EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-16041 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:90427040-90428670 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MecomMA0029.1chr3:90427237-90427251TGTTATCTTATCCT-6.55
RFX1MA0509.2chr3:90427513-90427529GGTCACCATAGCAACC+6.11
RFX1MA0509.2chr3:90427513-90427529GGTCACCATAGCAACC-6.11
RFX2MA0600.2chr3:90427513-90427529GGTCACCATAGCAACC+6.38
RFX2MA0600.2chr3:90427513-90427529GGTCACCATAGCAACC-6.55
RFX3MA0798.1chr3:90427513-90427529GGTCACCATAGCAACC+6.51
RFX3MA0798.1chr3:90427513-90427529GGTCACCATAGCAACC-6.55
RFX4MA0799.1chr3:90427513-90427529GGTCACCATAGCAACC-6.25
RFX4MA0799.1chr3:90427513-90427529GGTCACCATAGCAACC+6
RFX5MA0510.2chr3:90427513-90427529GGTCACCATAGCAACC+6.38
RFX5MA0510.2chr3:90427513-90427529GGTCACCATAGCAACC-6.54
Enhancer Sequence
GAGAGGACCC AGGTTGGGTT CTCAGAACCC ACGATAGTAG CTTACTGATA TACATATAGG 60
CAAAACACAC TTTTAAAGAT TTAAAAATGT AGAACTCTGA CATTTTGTGG ATTTGTGGGT 120
GCTTTTTGAG GCAGGGTCTC ATTATATATC CCTGGCTGGC CTGAAATTCA CCATGTAGCC 180
TAGGTTGGTC TCTAATGTGT TATCTTATCC TGATCACTGA TTCAGGTACT TGTGTTATCC 240
TCCCCTAGCT CAGCGGTCCT TACTAGCTTA GCAGAAGTGT TTTGTGGGTT CACCTGATCC 300
CACACCCAGA ATTTTCTGAA GCTGGGAGGG CAAAGGGGTC TCAGAGGTTT TGTTGTGTTA 360
GAACAGTCAC AGTAGCTGCA AAATGAAACA AAAGGCCTCA AGAAACAAAA GCACCTGCTG 420
AGTGAAATCC CCTAGTGAAC CCAGCAGCTG GAAAGCAGTA GGCATGCTGC CAAGGTCACC 480
ATAGCAACCA GAAACAGACA GAACCTTCAT ACAGTTTCCC TGCCCCTGAA GATATAAAAG 540
ACCCGTGGAC CTCATTGTGA ACTTTTGGCA GCTCTTGGCT GCTCATGTTG CTTGCCCTCT 600
CTTCCCAGGT TTGACACATT TTCCCTGATT GATGCTATCT TTTTCACCTT ATTGGCATAC 660
CCACATCCAA CCAGTCAGGC CCAGCTGGCA CCCTGGCACT TCTATGAATC CTCGATTCCA 720
GAGCTGCTGT AGGAGCCCAC CAGGGAAGAA CAGAAGGAAG ACTTCAAAGC CTGCTCCCTG 780
GCCCTGGCCT GCAGCTGTGC TCCAGATGTC CCTGGTTTCT TCAGAAGTTC TTCCTGAAGA 840
CTTAAGTGTC TGGCTTTTAG CTGGCTTGCT CATTGAAGAA GGAAGAGTGC CTTCCATAAT 900
CACCAGGGAC ACAGAGAGGA AGGTCCTTGG GTCTTAGGCA GGAAGCTTGC TGGATTCCGG 960
GACTTGAGCA GCTGCAGGTG GGGGACCTGT GCGCATCTCA TCCTTCAAGG CTCCCCTTGC 1020
CTGGTGGGCT ATGGAAGGGA ATTTTCTTCT GCAACTGTTT GTACTCTCTG AGACTTGGCT 1080
TCTAAGCCTG GAAGCCCCAA ACGTTCAGAT CTTGACACTT GAGAGACCTG TGACTCCAGC 1140
TTTGGACACC TGTTGTTCCA GAGACCTTCC ACTCCTGCCT TCTGGAGACA GAAGACTTGC 1200
TGCTTCTGTT ATTCCCACTG CTGACCTGCA GGGTTGCTCT GCAAGGCTCT GCTCTTTATT 1260
GGCACTCAAA GGACTCCAGC CTTTGAGGTC AGAGTTAGCA TGGACACCTG TTTCAACTTT 1320
TATCTCATTT AAAGGGAACG AACAATAAAG TACCCCCAGT TTGTGCTCTT CACTGTATGC 1380
CTACTTCATT CTTTGAGAAA GGTGGGACAA GAACCTGGTT GGAGACAGAC GGTAGACTCC 1440
GTCGACTGCT TCAGAAGGGC TGTTGTAAAG GGTAGTGGCT AGAACCTAGA TTTTGGAATA 1500
GGCAGAATCA AGTTTAAACC TTGTTGTGAG CCTGGTGTGG TGCTCATGCC TGAAATCCAG 1560
CACTCAAAGG TCAAGGTAGG AGGGCCAGGA GTTGTAGACC AGGATGGTCT ATGTGGTGAG 1620
TTCCAGGCAA 1630