EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-15786 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:68315670-68318420 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr3:68317406-68317421TGAACTTTGACCTCA-7.03
Hnf4aMA0114.3chr3:68317404-68317420AGTGAACTTTGACCTC-7.5
KLF4MA0039.3chr3:68317093-68317104GGAGGGTGTGG-6.32
Klf1MA0493.1chr3:68317095-68317106AGGGTGTGGCT-6.02
NR2C2MA0504.1chr3:68317406-68317421TGAACTTTGACCTCA-6.42
Nr2f6MA0677.1chr3:68317406-68317420TGAACTTTGACCTC-6.83
RREB1MA0073.1chr3:68317263-68317283ACACACACCACACACACACA+6.16
RREB1MA0073.1chr3:68317276-68317296ACACACACCACACACACACA+6.16
RREB1MA0073.1chr3:68317298-68317318ACACACACCACACACACACA+6.16
RREB1MA0073.1chr3:68317337-68317357ACACACACCACACACACACA+6.16
RXRBMA0855.1chr3:68317406-68317420TGAACTTTGACCTC-7.22
RXRGMA0856.1chr3:68317406-68317420TGAACTTTGACCTC-7.42
RxraMA0512.2chr3:68317406-68317420TGAACTTTGACCTC-7.38
Enhancer Sequence
GGGAACGCTT GCTGCTTGTA AGGTAGGTGA CAACTGTTGA GCTTAGTCTC CTCCTCCCAG 60
GGATCATGAA ACTACATTCA GCAGTTGCTT AATCTGGAGC AGTATGTCTT ACAGAGGTGG 120
TGGGATGCTT CCGTGCACAC AGGAAGCGGG CAATAGCACC ACCCAGCCTG AGCACAATGG 180
CACAGTCCTG TAATTCCAGC ACTGGACAGG CAGAGGCAGG AAGAGCAGGA GTCCAAGCTC 240
ATCCTTGGTT ACACAGCAAG TCAGAGGCTA CATGAGAGGT TGTCTCCCCA CAAAACAAAA 300
ACTCCTTTCT CCTTTTTAAT AACCACAGAT CTTGAAGTGT CGTTTCTTTG TGCTTAGATA 360
GGTGTATTGT GCAGTGGAGG AGTGGAAAGT GATTGCTTGA ATTTAGTAGT GACTTAATGT 420
TTAACTCTTA GGCCTTGGGG ACTTCCTGAG TATTTTGGTT AAAGGGAGTG GGCATATTTG 480
TGGGGGTTTC TGCAGGTCTG GATACTGTGA GATGGGACCA CGTTAACACA GAAAACTTGG 540
CAGTTTCCCT TGTGTGTTAA TGCAGATTCA CCCATCATGT CAGTTACCCC TGTAAGATGT 600
GGGGTAGAGA AGTTTCCAGG TGCCCTTGGT TATGACACTC ACTGTGCAAG CCCTTCCCAC 660
GGATCCCTTC CAGAACACGC AGTGTGTTGT TGGAGAAGCA AGCCAGGCCC TCCCTTCCCC 720
AGCCCAGCCA TCGGATTCAC AATGATTGGA TTTTGGAGTT TGGGTTTGGA GTGAAGGGTA 780
ATTACTCTGT CAGAGCGTGA GCAGTGAATC ATAGCGAGCG GAGGTAGAGG AGAAGACGAC 840
TCCGTCTCCC CACCTGCAGC GGAAAGCTGT TGAATGTCAA ATCTGGTTTG CAAGTTTGAA 900
GTGAATGTGT TTCCTTCCAC GTGTCATCTA CTTGAGCAAG TTCACACCTG TTCATTCGGG 960
CATTGGTTAG TGGAAGCATT GAGGGAGAGA GAGCAGCCGC GCCTTGGGGT CAAGGCATTT 1020
