EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-05836 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr12:88758960-88761420 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr12:88759557-88759572AAGGTCCAGAGTTCA+6.32
Nr2f6MA0677.1chr12:88761247-88761261TGCCCTTTGACCCA-6.07
RFX2MA0600.2chr12:88760079-88760095CATTTCCATGGCAACA-6.03
RFX3MA0798.1chr12:88760079-88760095CATTTCCATGGCAACA-6.21
RFX3MA0798.1chr12:88760079-88760095CATTTCCATGGCAACA+6.25
RFX4MA0799.1chr12:88760079-88760095CATTTCCATGGCAACA+6.13
RFX5MA0510.2chr12:88760079-88760095CATTTCCATGGCAACA+6.01
RREB1MA0073.1chr12:88760665-88760685GGGTGGGGGTGGGGTGGGGT-6.22
RREB1MA0073.1chr12:88760658-88760678GGGGTGGGGGTGGGGGTGGG-6.27
RREB1MA0073.1chr12:88760659-88760679GGGTGGGGGTGGGGGTGGGG-6.27
RREB1MA0073.1chr12:88760664-88760684GGGGTGGGGGTGGGGTGGGG-8.54
SOX10MA0442.2chr12:88761200-88761211TGCTTTGTTTT-6.02
TP53MA0106.3chr12:88760392-88760410AACATGGTCAGGCATGTC-6.1
TP53MA0106.3chr12:88760392-88760410AACATGGTCAGGCATGTC+6.33
ZNF263MA0528.1chr12:88760690-88760711GGAGGAAGAACAGGAAGGAAG+6.32
ZNF263MA0528.1chr12:88760687-88760708GGGGGAGGAAGAACAGGAAGG+7.67
Enhancer Sequence
ATAGTCTTGG AATATGTCCT GGGGTCTCTG AGAAGCTGAT CACACCCCAG TATGAGGAAG 60
GGCCATGGGG AGACCCATGC AGCCCACCTG GCAGCAGTGC ATATGGCCTC TTGGGAACTC 120
CTTCACCAAC TCACAGGTTT GGAAAGACGA ACCATTGTTT CCTGCAGTGA AGTGTAAGAA 180
TCAGTTGCCA TCTATGAACT CATGAGTTTC AGGCTCCTTC ATAGGCATCA TATTTACATG 240
CATGTAATTT CATGCTGAAA TATACTCATG TGAACATACA TGGAGTAGTT AGCTCTTTCA 300
GCTTCCTTAG ACTACAGCCT TGTGCAGCCC AACCTCATTG ACTTTACCTC TTCCTTACTA 360
ATGGATGTCC ACTGCATGGC CTGAGACACT TAGGGCCTTC TGGGTAATTG TGGGGCTTTG 420
GTCCTCTGGA CCATCTGGAG ACGTTAACCT CTGTGTTCTC TTAAGCAAAA CAGAGAAACA 480
TTTTGGTGTG GTGACTACTA CACTCCTTTC CCTGAATGTT GTCTTCTGGG CTTTATTAAA 540
GCACTGAAGA GGCTGGTGAG ATGGCTCAGT GGGTAAGAGC ACCTGACTGC TCTTCCGAAG 600
GTCCAGAGTT CAAATCCCAG CAACCACATG GTGGCTCACA ACCATCCGTA ACGAGATCTG 660
ACTCCCTCTT CTGGAGTGTC TGAAGACAGC TACAATGTAT TTACATATAA TAAATAAATA 720
AATCTTAAAA AAAAAAAGCG CTGAAGAAGC ACAGTAGACT TATGGGGGGG TGGTGGTGAT 780
