EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-16298 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:108522380-108524950 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:108523704-108523721TGAATTAATTAATTAAT+7.27
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:108523535-108523553GGAAGGAAGGAAGAAGAA+6.41
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:108523527-108523545GAATGGAGGGAAGGAAGG+7.12
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:108523531-108523549GGAGGGAAGGAAGGAAGA+8.52
FOXF2MA0030.1chr3:108524445-108524459ATTGTTTACCATTA-6.46
Foxd3MA0041.1chr3:108523301-108523313GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:108523305-108523317GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:108523297-108523309GTATGTTTGTTT+6.37
Lhx3MA0135.1chr3:108523709-108523722TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr3:108523705-108523718GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr3:108523706-108523719AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:108523707-108523717ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:108523711-108523721ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:108523707-108523717ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:108523711-108523721ATTAATTAAT-6.02
ZNF263MA0528.1chr3:108523528-108523549AATGGAGGGAAGGAAGGAAGA+6.16
Enhancer Sequence
GTACTGCAGG CGCTCCTATG GTAGAACTTA TTAGGCAAAC AGAGTAAGGC GTTCTATTTA 60
AGGGAAGCAA CTGAAGCAAA GAGGTGGGGT GTGTAGACAC TCCTGGGAAG CACATTGGTC 120
AGAAGTGGAA GAGAACATGA CCAAACTGTG AGGCTTGCAC TGTCTGGCTG AAGCACCTAT 180
TAGGCTCTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTTT TCCAATGGGA AACTTGTAGG 240
GTTATTATTA TTCTTTTTTT CCAACAAAGA AATAGCAAAA TTACATGTTA GGACAAGAAA 300
CAGGCAGCAT CACACAGGGC CAGATGAGGA GACAAGGTGA AAAGTACTGC AAAAACTCAA 360
AACTGACTAA GGAGCCTCTC TGCCCACTCA GGACATCAGT AAATATTCTG TGCACCACAG 420
ATGTCCAACC ATCTAGGTCT GAGAATGAGG CTGGGGTGTA GCTCAGCAGA GCAGGAAGCA 480
GGTGAGGGCA AGAACTGGGG TTCAACCATC AGGATAAAAG GGAATTCTGT AACCGTGCAA 540
AAACAGAGTT TATAACACAT TTCTAACAGT GGAGAAGACT ATATTTATAT TCTTGCAGAT 600
TCAAGTAAAC TTTGCTCTGT GTCTTTGGAA AGGTTAAAAG CTATGGGAAG TGTTATTTGC 660
TTTAGAACAC ACACACAAAG CGAGACCATC GTTACAAGGG TAGATAGATC CCTCCACACT 720
TCATAACAAA CCACCGACTG TATTGTGGTT TTAAGTAGAA TTATGTGCCA CAAGTGGGAT 780
TCAGAAACAC ATGGCCATTT AAGTGCAGTA GCTGGTGCTT TGAGATTAGG GAGTAGTCTC 840
AATCCCACCA GTAGCCTATT AATTACACAG TTTTAAAAAC AAATGCCCAC AGGTGTGTGG 900
GGTGAGGGTG GGGGTATGTA TGTTTGTTTG TTTGTTTTTA GGTAAGTCTT GGAGTACTTT 960
ATGGGTAAGA AAGGTGAAGG CTGAGGATGT GGTTTGGTTT TGCTCGGCAT ACACCTGCCC 1020
TGGATTTGAC CCTAAGCATG TATGGTGCAC ACCTGTAATC ACAGCACTGG GAGGATGGAG 1080
AAAGAGAATC AAAGAGTGCA AGGCCAAATT CAGCTATCTG AGACCCTGTC TCAAAACTAC 1140
ACTGAATGAA TGGAGGGAAG GAAGGAAGAA GAAAGTCAGC CAGCCATTTC ATACCAGGTG 1200
GAATTTGTGC ACATATTACA GCCCAGTAGC TGTAATCCCA GCTACTGGGC TGAGACAGGA 1260
GGATTCCAAG TTCCAGGCCA GCCCTAAACA TTTAGCAACA ATAGGTCTCA AATAAATGAA 1320
TGAATGAATT AATTAATTAA TAAATGAATA ATCTGGAATT ACCTCAGTGA TAGAACTCTT 1380
GCTTAGTGTT CACATGGTTT AGAGTTCAAA CCCAAGTACA GAGGAGGTGA GGTGTGGGGA 1440
GCCACACTAT ATATAGTGCA TTACCTTTGT AACTAGCCTA CTATTAAATC TCAGGTTTAC 1500
ATCAAAACAT ACTTGTAATA GTGTATGTCT GACCTACTGA AAATTCAGCT AAACTATTTT 1560
TCCGTGGGAC ACGCTTCCAC AATACTCCAC AGTCTCTGAA TTCATAACCA GTCCAATCCT 1620
CGAATTGTAA GTTAGAAATA GTTTGCAAGA GGGGCCTATG AATGCCTAGA ACCGGCCGGG 1680
CATCCCTGAA CTCCCCCACT GCCCTCAAGT CAAAGGACAG GAACCTTCGC TTTTGAACTT 1740
AGGCGGAACG AATCTCTGCT CTTAGCACGT CGAAACCCCA GGCAAAAGTG CTCTTTACCA 1800
GAAGCAATCA CGATGGTTAC TAACAAGCCG GAAAATCTTC AGTTTAGCCT TCCAAAGAGG 1860
CAGTCTGAAA ATTCTGCTTC GCTGGTGACA AAAACTTACA ACACAAACCA CACAGCAGTC 1920
CAATCAACAC AAAGCACCGA GAGGAGAGTC AAGAACTTAC CTATTCTAAG TCTACCCGGC 1980
GTTTAAATAA TGCATTAAGG CAAATAAACA TTGCCATCAT TACTCGTTTC AACAGAGTTC 2040
AAATGATACT TGTTAAAGCC ACCTAATTGT TTACCATTAA AATACAAGGA AATTACGTTT 2100
TCCACTTTTC ATCTGAAGAT ACTAAGTTTA CAGCTTTCCG GCTAAGATCT CAAACATGTT 2160
ACGCTTGCTA TAAAGCTGGT TACAACGATC TATCAGTTTC GCTTGCCAGT AAGTCTGGGA 2220
TCCGAAAAGT TCAGGAGTTT AAATGTGACT TGACAAAGGT GTCTGGTGTG GAGACCCGGG 2280
GCCGGCGACG TGCCTGGGAT TCGAATCCAC TGGGATTCGG CTTTGTATCC ACCGTCTGTT 2340
ACGCTCGGAA AACGCGTGAA GTCGCTGCAT CCCAGCAAGT ATTTTCAAGG TCTGCAGAAG 2400
CCCGATCCCC AGTCTCCCCT CACTTAGGGG ACAACAGCCT AAATGGTGCG GGTGCGAAGC 2460
CCCCCACGGA GCTCCCGGGT CCCAGCGTCA CCCGAGCCCG TCGAGCCTCG GTGGTCCAGA 2520
GACCCCCGCC CCACGCCCCC ACACACCCCA CTGGGTCACC CCCTCAGGCT 2570