EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-01029 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:135988590-135996880 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr1:135994647-135994664GTGTTTGTTTATTTGTG-6.51
IRF2MA0051.1chr1:135991607-135991625TGATAGCTTTCCCTTTCC-6.01
NFYAMA0060.3chr1:135993622-135993633TCTGATTGGCC-6.02
Nr5a2MA0505.1chr1:135994842-135994857ACTGGCCTTGAACTC-7.4
TCF3MA0522.2chr1:135996587-135996597AACACCTGCT+6.02
ZEB1MA0103.3chr1:135990141-135990152CCCACCTGCCC+6.14
ZNF740MA0753.2chr1:135991093-135991106GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr1:135991094-135991107GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr1:135991095-135991108GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr1:135991096-135991109GGGGGGGGGGGGG-6.03
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01169chr1:135945308-136008057Th_Cells
mSE_02680chr1:135989644-136013255HFSCs
mSE_03412chr1:135988310-135993777Bone_Marrow
mSE_03412chr1:135994137-135996732Bone_Marrow
mSE_04347chr1:135988863-135990647Cortex
mSE_04347chr1:135994484-135996722Cortex
mSE_04817chr1:135988482-135990712E14.5_Heart
mSE_04817chr1:135992375-135993735E14.5_Heart
mSE_04817chr1:135994315-135997432E14.5_Heart
mSE_06037chr1:135987913-135991022E14.5_Liver
mSE_06037chr1:135992860-135996988E14.5_Liver
mSE_06619chr1:135988158-135991765Heart
mSE_06619chr1:135992060-135997265Heart
mSE_07309chr1:135988354-135997070Intestine
mSE_08945chr1:135988492-135997234Lung
mSE_09588chr1:135988858-135991032MEF
mSE_09588chr1:135994199-135999076MEF
mSE_11210chr1:135987544-135991062Placenta
mSE_11210chr1:135993564-135997433Placenta
mSE_11929chr1:135988826-135993638Spleen
mSE_11929chr1:135993665-135996950Spleen
Enhancer Sequence
TTGTCCTTGT TTTAAGACTA AAGAGATCAG GGGAAGAGGA TGTAATCACC CTCTAAACAT 60
GGCCAGAGGT GGAGGGCTCT AATTTTTTAA AGAAAGGTCT CCTGCCCTCT GGACACGCCA 120
AATTCCCAAG AAGGGAGAGC CACCCAGGGC ATAGTGCTCA GCCACCAGCA GACAGAGAAC 180
AAGGGCAGCA AAGCCTAGAA TGGACACAGT TCAGACCCAG CAAGAGTGTT GGAATGAGGG 240
CGTCAACTGC AGCTGGAGTC CTACAGGGAA AGGCTTTCTA GGGCTTAGGT TAGGAGTCGG 300
AGTTACATTG GAAAGGGGGA AACAGGACTT GTTAGCAGCG AAACACAGGT GTGTGGTACA 360
CAGTGCCTGT TGCTCACCAT GACTGCCTGG AGACTTTGAC AGTTCCCACC CTCTTCCTGG 420
CTATCCTGGA AGAGTAGTCA CCAGCCCCAA ACAAACAGCC CTGAGAAAAA AGGAGGCCAA 480
