EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-15744 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:60303040-60305100 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
TTCAGGAAGC CAGAGCTCTT TGATAGAAAA TGGAAAGCAA CTGAAAACAA GGAAAGGCTA 60
GAAACAATCC TGTAGGCTAA GCTAGCCTTG GGAGTTTCCC AAGGCCCATC CCTTCCTCCA 120
TCCCTGCATG AGTCAGTTTT CCAGTGGGTC TACACCCATT TACCCTTCCT TTGCCAACAT 180
CCCTGAATAC ATTCTCAGTA ACCCTCTAAG CATTTGCCAA AGATCTTTCT AGAGTGCAAG 240
TCCAGACTCC ACCCTATCGC CCTGGTCCTG CGAACTAGTT CATAGTTTGC TGAATAACGT 300
TGAAGTTCCT GGCTTCCTTC TCTGCCGACA AGTTAATCTC CTTTTAAAGA AAGGAAACAG 360
ATGACTGTAT TGATTCTACA GGGCATTGAA ACAGATAGGC TTCTTGCACG TGCTCTGCAC 420
TTTGCTCCAC CGTCCCAGGG CCCACTTGTG CCACACTCCC TGTGCCTATG ATTGTGTGCA 480
CGTGGAAGCC AGGGGTCCAC ATTAGGTGTC TTCTGAAATT TACCTTCCAT CTTATTACTT 540
ACTTTTTTGA GTGTCTCTCA TTGAGTCTGG AATTCAGAGT TAACTGGCTA ATGGGCTGTG 600
AATATCTCCC ATTCTCTACC TGATCCCAGC ACTGTGGTTA CAGACACTTG CCTAGATGTT 660
CGGAATTTGA ACTCAGGTTC TCAGACCTGA GCTCCAGCTT CTTTACGCAG GAGTCATCTC 720
CCTAGCCAGC TAGCCTATCC AGGCAACTCT CTTTTTATCT TAGCAACTTC TGCACATCCT 780
TCAAGGCGCT GCTTGCATAA GTTCCTCCAG GGAGCCTTCC CTCCTTTTCT CAAGGGCATT 840
TTGGATATTT GCCTACCATC TTAGCACCAG CTGGCTGGTG CTCTTTTCTA CCATGCTGCT 900
CCAAAAAGTA CAATCCGTGT ACTCCATCCT CCTGCACTTA CCTCCATCCT ACCTATACTT 960
AACTACTTCT GCCATAGCTC ACATTCCATC CAGTTGCTGG AATGAATGCT GAGAAAGTCC 1020
TCAGGCGCTG GTGGTTACTA ATTGTCAGTT AGAAACTCCC TGTCTCTGTT CTCTGAGAAA 1080
ATGCTACTGT CATTCTACTT TGTTTCCATT GTTGGGGACT TGGGAACTTT TAATAATTAA 1140
CACTGAGAAG TGGTACTAGT TAATTAATTA ATTATTTCAG GAAGGGATCA GTAAGCAGCA 1200
AGTCCGTGTT TCATGGACCA GCAGAGGATC AAGATCTGTT ACTAGTACCT CTGCAAACTA 1260
GTGGAGTACT TTATTTATTT ATTTATTTAT TTACTCCGCC TAGGAGAGTG TGCCTGACCC 1320
ACTCAACAGA AACAGGGAGG GAGAAATCCA GTTTGCATTC ACTCACCTCA ACTCATGTTC 1380
AAACCATGAA ACAAACGTTT TTATAGTTAA AAATCATCCC TGACGAAGTT ATCAGAATTC 1440
CTTGAAATTC ACTGGAAATC CCGTCCGCAG ATCTTCAAAC TTTATCTCTT CTCAGAAGCC 1500
CAGAATTCTT TTCTTTCAAA GCCAAGTTAC AGGACAGCAG CTAATGAACT AGGAGCTGGT 1560
GTTTCATTTG CTCAGGCGGG CAGTTGCCCA GGGCTTGTTT GCGTGGGAGT ACCTCTGCAG 1620
CGCCTAAGAT GTTATTTTAT TTTAAAAGAG GGAGCCCTGC TTGCTTTCTG TACACCACAC 1680
TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG AGCCTTTAAA CTGCAAGTTT TATTTGCCGA TAGGACAGGA 1740
AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT TGGGTGACGA TCAGTTTTCT CGCAGAACTC CAAAACTGTG 1800
AGTGCTGAGA AAGATACCCA CCAACACCCG TGCAAGCTTC TTTCCCGCCC TTCGCCTTCC 1860
AGGTTCCAGG CGATGCGCTG CTTCTGCTGC TGCAGGCCGG GCAGCTAACT CTAACCTTCC 1920
GTCTAACCTT GCGGGCCTCG CGGGCTGGGC GCGGAGCCCC GGGAGCTGGA GCGGCGGTGA 1980
GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG CGAGCGGGCG GGCGGGCGGG GGCCGGGGCT GCGCGTGGGA 2040
GCTCTGCGCG TCCGCGCGCC 2060