EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-15422 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:9518960-9524250 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EOMESMA0800.1chr3:9520328-9520341GTTTTCACACCTT-7.52
Foxd3MA0041.1chr3:9521117-9521129AAACAAACAAAC-6.32
HSF1MA0486.2chr3:9519021-9519034GAAGGTTCTCGAA-6.11
HSF4MA0771.1chr3:9519021-9519034GAAGGTTCTCGAA-6.18
RARA(var.2)MA0730.1chr3:9522167-9522184TGACCCTGCACTGACCT-6.13
TBR1MA0802.1chr3:9520330-9520340TTTCACACCT-6.02
TBX21MA0690.1chr3:9520331-9520341TTCACACCTT-6.02
TBX2MA0688.1chr3:9520330-9520341TTTCACACCTT-6.62
TEAD1MA0090.2chr3:9519817-9519827ATGGAATGTG-6.02
TEAD4MA0809.1chr3:9519817-9519827ATGGAATGTG-6.02
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr3:9520023-9520036TCCCCTCGGGGCA-6.01
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr3:9520023-9520036TCCCCTCGGGGCA+6.16
TFCP2MA0145.3chr3:9520742-9520752AAACCGGTTT+6.02
TFCP2MA0145.3chr3:9520742-9520752AAACCGGTTT-6.02
ZIC1MA0696.1chr3:9520094-9520108CACAGCAGGGGGTT-6.46
ZIC3MA0697.1chr3:9520093-9520108GCACAGCAGGGGGTT-6.65
ZIC4MA0751.1chr3:9520093-9520108GCACAGCAGGGGGTT-6.28
Enhancer Sequence
AGTATACATG AAGACCCCTG ACACTGATGC TCAAATATGC TGCTTCATGC AGCATGTGAA 60
AGAAGGTTCT CGAAAAGAAG CTGCATCTCC ACGAAACATG CTGCAAAGAG AGTTAACTGG 120
ATGAAAATGG CCCCAAAGAC TCACAGGGCG TGGTCCTGTT AGGAGGTGTG CTCTCTCTGG 180
AGTAGGTGTG GCCTTGTTAG AGGAAGTATG ACACCAGGGT GGGCTTTCTT GCTGCCTGCT 240
GATCCAGGTG TATCTTCGGC TATCTATTTC TCCAACACCA TGTGTGCCTT GGCGCCACCG 300
TGCTTACCCC TGTGATGATA ATGGGCTAAC TCTGAACTGT GAGCCAGACC CAAGTAAATG 360
GTTTCCTTTA TAAGAGTTGC TGTGGTCATG GTGTCTCTTC ACAGCACTAG AAACCCCAAC 420
TAAGACACCA ACCAAAAGGC TAACAGTGTC ATTACGTAAG GTGGGAGGCC TCCAGCAGAA 480
GTACCTCCAC TCTGCTTCAA CCTGCCCACC TAATGTCCCC AGCAATGTCT GTGAAAGGTG 540
TCTTGATTTA TGGCTTTGTT CTGTTAGTAC AAAGGCTTTG TTAAACTGCT TCCGTGTGAG 600
AACAAGTAAT TTGAGGTAAC CTAAATGTGT CCTCGGGCCA CGCTCATTCA TATTTGTCTA 660
CAGAATAAGC TTTCTCCCTT TGAGGTCAGA ACTGTAAGTT TTTGCTCAAC CATCACACGT 720
CACTGTTTGT TTCTGGACTG CAATGCAGCT TTGTTCCTAA GTTATAGTCT CTTGTTATGA 780
AGCCTGGAGG TTTAGAACCA ACTCCATGCT GAGTTTAACT GCTCCTCAGT AATACATCCA 840
GCACAGATGA TTTCATTATG GAATGTGGCC TGGCTACTTT GCAGTATTTT CTGAGGCATA 900
GGAAGCTTTT ATCATAAAAA TCAAAACAAC ATTAATCTGC AAACGTGTCA CTTTACTTTC 960
ACTGCCAAGG AAAAAAGATA AAAAGAAGAA ACAAACTGAG ATAAGGCAAA CCTATACCAA 1020
AAACCTCGAC CAAAACAACA ATCAAAGCAG CTCCCTCCGT CCCTCCCCTC GGGGCAGTCG 1080
GGTTTAGGAG CTGAGGTTTC AGAGTCTACT TTACTTAATT GCTAAAGGCA AGAGCACAGC 1140
