EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-16964 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:46148780-46151250 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr4:46150587-46150604TTAAAATAAACAAAGAG+6.01
Lhx3MA0135.1chr4:46149499-46149512AAATTAATTTTTC+6.11
Nr5a2MA0505.1chr4:46149540-46149555GCTGGCCTTGAGGTT-6.23
Enhancer Sequence
CAAAGGAAAA TGAGTGGAGT AAGGAGGCAA GTGGAAGGGC TCCTCATACA CAGGAAGAGC 60
CCTTCTGAGG CAATAGCACT CATCTTCAAA GAAACATGAA CTAGGAAGTA AGCCAGGGGA 120
AAACAAAACA CAGGGCAGCA CATGAGAGCA GAAAAGCACT ATGGACTTCC CAAATCAACC 180
AACTCCAGTG TTTCTGTAGC TTTGTTTCTT TTGTTCTCAA ATCTCAGAGC CAAAATTTCC 240
AAATTGCTAC TGTGGCCAAA TCTTACCAAA ATGGATACAC TATAACCAAT GCAGTCTTCT 300
TTGTTACATT TGATTTACTT CTGTGGCTAC TTGTGCCGAG ATGCCTGCCA GTTCCATATC 360
TGCACAGGCT CCAGGGATCA AACACACGTT GTATTGTCAG GCTTGAGTGG CAGGGGTTTG 420
CCCACAGAGC CATCTTGCCA ACCCCTATTT TTTTTTTCCA ACAAAATTAA GAAAATTTTA 480
TTCTTGAATC TTTTTTACAG TCTAGTCTTT ATCCACCTTC CAGTCTGCCC TCTGTTCCTC 540
ATCCCACACC TTCTCTGTCC CCTGCCCAAG AGAATGCCCC CACTCCCTGG GGCCTCAAGT 600
TTCTTGAGGG TTAGGTGCAT CTTCCCTCAC TAAGGCCAGA CCACACAGTC CTCTGCTATA 660
TATGTGTCTG GGGCCTCCTA TCAGCTGGTG TATGCTGCCT GGGCCAACCC CTAGTTTTTA 720
AATTAATTTT TCTGAGTCTG GGTCTTGCTA TATAGTAGGG GCTGGCCTTG AGGTTCTAGT 780
AATCCTAAAT TTAAGATTCC CCTTGCCTCT ACTTCTAGAA TTCGGGGCCA CTATACCAGG 840
CCCAATGCTT TGCCATCCTT TGAAAGTCAG CAATCCACTT TGAACTACAC TCACTTCTTA 900
TCTGATTTAG TAATGGTTAA GGTTTGGTTT CTAACCTTGG ACCAAGGTGC ATATTTTACA 960
TATCAAAGCA GACATGGTCT TCAGGTTCTC CCAGTATCCC ATAGTCCCTA TCTGGTATAC 1020
CCTGTCCCAA CCCTGAACCT TCCCCCAGAG GCTCCTCTCT ATACAATCCA GACCTTTTGG 1080
CCTCCTTGTT GGGCCTCCTT CCCTTCTTTC TTTGCTCCTG TGTTCTTCCC TCCTCCACCC 1140
CCATCCCCAT AGTGACTTCC CTGGTCTCAA TCCTGGTAGC GGTCAGTGAA CTCACCTGAG 1200
AGCAGATTCC CAATAAACCC ATTTTTAATA TATTCTCATC TGGCTCGAAT TGGCTCATTT 1260
CAGGCAACTG GAGCCAGATG AGAATATATT AAAATCCTTT CTTGGAGGAC TCTTCCAAAG 1320
TCTTACTCTG GATAATCTGT CCTCAATAGC AAAGGATGAG TGATAATTTG TACCACTCGC 1380
CCTTTGCTAT TAAGTCCGTC AGACTACAGT ACCTGTGATC ATTCCTGAGA GGGTCACTTA 1440
GGGCTTCAGT ATCCTGAACA CCGTCTCGTT GTCCCATGTA CAGACGGTGA CAAATGTTAA 1500
TTAATACAAT ATAGTACTTG CTGAATGAAA TAAAGCAAGA GTTGAGGAGT CAGAGAAATA 1560
ACTCTGTAGG TCCCTGACAG TTAGTCATGT AAATTTCAGA GCAGAGACCA ACAGATAAAG 1620
AAAATAAGTC TTGATTCCTA AAATGTGAAC AAGCTGGACT TTAGCAGAAG AACATGGTGG 1680
TTTACACACA ATGACGGGAA CAGAACCCAA GAAGCCATAG TTTGGAATTC GCAGTGGAAA 1740
TTCCTGGAAA GATGGATTGC TTGCATGTAC GAATAAATAA ATGAAAAGAA TAGAAAAACG 1800
ATAATCTTTA AAATAAACAA AGAGAAGTAG AGCCGGAAAG ATGGCAAGAT GGCTCACTGG 1860
TTAAGAGTGC TTACTGCTCT AGCAGAAGAC CCGGGATTCA GCACCCCCAC CCCGCTCCCG 1920
CGCACTCTCC TCCTTGCTCA CAGAGAGTCT GAAACTCCAG TTCCAGGATG ATGTACAGAC 1980
TTACAAATAC ATAAAATATT GCTTTAAGTC TGTGAAGAGT TTTAAGCATA GTAAATAAGT 2040
TTGACTAGAC TTGCTCTCAG AGTATAGCAG GCAGTGTTAG TGGATAAACT GTAACACAGG 2100
AAGTGAAGGA GCTAATGACT CCTCCCTAAA TTCTTGGATT TAAGCAAACT ACCGAAACGG 2160
CCATTTACTG TAACAGGTAA GACTGAAGGA AAAGTTTGGG CTAGACCATG GACAAGACAG 2220
TTTGGTGTCC ATCACAGGGC AGAGGACGTC CACATACTGT ACACGTGCAG AGGAATAGAA 2280
CAATTGGAAC CACACCGATC AGTAGCTGGG GCGTCCGTCA GCTGGGAGAA GTAGGCAGTA 2340
GGACTACAGT GAGCAGATTC AGCCGGACGG GCCTGGATTC CCTACCGCTG AAAGTGGCTT 2400
GCCCTCCTCC CCGCTCAGGT CTCCCGAGGC GTCTACAGCG GGATGGCGAG AGAGAAAGAG 2460
AGAACACCTA 2470