EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-15703 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:55325840-55333040 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr3:55331675-55331686AAGAGGATTAA+6.14
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Foxd3MA0041.1chr3:55328766-55328778AAACAAACAAAC-6.32
LMX1BMA0703.2chr3:55332977-55332988TTAATTAAAAT-6.62
RFX1MA0509.2chr3:55325873-55325889TGTTTCCATGGCAACG-7.34
RFX1MA0509.2chr3:55325873-55325889TGTTTCCATGGCAACG+7.35
RFX2MA0600.2chr3:55325873-55325889TGTTTCCATGGCAACG+7.5
RFX2MA0600.2chr3:55325873-55325889TGTTTCCATGGCAACG-7.61
RFX3MA0798.1chr3:55325873-55325889TGTTTCCATGGCAACG+7.66
RFX3MA0798.1chr3:55325873-55325889TGTTTCCATGGCAACG-7.7
RFX4MA0799.1chr3:55325873-55325889TGTTTCCATGGCAACG-7.01
RFX4MA0799.1chr3:55325873-55325889TGTTTCCATGGCAACG+7.6
RFX5MA0510.2chr3:55325873-55325889TGTTTCCATGGCAACG+7.32
RFX5MA0510.2chr3:55325873-55325889TGTTTCCATGGCAACG-7.39
RREB1MA0073.1chr3:55329219-55329239GGGTGGGGGTGGGGTGGGGG-6.74
RREB1MA0073.1chr3:55329223-55329243GGGGGTGGGGTGGGGGGGGT-6.74
RREB1MA0073.1chr3:55329218-55329238GGGGTGGGGGTGGGGTGGGG-8.54
RUNX1MA0002.2chr3:55332522-55332533AAACCACAAAC-6.02
STAT1MA0137.3chr3:55327115-55327126TTTCCCAGAAA-6.02
STAT3MA0144.2chr3:55327115-55327126TTTCCCAGAAA-6.32
Sox3MA0514.1chr3:55326999-55327009AAAACAAAGG-6.02
ZNF740MA0753.2chr3:55329232-55329245GTGGGGGGGGTGA-6.78
Enhancer Sequence
ATAAGGTATG AGATGGTGCA GCTCAACAGT CAGTGTTTCC ATGGCAACGT GCTGGCAGTC 60
TCCATTTACC AGTTCCTTCA GTGGATAAAC ATGTTTTTGA TTTGTTACCC AGTCCATATG 120
CTGCTTTATC GGTTTCATTT TAATCTTGAT TGAGATGCCA CACCCCCTCA TTCCTTTTTT 180
TCACCCATTC TTCACACTGA CATTTGCCGG CTTTCTTTCC ATCGCACATG CTCAGTATCG 240
ATTTCCCCTT ACGGTTAAAA GGACAGTATA TTCCGTGCTG ATGCCAAAGC CTTTGCCTGT 300
TGTTGCTGAT TGCAGCAATG ATGTTTCCAG TGCTCTCCTG CCCTGTAATA AATGGAACTA 360
CAGCAGCACT TCAGTGTGTG TTCTATAGAA GTATATACTG TCATTTTAAA GTTACCCAGC 420
CCAGCCTTAA CCTTCTCAGA CGGTGAGACA ATGCATTTAC ACCTTAGCAG TAGAAATGCC 480
