EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-00415 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:64899720-64901540 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr1:64900937-64900948AAATCTCAGCA+6.32
Nr5a2MA0505.1chr1:64900786-64900801ACTGGCCTTGAACTG-6.59
TCF3MA0522.2chr1:64900038-64900048AACACCTGCT+6.02
Enhancer Sequence
GCCTTGTTGT TTACTTCCTT TATAAATCCC CTTCAAATCC CCTTCAGCCG CGCGCACACA 60
CACACACACA CAAACAAAAA ACAAACAAGA ACTAAACTGA ACTAAGCTGA ACTGAACTGA 120
ACCAAACTAT ACTAAACCAA ACTAAATTAA AAAAAATGCA GTCATTATGG TCGGTGGGAA 180
GCACAGACTG AAGGCTTCTG TTCTGGATCT AGGACTTGTA CATGGGACTT ATCATTCGGT 240
CCCTTCCACT TCCACACAGG ATCAGGAACA GCCTGGGGTC TGATCAGGAG GCATGGACTG 300
CCTGGCACCT GCTCAAGAAA CACCTGCTCC CTTGAGACTG CCAAGCAACA GGGCCTTCAA 360
AGAGTAACAT TCAACCCCTT CTCACCACCT CAGAAAAAAC CTTTGAGGAA AGCAGGCACA 420
TTCATTTTTC TAAATATTCA TTTGCTTAAA AAGCATTTTC CCAAATACCT TATGTTTCCC 480
CCCTAGTTCA TTAATTGTAT AGAACAGACC TGTAGAGTGG TTAACAGATT TACTGATGTC 540
TTAACGATAG CTCACTCCTG CCACATCCCA GAATGTGTCC AGGGTTTCTG AAGGCACAGT 600
AGCTACAGCA GACCCAAGCA CTGGCTAGGG AGTGACGCAG GCGAGCTGTC AGGCTTTGTG 660
TTTCTGCTTG TTAAATCCGA ATGCTCCTAA TTAGTTATTC TGCCCCATAA TGCTTGGGTG 720
GACAATGGTG CAGGGATCAG GGCTGCTGAG GCTATGAATA CAAGTTCCTC AGCCTCCTGA 780
GGCTTGGGGA TTGGTGACTT GGTTGTGGGC ACTGAAGCAC TGTGTTCCTG CTGGCTGTGG 840
ACTCAGTGAC ATCAACCCTC ACGTGAATAA AGGTCATCAC CTGTTAGTAC TTTGGCAGAA 900
GGTCAGCTGC CCTGAGTGCC CACTTAGGCC TTTCCTTTGT CTGCTGCCTC TGTGAAGAGT 960
GCCCACAGAG AACAACACTC TGTGAGTCTG TTTGCTTGGT GGGGGCAGGG CATACAAAGT 1020
GATTCACCAA CATCCTTGAA GAATTCAGCA AAACATATCT TCAAAGACTG GCCTTGAACT 1080
GCCTTGGACA TGGCCTTTTT GTGAACTTAC TAGCTATAGC TCTAGAGAAG CTCTGAAGTG 1140
GACCACCAGA TACATTGTTC CTGTACAACA TTTCTGACAG ACATTTATGT CACAGTGATG 1200
AATAGGGCAA CTCTGCAAAA TCTCAGCAGA GAAGTTTGCC ATCCAGGGAC ATTTAGTGAG 1260
TGTTCAGAAA GATTGCAAAA ATTAGCTAGG CTTGGAAGTG CATGCCTGCA ATCCCAGCAC 1320
TCTGGAGGCT AAAGCAGGAA GACTGGACTG GAAGTCAGCC TGTGTGGTAC AGCAAGACCT 1380
GTCTAAAATA CAAACAAAAA TTGGGCGACA TTAAACAACT CACAATTATC TTGATAGTCA 1440
AAAGCAGAGA TCAGGGAGCT GGAGTGATGG CTCAGTGAGT AAGAGCACTT GCTGTGACAG 1500
GAGGAGGGCC TAAGCTCAGA TTCCAAGAAC CCATGTAAAA GCATGCTGGC TCTGAAAAGT 1560
TCAGGGTTAG TGAGAGAACC AGGTGGAAAT GGATAGAGGC AGACACCTGA CATAATCTTC 1620
TGGAATATGT ATGCATGTAT ATGAGCATGT ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAA 1680
ATGGCCGGGG TGGGGGGGGG ACTATGCATC CCTTCCCTCC TATCTATCCA GCCACCCCAC 1740
CACTGAATAT GCACATGTGT GAGATGTTAA TGCTAATTAC TTCTGTGTGA AACAAGCGAC 1800
CAACCCACCG ACCAACTGTT 1820