EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-16078 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:95469920-95473120 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE22MA0818.1chr3:95471476-95471486ACCATATGTT+6.02
BHLHE23MA0817.1chr3:95471475-95471487CACCATATGTTT-6.27
FOXK1MA0852.2chr3:95472726-95472740GTCTTGTTTACTTC-6.11
Foxj3MA0851.1chr3:95471333-95471350GGCTTTGTTTATTTTTA-7.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:95470612-95470627TGAACTTCTGACCTT-6.22
OLIG3MA0827.1chr3:95471476-95471486ACCATATGTT+6.02
RARAMA0729.1chr3:95470609-95470627TCTTGAACTTCTGACCTT-6.64
RarbMA0857.1chr3:95470612-95470628TGAACTTCTGACCTTT-7.12
Twist2MA0633.1chr3:95471476-95471486ACCATATGTT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00303chr3:95449171-95480090pro-B_Cells
mSE_01444chr3:95428517-95481073Th_Cells
mSE_02855chr3:95470537-95480974HFSCs
mSE_03289chr3:95468264-95480124TACs
mSE_03526chr3:95471755-95473897Bone_Marrow
mSE_04834chr3:95469587-95473125E14.5_Heart
mSE_06241chr3:95467169-95473749E14.5_Liver
mSE_06608chr3:95469702-95473862Heart
mSE_07147chr3:95469772-95474146Intestine
mSE_08013chr3:95469678-95473884Kidney
mSE_08533chr3:95465734-95473902Liver
mSE_08948chr3:95469807-95473927Lung
mSE_09406chr3:95465791-95472994MEF
mSE_10020chr3:95465695-95474090Embryonic_stem_cells
mSE_11293chr3:95469834-95473707Placenta
mSE_11924chr3:95469725-95470688Spleen
mSE_11924chr3:95470728-95474135Spleen
mSE_12868chr3:95469727-95474262Thymus
Enhancer Sequence
GCCACCACGC CCGGCTAAAA CAAGATTTGA TAACTGGAGA ATTTTATAAA CATGAACATT 60
TAAGAAGTCC CATTAGTGTA CAGCATGGCT TTAGCCAGAT GCCCAAAGCA CAGGTAGTTC 120
CTGGAGCTGA AGGATCTGTA GAATATTCTA GTGTTTCAGG GCTTCACTTG TTCAGTGATT 180
TCAGAATGCT GCCTTCATGA ACCTCCCCCA CCCCCTCTTC AAAGGCTTCT CTAGAGATCT 240
GAAAACTTAG TTCTCTTAGT TCACAGTAGT TACAGTGTTA GCTTAGCTTA TCTCAGTTAT 300
TCGAAGCATC TGGGAGGGGG AGGGGCATCC GCAGGGAGGC TGGTGAGTCA AAGGACACTG 360
AGACTTGAGT GTTTTGTTTC CAAGTGTCAC TGCATTGCCC AGGCAAACCT GGGCTCCATT 420
GACTCTTACC TGAGTCAAGG GAGAAGGAGC TGGCTCTGGA TCAGTAAGCC TTTTTTTAAA 480
TTTATTTATA TGAGTACACT ACAGCAGTCT TCAGACACAC ACTAGAAGAG GGCATCAGAT 540
CCCATTACAG ATGGTTGTGA GCCACTATGT GATTGCTGGG AATCACGACC TCTGGAAGAG 600
CAGACCGTGT TCTTAACCGC TGGGCCATCT CTCCAGCCCC AGTAATTCTT TACTAATGAT 660
TTGACACAGG GTAGCCTGGT CAAGGTTACT CTTGAACTTC TGACCTTTCT GCCCTCACCT 720
CTGACATGCT GAAATTAAAG ACCTTTGCTA CCCCACCAGG CTATACACTA ATAGTTCTGG 780
GGTAAAAGAG AAAGAATTTG TGAGGGAGTT GTGTTGTTTT GGCTCTCTTT AAAGTCGTAT 840
TGACTGGCTT ACAAATCTGT ATATAGACCA AACTGGCCTC AAACTTGTAG CCGTCTTTCT 900
TTCCTACCAT TGACTCCTGT GAGTTTCTAC AAAATAATAA TCGTTCCCAA CAGCTGGGAA 960
