EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-09932 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr16:42716570-42718550 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr16:42717897-42717912TGACCTTTGCTCTTC-6
Nr5a2MA0505.1chr16:42717073-42717088GAAGTCAAGGTCAAC+6.04
RFX1MA0509.2chr16:42718289-42718305AGTTGCTATGGCAACA+6.78
RFX1MA0509.2chr16:42718289-42718305AGTTGCTATGGCAACA-6.78
RFX2MA0600.2chr16:42718289-42718305AGTTGCTATGGCAACA-7.13
RFX2MA0600.2chr16:42718289-42718305AGTTGCTATGGCAACA+7.15
RFX3MA0798.1chr16:42718289-42718305AGTTGCTATGGCAACA-6.79
RFX3MA0798.1chr16:42718289-42718305AGTTGCTATGGCAACA+7.02
RFX4MA0799.1chr16:42718289-42718305AGTTGCTATGGCAACA-6.52
RFX4MA0799.1chr16:42718289-42718305AGTTGCTATGGCAACA+6.92
RFX5MA0510.2chr16:42718289-42718305AGTTGCTATGGCAACA+7.38
RFX5MA0510.2chr16:42718289-42718305AGTTGCTATGGCAACA-7.42
Enhancer Sequence
GATATTTTCA AACATTTAAA GTACCACATC ATAACATGGG AGCCCACCCT GGTAAGCTGG 60
TTGCAAAAAG ATTCTTATTT AAGGGAGGAA TCTTTCTTCG ATACCAAACT AACGAGAGGT 120
AGATTGTGCA TTAGCATATA GCTAGCATTT TGGAACAGTT TCCAGCTGTG CAGGAAACAC 180
TGAGAAGCAG GAAAATGGAG CCCACTCTCT GCAGTCATCA ATCCGTGTAC AACACTTATG 240
GATTCCAGGA AATAAAAAAT CGCTCATTCC ACAAATATTT ACCAAACCTC ATCTGGTCCC 300
TTACACAGAC CTAAGAAGCA TCTTCAATAG AATTCCAAGC TTGTCATTGC TCAGGGACCA 360
TCCTCTCCAG CATCTAGGTG ATGCTCCCAT TAATGCCAGC CTTCCCCACT AGCATCCATA 420
TTTCCCCCAT TGTAACTAGG TAACTAGGTA ACTAGGTATT ACCTCTAGTG GCAGGAAGAG 480
AGAACCCCAT CAAAAGGTAC ATAGAAGTCA AGGTCAACAC ACACCTAATT TGCTTTTCCT 540
TTATGTAATA TGGTCTCACT AGGTTTCTGT AAAATGGAGC CAGGCTGCTA AACCCAGTGA 600
GATGTACAAA GAAAAGGACA TTATTGTCAT GCTCAAGGAG GGCTTTACTT AAAAAAAAAA 660
AAAAAAAAAA AAAAAGGAGC GGGGGAGAAA ATATCTTAGT CTGAGAGCAC AAGGGAGGGG 720
CCATAAACAT GATAGTTGAG GACAGACTAC CAGAGAAGCC CCTTGAAGCA TTCGGCCCAT 780
GGCTTACAGA GCATTCGGTC CCTGTTTAGC ACAAGGACAG TCTAGAGATG CTCTGTCTAT 840
CTGCTGATCA GAGACAAGGC TGCACAGAGG AGTGCCACTT AAATCCCATT CCAGCTGCTC 900
CCCATGTCAG AAGTCCACAC CGGAAAACTG GAATAGGCTC TGATGTGAGA GAGCTGCCCC 960
ATGGTTCAGA GTAGCAAGAA CTCGGACCTG CTGACCGCTT GCAGCTCTGA GCACAACAGA 1020
ATGTAGTAAA AGCCTTGCAG AGATGCAAAA TTAGATGAGT GGTCTCCGGG GAAATGAATG 1080
AATAAACACT AATGTCTGCT GTCTGACTGT CTACTCATTT GCTTGTGATA TTTATATTGA 1140
AGGCCTTCAG CGTGCTGATC GCATTTTAAA AGCCAAGTAT GTGTATGCTG GTTTACAAGT 1200
ATACAATCTA GAGAATGAAG CCTAGTTGAT CTAAAGAGGT CTGTCCCCAT GCCTCCCATC 1260
TTCACAGGGA AGAGGCAGAG GGGACAGAGG CAGCCTGCAA CTCAATGAAG TTTGCCTATT 1320
CAGGCTTTGA CCTTTGCTCT TCTTGTCTTG CCAGTGACAC TGAAGATTCT TAATCTAGTC 1380
ACTTGAGATG ACCTGTGTTA CTAGAAACCA TTACGGTCAA AATGAAAACG CATTAAAAGG 1440
CAGGTAATAT GCTTGCTACT GTGATACATG GGACTTTATT CTTCCTGCAG AGTGCAGAGC 1500
AACGCGAGTC TGCCCCATCA GCACAGAAAC AGGACAATCT TTCATATGGA TGAAATAGCC 1560
TTGAAAGCTT CGTCACTGCA GAGCAGAGAG AAGCTACTAA AATGGTTCTT CTTAGCCTCT 1620
TTCTGCTGAT AAAAAAAAAT GGAGAGAGAG AGAGAGTGAG AGAGTGAGAG AGAGAGAGAG 1680
AGAGAGAGAG ACTGCACCAC CTCCCAAGGG CTTCAATGCA GTTGCTATGG CAACACTATA 1740
TCTGAGTCAG AACTATTAAC AATCACCATG GCAACAAGTG TCTCACTTGC CATTTCCAGA 1800
AACTGGATGC GTTTGGACTG AAATCATCAC ACCATGAAGA AAGGGGTGGG GCCTCTCTCT 1860
CACTAGGAAA CAGAAATACT TTCTCCAAAT ACCTTACGCA AAAAAAAAAA AATGTTTTAA 1920
GTAAAATGAA GTTAAATAGG AAGGGAATCA TGTTGTTATG AGCCACACAA CACTGTCTCT 1980