EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-00966 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:134284070-134286470 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:134286152-134286171CAGCCAGCAGAGGGAGGTC+6.3
IRF1MA0050.2chr1:134285502-134285523AAAATGAAAGCAAAAGCAAGC-6.8
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr1:134284846-134284857CTTGAGTGGTT-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:134286165-134286180GAGGTCGAAAGGTCA+6.92
RARAMA0729.1chr1:134286165-134286183GAGGTCGAAAGGTCACCC+6.12
RarbMA0857.1chr1:134286164-134286180GGAGGTCGAAAGGTCA+6.82
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03609chr1:134284362-134285638Bone_Marrow
mSE_03609chr1:134285724-134288828Bone_Marrow
mSE_04094chr1:134284087-134288215Cortex
mSE_06071chr1:134283900-134288225E14.5_Liver
mSE_06983chr1:134283941-134288817Heart
mSE_08541chr1:134284063-134288148Liver
mSE_09006chr1:134283971-134288852Lung
mSE_11086chr1:134284178-134287026Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
CTGCACATGT GTCTCTCTAT GGACACCATT ATATGAATGT CCTATTTCAA TGTTTATAAT 60
AACATCTTTT GGTCTTAAAG TGCCCAGTTA TCTGTTAGTC AACAGACTAA CACAAACCTA 120
CCCTCTTGCC AATAGACTGA ATGGGGAAGT AACAGGAGCT ATTCGCAGGA TGCTGAAACA 180
CCCTCAAACA CCGGACCAGG AAAACCACCT AGGGTTCAGC TCTAATTTCC CTTGGTGTCT 240
GTTGTCTTCC CTGATCCTCA CTCAGTAGGA AGAGAGAACA GAATAAGCTA TGAACAGAGG 300
AACAGGATCT GAGCCTTGAG TCAAGAGCGC TTCCAACAAC ACAGGAACAA CATGAAGGTG 360
GAACTCTCCT ATCTTCTTTA AGGAGTGATG ATGATGCTGT TCAGAAATCC CAGAGGACAG 420
AGCACCTCTG GGAACTTTCC CTGGCCAGCA TCCTCTGGCT TTTCCTCTCA GAAAAGGCTC 480
TGTTCCTGCA CGGAGCGGTG GGATTGGAGT GGTGGAGGGT GGGCAATGCC TTCAGGAAGA 540
GCTGCACACT ACGCTCAGCC ATTCTCCCAG GCCTCAGCCA CAGGCTGTAT TCTAAACAGG 600
ATCTCTGTGT GCGGAGTTCC CCTAAGCTCC TCCCCACCCC TTCTCACTAC AGCCAGTCTC 660
CTCACTAGAG AATTCTGTTA CACTTTAGGT CAGCCAGCCA GTCTCTCCTC AACAAGCAAG 720
GACTCTGGAT AGCAGCAAAG GATGGAATCA TGAGACCAAG TGAATGGAGA TGTGAGCTTG 780
AGTGGTTAAA GGAATCCATT TTAACTATCA GGCTCCCCTT ACATACTGTC TGCTGAGATC 840
TTTCCCCCTG GAGGATTCAT GCTTATCTGA AGCTCTGGCA AAGCCTCAGA AGTGTTTACA 900
GAAGCCTCCT GTGGGGCCGG GCCCATTCGC AGGTTGCTTT TCTGTTATAG TTACCATTTT 960
AAAATGTTAC TATGTAACTA TTTTCCAGAC CCCCACCCCC ACCCCCTAAC CACATAATCA 1020
CAGATTCCAA GCTACCACAG AAGAAATTTA CGGTGATAGA GGGCTTGTCT AGTATGCTCA 1080
AGACGCTGGT TATGATCTCA GGACATCCAC CCCTACCCCA ACCTCCACAC AAAATAAGCC 1140
AAGAAATGCA CATCGTGCAG TATGATCATC CTTGAAGGAC CAGAGATAGC CGAAGCCCCT 1200
GACACTGCTG AGCATCACTA GCCGGGCATC ATTCAGATCT CTAGCAAAGA CCAGATTCTC 1260
CTCTTTCTCT CCTGCTATGG AGGTGCTTTA GACAGAGCTT TCCATGCCTT CGCTCCTTGC 1320
TCAACAATCA AGATGACTGT CTCCATTGAC ACACAATCAG TCCCCATGCC TGGAGCTGTC 1380
ACAAGAAAAT AGAAGTGGGA CTAAGGGACT GAAAGTTCCT ATCTCCAAGT TCAAAATGAA 1440
AGCAAAAGCA AGCCAGAGCT CCTGAACAGC ATCAACTAAA CACAGGCACG GGAAAGGCAT 1500
TCCAGATTAA AAAGCAAACG CATTTCCTCT TGGTATCATT GTCAAATTCA GAACAAGTCA 1560
GCCCCCACCC AGTTCCAGAG ACAATGATGA AATTTTTCCA CTAAACTGTC AGCCATGGGA 1620
AACTTGTCCA GCACTGGAAA ACAAGTTTAG CCACACTCCA ATATCCCTTG TTCCTTTCTT 1680
CAGAAAAGTT AAGTGACATG TCACATTTTG GTAGCCCTGA GTCACATCTG GTAGAGAGGT 1740
CTCTGTCCTG CAGTAAACAT GTTGTGATGA GACAGACAGA GATAAACAGG CAAGTGCTCT 1800
GTGAGTCTCC CCGTGCTTGC ATAAGCTTGG ATCCACACTG CCTGGGCTAT ATAGAAGTGT 1860
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTAAGG GTCCTCAATT CTCAATTCCT 1920
CCTCAGGACG GCTCAGCGGT TAACATATTG TAGTCAAGTG CAGTGCTATC GCTCTATCTG 1980
CCCCTGTTCA AAATGAATGT CATCAAAAAA GATGACACAG GAGGGTACAG ACAAGGAGCC 2040
TTGGGCAGCT TTATAGACAC AGAAACTACA GCCCCCTTAG CACAGCCAGC AGAGGGAGGT 2100
CGAAAGGTCA CCCCCTGTTC CTCTCGGCAG CATTAAAGGG ACTTACCATC TCAGTTAAAA 2160
CAAAAAACAT GTCACTTGGG GGAGGGAGTG ACACTTCTTG GAGCCTGAGG GAATCACAAG 2220
CTTTGTGAAG AAAGCCTAGG TGTTCAACTA GTCCATCATT ACACATAAGG TGGGTGGAAA 2280
GAGGTCAGGT TTGCAAAACT TCCACAAAAA TTTAAAAGTC CCACAAGGAG TGAGTGGGCT 2340
CTCTTCCCCA AGGGACAACA CACACACACA CACACACACA CACACACATA AAGCACACAT 2400