CACCAGATGA CATTGTTGAC AAAGTTTAAG CCTTCAGTGA AGTCAGAGGT CATTCTCAGT 540
GCAGCTGGAT GAGGCCCCAG ACACACGGAT TGGTAGGTAG GTGTCAACAC TGGCCTTTAC 600
CTTAAGATGG ATACCAGGCC AGGTTCCTCC CCATCGCCCA GTGACCACTG GAAAACTGAA 660
CAGCAAGCAC GGTTTAGGAA ACTTTTCACA CCAAGGCGGG TGGTGCATTG ATAGATATCC 720
TCACAAACAC CGACGTTGGC TGATATGCTC TCTGCTCTTT GGAGGAAACT GAGAACTGTT 780
GGCATTAGGA TTAGTTTAAG TGCAAGCCTT CCCTTTGCAC CAGCTCACAA AGGCCCTGGC 840
GTCCCAGCCT TCCGGTCTCA AAGGATTAAG GCATCTGTGA CTGGCCATCT GTGTTTCTAC 900
CTAGCTTTGA CATTTCATGA GAAACCCTGG AGATGGGAGA TAACGCCTGG GAAGGCTGTC 960
TGGCCCCCCT CCCGGCCCAG AGGTGACACG GAGCCAGCGT CCCTTCTCAA GACGTGACTG 1020
GCTGTGCGCC CGCCCCGCCC TGGCTGGGAC AGGAGGGCGG GGCTGCTGCG CAGGGCGGCT 1080
ACGGCCACGC AATTTCCCCG CCCGCAGCCG CACCGGGTCT GCGCCCAAAT AAGGACAGCG 1140
CTTCCCGGAG GATTGCTTGA CGCGCGGCGG CCACGTCAGC GGCGCGGGGG AGGTGTACGG 1200
AGACCGCGGT GACGCGGCCG GAGCAGACGG GGAGCACCCC ACCCCCACCC TTAAACCTGG 1260
TACCCTCTCC AGAGGGTCAC CCTCTCCAGC ATGTCATCCG ACGTAGCCAG ATAGCTTCCT 1320
CAGCCGGGCA CCCTTCTGGG GCCCATGGGA CAGCGTCTTG TGGTTGGTTG TGTACCTCCA 1380
GGTGGCAAGG CAGTTCACCG CAGTCCCAAG TGGGCTTGGG TGTGGTTTTC ATGGAAAGCT 1440
GAGGGAGTTT GCTCCTGGGT ATTTAAAACA ATCACTGTGC AGTGGAAACC TGGTCTTCAA 1500
ACAAAAACAA CATGGTTCCA CCTCCCTTGG GTAAAGAGAC AGGCTTCCCT CCCCACCTGC 1560
CCCCAGCCAA GTCAGGTGGT AAGACCTGGC CTATGGGGCA GATAGAGGAG AGGCTGTGAG 1620
ACAGGGGTAT CTGGCAGCTG CCTAGCAGGA GGGGGAGCAG AACTAGAGAG AGGGGGAACA 1680
GAACCAGAGA CACTTCTGGG AGGGCAGCTA AGGTGCCCAG TCCCAGTGCC AGAGAAACCT 1740
GTGACAGCAT CCGTATCAAA CTCTGCCCCA ATGCCATGCA CCCGCAAGGA CGTAGTGGGT 1800
GGAAAGGCCA TGGGAGCTGT GTGTAGTAAA AGATTCCCGG AGGCGGAGAG AATGGATAGA 1860
TTGCTGACAA GATGGGAGAC ACACAGAAGG CAATTGGGAA GAGTGAGACC TAACCAGAGC 1920
TCTCAGCCCG CGGTGGCTTG GGGAACTTGG TTGTCTAGGG GAGGGGTATG GGGAAGGGAA 1980
AGTCCCTGGA CTTTCTTTAT GCCTACCACA CTGCTTACCC ACACACAACC TCCCTCCTCT 2040
AAGGCCCACT TCCTCTGTCC ACTTCCTTGA ACTCAGGTTC TGCTTGGTGG AGCCGCTGTA 2100
TGGAAGCCTC ACCCCATTCC ACCCTCTGGG CACAGTGACA GAGGGGAGCC AGGCTTATAG 2160
GGAGGGAGGG GATGGCTTCT GACAGGGCAT GAGCAAGGAT GTGACTGGTT TGTCTTGGCT 2220
ATGAACACAT AGTCTCAGTG TTTTAAAGGC ACGGGAACAG CGCCTTTCTT CCCAGCCATT 2280
GTCTTGGGAA TTGGATGATG CCAGCGGTGT TGGGTGTGGG TGTGGAGCCG GCAGCAGGAT 2340
AGAGTTTGTG TTCATGCATG TGGCTATGTG TAAACTTTGG GGACGTTAGC CCTGCCACTC 2400
ACTGTGAGGT CTTGGCCAGC TTCTCACTTC TCTGGATCCT GATTTCCTCA TTTGAGAAAT 2460
