EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-05865 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr12:93002400-93005760 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr12:93005359-93005380GATTACTTTCACTTTCACCCA+6.78
IRF2MA0051.1chr12:93005358-93005376GGATTACTTTCACTTTCA-6.78
MAFFMA0495.3chr12:93003151-93003166GTGCTGACTAAGCAA+6.74
MAFFMA0495.3chr12:93003151-93003166GTGCTGACTAAGCAA-6.76
MAFGMA0659.1chr12:93003148-93003169CAAGTGCTGACTAAGCAAGGC+6.05
MAFKMA0496.2chr12:93003149-93003168AAGTGCTGACTAAGCAAGG+6.08
MAFKMA0496.2chr12:93003149-93003168AAGTGCTGACTAAGCAAGG-6.34
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr12:93003751-93003766TGACCTTGTGACCCC-6.65
PRDM1MA0508.2chr12:93005367-93005377TCACTTTCAC+6.02
RREB1MA0073.1chr12:93004478-93004498CCCCCCCACACACACACACA+6.17
RREB1MA0073.1chr12:93004480-93004500CCCCCACACACACACACACA+6.95
RarbMA0857.1chr12:93003751-93003767TGACCTTGTGACCCCT-6.82
ZIC1MA0696.1chr12:93003038-93003052CACAGCAGGGGGCC-7.38
ZIC3MA0697.1chr12:93003037-93003052ACACAGCAGGGGGCC-6.82
ZIC4MA0751.1chr12:93003037-93003052ACACAGCAGGGGGCC-7
ZNF263MA0528.1chr12:93004334-93004355AGAGGAGGGAGAAGTAGTGGA+6.18
Enhancer Sequence
AGCCCTGCTA GCTGTCTTGG AACTAGCTCT GTAGACCAGC CTGGCTTACA CTCACAGAGA 60
TCCGCCTACC TCTGCCTCCC CAGTGCTGGG GTTAAAGGCA TGCGTGTGCC ACCACAGCCT 120
GTGTTACAGC TACACTCTCA CGTTCTGCAT CAGAAGACTT CTCCCTGACG GACCACGGGT 180
AAGATGCATG GCTCGAAGCC TCCCCGTGGA ACTAGTTCTA GTACTTTTCT CACATGTTGG 240
GGCTCTCTGA ATCTCTTCAG TTAGGAAAAA TCACACATCC CACACGACAT CATCTGTGGT 300
TTAAGGTGCT TTATGGGCAG CCTGCCCAAA CTGCCACTGC CAACCCCCCT GGGACCTCTT 360
GACTCCCTGT TAAAGACTCA GCCCCAGAAC AGTGCGTCGG GCTCCACTCA GCTTCGGGCT 420
GTTCAAAACA AGACAGAATC ATTCCAGAGC CGCAGAGGGA AGCTAGACAT AGTGGCTCCC 480
ACTGACCCTG AGCCGATAAT TCCTTCTTTC CATTTTCAGC AATGTACAGA GGATCTGCTT 540
CCCTTTTCTG AGAATCCTGA CACAGGCAGA CAACCAAAAC CAGCCAGCCA GCCAGCCATA 600
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CAGCAGGGGG CCTCAAAGTT 660
GCAGCTGAGT GACCCCAGCC TGATGTGACC TTATCCTTGA GTATAGGTTG CGTTCCAGAC 720
CACTCACACA CAAGATCCGT CCCAAGTCCA AGTGCTGACT AAGCAAGGCT GTGTAGGGTT 780
CTCCAACAGC TAGGAGGGAT GAAGCCAGAC ACCCTGGTGG GCTTGGCACA GCTGGCATGT 840
CCACAGGGCT GGCTGGGCTT CAGTATATCA GGCTCAGGGG GTTGGGGTGG GGGATCTAAA 900
ATGCACCACC ATGCCTTCCT TTTTGAAAGC TGTTATGTTC AGGGCATGTC TGTTAGAAGT 960
GTCCTGACGA TGAGATAAGA GAATTCTCAG ATCATAAAAT GTGAGCAACT GACTCCGTTT 1020
CAATGGCCAC TGCTCACCTG CATCTCTGGT TCATTCCTGC TTTAAGAGTA ATTTTTGAAA 1080
TTCCTGTCCA TTTTTCTTAC ACACACTTAC ACTCACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1140
ACACACACAC ATTTTCCCAC TAAAGATAAT CTGGGAAATG TCTACAAGCA CACCCACAGT 1200
