EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM113-00296 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Neural_tube_embryo 
Coordinate
chr1:53879340-53881510 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PKNOX1MA0782.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA-6.92
POU2F2MA0507.1chr1:53880797-53880810AAATGCAAATGCA-6.16
POU4F1MA0790.1chr1:53879927-53879941GTTCATAATTAATG+6.32
POU4F1MA0790.1chr1:53879881-53879895CTGCATTATTGATG+6
POU4F3MA0791.1chr1:53879881-53879897CTGCATTATTGATGAT+6.19
TGIF1MA0796.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr1:53881161-53881173TGACAGCTGTCA-7.22
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00627chr1:53870893-53913933Myotubes
mSE_01654chr1:53874723-53882197Macrophage
Enhancer Sequence
CCCCCCCAAT TTAAAGATAG GGAACTTTGA AGCTGGTCTT GAACATTCAA CCTCTTTGTC 60
TCTGCTTTCT GGAATTACAG GTAGGATAGG CACCACCTGG CCTGGATTCA CAATCTACTT 120
TTATAATAAA TTACCTACCT ACAAAGCAAA GACCAACCCA AAAGTGCTAT CACGTTTACA 180
TATGCTAATA AGCTCATAAA TTGATTCAAT GGAAGAATAA GGTAAAAATC TTTAAGTATT 240
TCGGTTATAG GGAACTGAGT GGGTGGGCAG GGGGTGTTGA AGAGAGAGAT TGTTTTAGAG 300
GTTAAACTAT GAGAACCTAT CAGAAGCCCT CTCACATTAA CAGCCTCACT GGACACCAGC 360
AGCAGGACAG ATCCACAAAA GGGACACCAA TGGGTGTCCA GAACTCATCC TTATCCTTTT 420
TTTTTTTTTT TCTTAAATTG TGCAAAGAGC CATTTTATTT CAGGACTCCT CTGTGCTTTT 480
CTATTGACTA GCTGAAAGAG GGCCTGGATG GTAAACGCTC TTTTATTGGA GGAGGAAAAA 540
ACTGCATTAT TGATGATACT GCAGAGCAAT AAAAGACATG GAAAGAGGTT CATAATTAAT 600
GGTGTGAAAC ACACACACAC AAAAATCAGC TTGCAGACAG GTTATGCAGC ACAGTTTTTG 660
TTTTCAAATC TGTACACGTG TGTGTCCACA TGCGAGCAAC TTAAGGACGA GTAGAAGCAG 720
ACACTCCAGA CTGTTGGACA TTTGACTGGA GATATATATA TATACTTTAT ACACATTTAA 780
TGTATTTACA TTTTAAATAT TTTCCTTGGC ATGTTTGCAA AAAGTTTTCC TTTTATACCA 840
CAAATAAAAA GTATAATTTT CCAGTGAGAA AAAGATTCTC ATTAAAGAGA GAGAGAGAAA 900
AAAAAAACAA AACCAAACCT ACTATATGTT TCTAGGTCTA TTCCATTGGG TGTGGCAGTG 960
TGTGCGCCTC AGACACCAGC ACCCTTGAGA GTAAGGCTAA GCCAGGGAAT TACAAATTCT 1020
AGGTCAACCT GGGCTCCAAA AATCACAAAC CAGCAGTGCC GTTCTGTTGT ATAAAATCCT 1080
TTCCTGGAGA CTTCTGTTCC AGAGTGAGTT TACTCCCCTA ACTTTACTTT ACTCTCCTAA 1140
CTTCTGGGTT GACATTTCAG TCTTCTCAAA TTCATGACAC AACTAACTTC CTATATGAAC 1200
ATCTTCTCTT TGGTCAAAGA GAAGCGGCTT CCCCAAGCCT TCCCCAAGCG GCTGCAGTCC 1260
CTGCTGCTCT CTAACTCTCT CTCTCCCTCC ATTTTCAATC AGCCGGCAGA AACCTCAGAT 1320
GAACTCAGGA GAGAGCACTG CTCTGCACTT TGCAGACTGG CATGTGAACT GACTGCTTAA 1380
GAGGAAATGC CATAAAGTGA GTTTACTCTT TACTCATAAA ACCCCCAGAG CTCCAGGGGG 1440
TAGGAAGTCT TCTACAGAAA TGCAAATGCA GAGCGAAACC AGCAGCCACC AAGCAGAGGA 1500
AGTGCAGTAA TCCGTTCAGG CTGCTAGTCT CCATGGAAAC GCCATTGAGT AAGTCTCAAG 1560
TCTCTATCAG CTAAATCACT GGTTACTTTA TTACTACAGA AGAAGGGGGG AAAGTCGTGG 1620
ATACAACTTG TTCCGGCTTC AGAGACTACC ATATATACTT TAATAAACAC ATTTCTTGAG 1680
GAACATTTGA TCAGAGCTAC CCAGGGCTAC CACGGAATGA GCATAAGGAA TCAAAGAGCA 1740
CAAGTCACAC TAGCTTGCTT GGAAGGTTGA AAGACTGAAT TATCTGTCCA AGAGCCTCTC 1800
TGTCATCACT CTGGCTTGCA GTGACAGCTG TCACCCTTCA CACCCTTCCA ACTCTGCGGG 1860
TTAGAGCTTC TCATGGGAAG ATGATAATAT ACTTGTGAGA AGGAAGTTTC AAAAAAGTAT 1920
ATTTATTTTT AGTAAGGAGG ACATTGGTTC TATCTAGTAT ATTTGTACAG TATCACAACT 1980
TAAATGATAG ACACAGAATC ACTAAGAGGG AAAAGAATAT ACTGGAGCTG ACTGGCTTGA 2040
GGCCTACCAG CCGCCTAGCT CTGTGAAGCC AGGAAACAGC AAGGGGGCGG ATGGCTTTAG 2100
TGTGTATGTT TTGGTCTTTG GAGTATTAGA CTCAGTAATA TAAAGCAATG TCACCGATTT 2160
CTTTATACTC 2170