EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-15629 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:49668960-49672400 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BCL6BMA0731.1chr3:49670097-49670114CGCTTTCCATGAATTCC+6.65
Foxd3MA0041.1chr3:49671782-49671794AAATAAACATTC-6.74
LMX1BMA0703.2chr3:49670522-49670533GATTTAATTAA+6.02
MSCMA0665.1chr3:49672315-49672325AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr3:49672315-49672325AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr3:49672315-49672325AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr3:49672315-49672325AACAGCTGTT-6.02
Myod1MA0499.1chr3:49669896-49669909GGCAGCTGTCACT+6.04
NEUROD2MA0668.1chr3:49670278-49670288ACCATATGGC-6.02
PKNOX2MA0783.1chr3:49669895-49669907TGGCAGCTGTCA-6.02
TGIF1MA0796.1chr3:49669895-49669907TGGCAGCTGTCA-6.04
TGIF1MA0796.1chr3:49669895-49669907TGGCAGCTGTCA+6.18
TGIF2MA0797.1chr3:49669895-49669907TGGCAGCTGTCA+6.07
TGIF2MA0797.1chr3:49669895-49669907TGGCAGCTGTCA-6.44
Tcf21MA0832.1chr3:49672313-49672327TTAACAGCTGTTGC+6.44
Tcf21MA0832.1chr3:49672313-49672327TTAACAGCTGTTGC-7.06
Enhancer Sequence
CGAAGGTCTA ATCTCTGATA CATTCCAACT TTAAGGCAGT TTAGGAAAAA TCAGCAAGAT 60
AAAGTGACAA GTAACAGCTA CTGGGTGGGG GATGGGGATG GGAGAGGTGT GGCCTATGGG 120
ATGCCACTAG AGCACAGAAT TCCAAGCAGG CCAGGTATTG CCTAGGCACT ATGCGTTAAG 180
GACTCGGGTA CTGTGCATTA AGTTGAACAA TTAATTGTTT CTAAAACACA CAACTCCTTA 240
TGCCTTGGTG TGTGGAGACG TTTAGCTATG CCTAGTAAGC AGTGTCATAC TACTTACTGT 300
GTCTACATAG ATTAGCTTGC CTCACGGGTA GGCCAGTCCC AGGAAGTTAT TCCACCTGGT 360
GTTCTATTGA AGAAATGACT AGAATTCTCA GGACACATCT GGTAAAACTG ATTTACTCTG 420
TCTCTTTTAT CGGAGGGATA TTACCAATAC AAAAGGAGAT TGTATAATAT AGAAAACAGG 480
TGGATGAATA GCCACCCATT TAATTTTATT TATTTAATGC AATCTCTTTG GAAGGTGTCA 540
AAATGTGCTT TCTTGATAGG CTTGTGCCAT TTTAATAAAT AAATTAATAA ATTAATAGGA 600
TTTCTCTCTA GCACATACAA AGTCCTAGGT TCGGTCCTCT AGCATTGAAA ATAAAACAAG 660
CAATCCCAAA ACCTTTCCCA ACTTATCTAT ACATTAAAAG TGAACATTTA GGTGATCTAC 720
CAAAACGAAA TACATATAAT GCTATCACAA GACTTGCCAG ACACCTCCCA AAATGTAGGT 780
TACTAAATGT CCTCAGAGCA GAATTCACTG TGATCAGCTT GCACGAAGAT TAGAACACAC 840
ATACTACCAC AATTCAAGAA GATAGATTCT CAGAAAAAAA TTAAACAGTC CATGGAAGCG 900
GTTCGTGAAA GTTTAGCGAA GAGCCCACAA GTGTTTGGCA GCTGTCACTA CTAAGATACA 960
GTGAAGGAAT GAGAATGGAG ACACAGGAGT TTGCAGAAAT AACCAACAGA TATCATCCCC 1020
ACCCCCAAAG TGTTCTGTTC TAAGTGCCAT ATTAGGACAA TAAACAGAGT CTGCTTCTCA 1080
GAGGACTAGC GCGCAGCAGG CTGACTTCTC TCTGAAGTTT CGGATTCCAG GAACATCCGC 1140
TTTCCATGAA TTCCCTCCCA GCCCCTTTCT CTCTCTCTCA GTCCCCCAGC CCTCCTGCCA 1200
CCCCCGCATT CACACACTGA ACACAAATCG GTCTCATCTG GCGTCTCTTG ATCTTCCTCC 1260
