EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-16797 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr4:32444410-32449340 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr5a2MA0505.1chr4:32447251-32447266GAGTTCAAGGCCAGT+7.4
POU4F1MA0790.1chr4:32449324-32449338TTAAATAATTAATG+6.47
POU4F2MA0683.1chr4:32449324-32449340TTAAATAATTAATGAA+6.51
POU4F3MA0791.1chr4:32449324-32449340TTAAATAATTAATGAA+6.83
RFX1MA0509.2chr4:32445368-32445384TGTTTCCATGGCAACC-6.99
RFX1MA0509.2chr4:32445368-32445384TGTTTCCATGGCAACC+7
RFX2MA0600.2chr4:32445368-32445384TGTTTCCATGGCAACC+7.31
RFX2MA0600.2chr4:32445368-32445384TGTTTCCATGGCAACC-7.42
RFX3MA0798.1chr4:32445368-32445384TGTTTCCATGGCAACC-7.59
RFX3MA0798.1chr4:32445368-32445384TGTTTCCATGGCAACC+7.5
RFX4MA0799.1chr4:32445368-32445384TGTTTCCATGGCAACC-6.78
RFX4MA0799.1chr4:32445368-32445384TGTTTCCATGGCAACC+7.28
RFX5MA0510.2chr4:32445368-32445384TGTTTCCATGGCAACC-7.26
RFX5MA0510.2chr4:32445368-32445384TGTTTCCATGGCAACC+7.31
Sox6MA0515.1chr4:32445520-32445530AAAACAATGG-6.02
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr4:32447606-32447617AGCCTGAGGCA+6.14
TFAP2C(var.2)MA0814.1chr4:32447606-32447617AGCCTGAGGCA+6.32
YY1MA0095.2chr4:32444734-32444746CAAGATGGCAGC+6.32
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01452chr4:32325268-32527284Th_Cells
mSE_02291chr4:32438831-32453702Macrophage
mSE_12514chr4:32445516-32446501Spleen
Enhancer Sequence
CTCATTTACC TAATGGGTTA CATAATGTTG TGAAGTGCGT GTGTCTTATT AGAAGTAGTA 60
ACACTGTTAT AGTTGTTGAT AGGATTTGGA AATCATCATT ACTATTCACA GGCATTGTAT 120
CTGCAGAAGG CTAAAATTTT CATAGCAGTG AAACTTTAGG TGGCTTTGGC TTTCTGAACC 180
CAAACTTTTA CTGCAATGGT TTTGAGGTTG TAGTACCTCG AAAAATACCC ACTCTGCCCT 240
TCCAGCTTTT GATCATCCTA TTGTAAAAGA GCTACATGAT AGTTGTGAGA GGAAAAACTC 300
TTTTCTAGTA GCCAACAAGA GTGTCAAGAT GGCAGCCCTG ATGTCTGTAT AGGGTTGGTT 360
TGTCTGGAAA GGGAAAGTGC AGCATTGACT GACATCTGAC CAAAACTGTA TGGCTTCTAA 420
ACGCCACACA GAAGTTTCTA ATAAAAGGGC TGTGTTTCTC TTAGGTATAC TGAGACTCTT 480
GTTTTTGAGA AGTCTGCACT ACAAAATTCC CATTTAGTTT ATTTTTGGCT TGAGTCTGCT 540
CCACTAGGAA AAAAAAAAAC AACTATTTTT ATAATGCCGC TTCCAGTACT TCCAGCCACA 600
GGGGAGAAGG ATTCATGGAA CACCGTTCCC AGTGGTAACT GCGTGAAGTG CCCAGATCAT 660
TGCGGGACTG TGCTTTAAAC AAAGCTTTCC AAGATGGTTG AGTTTCAGCT CCGTCACAGG 720
GTCAGGCTCA CATGATTCTT GCCCCCAGCA CGCACGCTCG TACACAAAGG GGCTCATCCC 780
CTCTTGCTTG CGTACAGTAA GCCCTTGACT TCTTTAATCT GTGCATGTCT CCAGTGTGTG 840
