EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-16856 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:41522140-41524680 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:41524662-41524674GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:41524666-41524678GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF1MA0050.2chr4:41522561-41522582AAGATGAAAGTAAAACTTGAA-6.33
RREB1MA0073.1chr4:41522982-41523002CCCCCACCCCCCACCCCCCA+6.63
RREB1MA0073.1chr4:41522981-41523001CCCCCCACCCCCCACCCCCC+6.69
Enhancer Sequence
CAGTGACTAT CAGGTCAGAA ACTTTGTATG AATGACTGAG TGTTGAAAGA ATGATGGAAT 60
ATGGTGGTGG TGGTGGTGGG GTACCTTACC ATGTTTCCTC ACAGCAACTC TGGGGGAAAC 120
AGGAAAACCT TCTGAGAAAA ATGTGAGCGT TTAAGGTATG AACAGACACA TACGAATCCA 180
AAATGGAGAA TAAGAAATAA CCAAAAAAGT GAGAGGATGG TGAAGTCAGG GTAGTTCATC 240
AGCTGCTGTC AGCCATGTGG CCTGCTGCTA CAGTCAGTGG AGAAAGCACT GAGACATGGC 300
CTTCAGATGC AGTGATTAGG AATTCATTAA GGACTTTGCA GAGAACAACT TCAGAGGTAA 360
AAGCGAGACT GTGAACTAGA AGGCAGTGAA GACCATATGG GCAAGGATAT ATTTTTTTAA 420
AAAGATGAAA GTAAAACTTG AATATATTAA GCCCTGTGGC AAAGGATCCG GATGGAGAGA 480
AGTTGAAGAT AAAGGAGAGA AAAATTGAAT TATGACTTGA TCCAAGACTC CGAGAAGGTG 540
GGATGGGATC AGCAGAGACA GAAAGAGGGA TGCTTTGAAA CAAGGGAGAA AAAAGGGCAC 600
ATGCCAACGA TGATAATTTT GAGGTTTCGT GGCAGGAAGT TGAGAGGGTT TTCTCTTCTC 660
TTCCCCTAAT AGTGTTACGG AATTCCTTCT GGAAGTGATA ACTAGAAAAC AAATTTTGCC 720
AATGGCTGTT CCATTTTGTT ATGATTACAG TCATGCTATT TTCAGAGTTA TGGTCTGAGG 780
TTTGTCATGC GCAATTATCA GATTACAAAA CAGCTGTGAG TGTTTGAGGC CAGAACTCAG 840
TCCCCCCACC CCCCACCCCC CATTCACTGT GGAGCCTAGC ACATTGTTAG TATTTGGGAC 900
ATGCCAGGTA CTTGAATAAT AATGGCATGG GGCTCTCGGG CTTATCATTG GGCTTTGCAG 960
CCTGCAAGCC GATGATGAAG AGTAATGTTG GCTCCTTGGC TCCAGCTGTG AGCAAGCCAC 1020
ATGAACTTGT TTCTGCCGGT TAGGAATGCG GATGGCGTGC TCAATCTTCC CAGTTCTCGA 1080
GCACTGACAG GGTGGTGTGG GAGAAGCAAA GAATGTAGCT GTTGATCAAA CTTTAGTTCC 1140
ACTCCTTTGA GTTGTCACCA TGCTTTGGAT TTGCTGGGGT TTAATGTCCT TCATTTATCT 1200
TGCCTCCCTG CTTTGCGAGC CCTTGGGAAT AGGAACCAGC TCAGTTTTGT CCCCTTAGCT 1260
GTCATCCAAG GCCCTGTATC GTGGAGCCTG GGTGAAATGG TTAGTGGCCG AGTGAATCAG 1320
GACATACTCT AAACACAAGT TCTTTCTGCC CACAGAAGCT GTTCCTGCCA CCCTTATCCT 1380
CACGGAAGCA GGCCAATCCT GAGCACCAGA AGGAACCCTG CCTCGGGTGT TTAGCTTGGG 1440
TTCTCCTCCC ATTAGTACTT ACCTTATATC CATCTTCTTA TTTACTTGTT CTTTCCATGT 1500
ATCATGTATT AAGATCCATC CCCGGAATAT AAATGGACCA AGTAATCTGT GGGTCCTTGA 1560
ATAGACAGAC ACTTATGTGT ATACCTCTTG CCTTCATAAT AATGATTTTT ATCCTCTCTC 1620
CCCAGAGTCC CCAAGCCATT TCTTTTACCA TTATAGGCTT AATAAATTCT TAGGAATGTG 1680
TATAGGTGGC TTTTTTTCTC CCAATAGGTT TAGAGCCATA TAAACCCACT GTCAACTGAA 1740
AATATTGTAA GCCAAATGCA TTTACTACAC ATCGCTTACC AAGCATCATA GTTTAGCAAC 1800
ACAGTCCATT GTAGAGTGTG AGCTATTCAC CCTTAAGGTC GCTTAGCTGA CAGGGAGCTT 1860
TGTCTCATGG TTGCTGCCTA CCATTTCAAG AAAGTATACC ACATAGCACT GGCATAGGAA 1920
GGGAACAAAC TTTCAAGTAT TGCCTGTGCT GAATGCATAT CACTTTCATC ATCATAGGTT 1980
GCAAAGACAA GTCAGAGCAT CATAAGTCAG AGGCTGTCTA TAATGGAGGC AAGTTCTTTG 2040
AGTTGTAAAG AACAGAGCTT CTCCCAAGTT GGCTCAAAAT AAGACAGGCA GGAAAATACA 2100
CAAAGTGTCT ATGTGGAGGG CCGTGTATGG TCTCATAAGC GTATAGCTAG CCCAGCCTGG 2160
AGTTGGAAAC CATTCTGCAG CAGATGTCGA GGCCCGTGGC TTTGACCTCA TCTCAGAGCC 2220
TTGCTACTTC TTTTAACAAC TGCTCTTTTT CCCAACCAGC CAGTGTTTCT ATGGTCTCTG 2280
CTCCCTCATA ACTTAGTATT TCTAGTTCAT GACGCCTGCT CTGGCTTCCT CTGTCGCATG 2340
AGCATGCCAT CAGTATCTCA GTCTGACTAC CAGTTCTCTC TTTGGCACCA GCTCAGACTC 2400
TTAGGGAAGG GGTCTGACTG ACCTTAGCCT AGTCACTTTC GTCCATGGAG TCTGCATCAG 2460
GCTCTGTGAG GAGTCCAAGC TGGAAGCAGG CAGTTTCCTC TAGAAAGAGT TAGTCATTTT 2520
TTGTTTGTTT GTTTGTTTGT 2540