CCTTCCTGTG TCAGTCCTTT GCCCCCTCCA ACTGACTTTG TAAGTTGGTT CCCGCTGCAC 1320
CATATGGCAG CTGAGAGGGC TGGAGAGCAA TTATGTGGCT CTGAACAAAG GAGGCTGTAG 1380
TGTCACTGTG GCCCATGAAT GCATGCGACA CGGTCACGTA TAGGCAGGCC TCCAGGCCTG 1440
TCAGTGGACA CTAAAGGGGT GGCTGAAGGA GCTGCCTCCA CACAAGCAGA GAAGATGGAG 1500
TGGCCACAAA TAATGTCAGT GTAGCCATGC TCCCTCTGTC TCTCTGCATT CTGAGTTCTA 1560
GAGATTTAAT TAAAAAGATT CTGCAGCCAA TCTTATCAGC TTATTAGGAG AAGGTGTGCA 1620
CAACATAATA AGGGATTAAA CACACGACTT TATTCACCCA CTCCTGAGCA TCTCCAAACA 1680
GTACCTTAAG TATTACACAA AGATTTAAGT TCGAATAGAA AGAGCAGCTT CATAACAAGA 1740
GGGGCACATT CGCTTTCTTT CTCCCTCCCC TTAAAGAGTT CTTCTGTGTG TATAACAAGG 1800
GTTAAGAAAG TCATGAATGG GCACTATGCA GATGCCAGGA GATGGTCCAG GCACTCCTGG 1860
AGGGAGGGAG GGATGCCTTT GCTTATAAGA AGGTAGCTTT CTAAAATGCT GAAGTTACTA 1920
CACATAACAA GAGAAGACAC AGTCAGAACC CCCAGCTTAT TTCCGTCTCC CTTCTCCTTA 1980
AGATCCCCCC AACTCTGAGG TGATTTGTCT CAGGGGAAAA TTTCGGCAAA ACAGGCATAC 2040
ATTTGTTATT AGTGAAGTTA AGACCACGCT GGAAGAATCG TAAATCCAAG CTGTAAATTC 2100
ACTGATTTTT TTTAGAAGAT TCATTTATTT TCTTCCATAG GAAATAAAAT TCTACTGCAG 2160
GGGAAGATCC CAATATGACT GCATACATTT ATGAGGATCA TTTTATGCTC TGTTGCTGTG 2220
GGCTACTGCT GGTCTTAGGA GACGAAGTTG ATTCTATTTG ATGTAGGGTA AGAATACAAT 2280
GTAGCAGAGA TCAGGCCTCC CCAGGCTCTC ACCCATCCGC CTATCCACCC ACCCAAGGAG 2340
GACTGCTGGA CTGTGAAATG GCAGGACCCC TGGTGTTGTT TAAAGGAACC TGGGCAGATT 2400
TCCAAAATCT GGTGTCTGTG ACCTTTTGCA AGTAGGTAAC AATAACATTT CTTCATGAAA 2460
TAAATCAATA GACATGAGTA GAGACTGCGT GCAGGATCTT CCCTTCCTAA TCTTTAGGAA 2520
GTGGAGGGAG GTTATGTAGC TCAGTTCAGC CCATTGCCCA CATGTATCCT TTTAGAGACA 2580
CTTTTAACCA GGAAGAAGTC CTCCCCATCG TCTCTTGGCT TGAGCATCAT TTGGTGCCTG 2640
TCAATGAGGA ACACCTTTTT AAAATTCACA GAGTATTTTT CCTTTGTACA TGCAGCCTCA 2700
AGCCTGATAG TTATCTGTCA GTAGATGAAA AAGCAAGATC ACCTTGGCTT TTCAGTTATG 2760
CTCTTCGTAA ATTCCCTTTC AGAATTACCA TAAATGTTTG CTAGTGCACG AAGCAGTCGT 2820
TAAAATAAAC ATTCATTAAA ATAAACAGAT CCAAGGGCTC TCAGTGCCTG TGTTTAGCAA 2880
ATAGCAAGCC CTCTCTGTTT CTACTGCCAT GAGTTATACC GCATGTCACG TCATCTGCCA 2940
GAAAGGCTTG CATAGAGAGG ATTCTCTGAG GAACCAACAG AGAGCAAGAA ACAAAGCAAC 3000
CGTTCAGCCC TTTCTATTCA CTGCCCCCAC ATCTGTTTGC ATGGCCTCTG CTCCATCGGA 3060
AAGGCTTTGT CCTATTGCCT GCACTTTATT GCTCTGAGGG GCTGGCTGCT AGCAAGGGTT 3120
TCTTTCTCCC TTTGCCTTGT AAGACTCAGG AATTGAAATC AGTCTTGTGA AACAGATATC 3180
TGAAGACCAG GCACAGAGAC AGCAGTTGGT CCTTTCTCTG CTCTGTCCAG TTGGAGTTCT 3240
AATGAGGGTT AACTGTAAAC TCCAGAACCT TCATTAATCT TTAAAGTAAA TCAGACAGAC 3300
AAGCTGGTTT CTTTAGGGGC AGGCAGAGTC TACTGAGCTC CCAGTTCTCC TCATTAACAG 3360
CTGTTGCTTT GCCTTGTTTT AACACTCAAG AAGTTTTAGT TTTGAAAATG CACTTCCTCA 3420
CCAAAATTGT CCAAAGTGAA 3440