EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-01106 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:139925540-139927090 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr1:139925960-139925980TGTGGGGGGGTGTTTTGTGC-7.25
Tcf21MA0832.1chr1:139926322-139926336GTGACAGCTGTTGC+6.17
Tcf21MA0832.1chr1:139926322-139926336GTGACAGCTGTTGC-6.18
Enhancer Sequence
CACTTAGGAT GATGACTGAG AGGATAGAAT CAGACCTATT TGTGGAAGAA GGCTGAGATT 60
TCTAGCACTG ATCAAACTTG ATAGTTGAGG ACCATGACCC CTACAGATTT CTGTGTGTGC 120
TTTGCTCTTG GAAATCATTA AGCTTAGTGC ACAGAACTAA AGAGTGTGAA CTCATTCCCC 180
TCTGTTGTAC GGTAAGCACC GTCTTCATTG CAGTTTCACC TGGCTTTGTA GATTTGCCCA 240
CTTTCATAAT TGCTGGCTCA CTAGTTTCCT GTTGGCATTC TCTCAGCCCT CTCCTGCACC 300
CTCAGCAATC CTTGAGAGGA CTTCAAGAAT CTCAGAAAGC TGTCTGTGCA TATTGGAAAG 360
CAGCTGAGAG AAGAGAAGAA AAGCAGAAAG ATGCAAGCTC AACGGAAGAA ATAGTGTGTG 420
TGTGGGGGGG TGTTTTGTGC ATAGCTTTCT CTGGCAGGGT AGATGTCCAC TGGAGTTCGA 480
ACTATTTGTT TGAAATAGTC ACCATGTAAA ACCCTCTCTT TCATTTGTTA AAAAAAAAAA 540
TACATATGCT AGAAGTATGT TCCTAGGCAC AAAAGAGACA AGAACTAAAT GAGATGCATA 600
TTCAGTAACT TCCACTTTAC TGTCTTTAAT TCCTGGGACA GCCTTAGATG AACACCCCAG 660
AAAAGAGAGC TGGGTTCCAC TGGGGAACTG GTGCTGACTT GCTGCTGAGA CCCACCATGG 720
GCTGACTGTG GGTTGGAAGT TGCTATGGTT ATAAGAGGGG GCTGGTGAGC AGGGCGGGAA 780
CTGTGACAGC TGTTGCAGTG TCAGGAGCCC TTAACCCCTG TAAACTTTCG GGAAAATGGT 840
TTCCTTTGTG ATGAGCTTGA GATGGTACAC TGCTTCCTAG CGTGTGGCCA GTGTATATCA 900
TGAGGTCAAT AAACTTTCTG AAGATCTTGC AGTCAGACCA CTGTTTGCCT TCAATACATC 960
ACCCTGGCAA CCAGAAGGAA GCCACAGCTA CTGACAGGGC TAAGGGCATC CCGAGGGACC 1020
TTTTGTCTCT TTCTGAGAAA ACTCTGAATG TACTCCAAAT GCTGCTTCTT CCTTGACTCT 1080
TTCCCCTGCA TGACCTCAAA AGAGCCAAGC TCTATGCCTG TCCCTCGCTA AGGCAAAGCT 1140
TCACTCCAAA TTGCAAACCA GAAGCAATCC CTTCAAACTC GATAGGGCTG CAAATGCAGT 1200
CTCCTCACAC CTATGGCTCT CAGTCTCAGA TCCACATCAG TTCTTCCTGC AAAGCTAGGA 1260
CTGGGCAAAA CACATCTCAC ATGAAATGCC ACCTGCCTCA GGAATCCGAG AAGCCAAAAG 1320
ATGAACAACA GATGCCGAAT AACACAAAAA AAGACTATTA CACTGTCAAT AAAACATAGT 1380
GGTAGGCCCT CAGCAGATTT ATTTGGACAA AGAAATTCAG TCATATGCAA AGAGTAAATA 1440
CATAAGTGAT TAATCAACAA TGTTGAAATT AGCATTTTTT TCTGAAAATA CCTATAAAAG 1500
ACCTTAAAAT AAGAAGCTGG TTATAGTTCA GAAAATGCTG GAATCTTTTA 1550