EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-15712 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:55583800-55586430 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr3:55585756-55585767GTTTTAATTAA+6.14
PROP1MA0715.1chr3:55585427-55585438TAATCAAATTA+6.02
ZNF410MA0752.1chr3:55585439-55585456TACATCCCATAAGATTA+6.59
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03795chr3:55583851-55585934Cerebellum
mSE_03795chr3:55585999-55588431Cerebellum
mSE_04718chr3:55583783-55585294E14.5_Brain
mSE_04718chr3:55585525-55588573E14.5_Brain
mSE_05863chr3:55585786-55588516E14.5_Limb
Enhancer Sequence
CAAGTAGTTA AATAATTTAC CGGTATACGA GATATCTAAC GCCAAAACTT CGATTAAAAT 60
CAGGTGAATT ACACAAAAAT ACATCATTAA TTTTAATTCC TCTCCATGGA CAATTCAATT 120
AAAGTAAGCA CGGAAGGAAG CAGTCATCAG TGCGGTTTAG TTTTTCTTCA ACAAGGAGAG 180
GTGCTGAGAT TATGGAAAGG ATTCAGCTAC AGGCACAATT CATTTCTCGG ACTACGGGTA 240
GCGGGTAGCG GACGATCTGG GTAGCAGCAG CTAGAGAGAC AATCTAGCTT TATTCTAAGC 300
CTCCCAGTCA ACCCACAGGG ACAGCAGCCG CCCAGTGTCC GGTTTTATGT AAATCACTGT 360
CGGCTCCGGG CGTGGAGGGT GCTTCAGGAC GCTGGCCAGC CTGGCCCGCA ACACTCTAGT 420
TTCTTAGTCC TCTTGCTCCA AGCGAAAATC GTTCGGAAAA GGCCTCAGTT GCATCAATTA 480
GTTTGCGCAG AATGCTTCGG TGTTTAGCTT CGCCTTAACC CAATTAAGCC GCACAGCGAG 540
CCCAGAAAGA TGCGCCACCT GCGCCTGGCT GCAGTCGGCG GCCGTGGGAT CCTGAGTCCT 600
TCTGTTGGAC TGAGGGAACC AAGGCCTCGG CGTCGAAGCT ACATCGAGTC CCATAGTCCG 660
GGGTGAGGCA CGGGGCGCGC GCTCACCCGG GAAGGTGAGG GCCAAGTATT CCTGGGTGTT 720
CTGAGTACAG CACACGCTTG GCTGGGGCCA TTCGAGGGCG GGCAGGCGAT GAGAGCGAAG 780
GGCACCGAGA GTGTTTTGCA GCGATGGATG TGAGTGGGGG TCATCCAGAC ACCCAGAAAG 840
CTTTACAATT AGCCTGAGAG CAGATGAGCC AAGGAAGACA GCTGGGTGGG GTAGGGTATA 900
CGCAAGGGTT GTGGGGAGAG CGCTTGCCCG TCGCACCCCA TCCTGGGGAA CTACGCGTCC 960
CCAGCGGCTG CTCCCTGCCT GCCGCACAGC TCTTTCTTGT TGATCTGGCG CTCTGGGTTG 1020
CCTCTTCCAG CCCCTCTTCA GCTGCCAAAA GGTAGCTGCG CATTCACCCG CGATGCCTGC 1080
AAACTGGGGA GGGGCTTTGC AGGTCCCCAG TTCCCTCTCC CAAGGGAATG GTCTTGGGGA 1140
ATGGAGTAGG AGGCCATCTA AGCGCCAAAT GTGATGTACT ATTTTAATCT AATTCGGAAT 1200
CTATCACTCT TGGGTAACAA GAAACGAAAT TAGAGCTGGC CCTGTGATGC TTAAAAGGTG 1260
GGAGTCTTCA GCAGTAGCCC ATTAACAGTG CGTACACAGG TGCTACCATA CCCGGGCACT 1320
GAAAATTCTC TTAATTTGAA ATTAACAGAA CTTTGTACTA AAGGCAGAGA ACTGAAAACT 1380
ACGACATAAG CCCTAACTAC CCTATCTTTA GTTCATGTGC ACTGAGGACT CAACTGGTCA 1440
TGGTACTGGA AGGAAGAGCG ACCTATAAAA CCCTCCCTAG GGTTCCAAAA TCCAAAAGCT 1500
CCTCAGGTTC CAAAAAGAAA AGCTCATTTC TTTGAAATTT CCAAGATGAA ACTTAAATAA 1560
ATAATAAAAA TCCCTAACCT GAATGGTTAC AAATTATTTT TTTTGGAAGC CATTAGCCAT 1620
TTTCTCATAA TCAAATTATT ACATCCCATA AGATTAGGAA CCTACTGTTG GTCACCACTG 1680
AGGGTTTCTG AGGTGGAAGA TCCATCTTTA AGCCTGCAGG GGCAAACAAA CTGTAATGGC 1740
CACACCTTCC AGTGCCAAGC AAGCTCATCT CTGTGAATTC TCTAGATCCT TCTCTACAAG 1800
ACAGCTCACT ATGAGATGGC ACTCAAGCTT TCTCTAAATC TCAGAAAACA CCTTCAGGAA 1860
GTGTTTCCAC TACAGCATAC AGCCCTATCT GCTGTCTGGT ATTTCAGCAC TGGCCAATCT 1920
AGCTACAGAC AAGGGAAACT GCAAACAGGT GAACTTGTTT TAATTAAAAG GCTCCATTTT 1980
TAGTTGGGTA GATATCATCG ACTCCGTTGA GCAATACTTC TTAAATTCCT CTCAGCAAAT 2040
GCAAATGGGG AAAACCTAGG TTAAAAAGAG AAGAGACTCT GCCTAAGGTT TGGAAACATT 2100
CTGACTGCGA ACACGAACAC GAGTGAAGAC TAAAGAACTC CCCCAGCTGA AGCCAGCAGT 2160
CAGTCAGTAA GCAAAGTTCT AACTTGCACT AAAAAGACCC CAGGGATTAA CGGGCATTAA 2220
TTACCTTACT CTAAATGCAA GTTAGTGACT TTGTTCTAGA AGCCCCTTTG ACTTCGCTAA 2280
TTGGTGGATG ACCATTAGTA CAACTGGATA GCTCATCAGA GGTGAACAGA CAAGTGGGCT 2340
TTTCAGCAAA GAGAACCACT TGTCTTCACC AAGTCTTTTC CAAATGTCAA TATGCTTCAA 2400
GTTATACCAA AGCTGGGAGA TTTCATCTTG CTTTTCAACC TGTCTAGGTG GCCTGGGTGG 2460
GTTTCTGCCG GCAGCAGTTT CCTACCTTTG GTTTCTATGC TTCTATCCAC GAGGGGGGAT 2520
TAATTAGCCG GGCTGAAGCT GGAGGAGGCT GTCGTGACGA GCCCAGTGGC GATTGGCCGC 2580
CCGCCTGCCT GGCCCTGCCT TTATAATTTC CACACGAGTG CATCTGGGCT 2630