EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-04363 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr11:97668740-97675790 
TF binding sites/motifs
Number: 60             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr11:97671525-97671542AGTATTAATTAATTAAT+6.27
Alx4MA0853.1chr11:97671525-97671542AGTATTAATTAATTAAT+6.02
IRF1MA0050.2chr11:97672314-97672335GAAAAAAAAAAGAAAGAAAAG-6.07
KLF4MA0039.3chr11:97674653-97674664AGAGGGTGTGG-6.02
Lhx3MA0135.1chr11:97671527-97671540TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr11:97671530-97671543TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr11:97671534-97671547TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr11:97671538-97671551TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr11:97671542-97671555TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr11:97671546-97671559TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr11:97671531-97671544AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr11:97671535-97671548AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr11:97671539-97671552AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr11:97671543-97671556AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr11:97671547-97671560AATTAATTAATTT-6.92
NR2C2MA0504.1chr11:97669998-97670013TGACCTTTGACCCAG-6.74
NR2F1MA0017.2chr11:97669994-97670007CTTTTGACCTTTG-6.87
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr11:97669990-97670005TGACCTTTTGACCTT-8.73
Nr2f6MA0677.1chr11:97669998-97670012TGACCTTTGACCCA-7.52
POU6F1MA0628.1chr11:97671528-97671538ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:97671532-97671542ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:97671536-97671546ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:97671540-97671550ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:97671544-97671554ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:97671548-97671558ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr11:97671528-97671538ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr11:97671532-97671542ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr11:97671536-97671546ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr11:97671540-97671550ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr11:97671544-97671554ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr11:97671548-97671558ATTAATTAAT-6.02
RARAMA0729.1chr11:97669987-97670005AGGTGACCTTTTGACCTT-7.33
RFX1MA0509.2chr11:97674125-97674141GGTTGCCATGGGAACC+6.44
RFX1MA0509.2chr11:97674125-97674141GGTTGCCATGGGAACC-6.46
RFX2MA0600.2chr11:97674125-97674141GGTTGCCATGGGAACC-6.86