AGCAATGAAA GTATTAGTCT TATTTGTTCC TTTGAGGACT GACGGGGGGG GGGGGGGGGA 2520
GACGTGCTTA TTAAACATGT TGCACATACG TACCTTCTTT CTACAGTGTT GAGCTACAGG 2580
CACAGAGTGA ACACTTCACA GTAACGGTTA CAGCTTTAGC GGCAATGACA GTAATGGATG 2640
CTCTCCGGGA TCATCGGGTG CTCCAGGTTC GCCTGTAGGG TCCTTTCCTC TTAGTTCTTC 2700
CAGGACCCTT GTCATTCCCC TTACCCCCTG CAGCTAATCA CTAGCCAGGC TTCCAGGGAA 2760
GAGTACCCAT GGTAAGAAAA CTAGACAGCT CTACACCCCA TCTCTGTCAT GCCTGTGACA 2820
TGGGACCCTT CTGAGCCTTG GTGTCCCCAC TCCATGGAAT GGGGGGGAAC ACCTTCAAAT 2880
TGGAGCCCCT GTGGTAGGAG ATTAAAGTTG GTAAAGGGAC TCTGCAAACA GCCCTGGCCT 2940
CTCCATTTTA AATCTCCCTT TTCATCCCCA GCCGCTCCTG TAGCTGGGGC TGTCTCACAC 3000
TCTGTTCATA GCTTTGTTGA TAGCTTTCCC TTTCCCACCA AGTTCTGGAA GCTGATACTG 3060
CCTCCCTCGG TGAGCATTCA CCAGGTAGGA TGCCTTAATA CAGGGCAGCT CGTCAAGCCC 3120
AGGGCAGGGC ACCCAGTATG AGCCCCCATC AGAGTCAGTT TCTTTTTGTC TATCAGCAAA 3180
CCCAAGTGGC AAAGGCAGAA GGAAGTGACC CCAAAGAATT TGGGGAAGTA AACTCTGTCC 3240
CTCTTTATGG GGGACAGGAG GGAAGAGGAA GGGCCTTCCT AGCTGGGTTC ACAGCCCTCC 3300
GTGTCGAGAG CCCCACCTGT CTTATTCCCG AGAGGAAGGT GGGTGCTCTT TACAGAAGGG 3360
ACCTTGGGTG AGAAGTCTGC CTCCTCCCAG CTAGGACATT CCCCAAAGCC TGCCCCTCCC 3420
CTCTCCCATG CGTCCGGCCA CCCTTTTCAG CAGAGCTCAC TGAAACAGCA GCTATCCTGT 3480
AGCTGGTTGG CTTACAAATG GGACTTCTCA CCCCTCTTAC CTGGGCTAGC TAAAAACTTT 3540
GGCAATCAGG TATTCCCAGG CTTAGACCCT GCTTTTCTGG TACACAGGGG CAAGCCTGGG 3600
GCCCACACCT CTCTCATTTA GACCTATTCT TATTTTCCTG AGGCTGTGTG TGTGTGTGTG 3660
TGTGTGCATG TGTGTGTGCG TGTGTGACCT ACTCCACTCA CACCTGAATG CCTTGGGCCC 3720
CTCCTGTGTC CTGAGTCTTC TGACCTGCCG TTGCCCACTG GCATGGCCCT GGGCATTCAT 3780
TCTTCCTACC ACCATAACTT GGCTCCTAGG GAAATTTCCT CCCAAGTGGG AAGAACCCCT 3840
CTAAGGAGAG GCAGATGTCT ATGAGGAAGG CTGACCCTCC CAAAGAGGGT CACAACTCCC 3900
CCGGGCATAG CCAACAGGGA AAGAACATAA AGAGGGTGTC CCGGAAGCCC TGAGATCCAG 3960
ACCCCTCAGA AATGATGGGA GCTTCAGATT CTTCATCCAG AAAATGACGG TGAACTCTGT 4020
TTTCTGAGGC TGTGGGAAGA CTAGGGAGAG GCTGTGAGGT GTTCAGGAGA CTCTTATCCT 4080
AAGCAATGCC ACCATGGGTA CACATGCTCT TCCGTCTGTC ACCTTTCCTA GCCCTGGGTC 4140
TCTACCAGCT GCCATCCCTG CAAGTGGCCC TACCTCTCTG AACACCCAGT AGAGGCCAGC 4200
CTCCTCCGAA GCTGAGCGCG CCCTACCCTG ATTCTCTGGG GCTGACTTAT TTAACTTCCA 4260
TCTGTTGCTG GGGGTGGGGC AGAAGACATG AAAAGTACCC TCAAGTGCCC CCCCAAGATT 4320
GCGCATTTCT CTTAGACTCT GGGTCTCCTG CCCAGCATGG TAAGGGTGTG TAAGCCTGTC 4380
