EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-15379 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr3:5213410-5217280 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:5213463-5213475GTTTGTTTGTTT+6.32
Gata4MA0482.1chr3:5214089-5214100AGGAGATAAGA-6.14
POU6F2MA0793.1chr3:5213894-5213904ATAATGAGCT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:5215856-5215876ACCCAACACACACACACAGA+6.27
RREB1MA0073.1chr3:5216500-5216520CCCCCCCCCAGCCCCCCCCG+6.32
SOX10MA0442.2chr3:5213427-5213438TTCTTTGTTTT-6.62
SPI1MA0080.4chr3:5214697-5214711AAAAAGAGGAAGGA+6.06
SPICMA0687.1chr3:5214697-5214711AAAAAGAGGAAGGA+6.38
ZNF263MA0528.1chr3:5215960-5215981GGGAGAGGGAGAGGGAGAGAG+6.02
ZNF263MA0528.1chr3:5215964-5215985GAGGGAGAGGGAGAGAGAGAG+6.05
ZNF263MA0528.1chr3:5214871-5214892GGAGGATGCCGGGGAGAGGGA+6.38
ZNF263MA0528.1chr3:5215948-5215969GGGAGAGGGAGAGGGAGAGGG+6.44
ZNF263MA0528.1chr3:5215954-5215975GGGAGAGGGAGAGGGAGAGGG+6.44
ZNF263MA0528.1chr3:5215946-5215967GAGGGAGAGGGAGAGGGAGAG+6.5
ZNF263MA0528.1chr3:5215952-5215973GAGGGAGAGGGAGAGGGAGAG+6.5
ZNF263MA0528.1chr3:5215958-5215979GAGGGAGAGGGAGAGGGAGAG+6.5
ZNF263MA0528.1chr3:5215942-5215963GAGGGAGGGAGAGGGAGAGGG+7.87
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04641chr3:5214099-5216020E14.5_Brain
mSE_05530chr3:5213407-5214064E14.5_Limb
mSE_05530chr3:5214070-5217350E14.5_Limb
mSE_09724chr3:5213918-5217300MEF
Enhancer Sequence
CTTTCTCTCC TGTTTTTTTC TTTGTTTTTG TTTTTGTTTT TGTTTTTTGT TTTGTTTGTT 60
TGTTTTCCAT CTCTATCTTT TCACATCTGG ATTGTTCCGT TGGAGCTTCT CCCCAGACTA 120
ATAGCTCCAT ATGTTAGAGG AGAATGGGCT TGTGATCCTG GGCTTGTGTG CTTTGTGGGT 180
GGTAGTGGTG ATAAGAAGTC CTCCTTAATT GCAATAAGCG ATGTTGAAGA GCTTGTGAAG 240
TTAGTCAACT GCTATTGTTT GGGAAGAGTC CCCGTCTGAT TTTGTTTATA AACACTGGGC 300
TTGATGCCCA GAGGGAAAAG AGGTCACTGT ACTATCTGAG CTCTGACCTC CAGGAGGCCA 360
GAGGGCTCTG ACTCCCTCCC CCCCCTTTTT TTTCTTCTCT CCCTTAATTC TTCTCCCTCC 420
CGTGGCACCC TGTGTAGCTC CTCCTTCCTT TCCCATTCTT AACTTTAACT GTGTCTGAGT 480
TTACATAATG AGCTTTCCCA CCCCAAAGGT CAGAGCCTCC AGAGAAAAGG TCTAAAGTAG 540
ATTGCCTCTG AAATAAAAGC CTAAAGTTTC TCCAGAAAGA GAAAAATCTA TAAAGGTTTA 600
GAGCAGAGAC CTTGGAGCAT GAGTGTTATT TTAAGATAAA TAAGTAAATA AATATGTAAG 660
TAAATAAATA ATAGTATAAA GGAGATAAGA ACCAGTCTAG AGGAAATCAG AAAGGGATTC 720
AAGTGTCCAC AAATACTACA CACATACAGA GAGGCTTAAC ATGCTCTCTC CCCTTTGAAT 780
GCCACTGCGT TTACCTCTCA TATCAAAGAT GGTATGTTGC TTCTCCACGT TAACTCATAT 840
TGTAACACAT ACGGGCAGAC GCTCGCGCTT GCGTGCACAC ACACACACAA ACACACACAC 900
ACACACACCT TTGTTACTGC TCCAGGAAAC ACACTTTGTT CATAATAAGG TTTGGACAGA 960
CACACACACC TTTTGAATTA TCTCACTGTA AATCTGTGCT TGAGACACCT TCCCAAGCAA 1020
GCCCTGTACT TTTCCGTTCA TTTTCAATCA ATGTCCCATT TCCTCCTGAC CTATGCAAAT 1080
CCTCATATCC CTACACACAC ACACACACAC ACACACGGGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA 1140
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGCAGTC TTTGGTATCA AGTTTTAAGT 1200
GGATTGGAAT GAGCTGCTGA GTTAAACAAA AATGTTAGTT AACAGACTGC CTTTGTTAAA 1260
TGGCCCCTGG GTGGAGAAGA TTCAACAAAA AAGAGGAAGG AGGGGGGCGG TTAAGGATCT 1320