TCCCAATACA GCGGGCTACA GAATGCATTG TGTGTGTCAG TAAGCTTGTG TTTTCAAGTT 540
CTCCACCTTT TCGTTTTGTT TCTGTTTTAC CGTTCCCTTC CCCCTCCCTC TATGTACTAG 600
CTCCTGCATG AATTTACTTT CTGAATTTTG TAACTGTCAG ATTCTTTAGT TGGCTTCTCT 660
GCTTGAGCAA GGGGGTCGAT GGGAAGTGTG ACTTTGTTTA ACCAGCTTAT GAATTCTGTC 720
CCCTCGTTTC CGATTCCAGT CAATGGCGCT GGCGTCTCCT GCCAGGGGCA TTGTGTGTGT 780
ATCTCTCTAG AGTTACCCAC AAGCGTGATG GCTTGCGATG GTTTGAGACA TGAACTCTGA 840
GAAGTTCTAG GGAACTTCTC TTCACCTTAA TGTCTCCAAA ATGATCTCCA GGTAAAAGCT 900
CCATGTTATA GCACTCACCA AGGAAAAAGC ACCCCGAGCT TTGGCATTTG TTTTTCAAAT 960
AATAGAGTCT GTTGGTTGGC GCAGCACAGT ATCTGCCTGA CACCATTTCA TGGATCAGAC 1020
TGCCAAGTTT TACCACAAAA AAATTATATA TATATATATG TTCATGTGTA TATAGATACA 1080
TATATACTTT ATATATTATA ATACATATAC ATTTCCCCTT TGATTATTGC TCCTAATTAT 1140
TTTTTATAAT TAGGGTCTCA AAACAAAGGG CTTAGAAAAG CAGAATATTC AGACAAATAA 1200
CCAAAATCAT GATCAAAGTC ATGATCGTTT CTAGGTCTGC TTATAATAGG AAAACACCCT 1260
GGCTCGGTGA GAGGATTTCC CAGAAAGGGA TCTTTGTGCC TTCAGGATTG GTCCAAGGGA 1320
GGGGATCCCA CATCTAGTGT TTCATTTACC TAAGCAAATT AGCTCTGGGG GAGGGGGAGT 1380
TAATTATGAT TCGCCTGCAC ACAGACCCAG CTTTTGACTT TCCAGCACTG AAGAGAGTGC 1440
AGCAGGGTAC ACAGTTCACA AATGCTGATC TCCCCAGTGG ACCGCCCATG CTGTGCACAC 1500
TCAGTGCCCT TTCCAGTGCC CTTTCAGGGC CTTTCCGGAG TGTGGCTTTG TGCCAGGGGC 1560
AAAGGCTAAG CAGAAGTCTA CCTGTGGTGA TTAGCCTTGC TCCCTTTCAT ACTTTATGCA 1620
AATCGAGCCG TAGTGGTGGA TGCAGCCTTT CTTACCCTGT GTGTCCTGTC CTGGGGCGGA 1680
TCAGCCAGAC GTCTACATGT AGAATTGATA GATGGTGAAA AACAGGCCTC AAGTGTGTCT 1740
AATTACATCT GGACTTATTT GTATTCTTTT TGTTTTTTTT TTTTAAAGCA TCCATAAATT 1800
CATCTAATCT CAGAAAAAGG AACATTCTGA GGAATTACAA AACTTATAGA ATTAAGGGTA 1860
GAAGCAAAGT GTCAAGTAAA CACAATAATT AATACACGTG ATCCAGTATT AAAAAGACTA 1920
ACTGCAAGCC TAGCGACAGT CCCCATCGGC AGACAAAATG ACACATCCCT GAGTAACGGG 1980
CGGGAGCAGA TGGGAGATTA TCTCTTTCTT CTTCCACACA TAAACCGCTC TGCTTTCCAG 2040
CTGGGGGCAG TAACAACAAT GTTTATAGTT ACTGCTGCAC TAAACAGCGT ACACAGTATG 2100
TAAAGCTAAA CTGGAGACAT GACACTAAAA TCTCATTGCC GTCTATGCTT AATTAGGAAG 2160
