EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-16368 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:121993180-121996500 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:121995437-121995449AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:121995441-121995453AAACAAACAAAC-6.32
GFI1MA0038.2chr3:121994141-121994153TAAATCACAGCA+6.27
Gfi1bMA0483.1chr3:121994142-121994153AAATCACAGCA+6.62
MecomMA0029.1chr3:121993999-121994013TATTATCTTGTCTG-6.49
Nkx3-2MA0122.3chr3:121994765-121994778ATTAAGTGTTTAT-6.48
POU4F1MA0790.1chr3:121994190-121994204AATGAATAATTCAT-6.04
POU4F1MA0790.1chr3:121994191-121994205ATGAATAATTCATG+7.1
POU4F2MA0683.1chr3:121994191-121994207ATGAATAATTCATGAT+6
POU4F3MA0791.1chr3:121994188-121994204TTAATGAATAATTCAT-6.34
POU4F3MA0791.1chr3:121994191-121994207ATGAATAATTCATGAT+7.04
SPICMA0687.1chr3:121993786-121993800GACTTCCTCATTCT-6.1
Sox3MA0514.1chr3:121994583-121994593AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
ACACACACTA TCCTTTTATT TCATGGGCTA ATTTGGTGGC CAGCTTTGCT CGGAAACTGC 60
TGAGTTACTC CTCAAACATT CTGGTCTCAT GGTATAGACT GCCCATGCAT AAGCTGCCTA 120
GGACACACAA GGGAGGGGTA GAAGAAACAC CAGTTCCAAC AGGCAACAGG GCAAGGGACA 180
AAGCAGTGCT TTAAGTGATA AACATCTGTA AGTAGAGCTG ACCCAGGAGT TAAGACTGCA 240
AAAGGGTCGG ACACTATAGG AAGACAGATG CAAAGCCTTC TTATTTTATG TTTTTATTGT 300
ATTTATCCAT CAGGTATTGT AGGCTCCAGA GGAGACTCCT AACTTAGCAA AAGTTCACTC 360
AAGTTTCTAC AAAGTAACCC AGACAACTAA CGGGGGTCCC AGGACCCACA TGTCAGAATT 420
GTTATTTCTC TTAAGCTAGC AGGAAGCTAA CGTGTTCTGC CTGGCTGTGT GAGTTTAATC 480
AACTAAAGGT AAATGCGGCG ATTTTGCTGA CCGGTTGTCA GCCAAGGTGA TCTGGAGGCT 540
TCCGCAGTGA GTCTTGAGGA ACTGGCCTTT CCCTTAGTAA GAGCTTCTAC TTGGATTCCC 600
TGTTGTGACT TCCTCATTCT CCAGCAGCTC TCAGTGAGGT CAGAAAGGAC TAGGTCTGTA 660
GACATCCTGG CCTTTTGCCT AGTGCACTGT TTTATGAGGA AGCTGTTGAG GGCAGGCCTG 720
CGATGCACAC AAAGGGTCCA GAGTTTGCCT CTCCTTTCTT TGGACAACAA GCTGTAGTTC 780
CTTCTTCAGA ACCTCTGAAA CCTCGAGTCA GAATGAACTT ATTATCTTGT CTGGCGGAGA 840
CAAAAAGATG TCTAACGTCC TCACTAGAGC CTATACTCTC TCTAGTCTCC CGAGCAATGT 900
GTCAGAATGC TTGTTTCCCA CAGTCCATGT TATCAAACAA GGGGGACTTA TTCATAATTT 960
ATAAATCACA GCATGTGTAG CTTGTGACCA AGCTACTTTA TTATTATATT AATGAATAAT 1020
TCATGATTGT GCAAGGAAAT TAAAAAAATA ACTTGACCCC TCTAGACTGT ATACTAGCAC 1080
ACAAAAATTT CAGACCAATG CAGCAAACTA GAAAATCCAG AAAGAGAAGT GTGTACTGGG 1140
CTTTAGACAG CAATGAAGGT GGCATTTCAA ATTAGTACAG AGGACACAGA GGCTCAACAC 1200
CAGCAACTCT GGGACAGAAC TCCCATTCCA AAAGATATTT CAGATGGGGC AAAGGTTTAA 1260