GAAAGTGTCT GCTTTGCTCT AAAGAGATCC TAATGCTGAA ATCTTGTAAT ACCTTGTTTC 1380
AAACAGAGCT TATCTATAGA GCCCAGAAAC CCGGTCAAAA GACTGGGAAC CTTACCCTTG 1440
GGCTGGAGTT GTTCTTGAAC TGGAGGATGC CGGGGAGAGG GAGGTGGGGC ATTATTAGCG 1500
ACTTGGTGAG GGGAGGGCAG ACTGGAAGAA AGGACAGCTG GCGACTCTTT ATCCGGTTTG 1560
GAAAGCCCAG AGTGTCCTCA GCGTGGATTT GTGAAATAAA CTGCTCCAAG GAAAAAAGTC 1620
TAGAAGTAGA AGTTACCTTT TGTTTCAATG TTAATTGTCC CTCATCTTCA ACACTCAACA 1680
CCTAAACACT TGATGTAGCC TTGGGGTTCG CCAACAGTTA AAGACTCTGG CAAGGTTCTA 1740
GTGGTAGGAG AGAATTGAGC TCCGCTAGGG TAACTAGCGA AAGTTCTCCG TGCATGAGGA 1800
AAAACTAAAA AATAAAATAA AATAAAAAGT TCTCCTTTCA CTTTGAAAAA TAAAGTAGGC 1860
AGCGCTCCTT TAGAGTGGCG GCAGGTTGGT GGAGTTTAAG TACCTTGAGA CACTGCTTGT 1920
GAGTGGATTT GAAATCAGGG TCCAAGGTGC AGGGGCAGGG CTCTGCAGAG GGGACAAGCT 1980
GGGGGATTCT CAGTCGATCC GCCTAGAGTG AAATCTTCCT TGGCCCAGGC GGGAGGCTGT 2040
GTTCCTCCCC TGCTCCGAAG CAGCCTGCAG GCAGGGCTTG GGTTCGCCCT GGTCGACGCA 2100
TCCCTGCTGG CGACCCACCC AGCGCAGACC AGCCAAGGAT CCTGCCAACA GCTCTTCTAG 2160
CGCTGGCAGT GTGCTCTGAG GCCAAGCCCT GGAGGAGACT CTTGACTCTA TGCTAGTGTT 2220
CTCTGCCCCT TCGCCTGAGC CCATTAACCC CCGACCTCAC CCCCAGCCTC TCTTCTTAGG 2280
AAAGCGGTAA AAGAAGAACG GGGAGAGATG ATTAAAAACA AAATACACAC AAACACACAA 2340
GCTTTTGGAG GGCAACAGTC CAGGCACAGA AGGGATTGCA AAAGTGGGCA AAGGACCTCA 2400
ATCTGTTCTG CTTTTGTTTC CTTAGAATTC AATAACTGCC CTCTCTACCC AACACACACA 2460
CACAGACACA CACACACACA CACACAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA 2520
GAGAGAGAGA GAGAGGGAGG GAGAGGGAGA GGGAGAGGGA GAGGGAGAGA GAGAGAGAGA 2580
AGAGAGCGAG GGAGCTATAG TTTGCAAGAA AGAGAGGAGG GGTAATGGTG TTGGGATCAC 2640
TAGCCACAAA AATGTTTAAA TAATTTTGTT GACATTTGCT GGGTTTGATA TTAATGACAT 2700
TAATATTATT GATAACGTTT CAGGGAGGGT AAAGCAGCAA AAGAAATAAA GAATTTGTGG 2760
ATGCAATGAT CATTTTCCTT GTCCACCATG GCAGAAGTAG ACCCTTTCTT CACCTGAACC 2820
TGAAACAGAC TTATTACTCT CAGGTGTTTT CTTCATCACC TGCATTTGCC TGCCTGCAAT 2880
AGCAGGAAAT GGTTTTTCCA TCAGCAAGCT TGTACACTGA GCTCTTTCCA GCAAAAGGCT 2940
TGATTTTTGC TGATTTCAAC TTGAAAGTTT CCCCTGCTTT CATTTCCCCT TAGTCTCGTG 3000
AAAAGTCCAC CCCTTTTCTC CAGGCAGACA CCTCAGATAG TTTGTTATTA TTATGGCTTT 3060
ATCTAGGGTG TTTTTCTGTA AACATCCTCT CCCCCCCCCA GCCCCCCCCG CCCCCGCCCC 3120
CGCCCCCAGT GTGCAACATG TTTCTTAACC CTACTAAGGT GCAATGGGAG GGTTCCTGGT 3180
GAAGTTGCTG TGTGAAGGTA GGGCGACTAT AAACAAAATA ACTTTAAAAT CTTAGAAACT 3240
CTTTCACTGT GAACAGATTT CTTCCCAAAG ATGTTGGAAA TAGGAGTCTC TTGAGACAGA 3300
ATTTGCTTTT CTGTTGCCAT TTAGTGGCTT TGGTTTCTAA AACACGGCTT CATGTAGCCA 3360
CTCCAGATTT CTAAGATGGC ATTGCCTTTT CCTCTTACCA AAGACCACAT CTAGGTTTTA 3420
TTCTCTGCTT TGAATTTTCA TTGTAAAGTT AGCTAGTTGC TGAATGCAAG CAGCTTTTCA 3480
GATATGGGCC TAGGTCTGAT CTTGCAGGGA GGAGTATAAT TTTATCCACA CAGATGTTTT 3540
GTTCTATTTG CATTTGTCCT AGGATGTAAG GCGTATACAC TGATAGGACA AGGGTATTAG 3600
ACCCAGGAAG ACATATTTAC TGTCTCTGAA CTCTCAGTGA TGTGCTACAA ATCTTGCTGT 3660
TGCTATAAAC CTTGTTTGGT ACCTTTGGTT TTTAAGGACT AAAACAAGGT TTTGAAGCAG 3720
ATCCTGGCAA TCCAAAACTT CAAAGGCCTG TCAGCTCAGA AGTGGCTGGT GCCTCACCTG 3780
CTCAGGAAGC TGGGCAGCAC TGGTGTTTCC TGTTTGCAGC TCATTTGATT GGTTACTCTT 3840
ATTTTCATTA TATGATTCCA GGTTTTAAAA 3870