTAT TTCAAACAGC TATCATGACA AATATATCTT CTGTCTATGA CCATATTCCT 2160
TGGAACACAC TCAATCTCAT CAGACATAGC TCCTAACCAA GAAGATAACT TTCTTTCTTT 2220
TTTTTTTTAA ATAATAGCGA GTTACAAAAG TAAGATGGCG ACTTCCTAAG TCCTTTCTTT 2280
TAACTTGCAG AGGCGCTGGA TTGCATTGTG TGAACACTGT TGCTGACTGC ACCGATGCTG 2340
ACTGCGTTCT TTATATCCAG CCAGCTCATC CGTGACTGTC GGGAGGAGAA GTGCTTTGTG 2400
TGAATTGTCT AATCCAAATG TCTCTGAGTT GCTAGGTTTA GGCCAAGACG TTCCAATAAA 2460
AATGAGCAGA GCCTCCCTTG GCTTTGCCCA CACTTGATTC AAATCACATC TGCGTAGAAT 2520
GAATTACCTT CACAATCTTT TCTCCTGGGG CCTCTCTGGT CATAATAGAG ATAAGAAAAC 2580
AAAAGCTACT TATCAGCACT TGCGGTTAAA GAGAAAAAGG AGAATTTAAG CAAAATAAAT 2640
CTCTTTGAGG ATGCTGTTTC CAACATCATT GAGCTGCCTT AAAGATGGTA GTGATTAAAG 2700
AACGGGTGGG TCACTAAGGA AATATGGGTA AAAGTGGGCT CTCAGAAATT TATAATGTTC 2760
ATTATTTATC 2770