EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-01166 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:154900390-154902530 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr1:154901616-154901633CCAATTAATTAATTAAT+6.83
Alx4MA0853.1chr1:154901616-154901633CCAATTAATTAATTAAT+6.29
BCL6BMA0731.1chr1:154900608-154900625GGAATTCCTCCAACGCA-6.21
Lhx3MA0135.1chr1:154901621-154901634TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:154901618-154901631AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:154901622-154901635AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr1:154901619-154901629ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:154901623-154901633ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:154901619-154901629ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:154901623-154901633ATTAATTAAT-6.02
mix-aMA0621.1chr1:154901626-154901637AATTAATTAGG+6.32
Enhancer Sequence
ATATATACTT TATATATATA TAAAGTATCT CTCTACCAAA TAGTATAACA TGAAGCTAGG 60
GGAGAAAAAA AAAAAAAAAA CAGTAAAGTC AATTTGATGA GATCAATTTG GGCTGACTAG 120
ATAGCTCCAG GGGGTGAGGG CCCTTGCAGC CAAGCTTGGT GCCCCCGAAT TCCATCCCTA 180
AGACACACCA GGTGGAAGCT GAGAAACAAT TTCCACAAGG AATTCCTCCA ACGCAGTGAT 240
GTGCAGGAGT GCCCCCACTC CGCATGCAAA CTAACTAACT AACTGACTAA CTAACTAGCT 300
AGCTAGCTAA CTAACTAGCT AACTAAGGTG TAGTAGGGGG AGGAGTGGGA TAGACTATGA 360
AAACTCTCCA TGCTTTCTGT AACTCGATTG TAAGTGGAAA AAATTAATTT TATATTCTTA 420
TTTCATATCT TGCGTGTGTG CACAAACACG CAGTGTATAT GCGTGTAGTA AGACGGCTTG 480
TCAGAGTCAG TTTTCCCATC CCATCCTGTG ACTCTCAGGG ACCCAGCTCA GGTTACAAGT 540
TTAACCGCAA TGCTTTTATC TTAGAGCCGC CTCCTTTGCC CAAGTCTGAA AATTTTTAAA 600
AAAATAAAAT AAAAGAAGCC CCTGGTTTCT CTTCCTTTGA GCCCTCCCAA TCTTGAGAGC 660
TCACTCTCAT TTTCCCTTAA TAAGTCTGGA TTCATTCTAA AAATGAAAAC CAACCCAAGC 720
CTATGACTGA TGTGCCTAAA AAAAATTGGT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTGCTTTTT 780
CTATTTCATA GTGTTTATAA ATTTCTAAAT TTATCATGGC TAAATTTGAC AGACTGTGAG 840
GAGAGATGTG TGCCTGCATC GGGAGGGGAC CTTAGATGAG GCTCATTTCT CAGGCGCTGG 900
GAACAAAAAG GAGATTTCAT GGCTGTCAGT CATCCGGGCT ATAAAGTGGA TCCCACTGAG 960
AAGGAAGAGG AGGCCCTGTC TTGAGCTTGG CTGGGGACAA GCCTCTTTGT CCGCTCCCCC 1020
ACCGAGAAGT AAAAAGAGGT CCTTGCTGTT TGAACTTCCA GGAGAAAAAA ATAAAATCCT 1080
TACCAGCTGA GCGGCAAGGA GCCAGAGCAA TAAGTTTTGC CTGGTTATTA TATAACGTAA 1140
TTCTGGATGG GGGAAATACA AGACTGCTTA GAAATGCTTT CACTGCTGGT GGCCCTAATC 1200
ATCCCCTTAG AGCTCTTCAT AAAGAACCAA TTAATTAATT AATTAGGACT TGTGAGGAGA 1260
AAGGGTCTCT CCTGGTCCTC AGCCAGGAAT TCCCGCCATG GCCCTGGCTC CTCACTCCAA 1320
AAGCCTGTTC TCTGACTAGC AGCCACAGAA ACCATTTCTC TGTTGGAGCA GGAGGGTTTC 1380
TGAAGTGTAG GGGCTGACAG GACACTGGCC TTTGCCTAGT TGAACAGTGA GGAAGTCGGG 1440
CAGAGCTGGG GAGCAGGGCT CACACAACCC TTCCTGCAGG CTGGAAAGCT AACCAGGGAC 1500
CTTGGCGCCC AGCCACTGCA GTCTCCCTGT GAAGGAAACA CCTTCACCAG GCAGAGCGTT 1560
TGTCATGCTG GTCCTTGGCT CGGTCACTTT TTCCAATAGT ATTCTTCTGT GCTAAAACCA 1620
GGGCAGGATG AAATACTAGC CCCTTGCTTC CTATCCTCTG GGGCCATAAT TCTTCCACCT 1680
GCAATAATAT CGTTAGTTAC TGCTGGTCCT TTGCTTCATG TATCCAGAAG AGGCTTCATC 1740
AACCTTGGAT CCATCAAAGA ACAGAATTAT AACAATTTAA GAATCTTTAG TTTTTGAAAT 1800
GCCATCACTA CTTTATTTAT TTATTGTGTG CTGGGGGACA GGGGTATACA CACATGCTAC 1860
AGCAGTCCAC GGAGGTCAGA GGACAGTTTG CCTCGTGGGG TTGGTTCTCT CTTTCTACCA 1920
CATGGGTCCT AGGGATGGAA CTTGACTGCA AGAGCCTTTG CCAACTGAGC CATCTTGCTG 1980
GCCCCAGTTT GCAGATGTTA ACTGGCCTTC TTTTCAGTTC CAGAGCCCAG TAACGTTCTG 2040
GTCCACAAAA TAGAAGTATT ATGATGAGCC AAGTAGATGA AGTTGGATTA TAGACAAAAA 2100
GAAAGAAAAA AAGCCAGAAG GTAAATAAGG GGGTGGGGGT 2140