TGTGCACTGA TTGTCCTTTG TGCATTGTCT GTGGCCTCAT GTGCACACAT AGACACTGCA 900
TAAGTGTCTG TATCAAGGGT CCTCTTAAGA GACAATGGAC TGTTCTTTTA GGGAGTTGTG 960
TTTCCATGGC AACCCCCTTT CTCAAACTTT GAATATTAGC CACGTATATA TTTCAGAAAC 1020
TAGAGACAAG CTTATGTTTA ATTTAGAGAA TCTTTAAGTT TTGAGGAAGC AGTAGCTGAC 1080
CAGCAGATGC TAAGAACCAA CGTACTTTGA AAAACAATGG TGATTTCTTC TGTGCCTGTC 1140
ACCAAAGACC AGCGTTACAT TCAGCTCACC TTTTATTGTC TTTGGTTTTT CTGCTGCTTA 1200
GGATAGAAGA CACAAATCTG TACACACTTC TACAAAGCTA TAAATGATGG GTGTGTTGTC 1260
CGTGCCTGTC CCTGTAGTGA TGCCTGAGTG TCAGATCCGC GCAGTGCAAC ACTGCTGGCT 1320
CACCCAGTTA CATTTACTCT CATTTTTCAC TTCCTTTTTT TTTTCTCCAA ATGACTATGA 1380
GATCCATGGC TCTCCTTTAG CCACACACTG CAGTAGAGAG AGGGGTTGTG CTCCTATTTT 1440
GAAGGGAGGA CTGCCTCTGC ACTCAGGGCT CTGGCTTTTT AACAGTTGGG ATCTGGGAAG 1500
AGACATGGAC TTCCTTCCTG AGTGATAAAG ACAATGGCCA CTTCCTAATT CTCTGGGGTA 1560
ACTCAAGCTA AATCTGTGTG GTCTATGAAG TCTGTGTACG TCATGGGTCT TGCCTTGCTA 1620
CGGTTGGCTG TTTTATCCTG CCATGCCTTT TTTCCTTTTT GTTAATATCC TTAAAGACGT 1680
TTGAATCCTG ATTCTTTCTG AAACCCAGAT GCGATGATCT TAGGAGCCGA TCAGCTGTGT 1740
GCAGCCCTGT CTGCTCTTCG GAGTGTGTTA GCTGCCCCCG AGGCTTGTTT TGTTGACTGT 1800
GTTGCAGACC TGATTTGCCA TGGTCCATGC CTGCACTCTG CCTGACTGCG TTCTTGATTT 1860
CCCAGGAGGG CAAAAGCTCT GCCTTTCCTC TGAGTAATTA GTTATCTCAT TTCAAAAGGG 1920
AAGTTTCTAA GATGACTTTG TCACATGCAC ATGTCTGCTT TGGAGGATGA AAACCTGCTT 1980
AGTTACTTGT TTATCCCTGT GTTATATGCA TGGTTAGTCA CGATGGAAGG TTTTAAGTAT 2040
TTGAAGGGCG GAACATGGCT AATTTGACCA CTTATACTCA GCCGCCGAGA GATTGTGGGT 2100
TAGCTTATTA GTGATAAAAA GCTAGAGTAA GACATGATCG TGTTTGGCTC CATGAGAAGG 2160
TAGTGGTGTT CTCTGTTTTT GATGCACATT TTCATGTGTT TCCAGGGCCT CCGTGGCACT 2220
TTCCTTTGAA GAATTCTTAG CCAATCCTCT TGCTAAGTGA GCAGGGTCCT CCATCCACAG 2280
AGATCAGAGA CTGAGTTCTA TAGTCTTGCT ATTGTTTGAG CCCCAGAATA GAGAAGGACA 2340
GATGCCAGAC TCAGTTCTGA GCCAGGGGTG GGGGCTGGTA TCACACATAC ACACACACAC 2400
ACACACACAC ACACACACAC TGGGCACCAC CCTTCACGTC TTGTTGCTCT GTTACCCAGG 2460
CCCATGCATG ATCCCACTCA GCCTGGTCAG AGCCACACCT CCTCCACATT CTTTTTCTCC 2520
CTTAGCCTCT TAAATGACTT CCTTTTGCTG CTAGCTCTTA AAGCTGCGAG GGTCCCTTCT 2580
TCCCACCTTA TCCCTAAGCC TTCTTCTCTG TGGGATAAAT TCGATGCTGT CACCATGCAA 2640
GTATACTTTC AAAGGAAATG TAATAGCCTT TTAAGTATCT ATAATGTACA TTTGCACAAA 2700
GGTGCTTTAT AACATGTCTA TGTCTAAAAC TTTAAGTGGA CCAAGAGTCT AGCATTTTAA 2760
AATTGATAGA AATACATATT CTAGGGCTGA TAGTAAGGTC CGGGAAGACT GCAGGCTCAA 2820
AACCTGTCAG GTCTACAGAG TGAGTTCAAG GCCAGTCTGA TCATCTTGTC AGACTCTGTC 2880
