EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-01346 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:169198810-169202610 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr1:169201024-169201034GTCACGTGAT-6.02
HOXA13MA0650.2chr1:169201500-169201511CCCAATAAAAC+6.62
KLF16MA0741.1chr1:169199779-169199790GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr1:169199780-169199790GGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr1:169199785-169199795GGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr1:169199790-169199800GGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr1:169199795-169199805GGGGCGGGGC-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr1:169199522-169199535TTTAAGTGGATTA-6.13
RREB1MA0073.1chr1:169200469-169200489CGGGGGGGGGGGGTGGGGGT-6.07
RREB1MA0073.1chr1:169200468-169200488ACGGGGGGGGGGGGTGGGGG-6.11
RREB1MA0073.1chr1:169200764-169200784AGGTTGGGGCTGGGGTGGGG-6.11
SP3MA0746.2chr1:169199778-169199791GGGGGGCGGGGCG-6.11
SREBF2(var.2)MA0828.1chr1:169201024-169201034GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr1:169201024-169201034GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr1:169201024-169201034GTCACGTGAT-6.02
ZNF263MA0528.1chr1:169201084-169201105GGGGGAGGGGTGGCAGGGGAG+6.68
ZNF740MA0753.2chr1:169200472-169200485GGGGGGGGGGTGG-6.44
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_09605chr1:169198297-169202688MEF
mSE_10354chr1:169198335-169199776Embryonic_stem_cells
mSE_10354chr1:169199859-169202638Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TTGCCAGTCC TTGTGGGCAC TCACTACATT GCCCCTAGCA AGCTTGTGCT AAGCACCCCA 60
GACCAGAGTC AGGTTTTCTA GCCCTCCCCG CTCAGTTGGC TGGACAGGCT TCATTCAGAT 120
CCAGCACCAC CACTCTCTGG GCTATGGGAC TCGAGGCTGC TTACTGAACT CTATGAAAAT 180
GGGGAACCAT TACAGCAACC GCTCTGAGGG CTGAGGGGTT ATGGACTTAA GAGATGTTTC 240
TCCTAGGAAG AAACAAGGTC AGAGCTGGAG AGATGGTGTG GTGGGTAAGG GCCCCTGCTG 300
CCAAGGCTGG CTTGGGTTTG ATCGCCAGGA CCCATATGGT AGAAGGAAAG AACTTTCTGC 360
TCCAAGTTGC CCTCTGATAA CATTCATTCT GTGGCATGTG TGCAAGCAGG CATGCTCGGG 420
CAAGCACACA CAGGCACATA ATTTTTAAAA AGCCATGAAG TTGTTTTATA AAGAAGAAAA 480
CAGAAAGGAA TGGTGTAATA AATGTATTAG AGGTTGTTTA GGCTTCACTG GTGTGTTTAG 540
GGATATTTCC TTGGTTCGTT GGGACAGGGT CTTACTCTGA GGCCTTAGCT GGCCTGGAGC 600
TGCCTGTGTA CACTGAACTC ACACCAATCT GCCTCCCTCG TGTGTCCTAA GCCCTGGGAT 660
CCAGAGAATG AGCTCCAATG CCCGGCTAGA GGGCAAGTGT GCGCATGTGT GTTTTAAGTG 720
GATTAAGAGA AGAAAACCGG ACAGGATTGG GCCAGGGAAA GGTTGTTCCT CCTAATAAAG 780
TCAAGGGCTG TGTCACACCT CAAAACTGCT GAGCGCCAAC AACTTCCTGA AACTCAAACA 840
TCTGTCCAAG TGCTCAACAG AAGAGCTACA GTCTCTGCTG CAGAAGCAGG GTGCGTTTAA 900
AGCTGGCTTT TCCAAGAACT GGCATGTGAA GACTGACTTC TCAGATCTCA AATTCTAAAG 960
TTAGAATGGG GGGGCGGGGC GGGGCGGGGC GGGGCCGGGG GAGTGGGGGC GGGGTTCAGG 1020
CCGACTCCAC GTAAGACACT GAGAGAAACC TGAATACACT CTTCTCTCTC AAGGGCCTGG 1080
GCACCTGCTA CGCTGTACAG ACATAAGAGC AGTGTCCTTA AACTGGAAAG ATTAAATAGT 1140
ACAGAAGAAG GAACACCTAG GACGGGAATC CCAATTCAGA TTTAAGTGGA GTGGCAGACA 1200
CACACACAAG GGAAGAGGAA AGCTTAAGAG GGCTTTAAGA GATGAAGTGC CCGACTGGGC 1260
