EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-05395 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr12:40700420-40703720 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BCL6MA0463.2chr12:40702459-40702475AATTCCTCGAGAGCCA-6.42
BCL6BMA0731.1chr12:40702457-40702474GGAATTCCTCGAGAGCC-6.4
Gfi1bMA0483.1chr12:40703342-40703353AAATCACAGCC+6.02
IRF1MA0050.2chr12:40701319-40701340TTTTTGTTTCACTTTTGAATC+6.16
RFX2MA0600.2chr12:40702588-40702604AGTTTCCATGGAAACT+6.03
RFX2MA0600.2chr12:40702588-40702604AGTTTCCATGGAAACT-6.03
RFX4MA0799.1chr12:40702588-40702604AGTTTCCATGGAAACT+6.02
RFX4MA0799.1chr12:40702588-40702604AGTTTCCATGGAAACT-6.02
RREB1MA0073.1chr12:40702428-40702448GCCCACCCCACCCCCACCGC+6.3
Sox3MA0514.1chr12:40702194-40702204CCTTTGTTTT+6.02
ZNF263MA0528.1chr12:40701459-40701480TCCACCCCTCTTTCCTCCTTT-6.42
Enhancer Sequence
TTGGCAGCAA TCAGGGAAAG CTGAACCACT TTAAGGACAA ACTGCCAATG TCCTACATCC 60
GTTCCAGTAG ACCTCACCTA CCAAAGGGTT CCCTCATCCT AAGAGTGTCA CAGGCTGCTG 120
GCCATACATT TAACAGGAGC CACTGAGGGA ACATTTTCAA CCCTGAGAAA ACTAATTTCA 180
CTAAAAGATG CTGCCGTTTT CCCAGCAAGC AAAGCTCAGT CCAGCCTCCA TTTCTTTAAA 240
GAAACATACC TAAGTAGATG ATTTCCACTA TCAGCATTCC TCCAGACTTA ATCCCCTCTC 300
CGCTTCTGTC TACAACAGCC GAGCTATGCG ACACAGACAT TTCTCCACTA TCAATGCCAT 360
CCCCTTGTTC TTTGAGTTGA TCTCTCTGTT ATCAGTGACT TCCTCCCTCC TGAACTCTTC 420
CAACATGATG GCAGGAAAGG GTTAATACTT AATTCTTCTG TGGAAATCAG TCCATGACTT 480
ACCCACATTT CAACAAAACT TGAACTTCTT AGCTTTGCAT AAAACCACCC AAGAAGGCTA 540
CTGCCTTCTG CCTTCCCACC CCTTTCCATT ACTGTCTCGC TGAGACCTAC ACAGAATGCC 600
TACAACACTG GTCCTCTTCC AACTCCCTGC CTTTGACATG TTCCCTCCCT CTGGATGTAT 660
TTACCCACTT GTCTGCCTTA GTCACATCTC ACATCCTTGA GGACCCATGC ATGATAAATG 720
CATCTTGGGT TTAAAAGGCT TTACCTATCT TGCCTACACA GACAGTGCTA GGTTGACTGA 780
TTTTTCTCTG CTCTAGACTC TGATTTAAAA ACAAACAAAA AACAGATCTA CCCTCAACCT 840
GAGTATGTTG ACAATATGCA GTATTTCCAA TCATTGTTTT ACTGTTTGTG TTTTCGTAAT 900
TTTTGTTTCA CTTTTGAATC TGACAGTTCA GAGACTTATG TGCCTTTATA ATACATGAAC 960
TATTATAGCT ATTGCAGGAA ATGATGGGCT CTCTCACAGC AGCGCCCGCA GCCCAGCATG 1020
GCAAACATGA CAAGCCTTGT CCACCCCTCT TTCCTCCTTT TGTTAAACCA TTAGATTACA 1080
TTCCTAAAGT GAGCCCCCAA GGTCTATTCC CTTTGTTGGC CACTGACCCG TTCCTGAGAT 1140
TGATCTCCAA GGTCCAGCTA TCAAAATTCA TTATTGGAGA GCCTGTTCAA TCAGGACGTA 1200
CCAACTCACC CTAGTGCAGA CTTCCCTTAA ATGTGTTTCT TTCTGCAGAG AAACACATGC 1260
TGCTTGCTGC CTTTGTCCAA TCCAGAGGCA GCTCCCCACA TGCTTTTACT ACTCCAGGGT 1320