ATACTTCTAA ACTCTAGAGT AGTGTGATTT ATATTTATAT AACTGTTTGC ATGCATTTCA 1260
ACTTCCTGGG GACATGGCTA TTGTTCCAGG GGAGGCGTTC CCAGTGGGGG CAGAGGAGCC 1320
TGTCACCACA GACAAATGAG CCAGGATCCT CTGACCTTGT GACCCCTGTG CTAGCACCTT 1380
AGTGGCTAAG AATTAAGTCT GTTGCTTGTT TCTTCTCCCA AGTTGGTGGA AATTTCCCAC 1440
CGTTTAAGCC TACCCTCTTC ACTTCCTCAA ACTGGAAAAA CAGAAAGAAA AACTTCACCC 1500
TGGAAGGTCT TTCCTACTTT GATGTTTCTA ATGTTTTCTT TGCAGCCCTC ACATCACCCA 1560
CATCCATCTG GAAACTGTTT CTCAAAACAC TCCAGGATCG ATTTAGGAGC ACACCGCGCC 1620
ATGGCACATA CTTGGTCCTG CCACCGCGAA TAGTATTTCT CTGGGTAGAC AACTCACTGA 1680
CAGTAACTCT TGCGAAACAG AAAAGCCGCA AATTCAAAGC AGGTAAACCA CAAATGCAAA 1740
CCCAGCAGAA GTCTACTTGG AGAATGAGAG GCAGGACTAG AGAGCCGCAG TTGCCACTTG 1800
TGAACGTCTC AGAGGCTGGG GAGACGGCTC AGCGGGCAAT GAGCTCACTG GGCAAGAGCA 1860
AGGGGCAGAG GTTGGATCCC CAGCACCTGT GCCAATGGAT GCCGCGTGGG TGTGGAACCC 1920
ACCTGCAACC CAGCAGAGGA GGGAGAAGTA GTGGAGTGGG GGGTTGGATA GGGACAGTGA 1980
GGGACAAGCC AGCTAGACTA GCCAAATCGG TACGCTCTGG GCTCAAATAC GACAGACACC 2040
ACAAGGTGAA GGGTGACTGA GGAGCATGTC TATGCGTACC CCCCCACACA CACACACACA 2100
AATAATAAAA AAAACTTTAA TAGATCCAGA ATATTATTTA GAGATCAAAA TAAAGTGGTT 2160
TCAAACAACC ACACCATTTG AATTTACAAC AGAAGACAAG ATGAGCTCGC ATGTTAGGGG 2220
GCAGGGAGGA TCTTCCTGCT TGGCTTAGGG CAAGCATGAG GTCAGTGTCA CAGACAGAGA 2280
TGACCCACCC CCTGAACCCC TTTTTAAATG CCTGCATTTT TCTCTGAATG TCTCTGCCTC 2340
TGTGATTTGT GTAGCGACAG CCGCACCACG GGCCAGGCTT GGTCACTGGA TGTAGCATTT 2400
CAGTGACCAA GGAACGTCAC AAGTGACAAG TGTGAGCAAT GCATTGCATT AGCTCCTTGC 2460
CCTGCATCTG TGGTTCTCAG TCTGTGGAGA AGCGGAAGGG CTCTGAGGGC ATGTGAACCG 2520
CCAGGGTTCC TTTCTCTAAT GTGATGGCAC GACACAAGCG ATGACAGCCA CAGCTGAGGG 2580
AACCACTTCA GAGCATTAGT GCAGCACTCG CAGAGCCCTC CCCCCTCCTG CCTCAGGGAC 2640
AGGCTGTTAC TACCAGTTAC CAGCTGACAG GGACAGAGAC TCAGTCTTAG AGGCTGGGTG 2700
ACTTCCCCAA GGACACGAGG CTGCTGGGAG AACAAATGGT AGCCGATGCT GGTTCACTGA 2760
TTTTTCAAGA CTATGGGTGA GCCCCCTCAC TAGATGGTTA GAATGATATA AACAAGGCAG 2820
GACAATGCCA GTCTCCAAGA AGTCCGTTTC TTCTATTGTA AAGGGGAGGG AAAGAACAAA 2880
GTGGAGTCGG AGAGCCGGAC TGAGTCTTCT AAAAGCCAGA ACTCCGGTGA CCCTGGTTCA 2940
CACACAGAAC TCGCTACTGG ATTACTTTCA CTTTCACCCA GAATTAGGTC CTGTGCTGGT 3000
GCTAATGCTC TGAAGAGACA CCATGACCAA GGCAACTTAT AGGAGAAAGC ATTTAACTTG 3060
GGGCTCCCTT ACAATTTCAG AATGTCAGTC TATTATCATC ATAGCAGGAG GATCGGTGGT 3120
GGCAGGCAGG CAAGCATGGC ACTGGAGCAG TAGCTGAGAG CTACATCCGT ATCCACAGGC 3180
AGCAGGCTAA GAGGGAGAGA CTGAGATTGG TGTGGGCTTT TGAAACCTCA AAGCCCACCC 3240
CCAGTGACAT ACTTCCTCCA ACAAGGCCAC ACCTACCCCA GCACGGCCAT ACCTCCGAAT 3300
TCTTCCCAAA CAGTTCCACT CTCTGGTAAC TAAGCATCCG AACACATGAG CCTCAGGGAG 3360