AGGGGGTTTG AACCTCCTTC TTTGTGGCTC CCGGCTCTGC TTCTGGCGAA AGCAATCTTT 1200
AAATTCAGTG CTCTCAAACA GGCCCCACAG GCCCCACCGG CCCCTTGCTG TTCAACTTGG 1260
AGAAGATTTA AACTGGTAAA GAGCAGGCCG CTGTCTGCAG GACAGGTGAG ACGGGCTCAG 1320
ATTTCACAGC TGGCTGGGAG GCGAGCTAAC ACAAAGCATC GCAGGGGTGT TTTCACACCT 1380
TTATAAACAG TCTGTGTTTA AACACCACCC GTACAGTGCT TCTTTCCCAG TCCCTCAAAG 1440
CTGGCCACTG CTGTGTGTTT AATTACACTC CTAAATCTGA AAAAATCAAA ACAGCCAGCA 1500
AGGTTGATCT GCATTCTTTG GCTGGAGCCG CCGCGTGTGC AAAGCCAACC TGCCCGGGCT 1560
CCTGTTTCTA CTTTCCTCAG TGCAGCCTGC AGCCCAGCCA AACCTCCTCC TGGAGGGCGG 1620
CGAGCACAGA GCACAGAGCA CACCAACTGC CGGCGCGAGG AAGCAGTCTT CCCCACCACA 1680
CACTGTATTG AGAGCCATCT CTTGGCAATG CAAACATGTT TCTGGGCTTA GTGCCACTCA 1740
GACAACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACTGACAG AGAAACCGGT TTGGTCTTGT 1800
TCCAGGGCTC AGTCCAAACA ACCGAAGTTA AATGTAGCTT TCATTGTTGA TGCCTTTCTG 1860
TGTCAAATAT CAATCTTTCC GCAAAAGCAG CAGGGACGGA TGTAGCTATG AAGAAGGTTT 1920
TCCCTCCCCC ACTCTAAAGA GGAAAATATA TTTCACTCTC TAAGGGAGCA TTTGCTAAAG 1980
AAGGAAGCAA TGAAACAGAG GCCACAATGT TTTAGAATTT TAAAAAATAA CACCAGCTGT 2040
GGCGCACGCC TTTAATCCCA GCACTTGGGA GGCAGAGGCA GGCGAATTTC TGAGTTCGAG 2100
GCCAGCCTGG TAAGTTCCAG GACAGCCAGG ACTACACAGA GAAACCCTGT CTTGAAAAAA 2160
CAAACAAACA AAAAAATACA ATTCATGCTA GGGCTGTCAA CTTTCCCAGG CAGAGTAACC 2220
CCAGAGAACA GTTAAGCCCC AAACTTGCTA CAGAGCTGAT GGGAAAAGCT GTGAAGACCC 2280
GCAGAGCCTC TGCACCCCTC CCAGGGCAGG CCCTTGCTCT CCAGCATGAT GCAGGTCCAC 2340
CACAAGGAAG AGAAATGGCA TACAAAGGCA CAGAGGCATG CAGCCTAGAG CAAACTGCTG 2400
CAGGTCTCCC TTGCCGGCTC CAAACACTCC AACACCACAC TGTATTATCA GAAACAAACA 2460
AATCAAATGT CTCCTGACCA CTCCCCACCC AACGTCTGCC CAGGTGAGGC TGCCCATGAA 2520
GGTGGGACCA AGCAGGGTGG GTAGTTAGTG ATCTGGGCAC TTCCTCCACA CTAAGGCAGA 2580
GTCACTTTAA CCAGTGTAAG AAATACGCAA AAGGAAAGAA CAAATGGATC TACAGCGCTG 2640
CTGTCATGCT TTCCATGATA AGATTGTAAC AAAAAATTAA CTTGACTACT TATTTTTAAA 2700
AATCTTCTTA AACTTGAAAA TACTAACTAG TATGTATAAA TGTGAAGTGA CTTCATCTGA 2760
CATGAAATAT GAACTCTGAG AGCTCCAGGG AAGTCTGTAC AATACTTCTT TCCTGCATTG 2820
GATTTTGTAC ATTGACCAAT ACAAAAGCAC TTAATAAAAA TATCCTTGGT GCTCCAGACT 2880
TAAAACTGCT CACAGGTTCC CTCCCTCATG GCTGCTCTGG TGTAACTGTT CCTGGAATCC 2940
ATGCACAGAG GCCTTCAGTC CTTGGTTGCT CGGGGTGGCA CTACTGGGAG GTGCCGCCCA 3000
CACAGAGCCC ATGGATGAGT GCTAGACCGC TTCACAGACT GCCCCAGACA GAATTATGAG 3060
ATGCTGACCC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 3120
TCTTGCCTTT TCCCTTTCTG CTTCCTGGCT GGTGATCTGA GCTGCTCCAC CCCACCCTCC 3180