TTTTATAATG CCATTTAGCC CCAGAATGAA CACGCTCTCC TCGCTGATCA CAAATGCTTC 2220
CCTTTTATCT CCACGGAAGT GGGAGCATTC ATTTACCCAC AGTGGCAGGC CAACTCCTCA 2280
ATATAAACAA TCGTTGACGG CAGAGGACCC CAGTCCCAGC GCTTGTGTTT GTAAGTGCTT 2340
GTGGCTGTTC ACACTGTTCT GGGCAGAGTA CTCCTGGGTC CCACTTGCAC TTACAAAGTA 2400
TCTCACATGA GGGTGTCAGC TGCTAAAACC GGCTCCTTGC AGTGCCCCAA ATCAGTGAGG 2460
ACTTCTTAAT AGACATTTTA TCGATCATGG AGACATGATG GGATGGAGGG GGGGTGTCCA 2520
TTTTCTTCTT TCTCTTTTTC ATGCCCCTGA TTCTTTCTCA GCAACTCTGC TTTCTACCTA 2580
CAGCCAGGGC TGCATTTTCT GGCTGGCCCA TTTATCCAGG AGGCCTTACC ACCCAAAGCC 2640
CAAGCCCACA AGCTCGCTGG GCTATTCCAT GCCCCCTGAG GCCTGAAACA TTGCTTCTCC 2700
CTGCTGCAAG TCACAAGAAA ACACACCCTG CTCTAAACCT CCCTCCCCGC TGCCAAAGTG 2760
GGTCTAGTTG CATCATTTCT ACCTCTCTCA AGTGCAGATG TCCCCCGTGG CCCATATCAT 2820
GGCCGAGAAC ACGCAGAAGA GACTTCTGCA TCTGAAGTAT ATGCAGACCA TCAGGACCGT 2880
GACCAAAATG AACTAACTTG GTTAATAAAA ACAGAACCAG CCAAACAAAC AAACAAACAC 2940
AGGAGGCCAG TCCTTTGAAA ATGCTAAATA GGATGAAGCA TGGAGGTGAA ACAGGACAAA 3000
ACTGGTTGGG TTCCCAGGCA TGACATGACT AAAATGTGCA TACTGGTTTC AAGCCCCTCC 3060
TGAAACAGTG AGTAATGAGG CAAACCCTGG CAGCCAGGCG CTGGCTTTGG GAGGCTATTA 3120
AATGCCGTCA TGCTTGGCTG TTAAAAGGAA CGGAGTCTAT TAAGTGTATC TTGCTGGGTG 3180
CAGTTTGAAA GAGGTGTCCC TATTGAAGCC AGATAGTGCC CTCAGCACAC TGAGATCTCT 3240
GCCCAAGGAG GCCTGCTTTG TGGCCAGTTG CTTTGACCTT GTGCTGAGTG CCAGAGGCTG 3300
CCAGAGGCAA GCAGATAGCA TGGGATTGAC CGCTCCTTCT AGCTCCCATC GCAACCCCTG 3360
GCTTCTTCTG TAACAAGGGG GGTGGGGGTG GGGTGGGGGG GGTGAGTTTA GAGCATCCAG 3420
CAAGTCACAG ACAAATTTCA AAACCAGTCA AACTTTGGTG ACACTTTTGG CTTCCAGAGG 3480
ACAGTGAGCA TTGGGTCCAG CAGTTGTCCC TTAATGTCCC CTGAGTGATG GCTCAGGCCA 3540
GGTTCAGAAA CCCCAGAGCA CTTGATAGCT ATTGCTGTGG CAAAAAAAGT CAGGAATAGC 3600
TGAGAGTGGT AGTACATGCC TTTGATCCCA GCACGTGAGA GGCAGAGGCA GGTGGATCGC 3660
TATGAGTTTG GGTCCAGTTT GGTCTATGTA GCAAAATCCA GACCAGCCAG GACTCTACAG 3720
TAAACCTTGC CTCAAGAAAA AAAATAATAA TAAGTTAAAA ATATATAAAT GAAGCACAGG 3780
AGAACCACCT GGGCATATTT CACCCAGCCA CACCGCTGGC TGTTTCCTTT TGATTTTGTT 3840
