EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-15833 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:80848040-80850790 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr3:80850470-80850480TCTAATTAAA+6.02
DMRT3MA0610.1chr3:80850341-80850352TTTGATACATT-6.02
Gfi1bMA0483.1chr3:80849750-80849761AAATCACAGCT+6.14
MEF2AMA0052.3chr3:80850722-80850734TCTAAAAATAGC+6.52
MEF2BMA0660.1chr3:80850722-80850734TCTAAAAATAGC+6.22
MEF2CMA0497.1chr3:80850720-80850735CATCTAAAAATAGCA+6.82
MEF2DMA0773.1chr3:80850722-80850734TCTAAAAATAGC+6.14
ONECUT3MA0757.1chr3:80850062-80850076TTTATTGATTTTGG-6.02
PHOX2AMA0713.1chr3:80850467-80850478TAATCTAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr3:80850467-80850478TAATCTAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr3:80850467-80850478TAATCTAATTA+6.32
SP2MA0516.2chr3:80849055-80849072CCAAGCCCTGCCCACTT+6.52
ZNF263MA0528.1chr3:80848336-80848357TGCTCCTCCTCCTCCTCTCCC-6.26
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02228chr3:80844839-80862254Macrophage
mSE_09743chr3:80850231-80851068MEF
Enhancer Sequence
TCCCTTTCCC ATTGTAGTTG ACTCATTTCT CAGTCAAATG AGGTGTGTTG CTGCTGTACA 60
CTTCATGAGG AATCCAGACT CCCAACTACA AGATGCACAC AAATATAAGT TCAAGGTTAT 120
GAGTTTTCAT TGCCGGAGTG TCCATTGTGC AATTCGTGTG CCTTGTCTTT ATGAGACAGA 180
TCTTGTATGC TTTATTAGGA CATGCTTTCA ATCAGCAAAT AAAATGAGCA TGTGCTCTGT 240
GCCTGGCTCA GCCCTAGGTG TTGGGTTTCT GCAGGATACC TGAAGGAGGA ACTTGTTGCT 300
CCTCCTCCTC CTCTCCCCGC CTCTTCATTT TAAAACTCTG GTCTTGCTTT GTAGTTCAAG 360
CCAGTCTCGA TCTCACTATT GTAGCCCAAG CTGGTTGTCA AACTCCCCAT CCTCCTGCTT 420
CATGTTTCTG AGTGCTGGGG CCCTTGAAAT CTGCTACAGG AGGTTGGTAG GACTGTCCTT 480
TACCTTGTGT GCTATTAGTT CTGTGTCAGC AATCATATAG GAATGAAGAG GACCGACGAT 540
CCTTAGTGTC TTTATCTGAA TGGCTGATTT TGTCTGGATA GGAGGGTCAA GGAGAAATGT 600
TCCTTTAAGG ATAAGCAGAA TTGAGTTGAA ATGAGCCCTG GCATAAAGGA AAACATACTA 660
CAAAGGGAAG AGCCTGAACA AAACAACAGA GGCAAGAACA GTCTGGACTC TAGAGCCCAG 720
GCTGGCAGGG TGCAAAGTTG TCCTGAGCTC CTGTATTTGA AGCCTGATGC TGTTTCAGTG 780
TTTGCTTCCT GCAGCACTGG CAGGAAACCC AATGAAAGGC AAAGCTGTTG GTCACATTTA 840
CAATCCAGCT GAAAATCACT ATTTTTCATT ATTTTCTAAA CAGGCATGTA GGGAAAGTGG 900