ACCCACAGCC CAAAGCATGG AGCCAGCTGA CCCTGCACTG ACCTTTTTTC TTTACAAATT 3240
AACTCGGGTT ATTGTGTTAG AGCAACAGAA ACTGGCACCC AGATCTAAGG TAGGACTGTC 3300
AACTGAGCTC TGCTAAAGTC AGTTATGGCC AGACGGTGCG CAGCAGTCCG TGAGGTGTGA 3360
GGGGAAACTG CTCGCTCTCT GTTGTTGGTG CTAACTTATC TTCCCTCACT GTCCCGAGCT 3420
CTCAGTGGAT ACAAAGCAAA TGGCAGGAGC ACACCTCTGT TGTTCAAGCA TGCAAACTCA 3480
GTATAAGCTG CCGAGATTGA ATGTTAATTA AAAATAAAAT CAATTAGTAA TAATTAGCAA 3540
ACCATAAGTA TTCCATCAGA AGTTTGGGTG AGTCACTGCA GGTCTGAGAT TTTCATCTAC 3600
TCGACTTCCA CAGACAATTC TTCTCAGCAC CTCTCCTGAA ACTCAGGTCA CACAGACCAC 3660
TTCAGACTAA CCCAGAACAG AACAGGTCTG AGGAAGGACA GACAAGACTG CCAAGAGACG 3720
AGAGACACAC AGCTAACTTC TCCAAGCCTG TGGCTCTTGA CACCGAGTGT TCACACAGTC 3780
CGACTCTGAC AGAGGAACGC AGGTGTCCAG CTGCTTCCTG TCCCCCTCAG TGATGCAGTC 3840
AGTGTGCAGC TCTGAGAACC ATGCCTTCAT ATAATGGGGT TACTTTCTTT CAAAATGCTG 3900
TCCCAGAACA TAAAATATCT TAGGCAAAGA AGAAATGCAC GCATAACAGT ATCCTTAATC 3960
AGCAAGGCCA TGTAGCAAAA CGTAGCTGAA TATCTACAGT GCCCTGGGGG CCCCTTGAAG 4020
GACACACAAC CTGTATCAGA AACGCAAATC TTTCATGTAC CAGAAAGAAA GGTTCATTGA 4080
CAGTGAACAT CACACCTAAG AGCATCACAT CATGTCTCTC TGCACCGTGG CAGATGAACC 4140
CATGAATTTC TCATTAACGG CACTATTACC AGTCATTAGG CACCGGAACA TCATGAGGTA 4200
TTGCAAAGAT ACAGTCTCCT CTTAGCCGAG CACCAATTTC ACCAGGAAGC ATTGCTGCTG 4260
TCTCCACTTT ACAGGCTGGG TAATAGGCTG GCCTCCTTCC CGTGCTTATG CATGTGAAAG 4320
AGCTAAGAGT AAAGAAGCCC CACCCTGCCC CAGGTGTGAA GCAAAACTAA GACACCTAGC 4380
TCGGACAACT TCCCTGTCTC TAGTAACGTA TGCCACCGGA CCTGGAAATC AACTCAACCA 4440
CCCAGAAGAA CCTGCCGTAT TCATAATGGA CCATGGGGCT TAGTTTTGAC AAGTGCAAAA 4500
CAGGTTAATT TTTGCTAAAA CATTTCGAGT TTGGCAGTGC TCTACTGCTC TGTCAAAGGT 4560
TAAACAGTAT TCATCTAGCT GATCAGTGAG GAGTCCGGGA CTTCCTTCTC AAGCACTAGT 4620
TTCTGAGTCA CAAGGCTGCC TACACAACAA CACTGCAGTA AGGGTGGGTG TGCGATGAGG 4680
AAGACAGGAT GGTGTTTTCA CAGCCCTCAG GTCTCCATGA GTGGCCAGCT GGCCTTGCTT 4740
ACGCTGAGGC GCACCAGGCT TTGCAGCCGG TTAGCAGCTA TCCTCGCTGG CCAGGCTCTG 4800
GCTTACTACA GTGCTCTATT CTAACCGAGT TTTACAGCAG CAACTGCATT GGTATCATGT 4860
TGCTTCAAAT ACTTCTTCTC TGCCCTTTGA AGTATTGCCA GCCTCATGCT CATGAATAAA 4920
GGCCTTCCTT CAGTTCGCTG CAGAGAAATT GTCAGCCAGT CACCAAATTA TCAGTTATCA 4980
CAGGCACAGG CAAGCTGAAC AGAGCTGTAT TCAAAGCGCC TCTGAACCTG CCCGACCACT 5040
AAGCATAATT TGTGCCTTTA TTCTACCTTC ACTTGAGAGA TGGAGAGTGG GAAGCCATGT 5100
TCCACCAAAG GGCCTTTGTC AAGTGTCACA CTCATCAAGC ATTTCAGATA GAACTGCAGG 5160
TCATTATATA TCATGCTTGA TACAGTCATT TTGCTGATAA CCCAGTCCTT TACAAAGACT 5220
GACAGTAGCC TTGTACATCC ATTCCACAAA TCCAGTTTCA AATATCAAAA AAACAAAACC 5280
AAAACAAAAC 5290