TCAAAAGATG AAAAGAAGGC TGGAGAGGTA GCTCAGGGGT AGATCACTTA GCCAGCATGC 2940
ATGAGGCCTT AGGTTCGGTC CCTAGTACTG AATTAAAAAG GGAGAGAGGG AAAATATTAC 3000
CATCTAAGCA ATATGATGGT ACACTAGAAC AACTAAAGAA AGGGGGTAGG GGACTCATGG 3060
GAAGGTGCTT TACAATTTTT ATTTCTTGGA ATTGGGGGAA AAATGACCCA AGTAGAGCAG 3120
TGTCCACAAC AGAGAGAAGC GGCATCAGAG ATGCGACTGT GTCAGAGAGA GGACCATGTC 3180
ATTGCTCAGC AGGGCCAGCC TGAGGCATGG AGCCACTGCT GCAGCTGAAG CAAGCACAAT 3240
GGTCATGCCC AGGGTACCTG CAGGGAAGCC AGCACCAATG GAAGGGTGGT GTGAAGTAGC 3300
CTGGAGCTCT CACCAGCCCT GCCCCTGGAC ACTCTGCCTA GCCACACCAT CTCCCTGACT 3360
CTGGGCAGGA ACAGGATATC CCCGAGATGA GTCTCTGAGA TATTCCAGTA TTCGTGGCAC 3420
TATAGAAACC TTGAACCAGA TCGGTGACTG GTTGCAGTAA GTATTTGCCT GTAACGATGT 3480
TTGGGCAAAT AGTATATTGT GTGGCACACA GCAGATTGCA ATGCCAGATT AATAAATGAA 3540
TTGTGGTAGA GAGGTGGGAA CAGTGGCAGG AGAGGCACTT GAGGCAGAGA GAAGCAGAAC 3600
TGAAGATGTA GTGGGGGACC ACAGTGGCGG ACAAAGGAGC ACAACATTGC CAAGTAGGGC 3660
TGGTCCTCCG GCCACTGAGA AGCCACCATC GGCTCTCACC ACCCTGCCAC CACCAGCGAG 3720
GCCAGTGCTG CCCACAGCCC GCAGAGATGT CCAATATGAA GGATGGTTCA TTTTTAGGAC 3780
TAAGCCTCCT TGAAAGACTT CCATGGTCCA TGCTGGCACT GGAGGCTGTG TTGGTGTCCA 3840
TGGTCCATGC TGGCACTGGA GGCTGTGTTG GTGTCCATGG TCCATGCTGC CACCAGAAGC 3900
CATGATGATG TCAGTGGTCC ATGCAGCCGC CAGTGACGAT GCTGATGTTC GTGGACCATG 3960
TTGCATGTAG CTCTGCTACC CTGCCTAAGC TCCGGGAAAG GAACAGGCAG CGATACCAGG 4020
CCCCACCCAG CTTCCCTTGA ATCCACAGAT AAAAGACACA GACACACACG TTGTTCATTT 4080
TCAACTTGCC TTCTTGGCAC CATTGCTGGG CATTATTAAA CTCCCGAGGC CAGTGTACCC 4140
TTATCCATAC TCTTAGTTCC ATACCTCCCT TCTGCCCTAA ACTTTAGTTG CTCTGTTGCA 4200
TCTAGTCTCT GCTAACTCCC CTGATCACCT GCCTGTAGGA GTGAGCTGCG TGGCCACTCC 4260
GTTTCGAGAT CTCACACAGC TGGTCACTTT TTCTCCATCA GAAGCGTGGC AAACTCTCCT 4320
CTCATTTCCT TGTGTCTGTC TGTCTCTTGT CTCCAGGGCC CCAGAAGTCC CGCCTATCCC 4380
TTCCACCCAG CAATTGGCCC ATGGCTTCTT TACTGACAGA TCATGAACCA ATTGGAGAGC 4440
AGGATTTTAA CATCAGGACC ACCCCTACAG GACCAAACTG CCTATGTCTA TATCCACGAT 4500
CTGTGTTGCG TCTTTTGCAG TGGTATCAAT GACTGCAGAC TTATTATTAA GAAGGGCAGA 4560
CCCTGAAGGC TTCCGTGACA AGCTCCCTGA CCCCCCTCCC AACAATAAAA ACAACAAAAG 4620
CAATCCAGAC AGGAGCTATT GAAATGAGTC CTTAAAAATG TGATAAAGAT GCTATAGCTC 4680
TTCACAGTTG ATGGCTTCTG ATAGGAATGG AGGTGGAAAT GGACTCAATT TTATTTAAGG 4740
GACTGGCCAC TGGGAGTTTG ACCATGCTCC AATGTGGTAA ATACAACTTG AACTTGGTGG 4800
GATTTTGCTA TTGTTGTCAT TGCTTTCATC TGGGGTTGGG GCAGGGCAAG GGTGTGAGGG 4860
TGGACCTGGG AGGAATGTGA AGCCAGTATG ATCAGGTTGC ATTGTATGAT ATTTTTAAAT 4920
AATTAATGAA 4930