EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-09874 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr16:35205030-35207320 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EHFMA0598.2chr16:35206098-35206110CACCCGGAAGTG+6.18
ELF1MA0473.2chr16:35206098-35206110CACCCGGAAGTG+6.14
ELF4MA0641.1chr16:35206098-35206110CACCCGGAAGTG+6.18
ELF5MA0136.2chr16:35206099-35206110ACCCGGAAGTG+6.32
NR2C2MA0504.1chr16:35207152-35207167AGAGGGCAGAGGGCA+6.62
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr16:35206197-35206208CTTGAGTGGCT-6.62
RFX1MA0509.2chr16:35205970-35205986GGTTACCATGGCAATG+6.02
RFX1MA0509.2chr16:35205970-35205986GGTTACCATGGCAATG-6.05
RFX2MA0600.2chr16:35205970-35205986GGTTACCATGGCAATG-6.56
RFX2MA0600.2chr16:35205970-35205986GGTTACCATGGCAATG+6.6
RFX3MA0798.1chr16:35205970-35205986GGTTACCATGGCAATG+6.64
RFX3MA0798.1chr16:35205970-35205986GGTTACCATGGCAATG-6.93
RFX4MA0799.1chr16:35205970-35205986GGTTACCATGGCAATG+6.03
RFX4MA0799.1chr16:35205970-35205986GGTTACCATGGCAATG-6.78
RFX5MA0510.2chr16:35205970-35205986GGTTACCATGGCAATG+6.79
RFX5MA0510.2chr16:35205970-35205986GGTTACCATGGCAATG-7.01
TBX20MA0689.1chr16:35205048-35205059CTTCACACCTA-6.62
Enhancer Sequence
TAGCTGTTTT ACCTGATCCT TCACACCTAG TCTATGACAC TAAGCCTCTT ACGGAGTGTC 60
CCCCTCCCCA CCCCAACACA CACTGTAGAA ATCTATGCAC AGTGCTTCTT CATTGACCCT 120
CACCTTACCC CAGCAGCTGT GATGGCCTGG AGGACGCCTG GAGATGATTT GCTCCCCTGA 180
ATCTCTCCTG AATCCAGCAG GGAAGCTGGG GTGCCTGTCT CTAAGGAGTC AGATGCTAGA 240
ACATGTGTGG CAGCTTCCTG CAGGCTCCGT CCACATGGGG CCTGCTAGAG CTTAATGGAG 300
GAGAAAGGTC TCCCCTTGGC CAGCCGGTCC GTAAGATGTG GACCTGTCTG CAGATGGCCA 360
CTTAGTGTAC AGTATTGTGG TAGTGCTGGT TCCCGTAAGG GAAGACTGCA TGCAGCAGAG 420
CTTGCTCAGC GGGTGAAAGC CAGAGTCCTA GCAGCAGGGA AGAGCATGGG CCAGGCAAAC 480
AGGATGGGGC TTGAAAACTG CCACAGAGTA ACAATGGGGA GAGTAGTGAA ACAGTTAAGT 540
CGGATCCCAT GGGCTGTAGC CAGGTGTTTG GATAAAAGTT ACATTTCCGA CTGCCCTTTG 600
TTAGCTGTTT TGGAGCAGAA GATGTGCCTG GATTCTGAGC ATGAAAGTGG GGATGAAATT 660
AATATACAAC ATTGTCCAGA CCTATCCTTA CCAAATCATG GAGGACTGGA TCCCTTCCTG 720
GATCCTATGT GGCTTCAGCC AAGGAGACCT CCGAGTGACC CTGCCAGGCC ATGAGATGGC 780
TGTGCGTGAC TGTCCTCAGA GGAGTCCTCA GTTCCTTGCC AACAGAAAGT GTCAGTCCGC 840
AAAGAAGCCT TGCTTTTAGC CTAGAGGAGC ATTTTTGTTA CAAATCACCC AAAGGCCTCA 900
CTCAGTACTG GTGAGACGCT CTCCAGGTGC TGGGAGAGCT GGTTACCATG GCAATGGGCA 960
CACATCTGCC AGTGCTCTGT GCAGGAAGAC AACAGATGGC TGGCTGTATT GGTACTCTAA 1020
GGCCATGGGG TACTGTATCC CAGACACAGA GGTGCCTGGA CCCCAAGACA CCCGGAAGTG 1080
CTGTTGTGGG CAGCCAGCTG GTCCCTTCTA CAGCAAGGCT AACCCTGTGT TCCTGTTCCT 1140
ACCCTTCTTT CACCTTCTGG CTCCACTCTT GAGTGGCTAC CACACGTATT GTCTGCCTCC 1200
CACAGGGTCA GCTTCATTGT CTGCTTTGGT CATCCAGGCT CTTCAATCTG AGAAAGTGTT 1260
TATTTTCTCC AAGCCATTTT GTCAACCTCT TCCCTCCCTG CTTTGAAAAA GTCTGCTTGA 1320
AACAGCCTGT GGTGGGATAT GCTAATCTCA GCCCTGGGGA GGCAAGTTTG AGACCATATT 1380
GGGTTACAGA GCAAGACTTT GTCTTGAAAA CAGAAGCGAG AAGGAGGAAA AAGTCAGCTG 1440
ACTTGAAAAT CAAAGAATAA ATGGCTGGGA GTAGGGAAGA TTCTGTCCCA AAGGATGCTG 1500
GAGGACATTT AAGCCAGACA TTAGGAAGAA CTTTCAATTA TGAAGATTAG AAGAGACAAG 1560
CCTGTGGCTG TCCTTGAGTC CGGGAGACAT ATGCAAGAAG CGGGACAAAA GCGATCCTGG 1620
GCATTTCTGG CCCTTGCCCT TCACTGTGCC ACAGTATTGG CAGGGCTCCC CTTCCCTTCC 1680
ACCTAGTTCC ACCCATTCTT GGGAACACCA GGACAGAAAC AAAGTTAGTT TTTCCAGTTA 1740
CTGAGGAGCA AAGGCAGACA GGAGGCTTCT CAGGAGTCTG CAGTGGGCGT TGGTTCCCTG 1800
AAGTTTCCCC TTGTGTGAGG ATCCCTATAG TCTGTGCGTC CACGTGTGCT GGAGAAGGCA 1860
GGAAGGACCT GCTCTGCTGC TGAGCCAATC CGTGCTTCTA AACTCACTGA GACTCCTGGT 1920
GAATGTGGCA GTCTTCCCAC TGGGAACCCA ACAGGCCAAG CCCCGGTGCA CACAGGTTGC 1980
AGCCAAGCCA GAGTGGTAGG GTTCAGGAAG AGCCCCAGGA GGAAGCTGTG TGGTGAGGAG 2040
AATTCAATAG GTTGAGTGGA ATCCTGGTAG GTGTCAGGAA ATGAGGCAGG CCAAGAGGAG 2100
CATAGGGAAG CCCAAGGCAG GCAGAGGGCA GAGGGCAGAC AGACATTTTC CCTTTACCAA 2160
ACAGCCCAGC TCCTGTGTGT ATCTGTGTTT TAAATATGTA ACTTAATGCA GTTTTTACAC 2220
AGAAAGATGG TTTCTTGTAT CCCAGGCTGG CCTTAAGCTT ATTATGTACC TGAGGATGGC 2280
TTTGAACCTC 2290