EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-05310 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr12:29812310-29815700 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PKNOX1MA0782.1chr12:29815310-29815322TGACAGGTGTCA+7.22
PKNOX2MA0783.1chr12:29815310-29815322TGACAGGTGTCA+7.22
RFX1MA0509.2chr12:29813651-29813667TGTTGCCATGGCTACA+7.21
RFX1MA0509.2chr12:29813651-29813667TGTTGCCATGGCTACA-7.2
RFX2MA0600.2chr12:29813651-29813667TGTTGCCATGGCTACA+7.05
RFX2MA0600.2chr12:29813651-29813667TGTTGCCATGGCTACA-7.15
RFX3MA0798.1chr12:29813651-29813667TGTTGCCATGGCTACA+7.11
RFX3MA0798.1chr12:29813651-29813667TGTTGCCATGGCTACA-7.27
RFX4MA0799.1chr12:29813651-29813667TGTTGCCATGGCTACA+7.23
RFX4MA0799.1chr12:29813651-29813667TGTTGCCATGGCTACA-7.33
RFX5MA0510.2chr12:29813651-29813667TGTTGCCATGGCTACA-6.42
RFX5MA0510.2chr12:29813651-29813667TGTTGCCATGGCTACA+6.52
TGIF1MA0796.1chr12:29815310-29815322TGACAGGTGTCA+6.92
TGIF2MA0797.1chr12:29815310-29815322TGACAGGTGTCA+6.92
Enhancer Sequence
TTCCCCAGCC AAGTGATTTG TCTCCAGTTC TCCCATAGAA ACTCCAGCCT GGCATAATTC 60
TTGTCACATT TGCTTTCAAA TGACCTCTAC TTTTTTTTTT TCTTCATCCC TCTTGATTGC 120
TTTAGAACTT CACAAACCTG ATTTACATGC CAATCACTTA GATGTGCCAG AGTTGTTAGC 180
AGCCAGAAAG ATTTTATCCC ACAACAAGGC TCAAGAATGC TGCGAACTGC CCCACACTAG 240
TCCTGAGGTC TCTGCCAAAT TAACTTTTAC TCACCTCTCC ACTAAGCATA GTTCTGTCTG 300
GCCTGGTGAG CCAGGCATCA ACTGCCACCT TTCTCATGCC TAACTCCCTC AGTCCTCACT 360
ATCATGTAGA CTTCATTCAC TCTCTACACT GTCTAATTCT TCCCACTGGT TCCACGCTTT 420
GGATCCCATG AGGGCTTCTT TAGGACAGAT CTAATTTTTG CTCTTTGCCT TATGACTCCC 480
CAGAGCTGTG AGGAACAGAA CATCAGTATG TCTTATTCCT CTTATCCTTT TTTTTCTGCT 540
AAGTCAGAGA CGAATCTAAG CGATGCCTCC CACATCCCTC TTTCTCATTG TAATTCCTTC 600
CTTGCAAGGG CATGTTCCCT ATGGGTAGAT AGGTCAACCT CGGTTGTATG TCTTATTACA 660
CATCTCAGGG TGCATACGAC TGCCACCAGA GCTTCCTGGA AATCTCATTC CATACGTGTT 720
ATTTTCAGGT ACTGTATGGT ACATTTTTCA GTCCTTCCAT CTCTGTTTCA TGGGTTGGCC 780
CCTTGTCACG GAGGCTCACT GTTCCATGCT ACATCAGAAA AAGATGATGG TCCTGGGATC 840
CAGGCACAGA TATTCCACTC TTAGGTGGCC CAGCCTCAGC TGCATTTCTT ATTATCCATG 900
ATAGACATGC AACCTCTCTT CCCAGACTCA TCCTTGGATC TGTCATGTCC CAGTTCAGCT 960
ACCAATCCGT TGTGTTCTTT TTTCCAGGGA AACACAAAGA AATAGCTTTC TCCCCCGGAT 1020
AGAGAACCGA CATATGAAGG AAATTATTTT TTTTCCAGGT CTGGTTTGGT TGAGCCAGTG 1080
AGTTTATTAG AACTATTTAT AGGCACGTAG CTGACAGGTT ACTTATAGAA GCACGGTTGA 1140
CTCAGAAGCG GCTGTCTCAC TGTAAAACCC CACTCCATCA TGGGTGATGA GTGAAAGCCC 1200
CAGCTCCAGT GTCCCAGCTG CTGGAGAATC TCAGTTGAGG GTCTGACAAT GTTTCCTCTT 1260
