EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-01650 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:193958280-193960770 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX1MA0002.2chr1:193958541-193958552AAACCACAAAC-6.02
RXRBMA0855.1chr1:193958952-193958966GAGTTCAAGGGTCA+6.33
RXRGMA0856.1chr1:193958952-193958966GAGTTCAAGGGTCA+6.52
RxraMA0512.2chr1:193958952-193958966GAGTTCAAGGGTCA+6.34
Enhancer Sequence
CTAACAATAT CTCCCTTTTA CGAACGAGAA AACAAGTCTG AAGAAGTCAG ATAGTTCATA 60
CCAGAGAAAC TTGAAGGCTT ATGGTCACCA ATCATAGCTA CTCCTCCGGG GTCAGCACAG 120
TTAGGCAGCA AATACAAGAA CACCTTAACA ACCGGTTTAC AACTGACAAC CACCAGAACT 180
AGTTAACAAC TGATTTTCAA GAGAAATCCA GTCAGTAAAT CATAAGGACG TCAGCATGGC 240
CATGTAAGGG GAACAGCCCC TAAACCACAA ACCCATTTAC ACTGAAGACG ACAATCAGAA 300
ATCCAGGGAG TAAATCCTAA GGATACCAGC ATGGCCACGG AAGGTAAATG GCCAAGCTCC 360
CAGAACTCCA ACAAAACCCT CCACTTTTCC AGCTTGATAA TGGTTAGCCA TTTGTCCTGG 420
GTTTCTGAGA CCTAACAGTA AGTCATTCTC CATGTGTGTA AGTTCTACCA TCAACATCAT 480
TTCTTCTAAA ACACTCTTAC TTTTTCTACT TTCTCAGAAT AGTCTTAGGA CCTAAGGAAA 540
TTTTCTTCCA AGTGCCTTAC ATCTAATACT ACAGTGAATA ATTTCCATAC AAATAGTGCT 600
TTATTAGGGA TGAGGTGGGT AGGGGTACAC ATCTTTAACC CTAGCACTCA GGAGGTAGAG 660
GCAAGTGGAT CAGAGTTCAA GGGTCAGGCT AGTCTACCTA GGACAGCCCC AGGACAGGCA 720
AGGTTATGTA GAAGGACCTT GTCTCGAAAA CAAAACAGAA AGGGGTGGGG GGTTATGAAG 780
GAGAAAAGGA GAGCTTATTA TTTCTCAATT TTTATTATTA GCTAATTTTC CTTTTCTTCT 840
ATTATCTTTT CCCAATTAAT GCTTAAATTT TCATCTAATT ATACTAGCTC AACATGAAAT 900
AAAACTTTCG AAAAATAGTA CAACACTTAG ACTAAACCAG CAGCAACAGG CACACGAAGC 960
ACAGTGCTTC CTTCAGTGAT TCATGTGAAT GGCAAATGCT TTTCACTGTA TCCGTGGACG 1020
ACACTGCTAA TCAGAAGTAA GTGCATCTAA GGAACGTTAG GTTTATCCCT ATTCTATTGA 1080
TTACAGTCAG AGTAAATAAA TTGGAAATTT TAATTCAAAG CTAATAATAC TAATTGGGGT 1140
TTTGTCACCT CTCACAAACA TTCTAGGTAG CTGGAACAAG CAAAACTGAT AAAAATAATC 1200
AGTTAGGTTA GTTAACCAAA CAATGTCACC TAAGACCACC TAAATAGATT AACTATTTTT 1260
CCTAGTTTAA AATTGTTGCA TGAACTGTAT TTTAAAATGA CAAATGCTAA AACACATACA 1320
AGCCCCTAAC CAACTGCACA TAGCTAGGAG ACAAATATTG ACCGAGATCT ACCTAATGGG 1380
GCAAAAGATA GGTGTGCTTA TGACATAATT CGGCTGCTGG GTTCCATCGG GAAATGACTT 1440
CAGCAATATT TTAAAAAATT GAGTAGCAAC GAGAGCTCCA AATCGTTCTT CATAATTATG 1500
AAATCTAATC TTTACTGAGT AACTGCCATA TGCCTAGTCA TTTAATCCTG GCAAGAATTC 1560
CATGCAATGG TTTTTTACAG CTAGGAAAAT TGAAGCTCAG AGAAGGCCAG TGACTTGCTC 1620
AGAAGACAAA AACAAGAGAG CTGGGAATTA AATGCAGCCT ATCCTTCAGT GAACATGTCT 1680
TCTTTCCGAT GTCAAACTAA GCCCTGAAGC ACAGCCATAA AGTGAAGGAA CCCACCTACT 1740
AGCTAGCTAT GCCAACAAGA AAAATACGAC TACAAGAAGC CCACCACGGC ACACACCGAT 1800
AGTCTTCTAA TAAAATATCC CAACAGCTGT GTCGCTTTGA AGGTAACCCC CAAATCTGAT 1860
GAGCACTCTG GTATCATGTA CTGAAGGAAA CTGTCCTAAT TATGCTTGTA ACGGTTACCC 1920
TTCTCCTTTC AGAGAGGGGA TACTACCTAC TTGGTAAGTC CTAATGGGGA GAAGGATGGA 1980
AGCCCCCTAG CATACCTAAA CTAAACGGAC ATGACTGCTT TCCTTGTGAA ATTACAAGTG 2040
AGTCCTCTGC AACACCAACT ACAACTCCAG CGTCGGACTC GGGCAGTGCG GTTAAGAATG 2100
AGCTCTAGAC AAAAACTGAC TGCAGGAAAA GTGGGAGGGC AGTTCAGGCA GGGAAGGGCA 2160
GAGCCCACCC AGTGGCAAGT CTGGCTGGGT TAGAGCAGCC GAGCACTCCA GGCCCAGAGG 2220
CTCCAGCAAG GGCGCCTCCA TATGCGGAAC TCTCGCCCAA TCCCTGAGCA GCCTGACATC 2280
CCGTGACAGC CGGGGAGCCT GTTTGGAGAA AAGTAGAGAG GGAGCCCGCA AGCTGCGCTG 2340
GCGGAGGGCG CTGGAACCTG GCTGTTCCGG AGAAAATGTC TCCTTGGCAG CTGCTGCCGC 2400
TGTCCTGTGG TCTGGCTTCC CCGGGCTGGG TCGGCGCGCG GGGAGGGGTT GGGGGCGACC 2460
GGGGCGGTGT CGGGCACGGG CGTTTCCCCG 2490