RFX2MA0600.2chr11:97674125-97674141GGTTGCCATGGGAACC+7.01
RFX3MA0798.1chr11:97674125-97674141GGTTGCCATGGGAACC-7.04
RFX3MA0798.1chr11:97674125-97674141GGTTGCCATGGGAACC+7.2
RFX4MA0799.1chr11:97674125-97674141GGTTGCCATGGGAACC-6.42
RFX5MA0510.2chr11:97674125-97674141GGTTGCCATGGGAACC+7.24
RFX5MA0510.2chr11:97674125-97674141GGTTGCCATGGGAACC-7.29
RREB1MA0073.1chr11:97673477-97673497CCCCCCCCCCCCCCCCCCCG+6.07
RREB1MA0073.1chr11:97670929-97670949CACCCATCCACCCCCTCACC+6.1
RREB1MA0073.1chr11:97670925-97670945CCCCCACCCATCCACCCCCT+6.59
RXRBMA0855.1chr11:97669998-97670012TGACCTTTGACCCA-7.52
RXRGMA0856.1chr11:97669998-97670012TGACCTTTGACCCA-7.38
Rarb(var.2)MA0858.1chr11:97671212-97671229GGACCTCAGTGTGACCT-6.5
RarbMA0857.1chr11:97669990-97670006TGACCTTTTGACCTTT-9.63
RxraMA0512.2chr11:97669998-97670012TGACCTTTGACCCA-7.42
ZNF263MA0528.1chr11:97672612-97672633TTTTCTTCTCCCCCTTCCTTT-6.08
ZNF263MA0528.1chr11:97673473-97673494TCCTCCCCCCCCCCCCCCCCC-6.21
ZNF263MA0528.1chr11:97669529-97669550TTCTCTGCCACTTCCTCCCCC-6.37
ZNF263MA0528.1chr11:97674071-97674092TCTCCCTCCTTCCCCTCTCCC-6.41
ZNF740MA0753.2chr11:97673477-97673490CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr11:97673478-97673491CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr11:97673479-97673492CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr11:97673480-97673493CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr11:97673481-97673494CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr11:97673482-97673495CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr11:97673483-97673496CCCCCCCCCCCCC+6.03
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01253chr11:97658204-97702714Th_Cells
mSE_06011chr11:97668780-97669572E14.5_Limb
mSE_07185chr11:97668601-97676452Intestine
mSE_08061chr11:97666678-97671493Kidney
mSE_08061chr11:97671546-97672286Kidney
mSE_08061chr11:97672299-97676384Kidney
mSE_08534chr11:97668737-97676460Liver
mSE_09282chr11:97668755-97671233Lung
mSE_09684chr11:97668481-97670586MEF
mSE_10060chr11:97664422-97671526Embryonic_stem_cells
mSE_10060chr11:97672289-97673462Embryonic_stem_cells
mSE_11188chr11:97668699-97685098Placenta
Enhancer Sequence
TGTACGTGTG TGTATGGGTA CCACTTGTGT GCCTGGTATA TCCATGGAGA CCAGGAAAGG 60
GCATCAGATC CCTTGTCATT GGAGTTATAG GTGGTTGTGA GCTTAGATGT AGGTGCTGCA 120
AACTGAACCC ACGTCCTCTG CAAAAGTAGC CAGTGCTCTT AACCACCCTG CCAGCTCCTT 180
TTCTGCCTTG GAAGGGAGAC GGACATTGAC CATTATCCTG AGAGCTGCTA GCTTAGGTCC 240
TGTTCTGGCC AGCTGACACC ATTAGGAGAT GAGTCTCCTG CAGTTTTGGA GAGAGCTGAG 300
ACACCACTTC CAAGGGGGCT CATGAGTAGC AAGTACAACC TCAGCATGAA CGCCAGAGTT 360
CCAGGCTTAT TGGCCCGGTT TCACCATGAC CAGCTGGTCT CCCAGTTTAA TTCTACTTAG 420