ATGTCTTGGA ATCCCTTTTA CTTATTTTAG TTTTTGAGAC AGGCTTCGCT ATGAAGCTCT 1020
TGTTATGTAA CCCAGGCTGG CCTCAGACTC AAAGGGATCT ATCTACCTGC CCTGCCTCCT 1080
AGGTGTTAGG ATTTATGGCA TGTGTCACCA CACCCTTCTG TCTTTATTTT CGGGACAGGG 1140
TCTCAATACA TAGCCTTAGT CTGCTTGAAA GTTACTATAT AGCCTGACAG TGGTGGCGCA 1200
CGCCTTTAAT CCTGGCACTT GGGAGGCAGA GGCAGGCAGA GTGAGTTCCA GGACAGCCTG 1260
GTCTACAGAG TGAGTTCCAG GACAGCCAGG GCTATACAGA GAAACCGTCT CAAAAAAAAA 1320
AAAAAAAAAA AAAAGTCACT ATATAGACCA GTAGATCATG CTGGTTTTGA ACTCCCAGGA 1380
TCTCTCTCCC AAATGCTGAG ATTAAAGGTT CATGGCTTTG TTTATTTTTA AGTACCGGTA 1440
TGTGAGAGAG AGTGAATGTG GATTGAGTGG GTCGATCCTG AGTGAGGAGC TGGAATCAGG 1500
TATTTGTGAG CTGTCTACTT CGCGTACTGG GACACAAACT GGTTTCTGTA AAGAACACCA 1560
TATGTTTCCT AACTGCTGGG TCCTCACCTA CCCAAAAGTC TAGTCTGGAG TTTTACTTTT 1620
TCTCCTGGGA CCATGACAAA TAGTGCTATA TATTCTGGCA TTTGGCTACA CATCAGCTTC 1680
GACCTAGCTC CCTGTCAGCT CTATACGTCA GATGGGGAAC AACTGACATG ACCCCCACGA 1740
TGTACTGTGG GGGCTGTGAT AGTAACATTG ATTGACTAGC TGTATTGAGT GCCTTGTCTT 1800
ACTTGAGACA TTCTTGTTCC ATGGGCTGAG TCTAGTAAAT GCTGGGATTA CTGCCACGTC 1860
CTTACCTAAG TTTCTGTATG TATAGCCTGT TAGAGTAGAG CTGGATTCTC ACAGCTGCTT 1920
GGTCCTTCAC TGTCCAGACT CTCACAGCCA GGGAAAGCAA GCAGGGTTTT GAGCATAGGA 1980
CCAAGAGCTC CACTCTGCAA AACAAAATTC AGTAGGAACA ACCCCCGAAA GCGACTAAAT 2040
TCCTGGTGGC TTCTAGTCGT CATTTTGTTC CCGTGGGAGA CTCAATTACT GCTCTTCCCA 2100
TCCTGATTCA GAAAACCAGT TTGCTCTGGC TGCCCAGACT TCCCCCACGG ACTGCATTTT 2160
TCTTGCCCAT GAGCTCATTG TTTTGGCTGC CCTGCCGGTA TTAATCACCA AGCCTGTTGG 2220
GGAGATCTCA GCTCCTGGTC CCCTGACTGG CTGGGGCAGC ATTCCCCATT CAGAATCTCG 2280
CCCCAGCCCT CCTGTGCTCA CGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 2340
TGTGTGTGTT TATTCAAGTT AGCCTGGGGC AAGGTGTGCT GGGCAAGGGA GCAAGAAAAC 2400
AGTCCAGGAG AAAGCTTCTA ACTGGTTGCA GAAGCTGCGG CTTGGTTGTT TTGTTTTGTT 2460
TTTGTTTTTT TCGAGACAGG GTTTCTCTGT GTAGACCAGG CTGGTCTCGA ACTCAGAAAT 2520
CTGCCTGCCT CTGCCTCCCG AGTGCTGGGA TTAAAGGCGT GCGCCACCAC TGCCTGACTG 2580
CAGCTTTTTT TAAAAAAAGA AAAAAACATG GTTTGCTGTG TGTACTGGGT GGGCCTCAAA 2640
CTTGCAGCAG TCTCCTGCCT TAGCCACCAC CGCTTGCTAG GATTATAAGC ATGGGCCAAT 2700
GTGCCTGGAG CAGTCTCTGC CCTAGAAGTA TTGATGGGAG GGAGAGCCAG CTGGGCTGCC 2760
ACAGAGAAGC AGCTGTTAGG TTTGTGCACA TTTCCTGAGG ATGGTAGTCT TGTTTACTTC 2820
CTTTTGACCC AGAGAAGCCC AGGTCTGAGC CCAGACGCAG CCTGCAGGTG ACTGCATACA 2880
GAGTGGTGTT TCTCCTAGTG TGGAACATTC TGGATTACTT AGTATGAGCT TGCGAGCTCC 2940
TCCTGCCCTT CCGCTCCCGT CTCTTCATTC AAAACAAACA AATCACCATA AGCCATGCTA 3000
GTAATTTAAA CACATGAGAG ACAGACACAA AAGGATTGCC TCCAGTTTCA GGCCAGCCTG 3060
GGCTACAAAA AGAAAATTCC AAAGAAAATA AGATGAAACA AAATTTAAAA CAACGAACAA 3120
ACACAGAGGC TGTGGGAAGT GACGTGTTCT CATTTCTCAG AAATCCCTCA TGAAGCAGTG 3180
AAACAGAAAC AGGGAAACAA 3200