EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-17018 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:54131000-54132560 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr4:54131417-54131427AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr4:54131417-54131427AGCAGCTGCT-6.02
RFX1MA0509.2chr4:54131515-54131531TGTTGCCATGGCTACC+7.32
RFX1MA0509.2chr4:54131515-54131531TGTTGCCATGGCTACC-7.32
RFX2MA0600.2chr4:54131515-54131531TGTTGCCATGGCTACC+7.24
RFX2MA0600.2chr4:54131515-54131531TGTTGCCATGGCTACC-7.4
RFX3MA0798.1chr4:54131515-54131531TGTTGCCATGGCTACC+7.39
RFX3MA0798.1chr4:54131515-54131531TGTTGCCATGGCTACC-7.49
RFX4MA0799.1chr4:54131515-54131531TGTTGCCATGGCTACC-7.49
RFX4MA0799.1chr4:54131515-54131531TGTTGCCATGGCTACC+7.65
RFX5MA0510.2chr4:54131515-54131531TGTTGCCATGGCTACC-6.61
RFX5MA0510.2chr4:54131515-54131531TGTTGCCATGGCTACC+6.8
TFAP4MA0691.1chr4:54132260-54132270ATCAGCTGTT-6.02
Enhancer Sequence
CCAGGGATCA CACTTGGCCC GTTGGGCTTG GAAGGAAGAG CCTTTCTCCA CTGAGGCAGC 60
TTGCCATTCC TGAACTGCAC TTTAACATTT AAGAAACACT TCCAAACAAC TCTCCCTGTT 120
TCGCTTCTTA ACATGTTTTG TGAAGTAGGT TTTAGTCCTG GTTGTCACTC CATTTTTCAA 180
GTGAGGACTT TGAAGCTCTG CAAAGTTACA GGACTTGGCC AAGGTCACAC AGCTGGACAT 240
CCTGGGTTAA GCTGGGGTCC ACCCTGGGCA GCTAATGGTA AAACCCTAGC TGATTTTGGA 300
TACGGTTCCT CCCTTTCCTT GTTCTCTGTC TCCTCGCTCG GCACTGCCTC CTTTTGGTCT 360
CTAGTATTTC AGGTCTCCTG TCAACTTTTT CTTGAGTTCT CATAAACATA TCTTCTGAGC 420
AGCTGCTTGG TGTCAACCAC TTCTTCTCTC CCAGGTTTAG TTTATTTTTG TTAATAGTCT 480
GCCCCATGAA TAGAACTATT GTGAAGGCGC CTCCCTGTTG CCATGGCTAC CGATGCCAGC 540
CATTGCAGCA GCTTATTGTA AGGGTAGTCT CCTTGTGCTA TCAGTCACTG GAGCTGCTGT 600
TCACCATTGT CATGGCCCAG GCCATAATGA GCATGCTCAT GTAGCTCTGT GGTGAGACCC 660
CCAATGTAGA GAAGCCCTCT CACAGATTTG TGTCAATTCC CTTTCAGACC TCAAAGTAGT 720
ACTGCTGCCT CCATCCACAC CCCAGTATCC TCAGATTGCT ATGAGTCACT TGAAAAGCCA 780
GGAAAGTCTT ATGGAGGGGC TAGATCTGTG CAGAGGTAAC ACCCTGACAT CAGGATTCAT 840
CTTTGACTCC AACCACAGAT GATTGATGGG TACGATTTTT TTTTTAATCT TTCAGTGGCC 900
TCCCTGGCTA CTCAGGCAAG TAGGTTACTT GCTGGTGGTG GCCCCCTTTT GATTCCAAAT 960
ACATCCACCA GATATTTTGG TGACCCTAGC TTTGGTCCAA ACAGGGATCT TTGCCTTTGA 1020
GATACTATGA CCACTATCCT ATAACTGTGA TTTCAGAGAT CAGCAATAGT TCACAAACAA 1080
TTTGTGGAGA TAACACTGAA TTAACCACTG TTTATTGTAA CAAGACAGAA CAAGGTGTAA 1140
ACAATAGCCA TTGACTAAAG CCATGGGAAA AAAAAAGCTG GGTTTATGCC AGCTCCATGG 1200
TAACAGCAAG ATGTTAACAC CAAACACAGG GACAGGAAAA CCATGACCCT CAAATAAAAG 1260
ATCAGCTGTT AACTGAACCA AATTCATCAC AACCTCAAAC ACTGCTCTTC TTTCCCCATC 1320
TTGCTGCTGC ATTGGCAGTA TTGTCTTGAC TCGTTTGATC CCTCAGTAGT ACTATGGGGG 1380
TAAGTGTTAC CACTACACCT ATATTATAAG TGTAGAAAAT CAGAACCAGA GAGAGATTGG 1440
GCATAATGCC AAAAGTCATG GAGCTAATAA GGAAAGCAGA TAGGGCTTAA ATACAAGCCC 1500
TCCAGTGGCA AACATGCCTT TGCTTGGTTG ACTAAGCCAT TAAATATGAT GGTATACTCA 1560