AAGCAGGAGG CAGAATGCAG AGCAGAAGCA GCTCTGACAT CACAGGTGGA GGAGAGCCGA 1320
GCTCTGGGCC CTGGAAGCAG TTAGCAATGA GGATGGGAAA GGACAGGTGT GACACGTGCT 1380
AAGAGCTAGC CCATTACAGC CTTGGAAATG CCAAGGCCAA GAGCGGAAAC CCAGCCACAA 1440
AGAATGCCCA GGGAGTGACG AGCAGGATCA GAGCTGTATT TGTTTAAAGA TCACTCCCGC 1500
AGCAATGTGG AGAATGTTCT GGAGGGGGTC CAGGCTGCTG GCTGGGAAGC CAGCCACTGG 1560
AGAGTCATGC TGTCTGGAAA TGATGGAAGC CTGGCTAAGA TTCCAAGAGA GATTCACAAG 1620
TGGAACGGAG GGGATGGGCA GCCTGGATGG ACAGACTGAC GGGGGGGGGG GGTGGGGGTG 1680
ACAGCAGCAA GGTGTCTCTC CCGAGTAGCT GAAGGGAAGG TTGCAGGTGG GACTGGCAGG 1740
ATTCCAGGTC TCACACACTG AGTGGAAATG CAGGGTGACA GCTGAGGACA CGGGAAGGGG 1800
GCTCGGGACA AGTGATGACT GAGCAGACTC CAGAAGGGAG ACGCGCAGTG AGCCAAGGAG 1860
CTTCAGAGGC GGGACCCAAG CCCAAGAAGA AAGAATACAC AAAGCAACCG AGAGAACAAT 1920
GGGAGGCAGG AAGCCAGCAG CAGCCTGAGG GCGGAGGTTG GGGCTGGGGT GGGGGTGCAC 1980
AGTAGACCGG TGGTTCTCGA TCAGTGGGTC TCGACCCCCC TGGGGGAGGT AGGGTGACTA 2040
TTTCACAGGG GCTGACTATC AGATATCCTG CTTAACAGAT ATTTACACTA CAACTCATAA 2100
CAGTAGCAAC AAACATAGTT TTAAGGTTGC GAGTCACCCC AACACCACCA CAGTTTGCAG 2160
CACTGGGAAG GTTATGGGCC ACTGCAGTAG ACGCGTCCTA GAGGAAACAG CACAGTCACG 2220
TGATGCAGAA AGGTGAGCTC GGCAAGCAAT GGCTTCACAG GATCCAGAGA CTGGGGGGGA 2280
GGGGTGGCAG GGGAGGGTGA TTACACTTAA ATCCCGCAAG GAAGACTTCC CCATTAAACT 2340
CTCTCCAGCT CCTCTTGATC TGCCCAGAGC TTACTCACGT GGCACTCTCT GACACCTCAG 2400
AGATCCCCAG CGCACAGTCA ACCTTCACAT CACATTACCA ACTGAGGAGT GCCTGGCTGA 2460
GAATGGAAGC GCCCTCTTCC TTCAGGAGTA AGACATAGTC AATGGTTCGG GGGTCATTAC 2520
GGTTTGTGTT GTATGTATCA GGGTCTTGCT ATATATTCCA AAGTATATCC CCCAATTAAG 2580
CCTGGCAGTG GTGGCACATG CCTTTGATCC CAGCTCTCCA AAGGGAGAGG CAGGAGGATT 2640
GAGCCAGGGC TATACAAAGG AACCCTGTCT GGGTGGAGAG GGAGGTATTC CCCAATAAAA 2700
CAAATAAGTA CTGGGAATAT GTTTAACAAT AGACTGATCA GAGAGGCTGT TCTGGCAGCA 2760
CACACACTGT AGAACATGAA GGCAGGTAAC AGGAGGGCGA TTGTTCCCGG TTTAGACACC 2820
ACTGTGTATA CACTGGGGCC GGTGTTCTCA CAAGCCAGAC CTTATCTCCT TTTCACAGAT 2880
GTAGGGATGA GGTCAAAAGA ACCAGATTAA AAACAGGCCA AGACAGGCCA GGAACTGGAG 2940
CCTGACAGAG TACAAGGCCT ATGTTCCCTG TCCCCAACTC ACCTGAAAAC ACTTTTGCCA 3000
CAAGCCTGCG AGGTCTCCAC CCTAACTGGG CACAGTGACC GATGCCATAA AAGCTTCCAT 3060
TGGATTACAA TGGAAGACCT CAAATCTCAC AGTGAACACA ATCCCCTGGA AGGCCTGGTG 3120
GTGTCCTCAG TGCGGGTGCA TCCATCTGGG GAAACAAAGG GTCAACCCAG CTGCAGTGCT 3180
CTGGGGACTG GGGACAGCAG ACCAGGAAGG TCCTGCGGCT TGCTCTTCCT CCAGAATGGT 3240
GTTCATGCCT CCCTCATTCA AATAGGGCGT ATTGCTCCAT AATGTTCTGC TCTCAAATGT 3300
TGGCTTTCCC CACAGAAGCG ACAGAGTAGG GGAAATGCAG TCGGTGGCTA ATCAAAACAC 3360
CATGTTTGAC CTCCAGAGAT CAATAAGTCG TGAGAGCTAT GGCACAGCTC CAGGACCAGT 3420
CTCCAAAATG GGACTTCCTC AGACAACCAA ATATGGAACA CATAAGCGTC GTGGGCTCTC 3480
TCCTGAGACA GAACGGCCAC ACTGCTTCTG TGTGATGCTG CCCCCAGCAC ACCTAGCAGA 3540
AATGGGCTTG TGAAGCCCCC ACACATGCTG CAGGCCACAT GCAGCCCCCA GTTCCAACCC 3600
TGAGCTCTGA GTCCTAGTCA GAAGTAGGCA TTACCAATAG GATCACAAGT CCATTTGTGT 3660
GGGGAGAAGG GTTGTTGGGA CTGGATCTAT TATGTAGCCC TGGGTGTCCC GGTACTCACT 3720
AGGTAGACCA GGCTGGCCCA AAGTCACAGA GATACCTGCT TCTTTCTGCC TCCTTATTGA 3780
TGGGATTAAA GGTGTGCTCC 3800