AAAGAAAACC ATTAAAAGGG AACTAACACT CTGGGGGCCT TCACACTTAG AAGCTAGCAA 1320
CACTGGTCAA TTACAGTATG TGAATTTCTG TGGGAGGAAA ACGTTTCATA AGCACACAAG 1380
TAGACTGGAA AACAGAATTT ATTAAAACAA AGGCTGTTTT CTCTCCTAGG TAAAGAACTA 1440
CAAACTAATA CAAACATCCT ATTAGAACCA TCCTACGTGG GTGTGAGCAA CGCAATATGA 1500
AAATGAGCTC AATCCTAGGA CAGATAAATC ACAGAAAACA AAGTACAAGT TACCCTGAGC 1560
ATGAAGAAGT GGGTTGAAAA CTACGATTAA GTGTTTATGT TTCGGGGGAT GGGGGTTGTG 1620
GGAAACAGGC ATTCTCCCAC ACTGCTGGGG TGAATAAAGT GAGCAGAGTG TATGAGGGGA 1680
AGCTGCCAAA CCTTATCAAA GCAGGCAGAG ATTGGGAGCG CTGGAACCGG CTGGAGCCGG 1740
CGGTCCAACT TCCTAGGAAT CTATTGTAAA GATACACTTG TGCACAAAGA ACAGGATGTC 1800
CACTCAAGGA CTGCAATGGG CGAACAATGC CTGTCTAAAG GTCTAAGTAT TAGCTATTCC 1860
ATCAGCGGGA CACAACCGAG CAGTGCAGCT CCACCTGTAT TAACCGAAAG AGGTGAAATA 1920
TACTGTGAAA GTGTGTTTTT ACCGACAATT TTGATTTTTT TAACGGTTTG CATAAATTAG 1980
GGGTTTTGTC GGTACAGTGA ATTTTTAAAA ACTATGCATA CTGGCACTTG GTGAAGTGAA 2040
ACGCTCACTC TGTGCAAAGC TAGTTTTGTC ACTTGTCAGA AGGGGACAAG ACAGTAACTC 2100
TTGCCTCTAG CTGGCAGGCA AAGCCTGTCA ACTCCAACCT GTCTCCTTTC GTGAAGAAAG 2160
CAGACAACCC CAGAAATGCA GATTTCTGGG CCCCATTCCA GATCCACCGA AATGGAATCA 2220
TGAAATGACC ACAGAGATCT GCCTTTTTTA AAAAACAAAA CAAACAAACA AACAAAAAAA 2280
CAAAACAAGA TCCACTCGAG ATTCCGGAGG CGGGGTGGGG TGAGGTGAGG TGGTGTACTT 2340
CTAATGCCTT CGGACTAGCT TGCGCATCCT GTTTTCTTGA CCCTGCTGGC AGTCACTGTC 2400
AAGCTCCAGA CGTGGAATGT CACTCGAGAC CCAGGCCTAT CTCAAGCTCT CATTTAGGCC 2460
AAGGTCGAGC ACCTGGATTC TCTACTGCCT CCCTGTTCTC TCGACTGGGA TCGGTCCGGG 2520
TCTGCTAAAG GGGTCTGAAA GCTCCCGGAA CTCCAGGTAA GGGTTGCGGA GAGCAGCGGG 2580
AATGGTGTGT GGCTGTGCTG GGAATTAAGC CGTTTAGAAT ACAAAGAAAA GGAGTAAAAG 2640
ACAGAAATCA AAGATAATTT CCTCGGTGAC AAAAGAAAAA TGTTCCGACT CCGCCGGGAC 2700
TCGAACCCGG AACCTTTGAA TGCCTTCAGC CTCTAGAAGT CCAATGCGCT ATCCATTGCG 2760
CCACGGAGCC ACCTGTTGGA GGTTCCGCGC ATCTGCCGTA TTAAGCTAGA GGCAACGGCC 2820
CTGCTCCCGG GCCGACACCA TCGCGGCCGC CTCCGTCGCC GGAGCCCACC CGCCGCGCCT 2880
AGGTCACCTC CAACGGTAAC GGCGAGGCCG GCGAGCGCCC AGCCGCCCGG GAACCGCCGC 2940
TGCTCAGCTC AAGGGCCGCG GCTGCGGGCC GTGGGTCGGG AAAGCGCAGC GGGAGCCAGT 3000
CGTCCGTGGC CGACTCCGCC TGTCCCTCCC CGGCTCCCCG CCTGCCCCGC AACCCCGCCT 3060
ACCGGTGTCC GGAGGCCGCT CCCCTCCGGC CCGGGCCGCC GAGGCTGCAG GCCCAGACCG 3120
GCCGTTGCGC CGTCGCGCCG GGCACTTCTG TCGCCACCTG CGAGAGGCGA GGGCGAGCGG 3180
CCGCGCCCGG GGCTACGAGG CGAAGGCGGC GACCCATCGC GGGGCCCCCG GGCTCTTCCC 3240
TGACGCCTGG ACCTGCGGCT GCGAGTGCGG GCCGAGGCGA CGTCTGTGTG CGTGCTTGTG 3300
CGTGTTTATC TGCGCGGGGC 3320