CCAAAGTTTA CCAGGAAGGG AAACTGGAGA CCCAGCTCGT TGAGGGCCGC CTATCATGGC 480
CTATCATCTC CTGCGGGGTT TGAACATTTA CCAGACACTT GCTGCCTGCC CTCTGATCTA 540
TACCAACTTC TCAGGTGCTG GAAACCTGAT TTCTGATAAC ATCCAGAGCT TAAGAGGCAG 600
CGTAACTATG GTTCCTTCCG AAGGACCTGT CTCAGGCAGT TTGGAGTAGA GGAAGGACCA 660
CAGCTTTTTT TGATCCCTTA GTTCTGATTT CCATGGCTCC TCTGCCTCCC CCACCCCAAC 720
TCCCAGCCAG TCCAGCCCCA AGGGAAATGG GACATTCTTT GAATTCTTAA GGGCTCACAC 780
AAACCCTGAT TCTCTGCCAC TTCCTCCCCC CAACCCCCCT TTGGAGAGTG GGGTGAGGTT 840
CAGAGGAAAA AAAAAAAAGC CCAGGGCATT TAACCCTTTG GGTGCTGGAC TGCTTTAGGC 900
TGCTCTGCCA GCCTCCTTTG GGCATCTTCA AGCTGGGCCT CCACTTCCTG GCAGAAGTCT 960
GCCTGGCAGA AGTCTTTGCT CGCTTCTTCT CCAGTTGGCT TATCATCCTG TGAGCATCGA 1020
AAGTTGGAGA GAGAATGTTT TCTGTCAGAA TTGCTGGAGT TCTAACTTAG TCTTCTTGGG 1080
GAGACCTGCA GCAGTTGGGG GGGGGCTGGG TGAAGTAGGA GATGAGGTCT TTCCTGCTTG 1140
GAGAGTCAAC AGCTCTCTCT CCTTCCTGAC ATTCAGCTAG GGGAGTGGGT TGGCATCTCC 1200
TTTTGCCTCT CCAGTCATTT TTACAGACTC TGATTTCAGT CCTATCCAGG TGACCTTTTG 1260
ACCTTTGACC CAGTGTTTGT TGGGAAGGAC GTGCACTGGG GTGTGGGTGT GTGTGTGTGT 1320
CTCAGCTGTG CTTCATTCCA GCTGCAGCAG CCTCTTGACC ACCGCTGATG CTCCCTGGTG 1380
ACTTTGTCCT TGGCGCTGTC TGCTGAACTC CTCATCTAAA GCCAAATGCA GATACGTGGC 1440
CTCTGCACCT GCCTGAACTT GGGTTTCCCC TGCCTTAGAC CAGAATCTCC ACTACATGCC 1500
AGCGCCAGGC CCTATGGCAA ACTTCATTCC CTCCTGTTTC TTTCCAGCTG GTCTCTGGCA 1560
CTAGTTTTCA GTGGCATTAA GGTTCCTGAA TCTTGGGGCT TCTGGGGAAT TGTTCCCCCT 1620
GCACCCCAGA CTCCTTCCAA CCCCAGCTGT GCTTGTGGGC CACAGGCCAA GCCTCCTTCT 1680
GCAGAGCAGT GCTCCCCTCC CCTAGGCTAA GCCTGCCTGG GGCAGGACAT ACAGAGCCAG 1740
GTGACATCTC CTGGCATTTT GCCAGGGCTC TAAGGCCACC CAGAGAGTGT GACTCTGGTG 1800
TGCAGGGAAC TTCTGTGTGC TGCCTGTTTC TGGCCAGTGT CTGAGCCTGA GGGCAGCTAG 1860
GCTCTTGTGG AGGAAGAAGG AATGAGAGCC CCCTGTCCTC TCCGTCCTTC CAGAATTCTA 1920
GAAAGTGATC AGTGAAGGGC TTCTGTTTCC CTCCTTACAC CCGACAAGTG TGAGGGGAAG 1980
TCAGGGTCAT GAACACAGGC TAGGGCTCAC AGCCAGCCCA CCGGGTGGTG TGAAGCACAG 2040
GCATGCAGTT ACATAGTTCT GGAGTGGCCT CATCCTCACC TGGGGACCTA CTAGGCTCCC 2100
ACTGAGCTTC CTGCAGATTC CTTCTGGTCA GCTCTCTGCT GTAAGGCAGA GGCCACACAC 2160
ACTGACCTGC ACAGTAGCCC AAGGACCCCC ACCCATCCAC CCCCTCACCT CTTCTTTCAC 2220
TGCAACTTTC AGGTGGGTGG GGTGGGCCTG ATCTGTTGGC TAGAGAAATA TTTATACCCT 2280
GAGTTATTTG TTGTGTAAAT TGGATTATTG GAGCCCTGGT TCATGCAAAC CTGTTTCACT 2340
GGGACCATGC CAACTGTCAT AGAGGGTGGT GCTCAGGGCT GGTTTTGGGA TGGAGATGGG 2400
AACAAAGTGC CTTGGGGACC TGCAGACTAG AGGCCCACTA GGGCTAGAGG AAACTCTCTG 2460
GGGAAGGAAG AGGGACCTCA GTGTGACCTT TCTCCTCAGA CTGACAAAAG ACATCTGAGT 2520
TCCTGATTCA GTTTTCCTGA GCTGTGGAGT AAGGAAGGGG CTGAGTCGGG AAGTGTGAAA 2580
AATGTTCTTT CTGCTGGGGA CTGAATCTAC CCATTTCCAG GGCCTTAACT GAGAGTAGGG 2640
