EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-05819 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr12:88258160-88261450 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr12:88261216-88261231GAAGGTCAAAGTTCA+6.75
Hnf4aMA0114.3chr12:88261217-88261233AAGGTCAAAGTTCAAG+7.18
LMX1BMA0703.2chr12:88261057-88261068GTTTTAATTAA+6.14
NR2C2MA0504.1chr12:88261216-88261231GAAGGTCAAAGTTCA+6.19
Nr2f6MA0677.1chr12:88261217-88261231AAGGTCAAAGTTCA+6.79
RXRBMA0855.1chr12:88261217-88261231AAGGTCAAAGTTCA+6.98
RXRGMA0856.1chr12:88261217-88261231AAGGTCAAAGTTCA+7.06
RxraMA0512.2chr12:88261217-88261231AAGGTCAAAGTTCA+7.06
SOX10MA0442.2chr12:88258842-88258853TTCTTTGTTTT-6.62
STAT1MA0137.3chr12:88259751-88259762TTTCCAGGAAA+6.62
Stat4MA0518.1chr12:88259751-88259765TTTCCAGGAAATCG+7.42
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04393chr12:88258504-88261127E14.5_Brain
mSE_08366chr12:88258092-88260709Liver
mSE_09262chr12:88259127-88260690Lung
mSE_10025chr12:88252034-88261408Embryonic_stem_cells
mSE_10713chr12:88258295-88259562Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
GGAAGCCACA TGGGTCTCCA GTACAGAAGG ACTCTTCTCT TAGAGCAAAG AGAGCATGGA 60
GGGCAAAGCC CCTGTGCCCA GCATGGCAGG GCGGCTGATG GAATGCAGTG CTAAGCAAGA 120
CATTTAGGAG TCTTGGCCTA GCACTGGGGA TTGGTGTGTC CTGACTCCTT TAAAGGTAGG 180
CTTGGCCCCA GCCAAAGGCC AGAGTGCTGG CTCTTGCTTA GGCCTGACAA TGGGCCAGCA 240
GTCAACACAG AGGCAGGAAG AAAGCTATTC CTACCCCTTT CCACCTTTCT GGGGGTCGGT 300
AGGGAATGAG AACCAGAAAA AGCAGCTGGC TTTGATGTCA CCATACTCCT GCTCTGTCCG 360
GCTTTGTCGG GCTTTGTCCT GCTTCTTCTC ACCTGAGGGG CCCAGTGAGG GGTTCACCTC 420
TCTGCTTCTC TGCTGGCTGC CTCGACGCAG GTGTTGCTGG ACTTGGAGCA GAAGTTCAGC 480
ATGACTTTGG GGGTGCCATT GACCCCTCCA GTGTGGCAGT GGCCTGTTGA TGTCAGCTCA 540
GGTGACACCC AGCCATCTCA CCCATGGTTC CTCCTTGCCT AGTGGAAGCT AGGAGAGAGC 600
TGTCTTCCGA GAAGGGAGGC TTTGGGGAGC AACCAGGCAA CAGACAGAAC AAGCGGAAGA 660
CGCTGCGCTC CGACTCTCTG GGTTCTTTGT TTTGAGAACA TAAATATAGA GAGGAAACAA 720
AAGGGAGCTC TTGAATCAAA TCTGTAATCT CGGTACCCAG GAATCTGAGG CAGGGGGATC 780
ACTGTGAGTA TGAGGCCAGC CCGTGCATCC CAGTGAGACT GGTTTCAAAA TAAACAAGCA 840
AATAAACAGT GAGAGACAGC AGCAGCAGCA GCAGTGCAGT TCCTTCCAAT CCTGTTTCTG 900
ACCGGTGTCA ACACTGTCCC CAGCAATAAC CTATGTAGGG AGTGTACATG TATCGTGTCC 960
AACTTCCCAG GTGTTTATAT ATATGACATA CATGTGCACA CACACATGTG AGGTCGTGAT 1020
CTTTGTTCCT CGGTGATTTT TTTTACACAA ATGGCTGACC ATATTGCTCT GCAGTTGTTT 1080
CCCTGGAACA GTCCAAGCTG GCCTTCGTCT TGGGGGAAAG CCTCCTTGCT TGTTTTCCTA 1140
GCTTTCTGGA TAATAGTCCT CGGGCAGGTG TAGCACTGAC AGCTGGTTCA GTAGCTTCTT 1200