TCATTTGGTT TTCAGAAGCC TCTTGTGAGA GAATTTCAAC ATCATATATA TGCCTTTCTG 3900
TAACTTCAAC ATGTATCTAG AAATAAGAGA AAACCACGAA GCCTAAGTCC TCTCCCAAGT 3960
GGTATGAATT GAAAAGAGAG TCTATTCCTT TCTCTGGGGT TCTGGACAAT TCAGTATCTG 4020
CTAAATACTC TTTGGTAGCT ATTTGTACTT CACTGTCCTT CTTTTAAACT TTTTTTTAAA 4080
AAGCCTCAGT GATGTTTAAA ATGTTGTCCT TGAGAAGAGG ATTTGCATGC TGCAACACAT 4140
GAGTGGAGCC TAGCCTTCTT CCTGTTTTAA TTTTAAAGTT TTATTAGAAT ACAGCTACAT 4200
CCACTCATTG TCATGTTGTC TGTGGCTCCT TACGCCCTAT TGTGATAAGC TGTATCAGAG 4260
AACCATAGCC TGAAACCCAA AACTTGCCTA TTTGGCCTGT TGCAAAGTTT CCTCACCCCT 4320
GTGTTTAAGG GTGAAGGCTA GTTCTAAATT AAGAGCACCA TCTATTAAAA ATGCAAATTT 4380
CATGAGAATA AGGATGGGAC TTATTTAAAG TGGTATTTTT GCCAAAGTAA AAGTGAATAG 4440
TTGAACTCAA AAGAAGAAAT TTTGAGGTTG AATGTGTGTT GTTCCCCCCC GCCCCCCGCC 4500
CATGGTTATA TAAAAGGAAG AGTTGGGGTA ACCAGACAAC ATCTAAGATA GTCTGTAGGT 4560
TTTCATTTTT AACAACCCAG GAATAAATAA GCCTTTTGGC TCAGCTAAAA TTGTACTTGC 4620
AGTAAAACCA CCCAGCCTGT GACACAGCTG TGAGACTTAG TTTATGTTTT TAAATTTTTA 4680
CAGATTTGCC TAGGCTAAGC CCTGCCTGTG GGGATTGACT GGCTCACTAC TATGATGAGG 4740
GGCAGCCACC TGGCTGTTCA GTTTCTCTTC CATAAGGAAA CCAGGGGCTG CAGAGCAGAT 4800
GAAGGAAGTA TATTCAGCCT CCGGAAGCCT GATACTAACA CCCTGCAAGG GCCACCACTG 4860
TAACTCCGCT GGAGGCTAGG AAGGTGACAG AGCCAGGCTG GTTGAGACCC TTTTAAACAT 4920
TTAATCTCAA AGTCCTGTGT CGGATCAAGA TAGCTAGCAT AGAAGCACAC AGTCAGCCTT 4980
CCCAGGAAAG CAGGCCATGA TATCTCAGAG AGTCACCTTG AGGAAGTCAC ATGGAAGACT 5040
GGTTCTATCC TGGTGCAAGC CTCTTTTTTG CCATTTTAAG GGTGACTTTT ACTCTCGTGA 5100
AAATCCACAC TGTGTCTCCA GGAACTCTGG CAAGGCCCCC AAACGACACA ACAGCCAAAC 5160
AAAATAGAAC CGCACTAACC ATGACAATAA ACACAATGAA ACGAAGAGGG ATACCAGGAT 5220
CGATTTGTTA GTTTAATTTT AATGGCAAGC AAATTATAAC TTAGTCCCTA CAGAGTGAGG 5280
GTTAGCAAGG AGCGGGTTCC TGAGATTAAT GCCCCAGCCT CCTAGGTAGC ATGAATAATG 5340
GATGGACTAA AAGGCAAAAC GCACAATAAT GTTCTTTTAT TAATGAAATG AAGACTCGTT 5400
GTGATGGCTG GCAATAAATT AGGAAAAGCC AAAGAGGGAA AGTCATCAAC ACTTGCGCCT 5460
TTGAAAAATG TAGTTTCTTA AATCCAATAA TTACTGCCAT GACAGAAAAC ATCGCTGCAC 5520
