EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-01384 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:171693350-171695660 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PKNOX1MA0782.1chr1:171693447-171693459TGACACCTGCCA-6.02
PKNOX2MA0783.1chr1:171693447-171693459TGACACCTGCCA-6.27
RFX1MA0509.2chr1:171694355-171694371GGTTGTTATGGCAACA-6.71
RFX1MA0509.2chr1:171694355-171694371GGTTGTTATGGCAACA+6.73
RFX2MA0600.2chr1:171694355-171694371GGTTGTTATGGCAACA+6.67
RFX2MA0600.2chr1:171694355-171694371GGTTGTTATGGCAACA-6.73
RFX3MA0798.1chr1:171694355-171694371GGTTGTTATGGCAACA+6.25
RFX3MA0798.1chr1:171694355-171694371GGTTGTTATGGCAACA-6.74
RFX4MA0799.1chr1:171694355-171694371GGTTGTTATGGCAACA+6.11
RFX4MA0799.1chr1:171694355-171694371GGTTGTTATGGCAACA-6.25
RFX5MA0510.2chr1:171694355-171694371GGTTGTTATGGCAACA+6.36
RFX5MA0510.2chr1:171694355-171694371GGTTGTTATGGCAACA-6.67
RORAMA0071.1chr1:171695515-171695525ATCAAGGTCA+6.02
Enhancer Sequence
AGAACGTTGG CAAGGACAGA AATGAGTTTC CCACCCTATG TGTATGCCAG AGTCTCCATT 60
CAAGTTCAGC AGCGCCTGGC CAAGCCTTGG TGAGCCTTGA CACCTGCCAG CCTTCCTCTT 120
CCTCACCGTG ACTGTCCACC AACAGAGCAG GCATGTGCTG AGCGCCCGCT TCTCTCCAGC 180
CTCCCGAGAC TTGGGAACAC AGAGACAGCG TCTACAATGC AGTCTTCAGC AACGGCCCCG 240
TATAGTCCTC TCAGGCTCTG AGAGGATTTC ATACTTTTAT CAAGAGAGTC TCACTCTGTT 300
CCCCTTTGGG AAAGAAACGA AGATGAATTT GCTATTGGAG AATCCTTTAA AAGGAAGCAC 360
ACTGTTTCCA ACGGATTTTC CAAGATACCA ACCTGGCAAT TCTTATTCCG TGTGAAGTTT 420
TCCTCTATAG ATCAGAATTC TGTCTATATC GTAACCAGAG GCTGGCTTGT ATTGAAGATT 480
GCAATCGAGT TGGTGCGGAG GAGCTTTATA AACCCCAAGA ATCAGGAAGC ATGTAAGGAC 540
CATGTCTTAG TGGTTCACAA AATCCACCTC CTCTGCACTG CCGCACCCCA GTCCCCAGGA 600
GCTCTCAATA CACAGTCTCT TGCAGTCCCT ACATCATGCC AAACTAGGGG AGAGAAAGGA 660
AAGAATCTTG AGCCCATTTT CCAGATAAGA AAACTGAGAA CAAGAAAAGG AGATCGAGAA 720
AGGGCCTATT GGAAAAACCT GTCAGTTATT GATACTGGAG TCCCATGATA TCACAGCCCC 780
TCTCTGAATT ATGACCTGTG TAACCTGACT AGAGACATAC GGAGACCTCA GGGACTGTGC 840
TAGCAGCAGT GGCCATTCAA TGAATGGCCA GCATCATTTC TACTTGATAG AAAAATCAAG 900
CAGAAAAATG GACCAGCCTT TTAGAAATTA TGCCACTGGA GCATCATTGA TGGGGACTGC 960
GGATGATTTA ATCTGCTTTG AGATACCAAA CAGCATCCAA CAGCAGGTTG TTATGGCAAC 1020
ACTACTCTTC TCTTAGTGGC TTCAAACAAA AATATCTCAA GGGCAGAGTA ATTAGGTAAG 1080
TAGAGCAGAG AGTCGGTGTT TCATGCAGTC ATTTTCCAGT GATTACCATT TCATTGTGCC 1140
CAGTGCTCAG AGGCCTGCTA ATAAGGCAGA CTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1200
GTGTGTGTGT GTGTATTATG TGGGTCCCAC AGGGGAAGTG TCTTTGATTA GCACTTGTCC 1260
TCCAAACTCC ATTACTAGCT TGTGCCATAT GGCAGATTCC CACTGAACAC ATATGCAACG 1320
AAATAAAAGA ATATGGGGGA CGGCAAGACA CGCACAGCCT CCGACTGCGT CTGTCAGGGA 1380
CTATGAGTGT GTGCTGGGAG AACAGTGTTT GCCGTACCTT GCTTTATTTT TTTTTTAAAT 1440
TAAATTGAAA CACATCCCAG TGTTACTTGT TCCAGCTCTG ACTCATGTTG TCATTTCCCA 1500
ACACTCCCAA GAGGTCCTCT GCTTCTGTTT CTAATGCCTG GCATCCCTCC CCACCCCATC 1560
AGCCTCCATC ATAACTCTCC CCACTGACTC TGCCCCGGAA ATACAGAACT CCCCTGCTCA 1620
ATGGCTTATT CATACTGGGA GAATGTTGCT GGGGAGAATG TCTCCAGGTT TCAAACTTCC 1680
TATACTTTAG ATTGTGCCCC TGCCCCCAAA AGACATGAAG GAAAAGGAAA AATGAGCTGG 1740
TGTTCTTTGA ATACTCACTT TGGGCCAGGG TTTAGTCAGG TGCTTGGGGC TATCCGTACT 1800
CATAGCACAC ATGAGAAATG GAGACTCATT CATATTAAAA CCAAATTCCA GAATCACGTG 1860
GCTACTGAAG AACTGAGTCA GAATACGTAC GAAATGTTGG ATGAGCTCAA AGCCTTCAAT 1920
TTTTATGACC CCACATTGTC TTACTGAAGA AGGCTTATGC ATTTTGATAT GAGAGATCCA 1980
ATATCTCATC CCCTTGGTCC CACTGTGGTC TCTTGTCTGT TTTTAGGACT GTTGTTTCTA 2040
CACTCTTACG ACAGCTACTC ATAACTATGG TGTTTTGCAC ACCCCCTTCT CGGAGAGCAC 2100
ACTGAGAAAT GTCTGAGGTC ATTTTTCATG GTCACAACCA GGACTCTACA ACTGACCTGT 2160
AGTTGATCAA GGTCAAGGTT CGACTAGCCA TCTTAATGTC TGGATAATAT TCTCCACTAG 2220
AAAGAACTCT TCTGTCCAAA ACATCAGTTG CTTTTAAGTT GAAGATGATC CTAAAAATTG 2280
TCCCCACAAG AAAGAACTCT CCTATCCAGA 2310