ACGCCAGGAG TGTGGGAGAG CAGCCAGAAC CTCTTTGTTC TCCCTAGCTC AGGAGAACCT 4440
GCAGCACTGA ATGGGTGTGT GTTTGGAAGA GGGCACACAG CCAAGCGGTT TCTTGCGGGG 4500
GGCGGGGGGG GATGTTTCTA CTACATAAAA CCACAAAGAC AAATTGCTCT CCAGCTATAG 4560
AGGGTGTGTG TCTTTCCCTT CTTGTGAGTA GGGGTAATTT TGGATTCACC AGGACCCAGT 4620
AATGAGCACG GGAAAGCAGC TGCCCACAGA AGTCCAGAAG GCGCTGGAGG ACCAAGCTCT 4680
GTGGGGCTTC GCAGAGAACT GTTGGGAGAG GGATGAAGGG AGCCGGTCAT AAAGGTCCCA 4740
GCTGTCCATT CTCGCCAGGC CGAGTACCTA GCCCAGGGTT TCCACGGAAG GAGTGGTGGG 4800
GGCAAGCGTG CCTAGTACAC TCTGCTCGAA GAGCAGCTGG CACACTGCTT ATCAGTCCAC 4860
ACCCCCAGGG CTGCTGAGGG CCTTGCTTTT TTTCTCCTCT GTATATAGTG AAAGCCCATG 4920
AGTGCTTCAC CAATAGCAGT GAGAGAGACG ATCCTTTGGA GGGGACTGGG AGATAGGAAA 4980
TCTAAAAGGC ATTTCTGTTT ATCTTTTCTG AGAACTCTTT ACATGAAAGA CATCTGATTG 5040
GCCTAAGAGT GCCTCGTTGG CACATTCCCC TCTTCCCCCC TTCGATCGAT CGGTGTTGAT 5100
CATCTCCCAT AGCTTCTGGT TTACCCTATC CTCCAATCTT CCCAATGATC TCATAGACAG 5160
GCTATGTGAT TAGAGAGGCC AACCGGGCCC TGTAGCTCCC AGCAGCTCCT CTCCACTCCC 5220
AGCAGCTTTG CCCTGGGCTG GTCCACTGAT GAAGCCCCAA GGAGTTTGGG AGTGGAGTTC 5280
AAGATCCCTC AAAGAAGGGT GACTTGGTAT CAGGGTCAAT CCATGGGTAA TATTTGGGGC 5340
AGACATGGTA TAGGGAAAGG GCTGGCCATG TCAGAATTGG CTCCTTTTCC CTCTTCAATG 5400
ATGTCTTATC CCTGCCCTCC TGGAATCAAG GAAGTTCATG ACAAGATTGC TAGAACTCAA 5460
GTTAGTAGAG CCCAGTATAA ACACAGCCTG TTACACAAAC ACTTCAGGTA CTCAGAGGCC 5520
TGGAATTCAT AAACATACCT GGATCCAAGT ACATTCTGAA CTGACTCTAG AAGCGGGAGT 5580
CAGTGAGTCC TGTATCCTTG CCCACTGGTA CCTACTGGAT AATACTGTCC TACCCTGCCA 5640
TGGGGAACAG ACAGTCAGCC CACCCACCCC AGCTCTCCAG CATGAAGCCA GAAGTCAAGT 5700
GCCTCTGGAA CTCCCTGGCT GTGCCACCAT CTTGCTGGGC CCCGGTCTCC CTCACTGTAA 5760
ACTGGGATTG TTGGCTGACC ATGAGTTAAG ATACCCAGAT AGCTTGATAA TTTTCTTTGT 5820
ACCTTGTGCT CCCAACGCCC TCCATCCTCT GCCACTTGCG TTCGCTTGGC TGGCCTTGTG 5880
TACATCCTAT TAAAGGCCTT TTGTTATGTT TTTTTCCTCA CTCCCCAAAC AACTAGTAGT 5940
ACACACTAGG CAGGTACTGG AGAAATCTGC AGTGGCCACA GAGTAGTAGA GAGGACCCGC 6000
AGGCCAACAA CTGATAAAAA TCAAGATCTC GGGGGAGGAG GGCAGGTTTT GAAGTTTGTG 6060
TTTGTTTATT TGTGACTCAG GCTAGCCTAG GCTGGTCAGG AATTCACACT TAACCCAGTA 6120
ACTCCTTGTG GGTTTGAACC TTGCGCAGTA CTTCTACCTC CGCTTCCTGA ACGCGGAGGC 6180
TGCAGGCTCC AAACACCACA AGCTGCTCCC ACTGTCCTTC CTTCCTTGAG GCAGTCAGAC 6240
CATGCTGCCC AGACTGGCCT TGAACTCTCA ATCCTCCTGC CTCAGCTTTC AAGTGCTGCC 6300
ACACACCAGG TTATATGAAC CTTTTGAGTA CCCAAGAAGC AGCTTTTGAA TTTCAGCTCA 6360