TCAGGATTAT CATCCCGATG CCCCCCCTGC CTTTCACCTT CCCTGCAGTG CCCCTTCCAT 1080
CTTGGCTCTG TGAGCTGCAG CCGCCCTTCA CACAGAGCCT GTGAGATCTC CCTGACTCGG 1140
TAAAAGCCTC CCCCATTCAG ATGACATCTT GATAGAGGAG CTGCTTGATA ACACAAGAAT 1200
CAGGAACGGT TTGCTAAGGA CTCCCCGGAT GGTGGGCATC TCCCAATTAT TTCCTTCCTT 1260
GGTGGCTTGT GTTCTTTCTA GCGTGGTGCT TGGCTGGAGA AAATGGTTTA CAAATCAGTC 1320
AAGAGCAGAA CTTCAGGCTG AGAAGATGGC TCCGGTGTTA AAGTGTTTAC CATGCATGCA 1380
TGAAGACCCA GGTTTAGGTT CCTTAAATCC AAGTGGAAAG TTGGGAGGGT GTGGCTGCCT 1440
GTCTATAGCC TGCTGTGCTG GGACGTAGAA AGGGGGATTC CTGGGGTACC TCAGGAGTGA 1500
GCTCAGTAAG AGACCCTGCC TCAGTCTGTG ACATATGTAA GAAGACAATT GACACAAGGC 1560
CGCACACACT ACACACCCAC GCACACCACA CACACACACA CCACACACAC ACACCACACA 1620
CACACACCAC ACACACCACA CACACACACA CACCACATCA CACATGCACA CACACCACAC 1680
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACAGAAAG GAGTGAGAAA GAACAGTGAA 1740
CTTTGACCTC AAGTAAAGGT GAGATGCAAT CTCATGTTTG GCCTTCAGCT GCCCGCTGTG 1800
TAACCTAGTG ACTGAGCCAG CCAGGCTGAG AGCTACAAGC CAGGTAAGGA TTGTGGGGGA 1860
GTCTACAAAC GTCTCTCCCC ATCCATCCAT TTTAAAAAGT GAAAAGCTTT TGAGCGAACC 1920
CCACAATGCT CTGTAATACT GTCTAAGAAG TCATATTAAG TATGACTCAT CTTACACACC 1980
TACCAGTTAT TACTTAAAAT GCTAGGGTGG GCCATTGTCT GCAGGGCAGC ACTGTCCAGA 2040
CCCTTGATGA GTTTGCTCCT CTGAGAGGCC TAGCCATGCT CCCATAGACA AATGAGAGTG 2100
TTTTTCCATA TTAAAGCCAT GTTATTGGGG CCCACGGTAC GCTTCCCTCT CCCTGCATAA 2160
CTGCACAGTG ATTAAATATT GACTAAGAGC CAGCGTTTGA CAGCCAGCAG CCTCACCCTG 2220
GTAGATGCTG ATGTGTGAGA CTGAATGTAA ATACAGAAGC ATCCCCCGCA GGGCCAGCCT 2280
TTTTCCTTGG GAAGTGGGCA AGGCCTGAGT TATGCATGAG GTGTCAAACC CAACTGCTCC 2340
AATAGAAGGG TGTCATTTGA AACAAGTAGT TCCTTAAAAA GCAACCCAAT TCTGTCAAAA 2400
GAAAATATAT TTTCCTAATC AATTTGAATA ATAAAGAGGC TGTTTGTGAG TTTTCACAAA 2460
ACATCCAGGG TGTGCAGTGA ACAAAGGAGC TCTCCCGACA CTGGGACAGC TCTTCCTTTC 2520
AAAGACTCTG GTTGTTTGGT CTGTGTGAAA CAAACTGACT GAAATCATCA GATTTACTTC 2580
TGGGCTGTGG ATGTCTGATG GGGAAGTTTC AATACATCTT TCTATGCCCT GGTCACTGCC 2640
TGTGTTCTTT CTTGCCACTG TTGTAAGTAG GTTCACGTCT CCCCCTCCCC CTTTCTGCGG 2700
GAAAATGGCA GGTTTAGCTT GGTTTTCTAG AGGAAATTAA TTTTTAAAAT 2750