TAGAGTCTTA GTCAGTGTGT CCGTACATTC ATTCTAGCAT ACTGATCGCA ATCGCAGTTT 2700
GTTTGGCTTT GGTTTGTGAG ATAGTGTCAG GAAGCCAGGT CTGGTCTTAA GCTCTATGTA 2760
GCCAAGGATG AGGTTGAACT TACATAGTAT TAATTAATTA ATTAATTAAT TAATTAATTT 2820
ATTGTGTATA TGTGAAGGGG GAAAGAGGGA GAGGTCGGTG TGTGAGTCTA GGCAATCACA 2880
AGCCAAGGCG TGCATACAAT ACAGGTCAAG TCAGGAGTTG GTTCTCTTTC TCCACTGTAG 2940
TTTTGGAAGT TCTCAGGCTG AGTCATCTTG CTCCCTTGAA CTTCTGCTCC TCCTACCTCC 3000
ACCAAGGGCT GAGATGACCT GCGTGTGCCG CCACACCTGG TTAATCTGGG CTGGAGGTCT 3060
CGGGCTTGGT GCGAGCTAGC TAGGACAAAC ACTCTACTGG CTGAGCTACC TCTTGGCACA 3120
GATGGGTCTT GCTGTGTATG TAGATCTGGT TGGCCTTGCC ACGGTCCTGG GCGGAGCATT 3180
TGTGGCATTT GAGGCTTATC TACCTCTTTC AAGTTCTCTG CCTCTTACGG GGAAGTTTGA 3240
ATCAAATGTC TCAGGGAGCT GGAAGCAACA GAGGTGAGGG CAAGTCTGTT ACATTCTGGG 3300
TGAAGGAGGA AAACAAAAAC AGGCAGCCCG AGTGTCAAAG CCAGCCATCA AACACCTCCT 3360
GTCTCATGCA ACCCATAGTA GCTCCACACA TAGACATGTC GGGACCTCAA GGAATTTTGG 3420
GGATCACTTC CCTCTCACAC CTGGGCCCTA TTTATTGATA AGAAAGTTGA GACCCAATAT 3480
TTCCATGCCT TATTTAGCTT GGCAGAATCT TTTAAAATAT CACCAACAGG GAGAAAGTGT 3540
AGACATTGTT TAAAGTTGTT AGCAAAGGAA AGAAGAAAAA AAAAAGAAAG AAAAGGCCAT 3600
GGTTTTTCAT CTTGTCTGCA AAGCCTAAGG GTTGGTAAGT TCTTCCTCCA GTCTACACTT 3660
AATCTTTTGG ACTGCTCATT TGTGCCCGTC TGGCCAAACA ATGCCTCCTT GTTTTTTCTT 3720
ATCCTTGCCA CATTAGGCCT GAAGGCCTGG AGCTGGGCTT GTAAGAATCA AGGCTAACGG 3780
AGCCTGCCCT CTCTCACCAG CCTGTGGGCA GTGTTCCTAG CAGGGGATTG GGGATCCACG 3840
GTTGTAACCA GAGGGTCAGG ATGTTAGGTC TTTTTTCTTC TCCCCCTTCC TTTTGGCCAA 3900
ACCAACAGTT TCTTATTTTT GGCTGATATA TTTTTATTCC TCTTTGAACA CAAAGCTGTG 3960
GTGGTTTTTT TTTTTTTTGG GGGGGGGGGT GTTTTTTAAA AGAAGGTCCC AGCCTGGAAG 4020
GGGTAATGTT CCCTGCAAAA ATGAGCAGCT GGGCATTCAG GATCAGTGAG CCTGTCCTTG 4080
TTCTGCCCCA GGATACAGCT CCTGTGCACC CTCTCCCTGT CCCTGTCCCT GTCCCGCACA 4140
CTCCCCCCTG TCAAGCAATT CATAAAAGTC TTCTTGCCTT AAAGCAGCGT AGCCCAGGCC 4200
CTCGGGGTTA GCTTATCTCC TGGGATGGAG GTTGCTTCTC TTGATTCCTT AGGCCATTGT 4260
CCTCGCAAGG GTTTCAAAGG TCGGGCTGGG CTTCAAGGAT GAAGGACTTT GTTTGGCAGT 4320
CACTGCTCTG CCAATTATAC CTTTGTCGTT GGATCTGGAG CGGAGCCAGA GCCCATCTGC 4380
CCCAACAGGT CCACATGTCC TCATCTGGCT CAGCAGCTGT GGGGCAGGGT AAAGTGCACT 4440
GAACTAAGTC TCTGCCCTTG AATCCAAGCC TCAGGTTCCC TATATGCAAA ATGGGCACTC 4500
TGATAGTGCT GACTTTTCCA GCCTAGAGCC TGTGGGGTGT TTGGGGAGGT GGTACACCTG 4560
ATAGCTTACA GAGAAGCTGA ACAGTGAGAG AGCCTGTAGG GTTTCCCCAG CCGCTGCCCT 4620
GCTCCCCGCC TACCTTCTGG CTACCACAGG CTCTTTCTGC TTTTACCTTC CTGATGCCAG 4680
GTAGCTTCCT TGTCCCTCCC TCTCCACCCA GCTCTCTGTC CCATTGGCCT GTGTCCTCCC 4740
CCCCCCCCCC CCCCCCGCTA TCATTGGCAA AGACAGGTCT ATGACGAGGC CCCTATCGAA 4800
GGCATCGCAC TCTCTGGGAA TGATTAATAA GAGGCTAGCC CAGGAAGGGA CAAAGAGCAG 4860