GAGTGCCATG CTATAGGGCT AGGTCAGGCT TTCCTTTCTG ACAGAGAGGC TGTATACTTT 6420
CCAGCCGGAA TATAAGGGAG CAGATGCCCG AGACTGCTGT CGCTTGAGGT CTAGGTCCTG 6480
CTGGCCCTTT CTGAACCCTC CTGGCTCCTC CTCCCAGCCA CTGGAGAACT GCCACATTGA 6540
GAGGCAGAAC CTGGGAGGCG TCGGAGCCCA TTCATTTTTA ATAGTCCAGC TGCCATGGTC 6600
TCCCAGAAGT TCCGCTGCAC ACAAGCACTC TCAGTTGCCA GGCCTGGGTC TTGTCAATGT 6660
TTAATGGAAG CAAGGATCTT ATCTGGAGTT CCAAGTCGTT TAGATTACTC CTGTGTAAGG 6720
ACCTGTAGTG TGGGATGGTG AAGACAGATG GAAGACTCCT CAGAGTGACC CTGCTGCTCC 6780
CCGGGGCAGG AAGGGGTTCT TAGAGTTAAA AACAGTGTGT GGGTGGCCCA GGAAACAACG 6840
CAAACGGGAC AGAAAGCCCT ATCTCACTTT GGTCAGGGTC TGACCACACT GTCAACAGCT 6900
CTGCCTTGGA GTCGATTCCA GGTGCCCAGT GCACACCCTG CCAGGGGCCT CCTGGGAAAT 6960
CCAAGACACA AGGTAATGGA TGAAGTCTGG AGGGACTTAA AAATAGATGT CCATTGAGCC 7020
TGTTCTGGTG TCCCTCAGCA ACCAAATCTG CCTGTATTTG GGAGAAGAGA CACCATCTGG 7080
CTTGCCTCTA GTATCAAAGT GTTGCATGGA ATGACTACAA GTCCACACTA ACCTGCCAGA 7140
CTGAGCTGGG CCGCTCTGTG CTCCCGGTCC TGACTCCAGA GCAACTAGGG GAGGGACTAG 7200
TGCAGCTCCC CAAGGCCCCG AGGAATGCCT TACGCAGAGA GTCAAGTTCT ATTTGGGGAA 7260
TGGAACATCA CGGTTCTAAA CACAAGCCGG ATGTTATTTA CAAAACTTGT CTAATGGCCC 7320
AGCCTCCATA CCGGTAGCTC ATTGGCTGCT CGTCTAATGG CTCAGCCTCC ATACTGGCAG 7380
CTCATTGGCT TCCAGCTCAG GTTTCTCTAG CGGCTTTCTC CGGACTTTCT CCCGTCCTAC 7440
CAGTTTCCTC CGCTTACAGA TCAACATTCC AGCCGAAGTG TCTCACTGAC CACTGACTGT 7500
CACTCACCGA TGAGACCTGT GGAGGGAAGC TGGCAGGAGC AGTTCCTAAC TGGGAGACTG 7560
AGGCTTGGGA AGGGGAGACC GGCAGGAAAG AAAGTCAGAA TGATATCACC CTGCCCTGCT 7620
GTCTGCCATT CTTATGAGGG TTAAAATGAA AGACGGCCGA GGGCCTCTCC CAGTTCACCC 7680
GTGAAGCTCG AGTCTAAGTG ATGGGTCAGG TGATTTAAGC TTTTTCACTC CAATTCAGAC 7740
GGTGGAGAAG TCTGGCTGAA TGGATCAAAA CTGGCCAGCA CACTGGACAG ACCATTCCTA 7800
ACACCTGGCC TTTTGCTATG TTGTGTTTGG GGAGGTTGGA CTAGAGACTG GAAAATCCCA 7860
ACAGACATTC CTAAGTCCCG GGAAAGTCTG ACGCTGAGGT GTCAGGACTG TGGGCACATG 7920
CTCTTCTTGA ATATCCCTGG GTCTCTTAGG CCACTCTGTC CCCTTTGCTC ATCATCTTGT 7980
CTCATGCCTG TTCACCCAAC ACCTGCTCCA TCACCACCTC TCCCACACAG CGCAGGCCCG 8040
TGGGCTGCAT GTGGTATGTA TAATAGTAGT CCTTGCCCCA GTGACCCGTG AATATTCAGT 8100
GAGCTAACTC ATGTGGAATG CTTGGACCAG CATGGAGTAA AACCTCAATA AATATTAACT 8160
GCTACAAATG CCTGTTGCTG TATGGTTTCT CATCCTCCAT CCAGGGTAAA GGAACTTTAA 8220
AGGAACCCTG TCACGCGAGC CCTTCTAGGC CCTAGCATGA TCCCAGACCT GAACACGGAC 8280
AGCTGTGCCC 8290