EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-00919 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:130300870-130301940 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:130301609-130301627GGAAGGGAGGAAACAAAG+6.33
Foxq1MA0040.1chr1:130301902-130301913CATTGTTTATT+6.02
IRF1MA0050.2chr1:130301167-130301188AAAAAAAAAAAGAAAGAAAGA-6.25
Enhancer Sequence
TTGTCTGTGG TTGATTTTTG CCAAGTATTT TAAATACAAT TCAGCATGGC CATCTGTGAT 60
TTCCATGACC ATTTACTTTA AGTAAATGTT TTACAGGATT TACTTTAGAT TTAACTTATC 120
ACTTAAAATG TAAGGGCAGT GGTGCCACAC GCCTTTAATC CCGGGTGTAT GTATATATAC 180
AGTGCACTTG ACAGAGGTAG ACGGGTCTCT ATGAGTTCGA GGCCCGCCTG GTCTATAGAT 240
CAAGATCCAG GACAGCTAAG GTTACACAGA GAATCACTGT CTCAAAAAAA AAAAAAAAAA 300
AAAAAAAAGA AAGAAAGAGA AAAACAAAAA AGAAAAGACT ATCCATTCAT TTCCCCATGT 360
CTCTTTAATC ATTATCATGA GAATACTAAA TTCAGAAAAA CATGCTAACA AAATGGCTAC 420
ATCATAAACC ACGAAGAGTC AGAGTACCTA ACCACCCTAC TTTCCTATCT CAATGTCCTG 480
CTTCTTGCAA CTAAAACAAA ACAATGTTTT TCTATAGAGC TCTGAGCCAG GCAGCAATTC 540
CTTTACAGCT GGGAAAAAAG CAAGTTTTAT CTCTTTTTTT CCCCTAGACT CTTTGGTGTT 600
GAAGTTAAAA GCTGTAACAT TATTAATACA TGTTTGACTT CCTTCAGGAG GAAATCATCT 660
GCAAAAGCAC ATTGTCTTAC TTTACATACT TGTATTAGTT AGAAAACTTG TTGCTCATTA 720
TGCATCTCAA AGGGGTGGGG GAAGGGAGGA AACAAAGCTC AGCAAATACA GCAAACTCAA 780
GTTGCTGTGC CCTGTTCAGG ATGCCAGGCT TTTTGTTGCT CTACTTGAAA GTAATGTGAC 840
TTGTCTGTGA AGAGTGCAGC TTCAGCAATT CCAAATGAAT CACAAGCCTG TGCTCCATAT 900
TTTCTCCTTT GTGAGTTTAA TGTATTCAAG CAACACTGAA CTGACAATTT AAATAACTAC 960
ATTTTTAAAC AAACGAAGCA TTGATGTTAA TGTATGAAAA TGGTCCAAAC CCCTGGGAGT 1020
CTTGGTTCCC ACCATTGTTT ATTCTGACAA CAGGATATAA TTGCTTACTT 1070