CTGTTCTCTG TAGTGGACTC AGCTCTATCT CTGACTCTTA AACTGTCGCC TCATTTTGTT 4920
TCTGTGGGGG CCTGAAGGTC TGGCTGGGGT GGAGGTTAGG TGAGTGGACC TGTGGTCTAA 4980
ACTGTTTCCA AAGCTACACT GGTGTGTCCC CATTGTGCCC CCCCTCGCGC CCCAGCCCCC 5040
TAAATCCGAA GGTGAAGGCA TGGCTTCAAC CTGGGGTCTA AGAGGGCAGA GGAAGGTCGA 5100
ATTCTGAGCC ATCAGTTTCT GCAGGATCAT GCAGGATCAC CTGGAGTCCT CTTCAAAGAC 5160
CACCCTGTTG GGGGAGGGGA GCAGCGCGGA TGGATACTCT GGTATCCTGC CTTCTAGAGA 5220
CAAATCTGAG GACAGCTGTC TGCAAGAAAC CAGCCCAGGC CCCTTGGGCA TCTCCTTGGT 5280
GGAGGATACT CTTGTAGTCT GTCTTCCCCT GCCCCCATAC CCCTGTAGAC CTCTCCCTCC 5340
TTCCCCTCTC CCTTTCTCTG CTCTCCTGCC TGGAGCTGAG AATGAGGTTG CCATGGGAAC 5400
CTGAAGCACA GCAGCTAGCA GGAGAAGGGA AAGGCAGGGT TGTCTCACCC AGGGTTGGGG 5460
GCTGTGTGTG TGTGTGGAGG GGGCACTAAG CTGACCCATC AGGAGGAATG TAGTCCTTTG 5520
GTGCGCTTCC TCTGCCTGGG GCTGGGCGTA GCGGTTCCAT GGAGTGTCTT AACCCACTCG 5580
ACCAGATACA GGATTAAATT CCTTCCCCAT TTGTGGCACT CTAGAGTTCA CATCTAGGCT 5640
CCCCCCCCCC ATTAATATTC CTGTTCTAAG GGGTTGAGAA GATAATGGTG AAGAGCCTGG 5700
ATTCCATCTG AAGCAAGCAC CTGGTGCCTG GGACCTTCTA ATGGGGTACA GGGTGTGACA 5760
GGGGCAGGGC GAGTGGAGGA GGTGTGAGCG TGGAGGTTCC ACAGCTACCA GCTCAGCGTC 5820
CAGGAAACGC TTGGCAGTGT GGAGGGCACA CCTTCGTAGT AATCACTCCC GAGGGAGGCA 5880
GAAACTGTGT GAGCAGGAGC TGAGGACCTG GGGAGAGGGT GTGGCAGTCT GCACGTGTCT 5940
GGCTGTCCTT GGGCCAATGG AGATGGCTTT CTGCCTTACA TCTGTAGGCA GCCATATGAG 6000
AACAGTCTCC CCAGGGTTTG TGGATGGCTT CTGAGGATGG ATGCTTCTTG AGTCTTCAGC 6060
TCTTCAGGCT GCCTTCGCCC TGTGCAACAT AACAACTTGA CCTTGCACAC GTGGCCAGAG 6120
CTGCCTGAAT CCTGGATCCC TTCCCTGTGT GCATCTCTAT TGACTGACAG AGGCGCAGTT 6180
TGTGTTCCAC TTCCCTTCAG AGTGGGCCCA GTTTATATGG AGGTCCTTTT TGAAGCCCTG 6240
TCTCCTGGGG TCTCCAGATC AGCCAGCTCT TCTAGAGATC TCTCTTCCAA TCCCTCTGTT 6300
CATGTCTTGT CTTCTAGGAA CAGAGTCCGT CTTAATCCTC TCTGCCCTGG ATGGGAGTAG 6360
GAATTTTGGA TAGGCTCCTG AGCCGTGTGT GGCTTGGCTG TGCAGGGCAC CGGGCCAGAC 6420
CTGGGGGTGG GACCTTGCCT TTGCTTGTCT TCATCTGTGT CCGTGGCTGC TGCCAGCTGC 6480
GGGCACCTGC AGGTGTTTGC TTTTCTCGTC CAGCTCCCTC ATTTTGCTGA GGGAGTTGTT 6540
TATCTGGCTG ACTGGAATGG CCGGAACTCA TCGCCGAGGC CTAAGACAGT GACATCAGCA 6600
TGGAGGTGAA GTTGGTCGCC TAGGAAGAGC CCATCACGTG TCCCTTCTAG TCATGCCTTC 6660
TTTGGTTGAG TCCACTCTAC CCTGGGTGAC CCAGAGGGAT ATAAAACATT CACAGGGTGG 6720
TGCAGGCGGC TAGAGAGAGT GCCCAGTACA CAAGCAGGTG GCAGCTTATG ACTTCCTGTG 6780
GGCATGTTGG CCAGCTGGGG TGGGTCATAC TTGGAAAAAG GACCATCAAG GGCCGTCGTT 6840
TTCTTACCCG GTGCTTGTGA GTCTGTGAGT CAGGGCGTCT GCACTGGTTA CAGCTGTGGT 6900
GGGTGCAGTC ACCCAGAACT AAACATGGCC AGGTCAGGCT TTTCAATACA GTGTCTGCTT 6960
GGAGAAGCCA CCCATCAGGT CCCTGAGGTG GGTGAAGGTC ATGTGGGCCC CAGCTATTCC 7020
ATATTCTAGC ACTAAACACA GACCTGCCTG 7050