TCTCCTTTGG TGTTGGTAGT TAACTGCTCA TTGTCTGAAG TTTTCTGCTC TCTCAGTAGT 960
TAAGCATATT CTGAATTTGC TCCATGAGCA AGCTGCATAG TCTCTGCTCC AGCTCCCAAG 1020
CCCTGCCCAC TTCACACTCT TCTGTATGGC CTCCTTTAGG TAAACAAAGA GCTAATTTCA 1080
CACTTCATTC ATGAAATAGA TGGCATGCAG AAGGCAGCTG GGGGAGGGCT CCAGAGGTTG 1140
GCACTAAGCG CTGCTTCTGT TACAGGCCAT CAGTATAAAT GAAGCTGTTA CTTAACTATG 1200
GACCATAGCC TTAACACTTT TCAGGGAACA GGAATACAAG TTATTAATAT TCAAGTTATT 1260
AATATTTAAA ATATTAATCC TCCTGAGATG TCTTTGCCAA ATCAATTCTC TGGTGAGGTT 1320
CATTCTGGGC CCTGTATATA TAACAATGCT TACATCATTG TATGACGGTT AAGGGCTAGA 1380
AATGACTAAA TTGTGGTGGG TATGCTGTGT TGGTGTGTTG CCACTCTTTG AGGCTATACT 1440
GTTTGCACTC CAGGAAATCC TTGCTCCTGG GTGAATGCTA TTTTAAACAT TTCAGTGTTT 1500
GTAAGATGGA GGGAGTCCTC TGGCTTAAGC TTGTCCAGCT GTCCACTGCA CCTGCCCTTG 1560
TATCACAAAA TAGATGAGAC GCCATCAACA GCAGAAGTTA AACTTCCACG ACACTTATGC 1620
TGTTTCTGGC TGTTCTTTTT TACTGGCTAT TTATAAGGAC ATCTGTCTTC TAACAGTCGT 1680
ATCTTTTATC TTTCCTCTCT ACTGAGGGAT AAATCACAGC TTATATCCCA TACTGCCACA 1740
CACGCTCATA GCTAGGGTGA TTAGAAATGT AAATGGGGAA GGCATTAAAG TGCCATAATT 1800
TCCCTTTCTA TGGGAGCAGA GGGTGTTTAC AATCAGCACA TTGAGGGATA TTTGCTTGAG 1860
ATGTGAGCAA GATGTGAACA GAGGAGATGA AAGAAATATT CATCTTTCTT TGGGGGGGGG 1920
GGTATGAGAC ATCATTGTTC TACACATCCC TGGCTTTCCT GGAACTCATT ATGAAGACCA 1980
GGCTGGCTAG AAATGCTAAC TTTCTTATCA GTGGGTGCTT TTTTTATTGA TTTTGGGAAA 2040
CAGGGATAAT TCAAAGCATT TACTTCTGAC TTGTATTTTA AACTTAGACT TGATTATGGG 2100
GGCTGAGGTT CACATTGTTT AAGAACCTGG GAAGCACCAT AAGTCCACAG TAATACTTGG 2160
TAAGGTGTGC CCTGTCTTTA GATCACTGAA GAATACATGT GTACAGCTCT TGTTTCCAGT 2220
GATAACAATA AAAAGTAGGG TCACCAATAA ACCGATCTGA ATTCACTAGA GTGATTTTTA 2280
GGTAGTGGAA AAAGATTAAA GTTTGATACA TTTGGATTGA AAAGCATGGA TCTATACATC 2340
TATAGCCAAA GGGAGGTGAC CTAGGGGCAG AGTGGAGTGT GTTGTTCTTC TTCTTGTTGT 2400
TGTTGATGAT GATGAAGATG GTGACAGTAA TCTAATTAAA TTGGATGCAA TAGTGTCTCA 2460
ATCTATGCAC ACAGTTTACT GTACTGTTCC TGACATTCCA TAAGCACCCG AAGAGCCTCA 2520
CCATATCAAG ACCACACATC ATACACAAAG CAGGCACGTT TTCATAGCTT CTGATGCAAT 2580
TTTCTATCCT TTAGAGGTAC AGATGATGAT TTCAGCAGAA TCTTGCTATG TGTTGATCAT 2640
TGTGGTCAAA ATCATCTTGA CTATTTCTAC ACGAAGCAGC CATCTAAAAA TAGCACAGCA 2700
CCGCAGGTTG AGATCTGGCC AGGATAATGA GAGGCTAATC TAGAAACTTA 2750