EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-11341 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr17:85055120-85057510 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Myod1MA0499.1chr17:85057143-85057156AGCAGCTGCCCCC+6.03
Myod1MA0499.1chr17:85055362-85055375GGAAACAGCTGCA-6.19
MyogMA0500.1chr17:85055365-85055376AACAGCTGCAG+6.02
MyogMA0500.1chr17:85057316-85057327CAGCAGCTGTC-6.14
RFX1MA0509.2chr17:85056496-85056512CGTTACCATGGTAACA+7.97
RFX1MA0509.2chr17:85056496-85056512CGTTACCATGGTAACA-7.97
RFX2MA0600.2chr17:85056496-85056512CGTTACCATGGTAACA-7.79
RFX2MA0600.2chr17:85056496-85056512CGTTACCATGGTAACA+7.85
RFX3MA0798.1chr17:85056496-85056512CGTTACCATGGTAACA+7.73
RFX3MA0798.1chr17:85056496-85056512CGTTACCATGGTAACA-7.91
RFX4MA0799.1chr17:85056496-85056512CGTTACCATGGTAACA+7.48
RFX4MA0799.1chr17:85056496-85056512CGTTACCATGGTAACA-7.83
RFX5MA0510.2chr17:85056496-85056512CGTTACCATGGTAACA-7.76
RFX5MA0510.2chr17:85056496-85056512CGTTACCATGGTAACA+7.84
RREB1MA0073.1chr17:85056707-85056727GGGGGGGGGGAGGATGGGGG-6.21
RarbMA0857.1chr17:85057056-85057072TGAACTTAGGACCTTT-6.2
Tcf12MA0521.1chr17:85057316-85057327CAGCAGCTGTC-6.02
Tcf12MA0521.1chr17:85055365-85055376AACAGCTGCAG+6.62
USF1MA0093.2chr17:85057334-85057345GCCACGTGACC+6.62
USF2MA0526.2chr17:85057332-85057348TGGCCACGTGACCCAG-8
ZNF263MA0528.1chr17:85056712-85056733GGGGGAGGATGGGGGGGGAAG+7.4
ZNF740MA0753.2chr17:85056703-85056716GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr17:85056704-85056717GGGGGGGGGGGGG-6.03
Enhancer Sequence
CAAAGAAAAA CTTTCAAGAC TCCTTGTACC ATTTGGATTC TGGATATCAA ACTCAGGGCA 60
GCAGGCTTGG TGACAGATGC CTTTAGCCAC TGAGCCATTT TGTTGGCTCT GGTAGCGATT 120
TCATATAAAG GTGGGTGCCC ATGTTGGACA CCGTCCTTCT GGAAGGTGTA CTCAGATGCA 180
GCTGGCAGGA AACCAGGAAG GAGTTCTCTG TTGTCATGGT CTCCCTTCAA CAGAGGGGCA 240
CAGGAAACAG CTGCAGGTGC GCTTTCCTGA TCCTTAAACC CAGACTCCAG CTGCCTGGAA 300
TGAGCCACCT CCACCCCCAC TTCTCCCCTC ATCACCCAGT GAGACTGTCA CATTCGCTTT 360
AAATATCACC TTTTAAAGAA CAGGCTAGAC TTATGGGCTA GCATGTCACT AAGCTGACCA 420
AAACTTCATG AGAGAAGAAT TATACCAAGA ATGACTCCTA GATGAGCATC GCACGTAAGA 480
AGCCAGTTCT GAGTAAACAG CCACCATCAT AAGTCAGGAA AGTGTATTCT TGTAGCCTGC 540