ACAGCTGCAT TCTGGGGCCA CTGGAAAAGT GTATGGACCC AGTGGCCTTC CGTGTAGCAT 840
AAAATTGGTG AAGAGAATTG GCAGTCGTGT GTCACTCTAC CATCCCTAGA GTGCTCTTTG 900
CTGCATGGAG GTGATTGGCT GAGGCCCCCC AGGAAAGGGT GAGAAGGAGT ATGGGTATCT 960
ATGATAGGGA GGAGGGTGCG GGGAATGGGC TCTGCATCCT GCAGATGTAT TTCTGCCAGA 1020
GGGGTGTGCA TGCTATATAG GGGCTGCTGA CAGGGTGCCT CTCGTGCCTC AGTGTGGATG 1080
TGACCAAACT CAGATATGCT GCTGTTAAAT GAAGCGGGAC ATTTCCATGG CAACACATCT 1140
CTCAGCTCCC AGCCAGATGC CAAGGCCTTA CATTATGGTT TTCTGGCTGA GAGAGCACTT 1200
CAATTGCTTC TAGTCTCCAA AGCAATGGGA CCGCAGGGAC ACCAGATGCC TCAACCTAAT 1260
AGAACCTAAG GGGTGCTATG TGGGAGCCCG AAGGGGTTTT GCTTGGGGGA AGGCCTGCAA 1320
GTAGCCATAA TAGTTAAGGG GGCTGGACAG GCTCCAGACC TATCATCTCT GAAGCAGTGA 1380
CCTGGGCTTA ATGTTTTCCA GCACCTCAGT CTAAAAGAAG GATTGTACAA TGAACATGGT 1440
CAGGCATGTC AATCACTCCT TTCAGTAACC TCCTTCTTTC TGCCCATCCG TCATCCCTCC 1500
TTTGGAGTTT GAAGAGCTAG GTCCTAGCAT CCCTGCCTAC TTCATCATAG GTAACTAACT 1560
GGTTTGGGGC ACACAGCTGG CCCGAAGGTG GCTAAGCTGA TAGTCTTCCA TCAATTCGGG 1620
TCCAGTAGTG GCAGCCCCGT GTAAGTAAAA TTATCAGAGA TGGACTAAGG CAGCAAATGC 1680
AAAGCAGCTA AGACCACGGG GGTGGGGGTG GGGGTGGGGT GGGGTCGGGG GGAGGAAGAA 1740
CAGGAAGGAA GAAGACTGCA CCTGTGTTCC GATACCTTTT CCTGATTCTC CTACCTGGAT 1800
CTGCTTCCTG CAGTTGGCTG CTTTCTGTTT GACATGCTCC CTACTTAAGG TCCTGAGTAC 1860
TTGGGTCAAG TTCTGATAGC GATGCCCAAG GTGCCTTATC TATCACAATT CCACCCACAG 1920
TAACAACACA AGAGGCTGGC TTGAAAATGT TCAAACACCA GTCCGTGTTG TTGCTCTCTA 1980
GCGGCTACTG ATCTGCATAG AGTTCTGTGG GACCAGTGTC ACGGCAAGAT TATGACTACG 2040
ACTAAGCAGC TACTATGCAT TGCACGATGG GTCAGGTGTC AGGGAAGCAG CTCCAAAAGA 2100
GAGTGTGCTT GAGGAGTTTA TTCTCTGGAG GACACAAATT ATGGGCGAAT AAAAGCTGTC 2160
AGGTAGTGCT GTGGGCTATG CATTCCAAGA ATGGCTCCCA GGATGAGTCA GGACTAATCG 2220
GTTACATCAA GATTAAAAGG TGCTTTGTTT TCACAAGAGG GATGAAACCA CCGAGAGAAC 2280
CTTTGGCTGC CCTTTGACCC AAATAGTTAG AGTGAAACCA AATTTCCTCC TTTGCGGGTC 2340
AACTTTTATA TCGGTGTCCT CTTCTGGTGT GTCTGAAGAT AGTGACAGTG TACTCACATA 2400
CATACAATAA ATAAATCTTT AAAAAAAAAA TGACTGGCTT CAGAAACACA GAAGCAGCTT 2460