AACAGAAATG AAGTACATCC CTTGCGAATC CTGCCTGTAT TGCAGAGAAA TATTTTTGAT 5580
CCATAGACTG TAAGGTCTAT TATTTGCTAA GAGAAAACAC AGTCCATTAC GGTGGATTGA 5640
TGGCGATGTT AAGCATTCTG GTGGCATTCC ATAGGTGAAC ACAATTTTTA CTGGGGCTCA 5700
GGCATTGGAA GACCTTCTTT AGTGCATGCT CATGGAATCT AGAAGACTGT GGGGTAGACA 5760
GCACGACCAA GGTCACATTA TTAGCTGGGC TAGGACAAAA GCTAATTCTC CCAACTTCTA 5820
CCCACTGCTG CTTCCAAGAG GATTAAGCTA AAGCTGTCAG ACAAGACAGG CTTTACAGAG 5880
CTATGTGGTG CCTACAAATA GCAAAGACAA AGCTGATTCT ATAATCCATA CTCCTGGATC 5940
TTGCCAGGGC TTCCCCTGGT AGTGTGGCAT TTCCCTGTTT AACCCTGCAC AGGGACCAGA 6000
TGCAGTTCAA GTTCATTTGT ACACCCTTCA AATTTAGATC CTTGTCAGAA ACAAGGATTT 6060
AAAACATCTG AGTAGAAGGT AGAATGTAGA CGTACTTCAT CAATAGAAGA GGTCATTGAC 6120
CAGGTAATTC TTCGGGTTAG GATTTCCTTA CGTGTCAGTG TGCCTGGTAC TGTGGTAGGC 6180
TCAGAGACAG GATAGATGTT AATTCCTTTA TATTCCCAGC TATATATGCT GTGTGCAGGG 6240
CCCTGAGTTG CTGGGCTAAC TGACATATTA CAACCATCTG TCACCTGCTA CAGTAGCAGC 6300
TAGAGGCTTT GTCAGAGTCA AAAAGCTAAC AGTTGGTGGT GGGTATTTGT GGTGATTCTT 6360
TTATAGAGGG CGGACGGGCT TACATTAGTC TGTTTCTCTA CATCATTTCA TTTTCCAATG 6420
ATAATGGTTT TTTTCAACCA AGCACCCCGT ACAGAGAGTG GGGACAGAGA CATACATACA 6480
GGCATCTGAA GTAAGTCATA CTTGGTTACC ACTGGTCTGC CTTGGAATCC TAAGGGCTCC 6540
TAGCTCACCT CTAACCTGTG GTAATTAACA TCAAAATGTG ATACTACAGC CTTGAGATTC 6600
TCTTAGGGGC TCTTAATGGG GTGGAGACTC TCTGAGGAGA CATTTGGGAT TTCAATAGCA 6660
GCAATACATG CTGGATCCAA CAAAACCACA AACACTGAGC AGAATAAATT ACAAAATAAA 6720
TCTGTCAGGA AGTCTTATGT GTTCATGGGA CATTCAGCCC ACACCTTAAG ACACATCCAC 6780
TTTGCAAAGG TAGGCAGTGA GGAGGAGACA CTGAGAATAT CTATGATATC TGATATCTGA 6840
ATCTTGTATG GGTGATAAAA AATAAATGAA TAAGTAAAGC CACCTCCCAG CCATTCAGAA 6900
ATGGCCTGGA GTTCAGACAC AGCATTTCAG AGCACAAATC ACGCTTCAAA TGCTTTTTTT 6960
TGGGGGGGGT GTTCTAGTTT GTTCACATTT GCATGACAAT CTGCTACGAA TACATCACTA 7020
GGAGTAGTTC TGTTTTCTTG CTGAATCCAT AAGTTCTGGA ATGCACAAGG GGGCTACAGA 7080
ATCAGGTTGT AAAAAGTAAA CGGTACATGT CTGAGAGGTG TGCCAATTGT GATAACCTTA 7140
ATTAAAATTC TAAAGAAATC ACAAAAGGCA GTACTAACTG TGATCAGACA CTGCAATGGG 7200