EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-06834 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr13:60246730-60250170 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr13:60247402-60247414GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr13:60247406-60247418GTTTGTTTGTTT+6.32
GFI1MA0038.2chr13:60250048-60250060TAAATCACTGCA+6.92
RREB1MA0073.1chr13:60249192-60249212CCCCCCCACACACACACACA+6.17
RREB1MA0073.1chr13:60249712-60249732TGTCTGTGTGTGTGTGGGGG-6.22
RREB1MA0073.1chr13:60249190-60249210CCCCCCCCCACACACACACA+6.38
RREB1MA0073.1chr13:60249716-60249736TGTGTGTGTGTGGGGGGGGG-6.38
RREB1MA0073.1chr13:60249194-60249214CCCCCACACACACACACACA+6.95
TGIF1MA0796.1chr13:60247549-60247561TTACAGCTGTCA-6.07
ZEB1MA0103.3chr13:60247247-60247258GGGCAGGTGGG-6.14
ZNF263MA0528.1chr13:60248292-60248313CCCCCTCTCTCTCCTTTCTCC-6.03
ZNF263MA0528.1chr13:60248288-60248309CCCACCCCCTCTCTCTCCTTT-6.07
ZNF263MA0528.1chr13:60248933-60248954CTCTCCCTCTCTCCCTTCCTC-6.1
ZNF263MA0528.1chr13:60249241-60249262TTCTCTCCCTCTTCTACCTCC-6.21
ZNF263MA0528.1chr13:60248960-60248981TCTCTTCTCTCACCCTCCTTC-6.4
ZNF263MA0528.1chr13:60248848-60248869TTCTTTTCCCTCCCCTCCCCC-7.03
ZNF263MA0528.1chr13:60248934-60248955TCTCCCTCTCTCCCTTCCTCC-7.53
ZNF263MA0528.1chr13:60249247-60249268CCCTCTTCTACCTCCTCCTCT-7.59
ZNF263MA0528.1chr13:60248937-60248958CCCTCTCTCCCTTCCTCCCTC-7.63
ZNF263MA0528.1chr13:60249259-60249280TCCTCCTCTTCACCCTCCCTC-7.65
ZNF263MA0528.1chr13:60249244-60249265TCTCCCTCTTCTACCTCCTCC-7.92
ZNF740MA0753.2chr13:60249725-60249738GTGGGGGGGGGGA-6.3
ZNF740MA0753.2chr13:60249188-60249201CCCCCCCCCCCAC+6.92
Enhancer Sequence
GTAGGCAGGT CCATAGAGTC AGAAAGAAGA CCAGCAGCTG CCAGGAATGG AGTTGGGCAG 60
CCTGGGCAGG AGGACAGCAC TTACACAGGC TTTTCATCTT GATGGGTGTC ACGGTTACAC 120
ACTATCGTAA AAGCAATAGA CTCTACTGAA TTTTGAACTT CAAAAATGAT TAGCATTATG 180
TCACATGATG TGTATAGCAA TAGCTGCTTG GACCCCACCT CAGTATGTTG ACATTTTACT 240
GTGTTAAGTT TCCAGTGAAG AACGATGCTC TGTCAGACAA GTGGGGTGGG GCATTGTCAT 300
GGCCGCCTTC TTTGCCACAC TGAAAAAGGA GGCCCCGTGA AAGCAGCATC CTGCCAGGAC 360
TGCAGCTTGT GTTTGCAGAG TGTCTGTCAT CAGTAGTGAA CTAGTGGGTA CCAGGTATGT 420
GCCTCGCTAC ACCTTCTGAG CCTACAGCCT TGCTGATGAA CCTTAGGGAA AGTCATCACT 480
TTAAATACAC TGTGGACCAT GTCTGAACAT CCCACAAGGG CAGGTGGGAG CTTTGCCTAC 540
AGCTTTGACT TTCTTGCAGC ATCTCCTTCT GTATGAGAAT CCTGAGGCAT GGGTCAGCCC 600
TGTTATTTTA GGGGAGGCCA CCTCAATGAC AGCCCTGAGC TGAGATAAGA GACACCCGTT 660
TGTTTTGTTT TTGTTTGTTT GTTTGTTTTG TTTTGTTTTG TTTTTGAGTG CTTGGAACAA 720
CATTTTCAGA TGAGCTTTCC TCCATTTTGG AATCTCTGTC TAGACTTTCC CAGCTGGACA 780
TCCTTAATCC AGATATTGCA AATCTGAAAT GTCCCAGAAT TACAGCTGTC ATGTTGGATT 840
AGGGATGCTC ATCCATGTTT TTATCAAAAC CACCAAGGAC TGGCTGACTT GATCTGCCTG 900
CTGTCTTTGG ATGATCTTTT GACTCAAGCC CAATTTCTCC CACTTACATT CATTGGCGTT 960
CGGGAGATGA AGGGGCCTCC AAACACTGAG AACAGTTCAA AGGTAACTCC ATTTAACCAG 1020
CTGCTGGTGA GGCCTTGGAA ATACAAAAGG CCTCAAAGTG TTAAAGCTCA GGGCCACAGG 1080
