EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-00323 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:57903060-57905620 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr1:57903300-57903313AAATTAATTAATA+6.37
POU6F1MA0628.1chr1:57903302-57903312ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:57903302-57903312ATTAATTAAT-6.02
SREBF2MA0596.1chr1:57904107-57904117ATCACCCCAT-6.02
Enhancer Sequence
CCTCTCCCAC TCCCACATCC CATTCTTTTC TGAGCTTGTG TGACCACAAG TCTTTTTATC 60
ACTGAATCTG TCAACTCTTT GGAGAACAGG AGTTTTGGGA CCAGAGATCC AAGTTCAAAT 120
CCCAACTGAA CAGCGCTGCT TACTTGTGTG CCTTGCCTCT CTGTTCTTCC ATCTCAGTTT 180
CTCTAATAGG AAGTTGACAA GAACACAACT TCGTCTAGCA TAAAGCCTGT TGTGAGGATA 240
AAATTAATTA ATACCTGGAA ATGCATAGAA AATTCTCAGG GAAGATGATA AGCATTCACT 300
CGGTGTTAGC TTTGAGCCTT CCCAGCATCC TCCACAGACC TGATACATTG TTGGTATTAA 360
ATGAATGGTC AAAGACAAAG AAGGTAAACC CTTGCCCTTT CCGAGGCCTG CCCCTCTAGG 420
TGGTTAATGG TGGACGGAAG GAAAGCATTC TGTGTTTCTT TTTTAGCATT CGAGGAGAGT 480
TTGTGCTAAG ATTTTGGGCT CTGGAGGGTA AAGAGTTGTG TAAAGCTCTT GTCTTAAGCC 540
CTCTGGGATT TGGTATTTGT CCTGTGGGCA ATGGGAAGGA AGGAAAAGAA AACCTGTGTG 600
GTCTACGTGG ACACAGTTCC TGTGGCTTGC TTTGAGATGG AGTGGGGAGG TGTCTTCTGA 660
ACCCCCTTCT CTGCTTCTCA CACTGGCCTT TCTAGAGGCA TCTTTGAGGA CGAGCCTATT 720
TTAATAACTG GCGTTTACAT CACAGCATCT TAAAAGAACC CCCGTGTAAT TGAAATCCTG 780
AAACAAGTGG CTGCTTGTAC AAGGTCCAGG TCACCCCGCA TCTCTATGGA AACGCGTTTG 840
TTTTAAAGCC TAGCCATCAA AAGTGGGGCT TTATAGGCGC CAGTGTCAGG TTGCTTCTGG 900
AGAGAGGCAT TTATTTATAT TCTCTAGCCA TCAAAGACCT GTGAAATCAA AATATTTTAA 960
ATTAAATGGA AAACCCATGC CACAGATGAA TGTTAATAGA ACTCAAAGAG TATGTGCAGC 1020
CTCAGCTCAG AGCCTGCACC AGCTGGGATC ACCCCATTGA TCTCCACTGC CCTCTGCTTT 1080
GTAGCTTCCC CTTGTGCTCA GCCGGGGATG GGGTGGGGGT GGGGAGATGG ATGCTTTGGC 1140
ACATTATGCA AAAATGGTTA ATCTCCACTC ATAAGCATGT GCTGGGACTA TTAGCAAAAG 1200
GGGAAAATCA AAGTGGGCCT GTCATGCAGG GTGCTCTGTA TTGGCCCTGA CATATCTTGT 1260
CTACGCCATG TCGATGGGTG CTCAGAGGCA CAGGACCCTG CATCTATATG AGCACCTGTC 1320
CACACCTCGT CCACGGGGAA CTCAGAGGCA CAGGACCCTC CTGCCCACAT GAGCACCTGT 1380
CTGTTGGTGA AGACATTTCT CCCAGAAAGG TCTGAAATTC GCATGGGCAC ATCCTGCCCT 1440
CGATCCGCTC AAGTGATATT CTAAGTGACT GGAGGCTTTT ATCTGCCTCT GAAAGCAGGC 1500
CTTTTCAAAT AAGTATTGAC TGTTAATGAC CTGTTTAAAT AAAACATTCA ATTTTCTTTC 1560
TTCCCCCCAC AAAGAATTTA GTAGGCAGAG ACATTTCTAA AGGAAAGGCT AACCCTGCTT 1620
TTCAAAAGAG GCTGAGCCAA AGCTTTTAAA TGTGAACATT TTTTCCTGAC ATTTGCCCTT 1680
AAAATGCTAT TCAGTGAAGC TGTGCTAACA GTGGGTTGAG TACATTGAAG TGTCTTTGAA 1740
TAAAAATGCA ACCTTGAGGG TTTTTTTCCT CCAAATTAAA CAAAAATGTC CAAGGAAGTA 1800
CTGCCCTACA AAATTCATAT TTGTGTCACC ATGCTGTCTC GTTGTTTGTA TATCCTCGTT 1860
CTTAACAAAG AGAATTTCCT CTAAGGAACA GGGCTCTATA CGCAACCTTA AAAGCATGAG 1920
AACTTAAAAA AAAAAGAACC CATGAGATTG TAAATCTGAG ACCTCAATAA TTAATAAGTG 1980
CAGAGAGGTG ACACTGGCCC AGAGCACCAG AGGGAAGTTC AGGCAAGAGG AACCCTTCCT 2040
GGTAGTAAAT GCAGATCAAC TCTCCACTTC ACAAAAGAAT AAGTATTTTC CTCCTCGGTT 2100
GGCATGCAAG CACCCCACTG TGCATGGAAG ACTGGACAGT GAGTCTCTGA ACTAGTTGGA 2160
AGGTGATCTA CATAGAGAAG TAGCCTGCTA CATCAAGCCC GTGCCCTTTC TGCAGGTGAA 2220
TGGTCAGCTT CCCGCCACTC TAAGAGTCCC CATCAACTCC GGGTGCCTTT TCTGACTTGC 2280
AGTGCCCAGG AGCTACAAAG GACTGTAAAG GTCATTGAAT ACATCCACCT TTTCTCCGCA 2340
CTCAGAGACC TGAGGCTCAC ATGCCAGGCC TACATGAGGC CCTGTCAGGA TGAAAGGCAT 2400
CCTTTACAGA CAAGTGCGGC TTCCTCAGCT CCCCTGCCCA AGCCTGGCTC CTTTCCTATC 2460
TACTCCTACT GCATGTCGCT CTGGGATGAT GGATGTCAGG TGGAAGATGA AATGAGTCAG 2520
TCTTTCAAAG GTAATAGCAT GCCCTGAACT AAGAAAAACT 2560