AGTAAATCTC CTTTGTTCTG AGAACTTAGT GTCTGGGTAA CTTAGTATCT GGGTGTGTTC 1380
TGTAATGACT CTGAGGCCCC TTACCGGAAG AATACATCAA AGAGAGACAT TTTTTTTTCC 1440
TGAACATGAT TGTAATCAAA TGCAACAAGC AAGTATTGTA CCATGGATGC ATTAAAGTGT 1500
CAGTAGTTAC ACATAGTGCT GACTAACTCT GTAAGAGAGC TGGTGTATCC CCTCCTGCAT 1560
TAGACTTGTC TCCAGACAGC TTCATAGCAC TGGTCTGGCA CCGTGGAGGG TACAAATATA 1620
AATGAGGCAG TCTGCAACCC AATGAGAGAG ACATCGTTTT TTCCAAGGGA ATGAACATGA 1680
CTTCATTTGA CTCCACATGT ATGATCTCAT TTGTCTTTTA CTCTTACTTG ATCTGTATTT 1740
TCAGGTAACA CAGAATTGCC TCCTATCACT GATCCCTTTG TTTTGCCCTG AGCTTTCTTC 1800
TTAAGGCCTA TTTATTTCAG GAAGTTTAGA ATTTGAAGAA CAAGCCCACA TTTAGAAATT 1860
CAGTGGGTAT TTAAATATAT GCTTTGATTC TTTTAAGTCT TGTTGTTAAA TAATAATAAT 1920
AATGAATAAA TTCCTGGGCT TAAGCCTTTT GGAGAAATAA CTTTTTATCA CCCTATCTAT 1980
TTTATAGATC TCTTAATATT TAGTTGTTGC CCACCCCACC CCCACCGCCC TTAGGCAGGA 2040
ATTCCTCGAG AGCCAGGGTA GCACTAACCA GCTGATCTGC TCAGGAAACA GAGTGCTTGC 2100
AAATACAAAG AAAGGTAGAA TTTTTTTCTT GTGTGCCTTG AAGAATTATT TTGCCTTCCC 2160
TTTGTCCGAG TTTCCATGGA AACTCCTCTC CTGGAAATGA GCAGTTCATC AGAGCCCTCA 2220
TCCTGAATGT AAGCAGAACA CGGGGCCGAT GCTGTGATCT ATTTTAGTGC AGTCACGGCT 2280
TGCAGAAATC TAGGAATAAT TATTATATGC ATAAGGGGGT CAGGCAACAT GAAAATGAGC 2340
ATAAATGGGA AACAATGGCT TGGGTGGCAG CTTTAATCTT CTTGTTGCCT TTGTGTAGAT 2400
GTAATAGGGT GAAATGTGCT TCTTACTTGT ATCTCAAACA ATGAGCAGCA GGCAGCAGAG 2460
GAACCCACGG ATACCAAATC AGTCCGTACC TGCACGAGCC TATCAACATC ATGACAGTGA 2520
AAGAAATTGT TTCAAAATAG CAGAAATGGA CACAGAAATC AGTTTGTCGT CTACCGGAAA 2580
ACAACTTAGG AGAAAATCCA CTTTAAATGG AGATACAAGT AGCAGAGATT ATACTTTCTG 2640
TTCTGAAAGG TTTGGTTAAG AAACCCCATG ATGTATTTGA GTTGGAATCA TGAAGCAAGA 2700
CTTCCCATCT TCCCTGGGGG CTGGGGGGTG GGGCAGGGGA TGTTACAAGA TGGTGCTATG 2760
TAATAACAGG TATCTTAGCC TGGTGCTATA TATAGCTCAG TGGTACAGCA CATGCTTGGC 2820
ATGGAGAGCC TGACTAAATA ATCAACAATC AAAACAGAAA ATGCATAGAT ACACACTAGT 2880
ATTGAATATA CTGGTATCTG TGTATCCCTG GAGTTTTCTA TAAAATCACA GCCGTTTCAG 2940
ATTTCTTCTG TCCTACGTCA GTCATGTTCT AGCTATGGAA ATTCTCTAAG TTTCTAAAAC 3000
TATACAGCTC CATTTGGTCT TTCCTTCTTC CTCTGTGAAT TCAATGCTAG TATTGAATGC 3060
ATTTTTCCAG GAGTCTCATT TCAGGAGAAT TCTGTTGGCT TCTACTGTGA TGACATCACT 3120
CTGAGGTGGA AGGAATCACA CTTCCTCCTG AGCAAAGAAC TGAGAGAGGG GGGAAAAGGT 3180
ATCACCCGTA CATGATCTTC AATCTCTCAA CTCTCTGGAA ATACAAGCAT TCATAGTCTT 3240
TAGTTAGTTA GTTGTTTAGT TAGTTGGACT TAACCAGAAT GATGAGTTTT GAAACTGTAG 3300