EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-01108 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:140281360-140283500 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr1:140281933-140281943AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr1:140281933-140281943AGCAGCTGCT-6.02
IRF1MA0050.2chr1:140283071-140283092TTATGAAAAGTGAAACTAAAA-6.67
IRF2MA0051.1chr1:140283075-140283093GAAAAGTGAAACTAAAAT+6.97
MyogMA0500.1chr1:140282982-140282993GACAGCTGCTG+6.14
POU4F1MA0790.1chr1:140282101-140282115ATGAATAATGAATG+6.3
POU4F2MA0683.1chr1:140282101-140282117ATGAATAATGAATGAA+6.17
POU4F3MA0791.1chr1:140282101-140282117ATGAATAATGAATGAA+6.42
Tcf12MA0521.1chr1:140282982-140282993GACAGCTGCTG+6.02
Enhancer Sequence
TAAAAAACAT CTCCAAAGTT GTCAGCATTC GTACGTAAAC CTGGACCAGG GACGCACTAA 60
CCTCAGTCAC TCTGAAATGC AATTTGTGAT GGAGAAAGAA CAGCTTATGT ACTTTTAAGA 120
GCAGGGCTAG CATGAACAAA GAAGAATGGT CCTGCCCAGG TCCACATCTC CTGAGAGCAA 180
AGGCAGCCTC GGAAACTGAC AGTACACTCA AAAGTTCCTA ACCTTATGAA AATTGCAATC 240
CGTACTCTTT AAAAACCGAT TGATTTTTAT AAATCAGTCT CCCAGATCCT AGAACATCGT 300
GAGTGGGTAC CACAAATTAG AATCTGCAGA ATCAAGAACC CATCAGTTGG CCCATTGACA 360
CGATCCCATA TTTACACTCA TTCTGTTGTG GGATTTGGGC TGTGGCTTTT CTTCTTTCCT 420
CCTCAGACTT ACTGCCTGTG GTCTCAGAGT TAACCCGTTA ACGCCCAAGA CTCTGTGGTC 480
GGGTTCCCGC ATTTTATAGT CTGACAGATA TTCATCTCCG GCTCTCAGCT TGCAGGTGGG 540
AGCCTCAGCC AAGGAGCTTT GTGTCAGAAA ATCAGCAGCT GCTCGTATAT CACACTGGTC 600
ATTAGTGGAG GATCATTCTG GACCTTTGCC CACAGCTCCT TGCTACGGCA GGGGAAGGGC 660
TATAAAACCC TAGGCCCTGT CAGCCGTTGT CACTTAGGTG AGAATTTATC AGGTCTCCAA 720
GTGCCCTCTG ACTGGATTAT TATGAATAAT GAATGAAGCT TTATGCTACA CTGAAGCATT 780
AATAAGATGG GAATGACTGG GAGAAACTCG GGCCGCACAA TCACAGGCGC GCGCCGGGTG 840
AGCAAGATCC ACAGCTGGCG GGCCTGCCCA GCACAGCCTC TGCGAATCTG TGACTGAAGC 900
GAGGTCCTCC TTTAATTACG GATCAAGCTT TGCTTTACAG CCCGAGTTTT AGCCTGTGGG 960
TAGTAATAAA GAATCAGGGA TGAAGCTGTG TGCATCTGTG CTAGGCAAAA CCAGACCAAA 1020
TAGAATTTAG CTTCCCTTCA TTAAAAAAAG AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AACAACCCAA 1080
TGTCAATCAT CTGTTTTACT GTCACATTAG AGTGATAGTC AGCTGTGGAA ATACACACAT 1140
GTATAAAATT TCTAATGCAT AAATACGGAG TCTATTGTGA TGAGGGGGTG GGGATTTTGA 1200
TGGGTGAATT CAACTCCTTT TCAAAATGAG GCTACTCAGT GTCTCACATA TATAAGAATT 1260
GAACAAGAAA AGTAACTTGA AGAGTCGAGA CGAGCCAAAG GCAACACTCA CCTCACCGAA 1320
GAAACAGTGA CCTAAAGGAA ACCACATTTG GGGATTGTGA GAATTAGAGT CCCTCCCCCA 1380
CTCCCTGCAG CAGAGCCAGA TCCAAGACAG ACGGACACCA CTCAGCCCCC TTGGCTGGCA 1440
CCTTGGCAAC CATATCAGAA CATACTGGTC CTAGAAGGAT ACCTAAGCTT TATTAAAACA 1500
ATCAAAGCCT CATAAGGATG TGTGGCTAGA GAACAATGCC TGACTGAAGG AGCTGACATA 1560
TAATCTATGG ATCTGATAAA CAGCTGAAGT TTCCCGGATT CTGAGAGCCA TAAACTAGAT 1620
GAGACAGCTG CTGGTGTGCT TTCAGCTACA GACTCATGTA CCGGGGCCCT TGTAATTCCA 1680
TCCTTTCCTG ACCTTTTTGA ATATTGGGTA ATTATGAAAA GTGAAACTAA AATATATAAT 1740
ATTGCCACAC TGATAACCTG AATCTCTCAG TTCAGAGTTC TAAGGAATGG GGGTATGGAT 1800
AGAGTCTCTT CCCAAGACAG TGACATTACT TCCAAGATGT GGTCCATCTA TCTCTGACTC 1860
TTTATTGTCT GTATGACTTG AAACACCCTC TGAACCTCTC TCATTGGACT ATGTCCTAAG 1920
ACTCATCTAA AGTAGCAGTT GTAAGAACCA CAGTTTAAAA CCACGGGGAA CCACTGGTAT 1980
AGCTATGAAT AGAAGGAATT CACAACCCAG AAGATGTTGC AAAGAAAATG CTATGCAAGC 2040
CCTCTTCTGC TCTCTGTATC AAGAAAGAAA ACCACCCCTG GTTTTTCAGG AAATGGAAAT 2100
GATAAAATAA AAGCATTTAA ACCTAAGTAC CCTGGAAACA 2140