EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-16829 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:35072280-35074540 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr4:35072978-35072988TTTAATTAGA-6.02
Arid3bMA0601.1chr4:35073163-35073174ATATTAATTAG+6.02
Foxq1MA0040.1chr4:35073189-35073200AATTGTTTATT+6.02
HNF1AMA0046.2chr4:35072318-35072333AATTAATCATTAACT-6.49
HNF1AMA0046.2chr4:35072318-35072333AATTAATCATTAACT+8.25
HNF1BMA0153.2chr4:35072319-35072332ATTAATCATTAAC+6.02
HNF1BMA0153.2chr4:35072319-35072332ATTAATCATTAAC-7.34
RORA(var.2)MA0072.1chr4:35073215-35073229CTTATCTAGGTCAA+6.11
ZNF263MA0528.1chr4:35072658-35072679TCCCCCCCCCCTCCCAGCCCC-6.08
ZNF740MA0753.2chr4:35073885-35073898CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr4:35073886-35073899CCCCCCCCCCCCC+6.03
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_08597chr4:35073224-35074589Liver
Enhancer Sequence
CTTATCAGCG TGAAAGTAGT TTCCATACAG GTAGATCCAA TTAATCATTA ACTAGTAGAA 60
AATTAATGGA ATTAAATAGC AAGTGAATCT AAAATCAACT TACCATACAG CTTTGGCTTT 120
ACCTTCTTGC ATTTAAATGA AATTCTTCCC AGCAGAGTGT CTCCTAACTA GCTCCAATTT 180
CTACTTGCTT ATTCTTTTCT GAACCGGCCC AATGATTCCT TGTAAATCAA CAAGAAACTC 240
CAGAAAGAAA AAGGACTGAA AGGTGCAGAG GGAGCTGGCC TGGACGCTCT GCAGCCTGGA 300
AGCCATGAAA TGAATGGAGG GAGCTTGGGC AGAAGGATAA TGACAGTGGG AAATGCTATT 360
CAGATGACAG CTGCCTGCTC CCCCCCCCCT CCCAGCCCCC CACCGCCATT CTCCAGCTGC 420
CCCACCCCCT CCCTCCACAG AGCCTTGCTT CCCAGCCGAG GCACGCTACA GAGCAAGCTG 480
CCTCCCTGGT GTCCTCACAC TGAAAAGCCC AGAGGAGAAA GGGCTGCTAT GTTGAAAGCT 540
TGTGCCCCAG AGTACCAACA GTGTTAAACA GGCTTTAAAA TACGCTGCTA CTTTTCCTAT 600
CAATCACAGC CAATGCCAAG CGGCTCCCCA ATCTGCTGGG AGGTACAAGG GTGAGCATTG 660
CTTAATTGGC TCTGGGAATC TTATGAGCCT GCTAGACCTT TAATTAGAGG AGTTGCAGAA 720
TGGTATGATG CTTGTGCTAG GGATGGGCAG GTTGGGTCTG CCCCAGTCCT GGTAATTTGT 780
AAATTCACCT TTGAACAAAC TTAAGAAGGA TTCACTTATA CTAAATGACA CAGTCGAGGT 840
AACAGTACCC TCATGTATTA GCTCACAATC TTCGTCTCTT TGCATATTAA TTAGATTTGA 900
TAACACATAA ATTGTTTATT TTCGATTTGG AATGTCTTAT CTAGGTCAAA AGGAGAAACT 960
CTAAGCTATC CTATAGAAGG AGCGTCTGAT ACTCAAATAC ATTTTAGCTG CCAGCTGGAT 1020
AAACTGTATG GCGTGGGCAC TAAAGTCGGG CTTGAGTGTG GAGAAAGTTC CAGCAACGTG 1080
GATGGATTGT CTAACGTTTC AAGGATAACT CCATACCTTG ATATGACTCT GGGTTACAGG 1140
AAGACAAAGG GAGACAAAAC CCAATTCTTC TCATTAGAAA ACAAAAGTCT CTGGGGTCAG 1200
AATAGCCTTG TGGATACTGG ATTTGCAACC TTGCACTAGA AAGGAGCAAG GCCTTAACAT 1260
AGAACTATTT TATTTTGTGT TTGAGTGTGC ACATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1320
GTGTGTGTGT GGTGTATGTG CACATGTGTT GCCCCAGAGG ATGTTGGCTG GCTTATTCAC 1380
TCTCCAGTCA TTCCCTCGAG ACATAGTCTC TCTCTGTATC TGAAGCTAGG CTGGTGGCCA 1440
GCAAGACCAA ACGATCTTCT TGTTTCTTCC TCCAACACAC ACTGGAGTGG TATATGTGTG 1500
GCCAGGGCTT GCATCGTACA TGGATGCTGG GGATTTGCAT GCAGGGCCTC AAGTGTAAGA 1560
AGTAAGTACT CTTAGCTAGT GAGCCATCAT TCCAGCACTA CGCCTCCCCC CCCCCCCCCA 1620
AAAAAAAAAA AAAACCTTTC GGAATTTTAA AGAGCACTAC ATTGATCTTA CATGCATAAG 1680
TCAATATAAC TTAATCAAGT TTCTTGGATT CATTTTAGGT GTTTTCCTCC TTTTATTGAC 1740
ATAACAATGA TGTACCAGGG TTTATATTTC AAATATCTTG ACTAAGGCTT TAAAAGGCAA 1800
ATGCACACAC TTCCGCACCT CGGTTATTAC CAATGAAAAG ACTGAGGAAC AAAGAGACAC 1860
CACGACAAAA CCAGAGGAGG AGGTCAGAAC TCCAAAGCTC AGTCTCATGA GTCAACAAGA 1920
AAGCAAGCCT ATTAACCCTT CCGGCCCATG ACACAGCGCG TTGTATAACC AGGATGCTTT 1980
CATGGTAGTC CCAGCAAGCT CTGCTTTCGC TTCACTGGGA CCAGATCAGT GAGACTGTGG 2040
GAGAATATTC TATTTCCTTA CCTATGACAA CCTCTATAGC AGCGGATTCA GTTCCCTAGG 2100
ACCTAGAACG ATCTTATTAC AGCCTACAGT GTTTGGGAAC TTAGTGCAGT GTCCCCAAAC 2160
ACTGTTAAAA ACTCAGCCAC AAATCACTCT TGTTCCATCT CTTCCCTATT CAAATATTTA 2220
TTTTCAGATT CAATTTATTC CCCGTGCCTC TCCCATAGTC 2260