TCCCCAATTC TAAAAGGAAA TGTTAATAGC TCTCTTATGA CCACAGCAGA CCTTGCTATC 1320
ACTATACTTC CCTGTGTATT TTGTTGCCAT GGCTACAGTT TGAAGGTATT CTGAAGGCCA 1380
ATGTTTGTTT AGACCTGTAT GAAGTATTCC CACTATAACA AGAGCCTTGA TGACCCTGTT 1440
GAGGCCCCTC ATCCGTTTCT GTCTTGATGG CAGAACTCTG CTGACTTTGC TTCCATCTAC 1500
TCCAACAACG GGGCCTTGGG AACCTTTGCA CCTCATCCGA CAGCTTCATC ACTGGTGGGG 1560
ATCTAGCAAC ATCTGCTCTG GTGAGAGAGT GGCTCCTGCT GTCTGGTCAC GGTTTTGCAG 1620
GGGAGTCTGG ATCTTCACCA GGGCTTCCTT TACCATACCA GCTGTGCCTC CCGCTCAGCA 1680
GCCCTGCATC GAAGCCAGCC GCTTGGAAGA CACACAAGGG CACAAGGGCA CGCGTCTCCT 1740
GAAGAGGGTT GAGCAGCTTT AGCCGGTTGT TGTCTCAGAG CTGAGCTTTG GTACCAGGAG 1800
CCCATGCCTT TGGAAATGGT AGAGTGAATA GGAATCCACA GAAATGTTAC TGGGCATTTA 1860
GGGGAGTTCC CTAAGACTTG TCACATATTG GTCCTCTCTT GGGGTTCTTG ATCTCAATAA 1920
AATAATTTGA GAATGGACTA AAAGGAAACC CCAGGGCCAT TTCATTAGAA TTAAAAAAAA 1980
AAAAAACAAA AAAACCTCAC GACAGGCAAA CTGTAAATTT TATCAGTTGC CTGGGGAAGG 2040
AGATGAGGAG GCAGAGAAAC TCCATTGAAC TAAGCTGGCA TGAAGGTCGG CCATGTGCCA 2100
GAGAAACAGC TGTGTTCAGA GGAAGAGAAG GGAAACGGAG GATTTCAAAG AGACAGAAGA 2160
GAAGAAAGGG GAGTAATGAT AACTTCCTGA GTCAGAGAGA GTAGCAGGAC CTCACGGGGA 2220
CTTGTAGTGG CTGGATCAGG ACCAGGAATT CTTATAAGGA AAAATACATT ATCTCATTAG 2280
CTGGGCAACT GTTCCTGCAC CTTCTCAGTG TAGTTTAAGG TAGATTGGCC TTCCTGGAGT 2340
GGCCCCACCT TCCTAAGTGG TGGTCCCTTA GCCGGGGGCG GCCTTCCCAG CTGGATTAAC 2400
TCTCTTATAT TTAGGGAAGT TTGGAATTTC AGGCCTCTAC ACAGTCCAGG GAATTCACTT 2460
TCCCTGATGG GTATTCACAG AGCTCTGTAA CAGAACCTGC AGGGAGGAAG AGAAGGAATC 2520
CTGATGTCTT AGAGATAGAC ATCCATCTGT CTACAGAGTC ACATCCAAGG CCTGGGGCAT 2580
AGAGCCAGGC CATGTCCCAG TTAGAGTCGG AGGGGAGTGT GCTGTACCTT CTGACTGACA 2640
GGTGATGTCC CCCTTGACAG ATGTTCCTTT TGACAGGTAC TGCCTAGCAC TTCTGGCAGC 2700
TGCTTCCTGT CCCTCCTGAC AAATACTGTT CCTCCTGACA GGTGCTGTCC CTCATGACAG 2760
GTGTTGTTTC TCTTCCCTTC CTGATTGACA GGTGCTGCCC CTCCTGACTG ACAGGTGCTG 2820
TCTTTCTGCC CCTCCTGACT GACAGGTGCT GCCTCTCCTG ACAGGTGCTG CCTTTCTGCC 2880
CCTCCTGACT GACAGGTGCT ACCCCTCCTG ATTGACAGGT GGTGCCCTTC CTGACAGGTG 2940
CTTCCTCTCC TGTCAGATAC TGGCTCTCCT GACAGGTGCT GTCCTTCTGC CCTTCCTGAC 3000
TGACAGGTGT CATCCCTCTT GACTGACAGG TGCTGCCCTT CTGATTGACA GGTGCTGCTC 3060
CTCCTGACCA GAAGTGGTTT CCTTCATAAA TAGTTAACAG AAGGTCTAGG AACCAACATT 3120
CTAACTCACG TTTTCACATG GATCTCAAAG CATCAGAGTC ACAACCTTAC ATGGATTCTA 3180
GACTCTACAG CATGGAGTCA CAGGATGCTA AAGCCTCACC GCAGTGTGTA AGGACAGGTT 3240
CATGCGGCCC CTGGTTGAGA ACGTTCTGGG AACAGAGGTT GCAAAGATGC TCCAAGAGAT 3300
GGATCCTTGA GGAAGTAGGA CAAGGGGCCC CATCAAGGGG TAGGAGATAG AGTGGGACCA 3360
GCAGCTAGCT ATACCTCCCC AGGGCTGCCG 3390