CACACAAAAT GACACAAAGG ACAGTCCCAA AGAGAAGACA GGACAGCCAG GGACTCCTCA 1140
CCTTGGGCTC ATTTATCCTG TGCAGAGGTG AAGTGTGCTA GCAAGAAAAC AAAATGCTTG 1200
CTTTGGCTAA GGGGGTCTTA AAGAAATATG ACCCTTCGCT CCATTGGTTG TATCAACTTA 1260
AACAAAGAAT TTATGGTCTG AGATTTTTCT TTAGGACACT GTGACTAATA ATTTTAGGAC 1320
CGTCAGCCTG TCAGCTCTCT AAAACATCTT TTTTTTTTTT TAAACCTGGG GAATTTGTCT 1380
TTGCCAAACT CAAAAAGGGA AATGTATGCA CATTAGGATG AGGTTTTCAC CTTTTGTTCT 1440
TAGAAATATG GAAAATGAGA GTAGATCAAA AGGCCTGGTA ATACCCACTT CTCCTTTCAA 1500
AGCGTCACTC ACTTGGAGGG TCTCACGTTT CCTCAGGGTG TGAAATGCCT TATATCCCCC 1560
CACCCCCTCT CTCTCCTTTC TCCACAATGA CTACAAGTAC AGGAAGGAGA ATAAAGCCCT 1620
TCCCCACCAC CCACAGGCCA TCTCCCACCC CTGGCAGCTC TCCTGGCTCT GACCTCCCTG 1680
CTGCCCCTAA GGGCTTGGTG TCTGTCTAGC CAGACCCCGC TGGGTGCTTG AGAAGCCCAG 1740
AGCCTCCCCT CTGTGGTGGA GTCTTCCTCC ACAGTGCCCC CCCCCCCCTC CACTGTCCTC 1800
CTGCGTCCTC CTCCAGCAGG GTCATGTGGC CCAGGCGCAC CAGGGCCTTC CCAGCTTGCA 1860
TCCCGAGACC CCCATTTCTA TGCACCCTGG AAAGGGTGAT TAATTTAAAC TGAGTGGAGT 1920
CTGTTTCTTT AAGACAAGCT CATAAATCGT GAAAGATCAC CACTTCTTTT CAAAAGCCTC 1980
TCTGCGGTCT GAGTCTCCCT TCTGGGTCAC TAAAGTCATT GAAGCTTTAA CGGCGTGCCA 2040
TGGCAGATTA CACGATACAG CCGTCCCAGC ACCGTGAAAA TTAAGTTATG CCCCGTGTCA 2100
GCAAGGGGCT TTGCCCCTTT CTTTTCCCTC CCCTCCCCCA CAGGCTCCTT TCTGCTGCGT 2160
TCCTTCCCAC CCCGCGCGCT CTCCCTCCAC CGGCAGCCCT GCTCTCTCCC TCTCTCCCTT 2220
CCTCCCTCTT TCTCTTCTCT CACCCTCCTT CTTTCTCCCT CTCTTTCCTT CCTGAGCTGC 2280
CTTCTCGATG GTCCTGTCTG CCCTTTCGCA GTCCCGCTGG GAAGTGCACA TCCCAGAAGA 2340
GGCAGAAGTT GGCCCACAGG CGGCTGTGCT TTGAGCTTCA GCTATTGAGA TCTAGTAAAT 2400
GGAGCTGATG GGCTTGGCTT TCAGAGCAGA GCCAGCAAAA TGGTGCCTTT TGTTCTCACC 2460
CCCCCCCCCA CACACACACA CACATGCACA CATGCACACA TCCCAGCTTC CTTCTCTCCC 2520
TCTTCTACCT CCTCCTCTTC ACCCTCCCTC CCAGATCTGA CCTAAACCCT CCAAATCAAC 2580
TCATTGGCCC AGAAGCAGGC AGTATCCTCC TGAGGTTGCA AAGGATGGCC ACTAGCCACT 2640
CCCCCAGCTC CCCCTGTGTT CTATGCAAAG CCCAGGGTGT GCTTAGTGGA GACTTCACTC 2700
CTTCCCCAGG TCGGAAGCAG TGGACAAGCA AGAATACCCC TCAAAAGTAC CTGTGCCTAT 2760
GGAAGCGAGG GCTTGTGGGG AGAGGGAGTC CCCAACAAAC CACTACCATG TCACCAGTAC 2820
CCCAACATGC GTAGCAGGTA GCAACACACA TACACAGTCT CTTAATAATT CCTGATGGTC 2880
CAATAGCACC CAGCAAACCA TCAGAGAGAA AAACATGATT TAAATAGGCC TCTCTGCTTT 2940
TTCTTTTATG ATTTATTTTT GCTATTTTAA ATTATGTGTG TGTGTCTGTG TGTGTGTGGG 3000
GGGGGGGAGT GGATATGTGC ACAGGTGTGA GTGTGGACGC ATCAGGACAG TGTAAGTGCC 3060
AGCAGAGGTC AGAGGCATCA CATTGCCCTG GTTATGTGTG GTTGAGAGCC ACCTGATGTG 3120
GGTGCTGGAG ACTGAACTCT GTGCTCTTGT GCTGAGCCAC ATCTCCAGCC CTCCAGATGT 3180
TCTCCAGATG TTCTTAGCAA AGAATCCTAC AAGTCTATCT ACTCTACGTC ACTTCTTTGA 3240
CTCTTCTTCT CACCACCCGA ACCCCCTAAT CATACCCTTC AACCAGTTTT TCCTGTAAAA 3300
TTAGGTCTGG GAGTAAAATA AATCACTGCA CAGAATAGAT GCAACTTTCT GGCATGATGT 3360
AATAGTCAGA GCACAGCAAA CAGAAAGGCT TTGCGGAACC TCACCTAACC AGAACGGGAG 3420
AGTGCGTGAG AGGAGGAGTC 3440