ATGGCTCTTC ACACACTACA GGCACAGCTT CAAATCAGCA GGTCAGCTAA GAGCAGGAGG 600
GGTGGGGGCC TGTGGGTAGG GAGTCGCCTT TGGGTCATTC TGATGGAGGA GGAGTCTGTT 660
GGCTGTTTGT CTTGCATATG GTTCTGACAT TTGGGGATAA TGTTCAGCAG ATTTATGACA 720
GGTCTGTGCT GTGGAGAAAG CCCTCCTGTG GCCAGCACCT TGATGGCACA AACAGCCCAA 780
GCTATAACAG CAATAGTCGT GTTTGTTCTG GAAGTCGATT TTCTTCTATC ACTGTCCATT 840
ATGTGACTTG AGACCCTGGC TGTCTCTCGT GGAAAGCCAG GGTGTTTCTA GGGTGCTATC 900
ACTAGCATTT AATAGCGTGA AGTCACTCAC AATGTCAATT TCCCAGATGT TCCTGAGCTA 960
GAATGAAATT CATCTGCATG TGAATAGCAA AGCCCCTTCC ACTTCCTCCT GTCCTCAGCA 1020
AGTTGAAATC AGTGACTCCC AAGGAGGCTC CTGAGGGACC CTGTTTGAAC TGCTTGAGTA 1080
GATTACGTCT CTGAGGCTGC CTATAGCTGA TGTGACATAC ATAATCTGTA AGACATTGTG 1140
TAACTATTAT ACTATAATCA TCGGTGTCAC CGACCTTTTA TAAAAATTGA CAATACTATA 1200
CTGGTAACGT ACCGACGCCT CGGATCCTTA AATACAGTTC CGAGCAATAG GCTTCCACGG 1260
TGGCTTCCTT CATTCTGTAA TGGGAGGCAT TTCGAGTGCT ATAATTTATC ATTCTTTACA 1320
AGCTAGGTCG CAGTAACAGG ACAAGTTCAT GTGCTCTCTC TGAGAGCCTC GCTCGTCGTT 1380
ACCATGGTAA CATCGAGAGA ATTAAATTTC AGAGTTGTTC ACGAATGACT TGCAGATCAA 1440
TGAGAAAAAT AATCAGTCAT TTAGCAGAGA ATTCATTTCT AGCAGCCCAC ACCCATCATT 1500
TCATCTCTGG AAGTATGTTC AGTGGACAAG TGTCTGCTCT TATCAGCATC CCGCCCCTCC 1560
ACAACTCCGG ACCATGGGTT CCTGGGGGGG GGGGGGGAGG ATGGGGGGGG AAGCACCACT 1620
TGACTAGTTT TCTTTTTTTT AAAGATTTAT TTATTTATTT TATGTATGTG AGTGCACTGT 1680
GACTGTACAG ATGGTTGTGA GCCTTCATCT AGTTGTTAGG AATTGAATAT TTAGGGCCTC 1740
TGCTTGCTCT GGCCAACCCT GCTCCCTCCA GTCAGCCTCA TCGCTCTCAT TGGCCCCATT 1800
CCCTCAGTCC CTGCTCGATC TGGCCCAAAG ATTTATTATT ATACATAAGT ACACTGTAGC 1860
TGACTTCTGA CATACCAGAA GAGAGCGTCA GATCCCATTA CTGGTGGTTG TGAGCCACCA 1920
TGTGGTTGCT GGGATTTGAA CTTAGGACCT TTGGAAGAGC ATTGCTCTCA CCCGCTGAGC 1980
CATCTCGCCA GCCCTTGACT ACTGTTCGAT GTGGACGTTG CATAGCAGCT GCCCCCCAGA 2040
CTCACATAGC TCGTTTCTAT CACATGCTTC GTTGTAAAAG GCAAGCTATG CTAAGAGTGA 2100
AGAATAGCCA ACATTTGTCT GATATGTGGA GTTCAGTATT CATCCTCTTC CTTAAGTTTC 2160
ATTGCTGCGT ATCAGGGGTA TTCACCAACA TCTGCCCAGC AGCTGTCTGA TGTGGCCACG 2220
TGACCCAGCC CCATCATGTG GACAAGCATG GAGGGGGGCA GGTTAAATGG CAGCGGAAGT 2280
TCCTTATCCT CTTCTGTAGG AGGCTTCCTC AGTAAAACCC AGAGCTTTTC CCTGTATTGC 2340
TCAGTCAGTA ATCATAAGCA TTTTTTATTT TTATCAAATT CTTGATCAAA 2390