TTCCCCCTCG GCTCTCACTC AAGGCAGCAT GAGCCAGCTT TTATAGGAAA TGGCATGTCT 1260
GCCCAATTCC AGGGGCCACC ACCCACTCTC AGAATGTGTT AGCCCTGCCT GATGGACAGT 1320
CGAGGTGTCT CCAATTGTTA CCACACAGAC AATCCCGCAG GGACTATGCT GCCCAGGCCT 1380
TTCTGCATGC CTGTGAATAG ATTTGGGGGG GGGGGGCATT GTTCCCTAGG CTTAAACCAG 1440
TGGGTGGGCA GAAATGCATG CTCACTCCTC TGTCCCGTGG GTGGACAGGT CCCAGTGTGG 1500
GAGGGTGGCT AAAGGTTCCT TGCCTGCTCA GGCTCAGCCG AACGCGTCCC AGTAGCACAC 1560
ATCCCCCACG TGACTGCTGG CTGGACTGCT GTTTCCAGGA AATCGATTGT AAAGACCGCT 1620
GAGTGTCAGT GGCTCACACA CTGGAGGCCA TCCAGGGAGT AGATTAAATT GTAGGAGAAA 1680
AAAATCTTAT CCTGAGCTCA AGATGGTTGG TAATGGGAGC CCTGTGGTGA CCTTCCTGGA 1740
GAAGTTAAAA AAAAAAAAAA AATACAGGCA CTTTTAACCG CTCCCTGGCT CACCACCTCC 1800
AGCCTACCTG GCAGAAGTGT AGTCCCTCTG CCCTTGAAGG AGACTCTCTC ATGAGCAGGC 1860
CAGGCTGCTA GGGTAAGACC TAGTCTGGGG TCTAGACTGT CTTTGCAGCC AGAGGCTAGG 1920
AAACCCTCCT CACCAAGTCT CAGACCAGTG GCTGACCCTG GCTGGGCACA GCCCATTTCC 1980
TCTCCTACAC AAACGCAGGT ACACAAACAC AGAGCTGACT CCTGCCTTTC CTGACATTCC 2040
AGAACAATCA GGTACTCCGC CAGACTGCTC AGTCTAAGGA CAAGAGAGCC CTTGGGCGGA 2100
GCCTGTTTCT TTCTGCCAGG TGAAGCAGGG TTTTCCTTCT TCTTCTGAGA AATGATATGT 2160
TACATTGCTG TAATGGCCCA GCCGGGGAGA AGGGAGGGTG GGGTTGAAGC CAGAAAGGAG 2220
AGAGAAAGGA TGAAGCATGA AATGAAATGA GCAGTATGAG AGGAGGAGCG AGGTGTGGGT 2280
GGGGAGTGGC TGAGCCGTGG GCACGGTCTG ATCGCATCCG CAGTGGTAAC ACAGCCCATC 2340
ACCGCCATAA CGCAAAGGCA GCCTTATCCA CGCGCTCCAT CATCTGCAAA TTCCCTCATC 2400
GAATCTTTAC CCTCACGCCA GCATGATTAG TAGCTCTCAT TAGTTTTACA CATATAATAT 2460
GAGGCTGGGT CATTTGTTCG GTTGTCCCAG CTGGTAGGTG ACAGAACCAG CCTGTTATCT 2520
GATCCCAGAG CCCCATCACT GGATGGAGCT AGTTCTCTTC TGTGACCAGC CCTCAGCCAG 2580
TAGGATTTCC AGGTAAGCCT GCATTAGCCT TTCAGTGTGG CTTTGCCCTG TACACACACA 2640
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACAGT GCCTTTGAGG 2700
TCAAGGGCAA CTCAGGTTTT TGGTCTATTG GGATCCTGCA TCTTTATCTT AGAACAGCTC 2760
TGCCTGGAAC AAGAGTCCAA TGGATGAAAG GCAGAGTAAA CTCAGGTCTT CACACAGTCT 2820
GATGTCTCTC CCAAGCCCTG GTATGGGTGC TCAGGTAATC TCTACTGCTG AGCAGAAAGT 2880
CTTAGGGGTG AGTTACTGTT TTAATTAAGA CATGGCCTTT CTGTGCTGGG GATGTCGCTT 2940
ATCTAGTAGA GCGTTTGCCT AGTATTCATG AAAGCCTTGG GTTTGATCTT CAGAAGATCA 3000
TGAATGGGGC ACTGTAATAC ACACCCGAGA TCTCAGCTTT AAGGAGGTAG AGGCAGGAAG 3060
GTCAAAGTTC AAGTCCATTC TTAGCTACAC AGGAGTTCAC TGCCAGCCTG AGCTACATGA 3120
GACCTTATCC TTTAAAGAAT ATTTTAATGC ATTTTTATTT TTTAACAGAT ATGACTTTTT 3180
TGCCCCTGTG TGCATATGTC TGTGCAATAC ATATGCCTGG TGCCCTTGGA GGCCTCAAGA 3240
AGGTATAGCA TCCCTTGGAC TTAGAGGACA GTTATGAGCT GTCATGTGGG 3290